Yıl: 2015 Cilt: 29 Sayı: 2 Sayfa Aralığı: 75 - 78 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 29-07-2022

Kolorektal Kanserli Hastalarda DNMT3B Gen Polimorfizm Sıklığı

Öz:
Amaç: Kolorektal kanser (KRK) genetik ve çevresel faktörlere bağlı olarak gelişebilen, dünyada en fazla karşılaşılan gastrointestinal tümörlerden biridir. Sigara, alkol, sağlıklı olmayan beslenme biçimi, kanserojenik ajanlara maruz kalma, düşük methionin ve folat alımı gibi nedenlerle kolorektal kanser gelişebilir. DNA metilasyonu, CpG dinükleotidinde yer alan sitozinin 5' bölgesine bir metil grubu eklenmesiyle oluşan bir epigenetik modifikasyondur. DNA hipometilasyonu onkogenleri aktive eder ve kromozom yapısının kararlılığını yitirmesine neden olurken, DNA hipermetilasyonu tümör baskılayıcı genlerin susturulmasına yol açar. DNA metilasyonu DNA metiltransferazlar (DNMT) tarafından oluşturulur ve DNMT1, DNMT3A ve DNMT3B olarak adlandırılan 3 enzim grubu tarafından düzenlenir. Bu çalışmada DNMT3B gen bölgesinde yer alan 3 polimorfik bölge incelenerek hastalığın patogenezi üzerinde etkili olup olmadığının ortaya konması amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Çalışmada 98 kolorektal kanser hastası ile 96 sağlıklı kontrol olgusunda DNMT3B geninin rs2424913, rs1569686 ve rs2424908 olmak üzere üç tekli nükleotid değişimi (SNP) değerlendirildi ve genotipleme PCR-RFLP yöntemi ile gerçekleştirildi. Bulgular: Çalışılan üç polimorfizmin genotip ve allel frekansları kolorektal kanser hastaları ve kontrol olguları arasında önemli bir farklılık göstermedi (P>0.05) Sonuç:Eldeedilenveriler DNMT3Bgenininrs2424913, rs1569686vers2424908 polimorfizmlerinin kolorektal kanser etyopatogenezi üzerinde primer bir etkiye sahip olmadığını göstermiştir.
Anahtar Kelime:

Konular: Hematoloji

Frequency of DNMT3BGene Polymorphisms in Patients with Colorectal Carsinoma

Öz:
Objective: Colorectal cancer (CRC) is one of the most common gastrointestinal tumors depending on genetic and environmental factors. In addition, smoking, unhealthy diet habit and environmental carcinogenic agents are also the assumed risk factors of CRC, such as alcohol, low methionine, low folate diets. DNA methylation, a major epigenetic modification involving the addition of a methyl group to the 5? position of a cytosine in a CpG dinucleotide, maintains chromosomal stability and regulates gene expression and has been reported to play a significant role in the development and progression of various cancers. DNA methylation is typically mediated by DNA methyltransferases (DNMTs), specifically DNMT1, DNMT3A and DNMT3B. In this study we aimed to investigate whether DNMT3B gene polymorphisms have any effect on the pathogenesis of colorectal cancer. Materials and Methods: The study group consisted of 98 colorectal cancer patients and 96 healthy controls. Three SNPs of DNMT3B gene, rs2424913, rs1569686 and rs2424908 were genotyped by PCR-RFLP technique. Results: When genotype and allele frequencies of three SNPs compared between patients and controls, p values ranged from 0. 08 to 0.98. Conclusions: The results of study show that rs2424913, rs1569686 and rs2424908 polymorphisms of DNMT3B gene have not a primer effect on pathogenesis of colorectal cancer
Anahtar Kelime:

Konular: Hematoloji
Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık
  • Makinen MJ. Colorectal serrated adenocarcinoma. Histopathology 2007; 50: 131-150.
  • Linhart HG, Lin H, Yamada Y, et al. DNMT3b promotes tumorigenesis in vivo by gene-specific de novo methylation and transcriptional silencing. Genes Dev 2007; 21: 3110- 3122.
  • Bheemanaik S, Reddy YV, Rao DN. Structure, function and mechanism of exocyclic DNA methyltransferases. Biochem J 2006; 399: 177-190.
  • Esteller M, Fraga MF, Guo M, et al. DNA methylation patterns in hereditary human cancers mimic sporadic tumorigenesis. Hum Mol Genet 2001; 10: 3001-3007.
  • Issa JP. The epigenetics of colorectal cancer. Ann NY Acad Sci 2000; 910: 140-155.
  • Robertson KD. DNA methylation and human disease. Nat Rev Genet 2005; 6: 597-610.
  • Singal R, Das PM, Manoharan M, et al. Polymorphisms in the DNA methyltransferase 3b gene and prostate cancer risk. Oncol Rep 2005; 14: 569-573.
  • McCabe DC, Caudill MA. DNA methylation, genomic silencing, and links to nutrition and cancer. Nutr Rev 2005; 63: 183-195.
  • Wang J, Walsh G, Liu DD, et al. Expression of Delta DNMT3B variants and its association with promoter methylation of p16 and RASSF1A in primary non-small cell lung cancer. Cancer Res 2006; 66: 8361-8366.
  • Sun MY, Yang XX, Xu WW, et al. Association of DNMT1 and DNMT3B polymorphisms with breast cancer risk in Han Chinese women from South China. Genet Mol Res 2012; 11: 4330-4341.
  • Montgomery KG, Liu MC, Eccles DM, et al. The DNMT3B C-T promoter polymorphism and risk of breast cancer in a British population: A case-control study. Breast Cancer Res 2004; 6: 390-394.
  • Khorshied MM, El-Ghamrawy MK. DNA methyltransferase 3B (DNMT3B -579G>T) promotor polymorphism and the susceptibility to pediatric immune thrombocytopenic purpura in Egypt. Gene 2012; 511: 34-37.
  • Bao Q, He B, Pan Y, et al.Genetic variation in the promoter of DNMT3B is associatedwith the risk of colorectal cancer. Int J Colorectal Dis 2011; 26: 1107- 1112.
  • Shen H, Wang L, Spitz MR, et al. A novel polymorphism in human cytosine DNA-methyltransferase-3B promoter is associated with an increased risk of lung cancer. Cancer Res 2002; 62: 4992-4995.
  • Iacopetta B, Heyworth J, Girschik J, et al. The MTHFR C677T and DNMT3 C-149T polymorphisms confer different risks for right- and left-sided colorectal cancer. Int J Cancer 2009;125: 84-90.
  • Zhu S, Zhang H, Tang Y, et al. DNMT3B polymorphisms and cancer risk: A meta analysis of 24 case-control studies. Mol Biol Rep 2012; 39: 4429-4437.
  • Ozen F, Sen M, Ozdemir O. Methylenetetrahydrofolate reductase gene germ-line C677T and A1298C SNPs are associated with colorectal cancer risk in the Turkish population. Asian Pac J Cancer Prev. 2014; 15: 7731- 7735.
  • Yamak N, Yaykasli KO, Yilmaz U et al. Association between susceptibility to colon cancer development in the Turkish population. Asian Pac J Cancer Prev 2014; 15: 8963-8967. polymorphisms and the
  • Sari FM, Yanar HT, Ozhan G. Investigation of the functional single-nucleotide polymorphisms in the BCRP transporter and susceptibility to colorectal cancer. Biomed Rep 2015; 3: 105-109.
  • Düzköylü Y, Arıkan S, Turan S, et al. Possible relationship
  • between the resistin gene C-420G polymorphism and colorectal cancer in a Turkish population. Turk J Gastroenterol 2015; 26: 392-396.
  • Canbay E, Kahraman OT, Bugra D, et al. Association between PTEN IVS4 polymorphism and development of colorectal cancer in a Turkish population. Expert Opin Ther Targets 2013; 17: 1-6.
APA TAŞDEMİR P, DURSUN H, KÜÇÜKKARTALLAR T, GÜL ZAMANİ A (2015). Kolorektal Kanserli Hastalarda DNMT3B Gen Polimorfizm Sıklığı. , 75 - 78.
Chicago TAŞDEMİR Pelin,DURSUN H. Gül,KÜÇÜKKARTALLAR Tevfik,GÜL ZAMANİ Ayşe Kolorektal Kanserli Hastalarda DNMT3B Gen Polimorfizm Sıklığı. (2015): 75 - 78.
MLA TAŞDEMİR Pelin,DURSUN H. Gül,KÜÇÜKKARTALLAR Tevfik,GÜL ZAMANİ Ayşe Kolorektal Kanserli Hastalarda DNMT3B Gen Polimorfizm Sıklığı. , 2015, ss.75 - 78.
AMA TAŞDEMİR P,DURSUN H,KÜÇÜKKARTALLAR T,GÜL ZAMANİ A Kolorektal Kanserli Hastalarda DNMT3B Gen Polimorfizm Sıklığı. . 2015; 75 - 78.
Vancouver TAŞDEMİR P,DURSUN H,KÜÇÜKKARTALLAR T,GÜL ZAMANİ A Kolorektal Kanserli Hastalarda DNMT3B Gen Polimorfizm Sıklığı. . 2015; 75 - 78.
IEEE TAŞDEMİR P,DURSUN H,KÜÇÜKKARTALLAR T,GÜL ZAMANİ A "Kolorektal Kanserli Hastalarda DNMT3B Gen Polimorfizm Sıklığı." , ss.75 - 78, 2015.
ISNAD TAŞDEMİR, Pelin vd. "Kolorektal Kanserli Hastalarda DNMT3B Gen Polimorfizm Sıklığı". (2015), 75-78.
APA TAŞDEMİR P, DURSUN H, KÜÇÜKKARTALLAR T, GÜL ZAMANİ A (2015). Kolorektal Kanserli Hastalarda DNMT3B Gen Polimorfizm Sıklığı. Fırat Üniversitesi Sağlık Bilimleri Tıp Dergisi, 29(2), 75 - 78.
Chicago TAŞDEMİR Pelin,DURSUN H. Gül,KÜÇÜKKARTALLAR Tevfik,GÜL ZAMANİ Ayşe Kolorektal Kanserli Hastalarda DNMT3B Gen Polimorfizm Sıklığı. Fırat Üniversitesi Sağlık Bilimleri Tıp Dergisi 29, no.2 (2015): 75 - 78.
MLA TAŞDEMİR Pelin,DURSUN H. Gül,KÜÇÜKKARTALLAR Tevfik,GÜL ZAMANİ Ayşe Kolorektal Kanserli Hastalarda DNMT3B Gen Polimorfizm Sıklığı. Fırat Üniversitesi Sağlık Bilimleri Tıp Dergisi, vol.29, no.2, 2015, ss.75 - 78.
AMA TAŞDEMİR P,DURSUN H,KÜÇÜKKARTALLAR T,GÜL ZAMANİ A Kolorektal Kanserli Hastalarda DNMT3B Gen Polimorfizm Sıklığı. Fırat Üniversitesi Sağlık Bilimleri Tıp Dergisi. 2015; 29(2): 75 - 78.
Vancouver TAŞDEMİR P,DURSUN H,KÜÇÜKKARTALLAR T,GÜL ZAMANİ A Kolorektal Kanserli Hastalarda DNMT3B Gen Polimorfizm Sıklığı. Fırat Üniversitesi Sağlık Bilimleri Tıp Dergisi. 2015; 29(2): 75 - 78.
IEEE TAŞDEMİR P,DURSUN H,KÜÇÜKKARTALLAR T,GÜL ZAMANİ A "Kolorektal Kanserli Hastalarda DNMT3B Gen Polimorfizm Sıklığı." Fırat Üniversitesi Sağlık Bilimleri Tıp Dergisi, 29, ss.75 - 78, 2015.
ISNAD TAŞDEMİR, Pelin vd. "Kolorektal Kanserli Hastalarda DNMT3B Gen Polimorfizm Sıklığı". Fırat Üniversitesi Sağlık Bilimleri Tıp Dergisi 29/2 (2015), 75-78.