Türkiye’de invazif streptokok enfeksiyonlarının epidemiyolojisi, klinik ve mikrobiyolojik özellikleri, 2010-2011

Bu çalışmada, ülkemizdeki invazif A grubu streptokok (AGS) enfeksiyonlarının epidemiyolojik ve mikrobiyolojik özelliklerinin belirlenmesi ve bu hastalıkların önlenmesinde uygulanacak olan ulusal stratejilere veri sağlanması amacıyla bir yıllık aktif sürveyans yapılması planlanmıştır. Çalışmaya, Türkiye’nin 12 farklı bölgesinden (İstanbul; Doğu ve Batı Marmara; Doğu ve Batı Karadeniz; Ege; Akdeniz; Batı, Orta, Kuzeydoğu, Ortadoğu ve Güneydoğu Anadolu) toplam 46 klinik mikrobiyoloji laboratuvarı katılmıştır. Katılımcı merkezlerde, Haziran 2010-Haziran 2011 tarihleri arasında steril vücut bölgelerinden (kan, beyin omurilik sıvısı, eklem, plevra, periton, perikard sıvıları) izole edilen AGS’ler, doğrulama ve ileri çalışmalar için Maltepe Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı Laboratuvarına gönderilmiştir. Bakterilerin tanımlanması konvansiyonel yöntemlerle yapılmış; serotiplendirme için opasite faktörü (OF) ve T protein tipleri araştırılmış, genotiplendirme için AGS lizatı hazırlama, emm geni amplifikasyonu ve dizilenmesi, “Centers for Disease Control and Prevention” protokolüne göre uygulanmıştır. Çalışma dönemi içinde katılımcı merkezlerin 15’inden, 65 invazif AGS suşu izole edilmiştir. İnvazif AGS izolasyon oranının bölgesel farklılıklar gösterdiği belirlenmiş, en yüksek izolasyonun Doğu Karadeniz (Trabzon; n= 19) bölgesinde olduğu, bunu İstanbul (n= 17) ve Batı Anadolu (Ankara, Konya; n= 14) bölgelerinin izlediği görülmüştür. İnvazif AGS enfeksiyonu tanısı konulan hastaların 33’ü kadın, 32’si erkek olup, yaş aralığı 0-89 yıl arasındadır. AGS suşlarının en fazla yumuşak doku (n= 18), apse (n= 10), steril vücut sıvısı (n= 8) ve kan (n= 7) örneklerinden izole edildiği gözlenmiştir. Serotiplendirme sonucunda 36 (%55) izolatın OF pozitif olduğu saptanmış; en sık saptanan T protein tipleri poligrup T (n= 20) ve U (n= 14) olmuş, bunları B (n= 5), X (n= 3) ve Y (n= 2) izlemiştir. Yirmi iki izolatta T proteini tespit edilememiştir. Genotiplendirme sonucunda izolatların 17 farklı emm tipine sahip olduğu saptanmış; en sık rastlanan tipler; emm1 (n= 13), emm4 (n= 6), emm6 (n= 6), emm12 (n= 6), emm24 (n= 4), emm14 (n= 3) ve emm28 6 (n= 3) olarak belirlenmiş, dokuz suş dizileme ile tiplendirilememiştir. İzolatların emm tipleri ile serotipleri arasındaki korelasyon %58 olarak bulunmuştur. Kullanımdaki 26 değerli aşının invazif AGS suşlarının %70.5’ini kapsadığı tespit edilmiştir. Sonuç olarak bu çalışmayla Türkiye’de invaziv AGS enfeksiyonlarının epidemiyolojik ve mikrobiyolojik özellikleriyle ilgili ilk veriler elde edilmiştir. İnvazif AGS enfeksiyon sıklığının ülkemizde düşük olduğu, 26 değerli ASG aşısının aşı programına dahil edilmesinin ülkemiz için şu anda acil halk sağlığı sorunu olmadığı ve eğer ülkemizde kullanılacaksa aşıya emm4 ve emm24 tiplerinin de eklenmesi gerektiği ortaya çıkmıştır.

Anahtar Kelime:

Konular: Biyoloji Mikrobiyoloji Viroloji

Epidemiology, clinical and microbiological characteristics of invasive streptococcal infections in Turkey, 2010-2011

Öz:

A one-year active surveillance study was conducted to investigate the epidemiological and microbiological characteristics of invasive group A streptococci (GAS) infections in Turkey and to provide data for the establishment of national preventive strategies related to invasive GAS infections. A total of 46 clinical microbiology laboratories from 12 different regions of Turkey (Istanbul; Eastern and Western Marmara; Eastern and Western Blacksea; Aegean; Mediterranean; Western, Central, Northeastern, Middle-eastern and Southeastern Anatolia) participated in the study. Accordingly, GAS strains isolated from sterile body sites (blood, cerebrospinal, synovial, pleural, peritoneal, pericardial fluids) in the study centers between June 2010-June 2011, were sent to Maltepe University Hospital Clinical Microbiology Laboratory for microbiological confirmation and further analysis. The isolates were identified by con- ventional methods, and for serotyping, opacity factor (OF) and T protein types were investigated. For genotyping GAS lysate preparation, emm gene amplification and sequencing were performed by using the protocols recommended by Centers for Disease Control and Prevention. A total of 65 invasive GAS strains were isolated in 15 of the participant centers, during the study period. The rate of invasive GAS isolation exhibited regional variation, with the highest rates in the Eastern Blacksea (Trabzon, n= 19), followed by Istanbul (n= 17) and Western Anatolia (Ankara, Konya, n= 14). Of the patients with invasive GAS infection 33 were female, 32 were male, with the age range of 0-89 years. GAS strains were most commonly isolated from soft tissue specimens (n= 18), followed by abscess material (n= 10), sterile body fluids (n= 8) and blood (n= 7) samples. Serotyping revealed that 55% (36/65) of the strains were OF positive, and the majority of T protein was polygroup T (n= 20), followed by U (n= 14), B (n= 5), X (n= 3) and Y (n= 2). T protein was not detected in 22 isolates. The strains were found to have 17 different emm types; emm1 (n= 13), emm4 (n= 6), emm6 (n= 6), emm12 (n= 6), emm24 (n= 4), emm14 (n= 3) 6 and emm28 (n= 3). Nine of the strains could not be typed by sequencing. The correlation between emm typing and serotyping was detected as 58%. It was observed that 26-valent vaccines included 70.5% of the invasive GAS strains included in this study. Our study provided initial data concerning the epidemio- logical properties of invasive GAS infections and characterization of GAS strains in Turkey. The incidence of invasive GAS infections is low in our country. Although immunization programme by 26-valent GAS vaccine is not currently an urgent public health issue for our country, the results of this study indicated that emm types 4 and 24 should better be included in such a vaccine to be used in Turkey. Additionally, since epidemiological features of GAS infections and the microbiological characteristics of the strains can vary by time, for the diagnosis of invasive streptococcal infections and to take the necessary preventive measures, epidemiological studies should be conducted repeatedly.

Anahtar Kelime:

Konular: Biyoloji Mikrobiyoloji Viroloji

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Bibliyografik

1. Stevens DL. Invasive group A streptococcal disease. Infect Agents Dis 1996; 5(3): 157-66.
2. Hoge CW, Schwartz B, Talkington DF, Breiman RF, MacNeill EM, Englender SJ. The changing epidemiology of invasive group A streptococcal infections and the emergence of streptococcal toxic shock-like syndrome. A retrospective population-based study. JAMA 1993; 269(3): 384-9.
3. O’Loughlin RE, Roberson A, Cieslak PR, et al. The epidemiology of invasive group A streptococcal infection and potential vaccine implications: United States, 2000-2004. Clin Infect Dis 2007; 45(7): 853-62.
4. O’Grady KA, Kelpie L, Andrews RM, et al. The epidemiology of invasive group A streptococcal disease in Victoria, Australia. Med J Aust 2007; 186(11): 565-9.
5. O’Brien KL, Beall B, Barrett NL, et al. Epidemiology of invasive group A streptococcus disease in the United States, 1995-1999. Clin Infect Dis 2002; 35(3): 268-76.
6. Courtney HS, Hasty DL, Dale JB. Anti-phagocytic mechanisms of Streptococcus pyogenes: binding of fibrino- gen to M-related protein. Mol Microbiol 2006; 59(3): 936-47.
7. Faclam RF, Martin DR, Lovgren M, et al. Extension of the Lancefield classification for group A streptococci by addition of 22 new M protein gene sequence types from clinical isolates: emm103 to emm124. Clin Infect Dis 2002; 34(1): 28-38.
8. Johnson DR, Kaplan EL, VanGheem A, Facklam RR, Beall B. Characterization of group A streptococci (Strep- tococcus pyogenes): correlation of M-protein and emm-gene type with T-protein agglutination pattern and serum opacity factor. J Med Microbiol 2006; 55(Pt 2): 157-64.
9. Luca-Harari B, Darenberg J, Neal S, et al. Clinical and microbiological characteristics of severe Streptococcus pyogenes disease in Europe. J Clin Microbiol 2009; 47(4): 1155-1165. s
10. Bayramoğlu G, Topkaya AE, Balıkcı A, Aydın F. Serotypes and antimicrobial susceptibilities of invasive group A streptococci identified in eastern Black Sea region of Turkey. Mikrobiyol Bul 2011; 45(3): 446-53.
11. Topkaya AE, Yildirim T, Arsan S. Isolation ratio and T- serotyping of group A streptococci from pediatric up- per respiratory tract infections in Turkey. Anadolu Kardiyol Derg 2005; 5(4): 302-4.
12. Breiman RF, Davis JP, Facklam RR, et al. Defining the group A streptococcal toxic shock syndrome. Rationale and consensus definition. The Working Group on Severe Streptococcal Infections. JAMA 1993; 269(3): 390-1.
13. Centers for Disease Control and Prevention. Streptococcus pyogenes emm sequence database. Identification of other Streptococcus Species: Streptococcus general methods. Available at: http://www.cdc.gov/ncidod/ biotech/strep/strep-doc/index.htm
14. Rehder CD, Johnson DR, Kaplan EL. Comparison of methods for obtaining serum opacity factor from group A streptococci. J Clin Microbiol 1995; 33(11): 2963-7.
15. Centers for Disease Control and Prevention. Streptococcus pyogenes emm sequence database. Protocol for emm typing. Available at: http://www.cdc.gov/ncidod/biotech/strep/protocol_emm-type.htm
16. Hollm-Delgado MG, Allard R, Pilon PA. Invasive group A streptococcal infections, clinical manifestations and their predictors, Montreal, 1995-2001. Emerg Infect Dis 2005; 11(1): 77-82.
17. Davies HD, McGeer A, Schwartz B, et al. Invasive group A streptococcal infections in Ontario, Canada. Ontario Group A Streptococcal Study Group. N Engl J Med 1996; 335(8): 547-54.
18. Thigpen MC, Richards CL Jr, Lynfield R, et al; Active Bacterial Core Surveillance/Emerging Infections Program Network. Invasive group A streptococcal infection in older adults in long-term care facilities and the community, United States,1998-2003. Emerg Infect Dis 2007; 13(12): 1852-9.
19. Demers B, Simor AE, Vellend H, et al. Severe invasive group A streptococcal infections in Ontario, Canada: 1987-1991. Clin Infect Dis 1993; 16(6): 792-800.
20. Centers for Disease Control and Prevention (CDC). Invasive group A streptococcal infections--United Kingdom, 1994. MMWR Morb Mortal Wkly Rep 1994; 43(21): 401-2.
21. Wahl RU, Lütticken R, Stanzel S, van der Linden M, Reinert RR. Epidemiology of invasive Streptococcus pyogenes infections in Germany, 1996-2002: results from a voluntary laboratory surveillance system. Clin Microbiol Infect 2007; 13(12): 1173-8.
22. Ekelund K, Skinhøj P, Madsen J, Konradsen HB. Reemergence of emm1 and a changed superantigen profile for group A streptococci causing invasive infections: results from a nationwide study. J Clin Microbiol 2005; 43(4): 1789-96.
23. Steer AC, Batzloff MR, Mulholland K, Carapetis JR. Group A streptococcal vaccines: facts versus fantasy. Curr Opin Infect Dis 2009; 22(6): 544-52.
24. Siljander T, Toropainen M, Muotiala A, Hoe NP, Musser JM, Vuopio-Varkila J. Emm typing of invasive T28 group A streptococci, 1995-2004, Finland. J Med Microbiol 2006; 55(Pt 12): 1701-6.
25. Arslan U, Oryaşın E, Eskin Z, et al. Distribution of emm genotypes and antibiotic susceptibility of Streptococ- cus pyogenes strains: analogy with the vaccine in development. Mikrobiyol Bul 2013; 47(2): 318-23.

APA	EREN TOPKAYA A, BALIKÇI A, Aydın F, HASÇELİK A, KAYMAN T, Kesli R, Aydemir S, AKYAR I, GÖKALP A, DÜNDAR G, Gürler N, PERÇİN D, FINDIK D, AVUNDUK H, Bayraktar B (2014). Türkiye’de invazif streptokok enfeksiyonlarının epidemiyolojisi, klinik ve mikrobiyolojik özellikleri, 2010-2011. , 1 - 13.
Chicago	EREN TOPKAYA AYNUR,BALIKÇI Ahmet,Aydın Faruk,HASÇELİK AYŞE GÜLŞEN,KAYMAN Tuba,Kesli Recep,Aydemir Sohret,AKYAR Işın,GÖKALP Aslı,DÜNDAR Günnur,Gürler Nezahat,PERÇİN Duygu,FINDIK Duygu,AVUNDUK Haluk,Bayraktar Banu Türkiye’de invazif streptokok enfeksiyonlarının epidemiyolojisi, klinik ve mikrobiyolojik özellikleri, 2010-2011. (2014): 1 - 13.
MLA	EREN TOPKAYA AYNUR,BALIKÇI Ahmet,Aydın Faruk,HASÇELİK AYŞE GÜLŞEN,KAYMAN Tuba,Kesli Recep,Aydemir Sohret,AKYAR Işın,GÖKALP Aslı,DÜNDAR Günnur,Gürler Nezahat,PERÇİN Duygu,FINDIK Duygu,AVUNDUK Haluk,Bayraktar Banu Türkiye’de invazif streptokok enfeksiyonlarının epidemiyolojisi, klinik ve mikrobiyolojik özellikleri, 2010-2011. , 2014, ss.1 - 13.
AMA	EREN TOPKAYA A,BALIKÇI A,Aydın F,HASÇELİK A,KAYMAN T,Kesli R,Aydemir S,AKYAR I,GÖKALP A,DÜNDAR G,Gürler N,PERÇİN D,FINDIK D,AVUNDUK H,Bayraktar B Türkiye’de invazif streptokok enfeksiyonlarının epidemiyolojisi, klinik ve mikrobiyolojik özellikleri, 2010-2011. . 2014; 1 - 13.
Vancouver	EREN TOPKAYA A,BALIKÇI A,Aydın F,HASÇELİK A,KAYMAN T,Kesli R,Aydemir S,AKYAR I,GÖKALP A,DÜNDAR G,Gürler N,PERÇİN D,FINDIK D,AVUNDUK H,Bayraktar B Türkiye’de invazif streptokok enfeksiyonlarının epidemiyolojisi, klinik ve mikrobiyolojik özellikleri, 2010-2011. . 2014; 1 - 13.
IEEE	EREN TOPKAYA A,BALIKÇI A,Aydın F,HASÇELİK A,KAYMAN T,Kesli R,Aydemir S,AKYAR I,GÖKALP A,DÜNDAR G,Gürler N,PERÇİN D,FINDIK D,AVUNDUK H,Bayraktar B "Türkiye’de invazif streptokok enfeksiyonlarının epidemiyolojisi, klinik ve mikrobiyolojik özellikleri, 2010-2011." , ss.1 - 13, 2014.
ISNAD	EREN TOPKAYA, AYNUR vd. "Türkiye’de invazif streptokok enfeksiyonlarının epidemiyolojisi, klinik ve mikrobiyolojik özellikleri, 2010-2011". (2014), 1-13.

APA	EREN TOPKAYA A, BALIKÇI A, Aydın F, HASÇELİK A, KAYMAN T, Kesli R, Aydemir S, AKYAR I, GÖKALP A, DÜNDAR G, Gürler N, PERÇİN D, FINDIK D, AVUNDUK H, Bayraktar B (2014). Türkiye’de invazif streptokok enfeksiyonlarının epidemiyolojisi, klinik ve mikrobiyolojik özellikleri, 2010-2011. Mikrobiyoloji Bülteni, 48(1), 1 - 13.
Chicago	EREN TOPKAYA AYNUR,BALIKÇI Ahmet,Aydın Faruk,HASÇELİK AYŞE GÜLŞEN,KAYMAN Tuba,Kesli Recep,Aydemir Sohret,AKYAR Işın,GÖKALP Aslı,DÜNDAR Günnur,Gürler Nezahat,PERÇİN Duygu,FINDIK Duygu,AVUNDUK Haluk,Bayraktar Banu Türkiye’de invazif streptokok enfeksiyonlarının epidemiyolojisi, klinik ve mikrobiyolojik özellikleri, 2010-2011. Mikrobiyoloji Bülteni 48, no.1 (2014): 1 - 13.
MLA	EREN TOPKAYA AYNUR,BALIKÇI Ahmet,Aydın Faruk,HASÇELİK AYŞE GÜLŞEN,KAYMAN Tuba,Kesli Recep,Aydemir Sohret,AKYAR Işın,GÖKALP Aslı,DÜNDAR Günnur,Gürler Nezahat,PERÇİN Duygu,FINDIK Duygu,AVUNDUK Haluk,Bayraktar Banu Türkiye’de invazif streptokok enfeksiyonlarının epidemiyolojisi, klinik ve mikrobiyolojik özellikleri, 2010-2011. Mikrobiyoloji Bülteni, vol.48, no.1, 2014, ss.1 - 13.
AMA	EREN TOPKAYA A,BALIKÇI A,Aydın F,HASÇELİK A,KAYMAN T,Kesli R,Aydemir S,AKYAR I,GÖKALP A,DÜNDAR G,Gürler N,PERÇİN D,FINDIK D,AVUNDUK H,Bayraktar B Türkiye’de invazif streptokok enfeksiyonlarının epidemiyolojisi, klinik ve mikrobiyolojik özellikleri, 2010-2011. Mikrobiyoloji Bülteni. 2014; 48(1): 1 - 13.
Vancouver	EREN TOPKAYA A,BALIKÇI A,Aydın F,HASÇELİK A,KAYMAN T,Kesli R,Aydemir S,AKYAR I,GÖKALP A,DÜNDAR G,Gürler N,PERÇİN D,FINDIK D,AVUNDUK H,Bayraktar B Türkiye’de invazif streptokok enfeksiyonlarının epidemiyolojisi, klinik ve mikrobiyolojik özellikleri, 2010-2011. Mikrobiyoloji Bülteni. 2014; 48(1): 1 - 13.
IEEE	EREN TOPKAYA A,BALIKÇI A,Aydın F,HASÇELİK A,KAYMAN T,Kesli R,Aydemir S,AKYAR I,GÖKALP A,DÜNDAR G,Gürler N,PERÇİN D,FINDIK D,AVUNDUK H,Bayraktar B "Türkiye’de invazif streptokok enfeksiyonlarının epidemiyolojisi, klinik ve mikrobiyolojik özellikleri, 2010-2011." Mikrobiyoloji Bülteni, 48, ss.1 - 13, 2014.
ISNAD	EREN TOPKAYA, AYNUR vd. "Türkiye’de invazif streptokok enfeksiyonlarının epidemiyolojisi, klinik ve mikrobiyolojik özellikleri, 2010-2011". Mikrobiyoloji Bülteni 48/1 (2014), 1-13.