Molecular Characterization of Some Turkish Olive Cultivars Using Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) Markers

Ergun KAYA, (Muğla Sıtkı Koçman Üniversitesi, Fen Fakültesi, Moleküler Biyoloji Genet, Muğla, Türkiye)
Emel GÖKDOĞAN YILMAZ (Muğla Sıtkı Koçman Üniversitesi, Fen Fakültesi, Biyoloji Bölümü, Muğla, Türkiye)
Süleyman Demirel Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi
1 0
Yıl: 2015 Cilt: 19 Sayı: 1 Sayfa Aralığı: 103 - 106 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 29-07-2022

Molecular Characterization of Some Turkish Olive Cultivars Using Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) Markers

Öz:
Zeytin (Olea europea L.), Akdeniz Bölgesine özgü en eski kültür bitkilerinden biridir ve bölgede yağ verimi sağlayan en önemli üründür. Kültür zeytini (O. europaea L. var. europaea), tohumla çoğaltılan yabani zeytin (O. europaea L. var. sylvestris)in çeliklenmesi ya da aşılanması ile yetiştirilir. Her iki zeytin çeşidi de kendi içlerinde tozlaşabilmekte ve pek çok sayıda varyete oluşumuna yola açabilmektedir. Zeytinde morfolojik tanılar, çok sayıda sinonim ve homonim içermesi, etiketleme hataları, varyasyonel klonlar ve günümüze kadar yapılmış net olmayan tanılar nedeniyle tam anlamıyla güvenilir değildir. Rastgele çoğaltılmış polimorfik DNA (RAPD) gibi moleküler markörler, çevreden bağımsız ve zeytin çeşitlerinin tanısında, sinonim ve homonimlerin belirlenmesinde oldukça etkilidir. Bu çalışmada seçilen onbeş adet RAPD markör primeri, dört önemli Türk kültür çeşidine ait yirmi bireyin aralarındaki akrabalık düzeylerini belirlemek amacıyla kullanılmıştır. Elde ettiğimiz sonuçlar RAPD markörlerin zeytin kültür çeşitlerindeki farklılıkları ortaya çıkarmak için kullanılabileceğini göstermiştir.
Anahtar Kelime:

Rastgele Çoğaltılmış Polimorfik DNA (RAPD) Markörler Kullanılarak Bazı Türk Zeytin Çeşitlerinin Moleküler Karakterizasyonu

Öz:
Abstract: Olive (Olea europea L.) is one of the oldest cultivated plants characteristic in the Mediterranean area, where it is the most important oilproducing crop. The cultivated olive (O. europaea L. var. europaea) is propagated by cutting or grafting, whereas wild olive (O. europaea L. var. sylvestris) is reproduced from seeds. These two olive types are interfertile and have led to a large number of varieties. Morphological descriptions are not entirely reliable, due to numerous synonyms and homonyms in designations, labelling mistakes, the presence of varietal clones, and the uncertain identification methods thus far applied. Molecular markers, as random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers, are environment-independent and efficient to identify olive varieties and to detect synonymous and homonymous. In this study, fifteen selected RAPD markers are used for determination of relationships among twenty individuals belonging to four important Turkish olive cultivars. Our results showed that RAPD markers can be used to differentiate olive cultivars.
Anahtar Kelime:

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık
  • Angiolillo, A., Mencuccini, M., Baldoni, L. 1999. Olive genetic diversity assessed using amplified fragment length polymorphisms. Theor. Appl. Genet. 98, 411– 421.
  • Bartolini, G., Prevost, G., Messeri, C., Carignani, G. 2005. Olive germplasm: cultivars and word-wide collections. Seed and Plant Genetic Resources Service AGPS.http://www.apps3.fao.org/wiews/olive/oliv.js
  • Belaj, A., Trujillo, I., de la Rosa, R., Rallo, L., Giménez, M.J., 2001. Polymorphism and discriminating capacity of randomly amplified polymorphic markers in an olive germplasm bank. J. Am. Soc. Hort. Sci., 126:64– 71.
  • Besnard, G., Baradat, P., Berville, A. 2001. Genetic relationships in the olive (Olea europaea L.) reflect multilocal selection of cultivars. Theor. Appl. Genet., 102, 251–258.
  • Bronzini de Caraffa, V., J. Maury, C. Gambotti, C. Breton, A. BerviM, Giannettini, J. 2002. Mitochondrial DNA variation and RAPD mark oleasters, olive and feral olive from Western and Eastern Mediterranean. Theor Appl. Genet; 104, 1209-1216.
  • Diaz, A., Martin, A., Rallo, P., Barranco, D., De la Rosa, R. 2006a. Selfincompatibility of ‘Arbequina’ and ‘Picual’ olive assessed by SSR markers. J. Am. Soc. Hortic. Sci. 131, 250–255.
  • Diaz, A., Martin, A., Rallo, P., De la Rosa, R. 2006b. Selfand crossincompatibility mechanisms: a strategy to ensure a great variability in olive (Olea europaea L.) populations. Olea 25, 29–33.
  • Doyle, J.J., Doyle, J.L. 1987. A rapid DNA isolation procedure from small quantities of fresh leaf tissue. Phytochemical. Bull. 19, 11–15.
  • Fabbri, A., Hormaza, J.I., Polito, V.S. 1995. RandomamplifiedpolymorphicDNA analysis of olive (Olea europaea L.) cultivars. J. Am. Soc. Hort. Sci., 120, 538–542.
  • Green, P.S. 2002. A revision of Olea L. (Oleaceae). Kew Bull. 57, 91–140.
  • Hess, J., Kadereit, J.W., Vargas, P. 2000. The colonization history of Olea europaea L. in Macaronesia based on internal transcribed spacer 1 (ITS-1) sequences, randomly amplified polymorphis DNAs (RAPD), and intersimple sequence repeats (ISSR). Molecular Ecology, Vol.9, pp. 857–868.
  • Martins-Lopes, P., Lima-Brito, J., Gomes, S., Meirinhos, J., Santos, L., Guedes-Pinto H. 2007. RAPD and ISSR molecular markers in Olea europaea L.: Genetic variability and molecular cultivar identification. Genetic Resources and Crop Evolution, 54:117–128.
  • Rallo, P., Dorado, G., Martin, A. 2000. Development of simple sequence repeats (SSRs) in the olive tree (Olea europaea L.). Theor Appl Genet 101:984–989.
  • Rugini, E., Lavee, S. 1992. Olive. In: Hammerschlag, F.A., Litz, R.E. (eds) Biotechnology of Perennial Fruit Crops. CAB Int., Wellingford, UK, pp. 371–382.
  • Sanz-Cortés, F., Badenes, M.L., Paz, S., Iñiguez, A., Llácer, G. 2001. Molecular characterization of olive cultivars using RAPD markers. J. Am. Soc. Hort. Sci. 126:7–12.
  • Wiesman, Z., Avidan, N., Lavee, S., Quebedeaux, B. 1998. Molecular characterization of common olive varieties in Israel and the West bank using randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) markers. J. Am. Soc. Hort. Sci., 123:837–841.
  • Williams, J.G.K., Kubelik, A.R., Livak, K.J., Rafalski, J.A., Tingey, S.V. 1990. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers. Nucleic Acids Res. 18: 6531–6535.
  • Zohary, D., Hopf, M. 1994. Domestication of plants in the Old World, 2nd edn. Clarendon Press, Oxford, UK.
APA Kaya E, GÖKDOĞAN YILMAZ E (2015). Molecular Characterization of Some Turkish Olive Cultivars Using Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) Markers. , 103 - 106.
Chicago Kaya Ergun,GÖKDOĞAN YILMAZ Emel Molecular Characterization of Some Turkish Olive Cultivars Using Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) Markers. (2015): 103 - 106.
MLA Kaya Ergun,GÖKDOĞAN YILMAZ Emel Molecular Characterization of Some Turkish Olive Cultivars Using Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) Markers. , 2015, ss.103 - 106.
AMA Kaya E,GÖKDOĞAN YILMAZ E Molecular Characterization of Some Turkish Olive Cultivars Using Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) Markers. . 2015; 103 - 106.
Vancouver Kaya E,GÖKDOĞAN YILMAZ E Molecular Characterization of Some Turkish Olive Cultivars Using Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) Markers. . 2015; 103 - 106.
IEEE Kaya E,GÖKDOĞAN YILMAZ E "Molecular Characterization of Some Turkish Olive Cultivars Using Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) Markers." , ss.103 - 106, 2015.
ISNAD Kaya, Ergun - GÖKDOĞAN YILMAZ, Emel. "Molecular Characterization of Some Turkish Olive Cultivars Using Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) Markers". (2015), 103-106.
APA Kaya E, GÖKDOĞAN YILMAZ E (2015). Molecular Characterization of Some Turkish Olive Cultivars Using Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) Markers. Süleyman Demirel Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi, 19(1), 103 - 106.
Chicago Kaya Ergun,GÖKDOĞAN YILMAZ Emel Molecular Characterization of Some Turkish Olive Cultivars Using Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) Markers. Süleyman Demirel Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi 19, no.1 (2015): 103 - 106.
MLA Kaya Ergun,GÖKDOĞAN YILMAZ Emel Molecular Characterization of Some Turkish Olive Cultivars Using Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) Markers. Süleyman Demirel Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi, vol.19, no.1, 2015, ss.103 - 106.
AMA Kaya E,GÖKDOĞAN YILMAZ E Molecular Characterization of Some Turkish Olive Cultivars Using Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) Markers. Süleyman Demirel Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi. 2015; 19(1): 103 - 106.
Vancouver Kaya E,GÖKDOĞAN YILMAZ E Molecular Characterization of Some Turkish Olive Cultivars Using Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) Markers. Süleyman Demirel Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi. 2015; 19(1): 103 - 106.
IEEE Kaya E,GÖKDOĞAN YILMAZ E "Molecular Characterization of Some Turkish Olive Cultivars Using Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) Markers." Süleyman Demirel Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi, 19, ss.103 - 106, 2015.
ISNAD Kaya, Ergun - GÖKDOĞAN YILMAZ, Emel. "Molecular Characterization of Some Turkish Olive Cultivars Using Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) Markers". Süleyman Demirel Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi 19/1 (2015), 103-106.
Sayfa Oluşturulma Tarihi
22-04-2024 22:36

İLETİŞİM

TÜBİTAK ULAKBİM TR Dizin

Yüzüncüyıl, İşçi Blokları Mahallesi

Muhsin Yazıcıoğlu Caddesi No:51/C

06530 Çankaya / ANKARA +90 (312) 298 92 00

trdizin@tubitak.gov.tr

TÜBİTAK ULAKBİM Ulusal Akademik Ağ ve Bilgi Merkezi Cahit Arf Bilgi Merkezi © Tüm Hakları Saklıdır. Gizlilik Politikası Kullanım Şartları