Bazı Inocybe (Fr.) Fr. Taksonlarının Morfolojik ve Moleküler Yöntemlerle Karakterizasyonu
Yıl: 2017 Cilt: 21 Sayı: 2 Sayfa Aralığı: 659 - 665 Metin Dili: Türkçe DOI: 10.19113/sdufbed.89543 İndeks Tarihi: 23-11-2018
Bazı Inocybe (Fr.) Fr. Taksonlarının Morfolojik ve Moleküler Yöntemlerle Karakterizasyonu
Öz: Dünyada birçok ekosistemde yayılış gösteren Inocybe, cins düzeyinde teşhisi kolay olmasına rağmen, morfolojik özelliklerinin birbirine yakın olmasından dolayı, tür düzeyinde tayini zaman alabilmektedir. Bu nedenle, Inocybe cinsi son yıllardaki moleküler tekniklerdeki gelişmelerin etkisiyle filogenetik olarak değerlendirilmektedir. Yapılan filogenetik analizler, cins içindeki taksonomik problemlerin ortadan kaldırılabilmesi için kullanışlı veriler sunmaktadır. Bu kapsamda, Kütahya yöresinden toplanan Inocybe örneklerinin morfolojik ve moleküler analizi yapılarak cins içindeki filogenetik pozisyonlarının belirlenmesi amaçlanmıştır. Bunun için, örneklerin ITS bölgesinin sekansları çıkartılmış, GenBank’tan alınan diğer sekanslarla karşılaştırılarak analiz edilmiştir. Yapılan morfolojik ve filogenetik analizler sonucunda, araştırma bölgesinden I. calida, I. cervicolor ve I. rimosa taksonları belirlenmiştir. Ayrıca, bu taksonların yer aldığı Cervicolores, Marginatae ve Rimosa seksiyonları filogenetik olarak değerlendirilmiş ve türler arasındaki morfolojik farklılıklar incelenmiştir.
Anahtar Kelime: Konular:
Characterization of Some Inocybe (Fr.) Fr. Taxa Based on Morphological and Molecular Methods
Öz: Inocybe is a fungi genus widespread in the world ecosystems and relatively easy to be identified at the genus level; however species identification for this genus is at times may take time due to close similarities in morphological characteristics among some of the species. For this reason, the genus Inocybe has also been continuously evaluated phylogenetically by taking advantage of the developments in molecular approaches in recent years. The phylogenetic analyzes provide useful inputs to tackle taxonomic problems within the genus. In this context, we aim to conduct morphological and molecular analyzes of Inocybe samples collected from Kütahya region to determine phylogenetic positions in the genus. Towards this goal, ITS regions of the samples were sequenced and compared with the other sequences obtained from GenBank. As a result of the morphological and phylogenetic analyzes performed, I. calida, I. cervicolor and I. rimosa taxa were identified from the study area. Furthermore, the Cervicolores, Marginatae and Rimosa sections of these taxa were phylogenetically evaluated and the morphological differences between the species are discussed.
Anahtar Kelime: Konular:
Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık
- Kimura, M. 1980. A Simple Method for Estimating Evolutionary Rate of Base Substitutions Through Comparative Studies of Nucleotide Sequences. Journal of Molecular Evolution, 16, 111–120.
- Tamura, K., Stecher, G., Peterson, D.I., Filipski, A., Kumar, S. 2013. MEGA 6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 6.0. Molecular Biology and Evolution 30, 2725–2729.
- White, T. J., Bruns, T. D., Lee, S. B., Taylor, J.W. 1990. Amplification and Direct Sequencing of Fungal Ribosomal RNA Genes for Phylogenetics. Innis, M.A., Gelfand, D.H., Sninsky, J.J., White, T.J. ed. 1990. PCR Protocols–A Guide to Methods and Applications, Academic Press, San Diego.
- Ryberg, M., Nilsson, R.H., Kristianson, E., Töpel, M., Jacobsson, S., Larsson, E. 2008. Mining Metadata from Unidentified ITS Sequences in GenBank: A Case Study in Inocybe (Basidiomycota), BMC Evolutionary Biology, 8, 50–64.
- Latha, K.P., Manimohan, P., Matheny, P.B, 2016. A new species of Inocybe representing the Nothocybe lineage. Phytotaxa 267(1):40-50
- Larsson, E., Ryberg, M., Moreau, P.A., Mathiesen, A.D., Jacobsson, S. 2009. Taxonomy and Evolutionary Relationships within Species of Section Rimosae (Inocybe) Based on ITS, LSU and mtSSU Sequence Data. Persoonia, 23, 86–98.
- Mathaney, P.B. 2005. Improving phylogenetic Inference of Mushrooms with RPB1 and RPB2 Nucleotide Sequences (Inocybe; Agaricales). Molecular Phylogenetics and Evolution 35, 1–20.
- Seress, D., Dima, B., Kovács, G.M. 2015. Characterisation of Seven Inocybe Ectomycorrhizal Morphotypes from a Semiarid Woody Steppe. Mycorrhiza, 26, 215–225.
- Kuyper, T.W. 1986. A Revision of the Genus Inocybe in Europe. Persoonia, Suppl. Vol. 3. (1986), 1- 247.
- Jacobsson, S. 2008. Inocybe (Fr.) Fr. ss 868–906. Knudsen, H., Vesterholt, J., ed. 2008. Funga Nordica, Agaricoid, Boletoid and Cyphelloid Genera, Nordswamp, Copenhagen.
- Solak, M.H., Işıloğlu, M., Kalmış, E., Allı, H. 2015. Macrofungi of Turkey, Checklist Vol. 2. Üniversiteliler Ofset, İzmir.
- Solak, M.H., Işıloğlu, M., Kalmış, E., Allı, H. 2007. Macrofungi of Turkey, Checklist Vol. 1. Genç Üniversiteliler Ofset, İzmir.
- Kirk, P.M., Cannon, P.F., Minter D.W., Stalpers J.A. 2008. Dictionary of the Fungi, 10th Edition. CABI, Wallingford.
- Matheny, P.B., Aime, M.C., Bougher, N.L., Buyck, B., Desjardin, D.E., Horak, E., Kropp, B.R., Lodge, D.J., Soytong, K., Trappe, J.M., Hibbett, D.S. 2009. Out of the Palaeotropics? Historical Biogeography and Diversification of the Cosmopolitan Ectomycorrhizal Mushroom Family Inocybaceae. Journal of Biogeography, 36, 577-592.
| APA | ÇÖL B, ŞEN İ, ALLI H, HAS G, TIRPAN E (2017). Bazı Inocybe (Fr.) Fr. Taksonlarının Morfolojik ve Moleküler Yöntemlerle Karakterizasyonu. , 659 - 665. 10.19113/sdufbed.89543 |
| Chicago | ÇÖL Bekir,ŞEN İSMAİL,ALLI HAKAN,HAS Gökçe,TIRPAN Ezgin Bazı Inocybe (Fr.) Fr. Taksonlarının Morfolojik ve Moleküler Yöntemlerle Karakterizasyonu. (2017): 659 - 665. 10.19113/sdufbed.89543 |
| MLA | ÇÖL Bekir,ŞEN İSMAİL,ALLI HAKAN,HAS Gökçe,TIRPAN Ezgin Bazı Inocybe (Fr.) Fr. Taksonlarının Morfolojik ve Moleküler Yöntemlerle Karakterizasyonu. , 2017, ss.659 - 665. 10.19113/sdufbed.89543 |
| AMA | ÇÖL B,ŞEN İ,ALLI H,HAS G,TIRPAN E Bazı Inocybe (Fr.) Fr. Taksonlarının Morfolojik ve Moleküler Yöntemlerle Karakterizasyonu. . 2017; 659 - 665. 10.19113/sdufbed.89543 |
| Vancouver | ÇÖL B,ŞEN İ,ALLI H,HAS G,TIRPAN E Bazı Inocybe (Fr.) Fr. Taksonlarının Morfolojik ve Moleküler Yöntemlerle Karakterizasyonu. . 2017; 659 - 665. 10.19113/sdufbed.89543 |
| IEEE | ÇÖL B,ŞEN İ,ALLI H,HAS G,TIRPAN E "Bazı Inocybe (Fr.) Fr. Taksonlarının Morfolojik ve Moleküler Yöntemlerle Karakterizasyonu." , ss.659 - 665, 2017. 10.19113/sdufbed.89543 |
| ISNAD | ÇÖL, Bekir vd. "Bazı Inocybe (Fr.) Fr. Taksonlarının Morfolojik ve Moleküler Yöntemlerle Karakterizasyonu". (2017), 659-665. https://doi.org/10.19113/sdufbed.89543 |
| APA | ÇÖL B, ŞEN İ, ALLI H, HAS G, TIRPAN E (2017). Bazı Inocybe (Fr.) Fr. Taksonlarının Morfolojik ve Moleküler Yöntemlerle Karakterizasyonu. Süleyman Demirel Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi, 21(2), 659 - 665. 10.19113/sdufbed.89543 |
| Chicago | ÇÖL Bekir,ŞEN İSMAİL,ALLI HAKAN,HAS Gökçe,TIRPAN Ezgin Bazı Inocybe (Fr.) Fr. Taksonlarının Morfolojik ve Moleküler Yöntemlerle Karakterizasyonu. Süleyman Demirel Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi 21, no.2 (2017): 659 - 665. 10.19113/sdufbed.89543 |
| MLA | ÇÖL Bekir,ŞEN İSMAİL,ALLI HAKAN,HAS Gökçe,TIRPAN Ezgin Bazı Inocybe (Fr.) Fr. Taksonlarının Morfolojik ve Moleküler Yöntemlerle Karakterizasyonu. Süleyman Demirel Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi, vol.21, no.2, 2017, ss.659 - 665. 10.19113/sdufbed.89543 |
| AMA | ÇÖL B,ŞEN İ,ALLI H,HAS G,TIRPAN E Bazı Inocybe (Fr.) Fr. Taksonlarının Morfolojik ve Moleküler Yöntemlerle Karakterizasyonu. Süleyman Demirel Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi. 2017; 21(2): 659 - 665. 10.19113/sdufbed.89543 |
| Vancouver | ÇÖL B,ŞEN İ,ALLI H,HAS G,TIRPAN E Bazı Inocybe (Fr.) Fr. Taksonlarının Morfolojik ve Moleküler Yöntemlerle Karakterizasyonu. Süleyman Demirel Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi. 2017; 21(2): 659 - 665. 10.19113/sdufbed.89543 |
| IEEE | ÇÖL B,ŞEN İ,ALLI H,HAS G,TIRPAN E "Bazı Inocybe (Fr.) Fr. Taksonlarının Morfolojik ve Moleküler Yöntemlerle Karakterizasyonu." Süleyman Demirel Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi, 21, ss.659 - 665, 2017. 10.19113/sdufbed.89543 |
| ISNAD | ÇÖL, Bekir vd. "Bazı Inocybe (Fr.) Fr. Taksonlarının Morfolojik ve Moleküler Yöntemlerle Karakterizasyonu". Süleyman Demirel Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi 21/2 (2017), 659-665. https://doi.org/10.19113/sdufbed.89543 |
