Viridans streptokokların laboratuvar tanısında klasik ve yeni yaklaşımlar

ERGİN, MUSTAFA ALPER

Viridans streptokokların laboratuvar tanısında klasik ve yeni yaklaşımlar

MUSTAFA ALPER ERGİN (Hacettepe Üniversitesi, Sağlık Hizmetleri Meslek Yüksek Okulu Tıbbi Laboratuvar Programı, Ankara, Türkiye)

Mikrobiyoloji Bülteni

47 0

Yıl: 2010 Cilt: 44 Sayı: 3 Sayfa Aralığı: 495 - 503 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 29-07-2022

Viridans streptokokların laboratuvar tanısında klasik ve yeni yaklaşımlar

Öz:

Viridans grubu streptokoklar (VGS), koyun kanlı agarda alfa-hemolitik koloniler oluşturan, gram-pozitif kok şeklinde mikroorganizmalardır. Oral kavitede, üst solunum yollarında, gastrointestinal sistemde, ürogenital bölgede ve deride normal flora olarak yer alırlar. Diş ile ilgili girişimlerden sonra bakteriyemi, endokardit, menenjit ve septisemi yapabilirler. Taksonomik sınıflandırılmaları ve tür isimlerinin değişmesi nedeniyle VGS’lerin tanımlanması güçlük yaratmaktadır. Biyokimyasal reaksiyonlar ve 16S rDNA dizilerine göre VGS’ler 5 grupta (Sanguinis, Mitis, Mutans, Salivarius, Anginosus) incelenmektedir. Mitis grubunda Streptococcus pneumoniae’nın yer alması, bu gruptaki VGS’ler ile ilgili çalışmaları önemli kılmıştır. Aynı anatomik bölgede yer aldıkları için, Streptococcus mitis, Streptococcus oralis ve S.pneumoniae arasında gen alışverişi, transformasyon ve lizis mekanizması ile her zaman devam etmektedir. Bu mekanizmalar kapsül ve antibiyotik direnç genlerinin değişiminde önemli rol oynamaktadır. VGS’lerin tanımlanmasında kültür yöntemi ilk basamak olup, çeşitli hasta örneklerinin koyun kanlı besiyerine ekilmesi ve burada özellikle alfa-hemolitik koloniler görülmesiyle ileri incelemeler başlamaktadır. Gram-pozitif kokların mikroskopta görülmesi, istisnalar olsa da optokine dirençli ve safrada çözünmeyen koloniler, ileri tanımlama için ipuçları vermektedir. Daha sonra biyokimyasal testler, otomatize tanı sistemleri ve moleküler yöntemlerle VGS izolatlarının tür adı konulmaktadır. VGS tanı basamakları, gittikçe artan penisilin ve eritromisin direnci nedeniyle antibiyotik duyarlılık testleriyle son bulmaktadır. Bu derleme yazıda, VGS’lerin sınıflandırılması, mitis grubu streptokokların S.pneumoniae ile olan benzerliklerinin ve viridans streptokokların laboratuvar tanı yöntemlerinin irdelenmesi amaçlanmıştır.

Anahtar Kelime:

Konular: Mikrobiyoloji

Classical and new approaches in laboratory diagnosis of viridans streptococci

Öz:

Viridans group streptococci (VGS) are gram-positive microorganisms that can form alpha-hemolytic colonies on sheep blood agar. They reside as normal flora in oral cavity, respiratory, gastrointestinal, urogenital tract and on skin. They can cause bacteremia, endocarditis, meningitis and septicemia following dental procedures. The diagnosis of VGS are difficult since the taxonomic classification and species names may change due in time. Viridans group streptococci are classified into 5 groups (Sanguinis, Mitis, Mutans, Salivarius, Anginosus) according to biochemical reactions and 16S rRNA sequencing. Since Streptococcus pneumoniae is a member of the Mitis group, the other important species in this group deserves investigation. Genetic exchange between Streptococcus mitis, Streptococcus oralis and S.pneumoniae by transformation and lysis mechanisms occur continously as they share the same anatomical region. These mechanisms play role in exchanging capsular and antibiotic resistance genes between these species. The cultivation of VGS usually starts with the inoculation of various patient specimens into sheep blood agar and the detection of alpha-hemolytic colonies. Observation of gram-positive cocci microscopically, the detection of optochin-resistant and bile insoluble colonies with few exceptions are the further important steps in laboratory diagnosis. VGS are then identified at species level by using biochemical reactions, automated diagnostic systems and molecular methods. The last step in the laboratory diagnosis of VGS is antibiotic susceptibility testing which is of outmost importance as penicillin and erythromycin resistance are on rise. In this review article, classification of VGS, similarities between S.pneumoniae and Mitis group streptococci and the laboratory diagnosis of VGS have been discussed.

Anahtar Kelime:

Konular: Mikrobiyoloji

Belge Türü: Makale Makale Türü: Derleme Erişim Türü: Bibliyografik

1. Shenep JL. Viridans-group streptococcal infections in immunocompromised hosts. Int J Antimicrob Agents 2000; 14: 129-35.
2. Bruckner L, Gigliotti F. Viridans group streptococcal infections among children with cancer and the importance of emerging antibiotic resistance. Semin Pediatr Infect Dis 2006; 17: 153-60.
3. Paganini H, Staffolani V, Zubizerrata P, et al. Viridans streptococci bacteremia in children with fever and neutropenia: a case-control study of predisposing factors. Eur J Cancer 2003; 39: 1284-9.
4. Facklam R. What happened to the streptococci: overview of taxonomic and nomenclature changes. Clin Microbiol Rev 2002; 15: 613-30.
5. Balsalobre L, Hernandez-Madrid A, Llull D, et al. Molecular characterization of disease-associated streptococci of the mitis group that are optochin susceptible. J Clin Microbiol 2006; 44: 4163-71.
6. Kilian M, Poulsen K, Blomqvist T, et al. Evolution of Streptococcus pneumoniae and its close commensal relatives. PLoS One 2008; 3: e2683.
7. Arbique JC, Poyart C, Trieu-Cuot P, et al. Accuracy of phenotypic and genotypic testing for identification of Streptococcus pneumoniae and description of Streptococcus pseudopneumoniae sp. nov. J Clin Microbiol 2004; 42: 4686-96.
8. Berkiten R. Streptococcus pneumoniae: Klasik ve moleküler tanıda karşılaşılan sorunlar. ANKEM 2006; 20:180-6.
9. Kiratisin P. The role of gene analysis for species determination of viridans streptococci. Clin Microbiol Newsletter 2003; 25: 169-73.
10. Johnson CC, Tunkel AR. Viridans streptococci, Groups C and G streptococci and Gemella morbillorum, pp: 2433-40. In: Mandell GL, Bennett JE, Dolin R (eds), Mandell, Douglas anBennett’s Principles and Practice of Infectious Diseases. 2005, 6th ed. Churchill Livingstone, Philadelphia.
11. Donay JL, Mathieu D, Fernandes P, et al. Evaluation of the automated Phoenix system for potential routine use in the clinical microbiology laboratory. J Clin Microbiol 2004; 42: 1542-6.
12. Brigante G, Luzzaro F, Bettaccini A, et al. Use of the Phoenix automated system for identification of Streptococcus and Enterococcus spp. J Clin Microbiol 2006; 44: 3263-7.
13. Gavin PJ, Warren JR, Obias AA, Collins SM, Peterson LR. Evaluation of the Vitek 2 system for rapid identification of clinical isolates of gram-negative bacilli and members of the family Streptococcaceae. Eur J Clin Microbiol Infect Dis 2002; 21: 869-74.
14. Garnier F, Gerbaud G, Courvalin P, Galimand M. Identification of clinically relevant viridans group streptococci to the species level by PCR. J Clin Microbiol 1997; 35: 2337-41.
15. Teng LJ, Hsueh PR, Tsai JC, et al. groESL sequence determination, phylogenetic analysis, and species differentiation for viridans group streptococci. J Clin Microbiol 2002; 40: 3172-8.
16. Poyart C, Quesne G, Coulon S, Berche P, Trieu-Cuot P. Identification of streptococci to species level by sequencing the gene encoding the manganese-dependent superoxide dismutase. J Clin Microbiol 1998; 36: 41-7.
17. Kiratisin P, Li L, Murray P, Fischer SH. Use of housekeeping gene sequencing for species identification of viridans streptococci. Diagn Microbiol Infect Dis 2005; 51: 297-301.
18. Simmon KE, Hall L, Woods WC, et al. Phylogenetic analysis of viridans group streptococci causing endocarditis. J Clin Microbiol 2008; 46: 3087-90.
19. Clinical and Laboratory Standards Institute. Performance standards for antimicrobial susceptibility testing. 18th Informational Supplement. M100-S18. 2008. CLSI, Wayne, PA.
20. Ondrusova A, Liskova A, Miklosko J, et al. Resistance to penicillin and erythromycin in viridans streptococcal bloodstream isolates from cancer and non-cancer patients within 10 years. Infect Control Hosp Epidemiol 2004; 25: 365-7.
21. Smith A, Jackson MS, Kennedy H. Antimicrobial susceptibility of viridans group streptococcal blood isolates to eight antimicrobial agents. Scand J Infect Dis 2004; 36: 259-63.
22. Lyytikainen O, Rautio M, Carlson P, et al. Nosocomial bloodstream infections due to viridans streptococci in haematological and non-haematological patients: species distribution and antimicrobial resistance. J Antimicrob Chemother 2004; 53: 631-4.
23. Potgieter E, Carmicheal M, Koornhof HJ, Chalkley LJ. In vitro antimicrobial susceptibility of viridans streptococci isolated from blood cultures. Eur J Clin Microbiol Infect Dis 1992; 11: 543-6.
24. Ergin A, Ercis S, Hasçelik G. Macrolide resistance mechanisms and in vitro susceptibility patterns of viridans group streptococci isolated from blood cultures. J Antimicrob Chemother 2006; 57: 139-41.
25. Paulus S, Dobson S, Rassekh S, Blondel-Hill E. In vitro inferiority of ceftazidime compared with other betalactams for viridans group Streptococcus bacteremia in pediatric oncology patients. J Pediatr Hematol Oncol 2009; 31: 267-9.
26. Brown DFJ, Hope R, Livermore D, et al. Non-susceptibility trends among enterococci and non-pneumococcal streptococci from bacteraemias in the UK and Ireland, 2001-06. J Antimicrob Chemother 2008; 62 (Suppl 2): ii75-85.

APA	ERGİN M (2010). Viridans streptokokların laboratuvar tanısında klasik ve yeni yaklaşımlar. , 495 - 503.
Chicago	ERGİN MUSTAFA ALPER Viridans streptokokların laboratuvar tanısında klasik ve yeni yaklaşımlar. (2010): 495 - 503.
MLA	ERGİN MUSTAFA ALPER Viridans streptokokların laboratuvar tanısında klasik ve yeni yaklaşımlar. , 2010, ss.495 - 503.
AMA	ERGİN M Viridans streptokokların laboratuvar tanısında klasik ve yeni yaklaşımlar. . 2010; 495 - 503.
Vancouver	ERGİN M Viridans streptokokların laboratuvar tanısında klasik ve yeni yaklaşımlar. . 2010; 495 - 503.
IEEE	ERGİN M "Viridans streptokokların laboratuvar tanısında klasik ve yeni yaklaşımlar." , ss.495 - 503, 2010.
ISNAD	ERGİN, MUSTAFA ALPER. "Viridans streptokokların laboratuvar tanısında klasik ve yeni yaklaşımlar". (2010), 495-503.

APA	ERGİN M (2010). Viridans streptokokların laboratuvar tanısında klasik ve yeni yaklaşımlar. Mikrobiyoloji Bülteni, 44(3), 495 - 503.
Chicago	ERGİN MUSTAFA ALPER Viridans streptokokların laboratuvar tanısında klasik ve yeni yaklaşımlar. Mikrobiyoloji Bülteni 44, no.3 (2010): 495 - 503.
MLA	ERGİN MUSTAFA ALPER Viridans streptokokların laboratuvar tanısında klasik ve yeni yaklaşımlar. Mikrobiyoloji Bülteni, vol.44, no.3, 2010, ss.495 - 503.
AMA	ERGİN M Viridans streptokokların laboratuvar tanısında klasik ve yeni yaklaşımlar. Mikrobiyoloji Bülteni. 2010; 44(3): 495 - 503.
Vancouver	ERGİN M Viridans streptokokların laboratuvar tanısında klasik ve yeni yaklaşımlar. Mikrobiyoloji Bülteni. 2010; 44(3): 495 - 503.
IEEE	ERGİN M "Viridans streptokokların laboratuvar tanısında klasik ve yeni yaklaşımlar." Mikrobiyoloji Bülteni, 44, ss.495 - 503, 2010.
ISNAD	ERGİN, MUSTAFA ALPER. "Viridans streptokokların laboratuvar tanısında klasik ve yeni yaklaşımlar". Mikrobiyoloji Bülteni 44/3 (2010), 495-503.