Çeşitli klinik örneklerden izole edilen candida türlerinin tanımlanmasında kromojenik besiyerinin değerlendirilmesi

ERTÜRK, AYŞE; KOÇ, A. Nedret; ÇİÇEK ÇOPUR, Ayşegül; DEMİR, Gonca; Bahçeci, İlkay

Çeşitli klinik örneklerden izole edilen candida türlerinin tanımlanmasında kromojenik besiyerinin değerlendirilmesi

Ayşegül ÇİÇEK ÇOPUR, (Recep Tayyip Erdoğan Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Rize, Türkiye)

A. Nedret KOÇ, (Erciyes Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Kayseri, Türkiye)

Ayşe ERTÜRK, (Recep Tayyip Erdoğan Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Enfeksiyon Hastalıkları Ve Klinik Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Rize, Türkiye)

Gonca DEMİR, (Erciyes Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Kayseri, Türkiye)

İlkay BAHÇECİ (Recep Tayyip Erdoğan Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Rize, Türkiye)

Abant Tıp Dergisi

7 3

Yıl: 2014 Cilt: 3 Sayı: 3 Sayfa Aralığı: 248 - 252 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 29-07-2022

Çeşitli klinik örneklerden izole edilen candida türlerinin tanımlanmasında kromojenik besiyerinin değerlendirilmesi

Öz:

Amaç: Bu çalışmada çeşitli klinik örneklerden izole edilenmayaların tür düzeyinde tanımlanmasında konvansiyonelmikolojik yöntemler ile Kromojenik besiyeri (Oxoid Brill iance Candida agar, İngiltere) (KB) kullanılarak yapılantanımlamaların karşılaştırılması am açlandı.Yöntem : Otuz üç idrar, 34 transtrakeal aspirat (TTA), 7bro n koalvaolar lavaj (BAL) örneği, 13 balgam, 12 kan, 9yara, üç kateter ve iki vajinal akıntı olmak üzere toplam113 klinik örnek çalışmaya alındı. İzole edilen suşlarınkonvansiyonel mikolo jik yöntemlerle; mikroskopik vemakroskopik mo rfoloji, germ tüp testi, üre hidrolizi, ka rbonhidrat kullanımı (API 20 C AUX, Biomerieux, Fransa),üreme ısısı ve sikl o heksimid hasasiyetine göre tür tanı mlaması yapıldı. Suşlar kromojenik besiyerine (Oxoid Bri ll iance Candida agar, İngiltere) ekilerek renk değişimlerideğerlendirildi ve her iki yöntem karşılaştırıldı.Bulgular: Çalışılan klinik örneklerde her iki yöntemle to plam 113 örneğin 103ünde (% 91.2) aynı tür tanımlamasıyapılırken,10 (%8.8) tanesinde farklı tür tanımlanmıştır.Kromejenik besiyeri C. albicans suşlarını %94.1, C. paraps ilosis %88.9 , C. glabrata %81.3 oranında doğru tanımlarkenbirer suş olan C. krusei ve C. tropicalis doğru, C. lusitaniayanlış tanımlanmıştır. Stok kültürlerimizin 6 tan esindenbirinin bakteri ile 5inin iki çeşit Candida türü ile karışıkkültür olduğu kromojenik besiyeri ile anlaşılmıştır.Sonuç : İnfeksiyon etkeni olarak sık karşılaşılan Candidasuşlarının tür düzeyinde tanımlanmasında ve karışık kü ltürlerin ayırt edilme sinde kromojenik besiyerinin duyarlıl ığının yüksek olmasına rağmen nadir karşılaşılan mayatürl e ri için daha fazla çalışmalara gereksinim vardır.

Anahtar Kelime:

Konular: Mikroskopi Biyoloji Mikrobiyoloji Biyoteknoloji ve Uygulamalı Mikrobiyoloji

The evaluation of chromogenic medium in identification of candida species isolated from various clinical samples

Öz:

Objective : To compare of conventional mycologic methodsused to determine yeast or candida spp extracted fromsome clinical samples with the definitions identified usingthe chromogenic medium (CM, Oxoid Brilliance Candidaagar, United Kingdom) was aimed in this study.Method : Total of 113 clinical samples (33 of urine, 34 oftranstracheal aspirate (TAT), 7 of bronchoalveolar lavage(BAL), 13 of sputum, 12 of blood, 9 of wound, 3 of catheter,2 of vaginal smear) were included. Species identificationwas carried out using convantional mycologic methods;microscopic and macroscopic morphology, germ tube test,urea hydrolysis, carbonhydrate use (API 20C AUX, Biom erieux, France), growth temperature and cycloheximidesensitivity. The strains were inoculated in the chromogenicmedium (Oxoid Brilliance Candida agar, UK) and colourchanges were evaluated, and two method s were comp ared.Results : With both method, 91.2% of (n=103) total 113samples was identified as similar whilest 8.8% of them(n=10) was defined differently. 94.1% of Candida albicansspp, 88.9% of C. parapsilosis and 81.3% of C. glabrata wastruly identi fied. C. krusei and C. tropicalis were correctlyidentified whereas C. lusitania was wrongly identified. Itwas understood that one of total 6 of our stock cultureswas found as mixed culture with bacteria, and the rest ofthem was found as mixed with two types of Candida sp ecies, with using chromogenic medium.Conclusion : There is a need to further studies for rare yeastspecies although the sensitivity of chromogenic medium ishigh for using the determination of common candida sp ecies as infectious agents.I

Anahtar Kelime:

Konular: Mikroskopi Biyoloji Mikrobiyoloji Biyoteknoloji ve Uygulamalı Mikrobiyoloji

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık

1. Atalay MA, Sav H, Demir G, Koç AN. Kan Kültürlerinden İzole Edilen Candida Türlerinin Dağılımı ve Amfoterisin B ve Flukonazole İn Vitro Duyarlılıkları. Selçuk Tıp Derg 2012; 28: 149-51.
2. Lass -Flörl C. Thechancingfaxe of epidemiology of invasivefungalDisease in Europe. Mycoses 2009; 52: 197-205.
3. İnci M, Atalay MA, Koç AN, Özer B, Kılınç Ç, Du rmaz S. Candida albicans dışı mayaların tanımlanm asında VITEK 2 YST kart ile API 20C AUX sisteminin karşılaştırılması. Dicle Tıp Derg 2012; 39: 80-82.
4. Ener B. İn vitro antifungal duyarlılık testleri: sta ndardizasyon ve klinik önemi. Mikrobiyol Bul 1996; 30: 419-25.
5. Freydiere AM, Guinet R, Boiron P: Yeast identification in the clinical microbiology laboratory: phenotypical methods. Med Mycol 2001; 39: 9-33.
6. Kaçmaz B, Sipahi AB, Aksoy A. Candıda Türlerinin Tanımlanmasında API 32C Ve RapidYeast Plus Sistemlerinin Karşılaştırılması. ANKEM Derg 2006; 20: 214-6.
7. Otağ F, Aslan G, Şen S, Emekdaş G. Fungemi e tkeni Candida türlerinin hızlı tanısında CHROMagar Candida besiyerinin kullanımı. Türk Mikrobiyol Cem Derg 2006; 36: 200-4.
8. Horvath LL, Hospenthal DR, Murray CK, Dooley DP. Direct isolation of Candida spp. From blood cultures on the chromogenic medium CHROMagar Candida: J Clin Microbiol 2003; 41: 2629-32.
9. Yücesoy M, Marol S. Performance of CHROM A- GAR candida and BIGGY agar for identification of yeast species. Annals Clin Microbiol Antimicrobial 2003; 2: 8.
10. Pfaller MA, Diekema DJ, Sheehan DJ. Interpret ive breakpoints for fluconazole and Candida revis ited: a blue print for the future of antifungal suscep- tibility testing. Clin Microbiol Rev 2006; 19: 435 -47.
11. Koehler AP, Chu KC, Houang ET, Cheng AF: Simple, reliable, and cost-effective yeast identification scheme for the clinical laboratory. J Clin Microbiol 1999, 37: 422 -6.
12. Gültekin B. Yazıcı V, Aydın N. Vajinal örnekle rden izole edilen candida suşlarının dağılımı ve chrom agar candida besiyerinin değerlendirilmesi. Mikrobiyol Bul 2005; 39: 319-24.
13. Odds FC. Presidential address. Candida albicans, the life and times of a pathogenic yeast. J Medical and Veterinary Mycology 1994; 32: 1 -8.
14. Pulimood S, Ganesan L, Alangaden G, Chandr asekar P. Polymicrobial candidemia. Diag Microbiol Infect Dis 2002; 44: 353 -7.
15. Yera H, Poulain D, Lefebvre A, Camus D, Sendid
16. Willinger B, Manafi M. Mycoses. Evaluation of CHROMagar Candida for rapid screening of clinical specimens for Candida species. 1999; 42: 61 -5.
17. Mahmoudi Rad M, Zafarghandi S, Abbasabadi B, Tavallaee M. The epidemiology of Candida species associated with vulvovaginal candidiasis in an Ir anian patient population. Eur J Obstet Gynecol Reprod Biol 2011; 155: 199-203.
18. Castro LA, Alvarez MI, Martínez E. Pseud o- membranous Candidiasis in HIV/AIDS Patients in Cali, Colombia Mycopathologia. 2013; 175: 91 -8.
19. López - Soria LM, Bereciartua E, Santamaría M, Soria LM, Hernández -Almaraz JL, Mularoni A, Nieto J, Montejo M. First case report of catheter -related fungemia by Candida nivariensis in the Iberian P eninsula. Rev Iberoam Micol. 2013; 30: 69-71
20. Eddouzi J, Hofstetter V, Groenewald M, Manai M, Sanglard D. J ClinMicrobiol. Characterization of a new clinical yeast species, Candida tunisiensis sp. nov., isolated from a strain collection of Tunisian hospitals. 2013; 51: 31 -9.
21. Otag F, Kuyucu N, Erturan Z, Sen S, Emekdas G, Sugita T. An outbreak of Pichiaohmeri infection in the paediatric intensive care unit: case reports and review of the literature. Mycoses 2005; 48: 265 -9.
22. Ersoz G, Otag F, Erturan Z, Aslan G, Kaya A, Emekdas G, Sugita T. An outbreak of Dipodascus capitatus infection in the ICU: three case reports and review of the literature. Jpn J Infect Dis 2004; 57: 248-52.
23. Agarwal S, Manchanda V, Verma N, Bhalla P. Yeast identification in routine clinical microbiology laboratory and its clinical relevance Indian J Med Microbiol 2011 ; 29: 172 -7 B. Polymicrobial candidemia revealed by peripheral blood smear and chromogenic medium. J Clin Pa thol 2004; 57: 196-8.

APA	ÇİÇEK ÇOPUR A, KOÇ A, ERTÜRK A, DEMİR G, Bahçeci İ (2014). Çeşitli klinik örneklerden izole edilen candida türlerinin tanımlanmasında kromojenik besiyerinin değerlendirilmesi. , 248 - 252.
Chicago	ÇİÇEK ÇOPUR Ayşegül,KOÇ A. Nedret,ERTÜRK AYŞE,DEMİR Gonca,Bahçeci İlkay Çeşitli klinik örneklerden izole edilen candida türlerinin tanımlanmasında kromojenik besiyerinin değerlendirilmesi. (2014): 248 - 252.
MLA	ÇİÇEK ÇOPUR Ayşegül,KOÇ A. Nedret,ERTÜRK AYŞE,DEMİR Gonca,Bahçeci İlkay Çeşitli klinik örneklerden izole edilen candida türlerinin tanımlanmasında kromojenik besiyerinin değerlendirilmesi. , 2014, ss.248 - 252.
AMA	ÇİÇEK ÇOPUR A,KOÇ A,ERTÜRK A,DEMİR G,Bahçeci İ Çeşitli klinik örneklerden izole edilen candida türlerinin tanımlanmasında kromojenik besiyerinin değerlendirilmesi. . 2014; 248 - 252.
Vancouver	ÇİÇEK ÇOPUR A,KOÇ A,ERTÜRK A,DEMİR G,Bahçeci İ Çeşitli klinik örneklerden izole edilen candida türlerinin tanımlanmasında kromojenik besiyerinin değerlendirilmesi. . 2014; 248 - 252.
IEEE	ÇİÇEK ÇOPUR A,KOÇ A,ERTÜRK A,DEMİR G,Bahçeci İ "Çeşitli klinik örneklerden izole edilen candida türlerinin tanımlanmasında kromojenik besiyerinin değerlendirilmesi." , ss.248 - 252, 2014.
ISNAD	ÇİÇEK ÇOPUR, Ayşegül vd. "Çeşitli klinik örneklerden izole edilen candida türlerinin tanımlanmasında kromojenik besiyerinin değerlendirilmesi". (2014), 248-252.

APA	ÇİÇEK ÇOPUR A, KOÇ A, ERTÜRK A, DEMİR G, Bahçeci İ (2014). Çeşitli klinik örneklerden izole edilen candida türlerinin tanımlanmasında kromojenik besiyerinin değerlendirilmesi. Abant Tıp Dergisi, 3(3), 248 - 252.
Chicago	ÇİÇEK ÇOPUR Ayşegül,KOÇ A. Nedret,ERTÜRK AYŞE,DEMİR Gonca,Bahçeci İlkay Çeşitli klinik örneklerden izole edilen candida türlerinin tanımlanmasında kromojenik besiyerinin değerlendirilmesi. Abant Tıp Dergisi 3, no.3 (2014): 248 - 252.
MLA	ÇİÇEK ÇOPUR Ayşegül,KOÇ A. Nedret,ERTÜRK AYŞE,DEMİR Gonca,Bahçeci İlkay Çeşitli klinik örneklerden izole edilen candida türlerinin tanımlanmasında kromojenik besiyerinin değerlendirilmesi. Abant Tıp Dergisi, vol.3, no.3, 2014, ss.248 - 252.
AMA	ÇİÇEK ÇOPUR A,KOÇ A,ERTÜRK A,DEMİR G,Bahçeci İ Çeşitli klinik örneklerden izole edilen candida türlerinin tanımlanmasında kromojenik besiyerinin değerlendirilmesi. Abant Tıp Dergisi. 2014; 3(3): 248 - 252.
Vancouver	ÇİÇEK ÇOPUR A,KOÇ A,ERTÜRK A,DEMİR G,Bahçeci İ Çeşitli klinik örneklerden izole edilen candida türlerinin tanımlanmasında kromojenik besiyerinin değerlendirilmesi. Abant Tıp Dergisi. 2014; 3(3): 248 - 252.
IEEE	ÇİÇEK ÇOPUR A,KOÇ A,ERTÜRK A,DEMİR G,Bahçeci İ "Çeşitli klinik örneklerden izole edilen candida türlerinin tanımlanmasında kromojenik besiyerinin değerlendirilmesi." Abant Tıp Dergisi, 3, ss.248 - 252, 2014.
ISNAD	ÇİÇEK ÇOPUR, Ayşegül vd. "Çeşitli klinik örneklerden izole edilen candida türlerinin tanımlanmasında kromojenik besiyerinin değerlendirilmesi". Abant Tıp Dergisi 3/3 (2014), 248-252.