İnvazif enfeksiyonlara neden olan GSBL pozitif enterobacteriaceae izolatlarında karbapenem direnci

ESER KÖSEOĞLU, Özgen; ŞENER, Burçin; Boral, Baris; HASÇELİK, AYŞE GÜLŞEN; ERGİN, MUSTAFA ALPER; ULUDAĞ ALTUN, Hatice

İnvazif enfeksiyonlara neden olan GSBL pozitif enterobacteriaceae izolatlarında karbapenem direnci

Özgen ESER KÖSEOĞLU, (Hacettepe Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Ankara, Türkiye)

Hatice ULUDAĞ ALTUN, (Turgut Özal Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Ankara, Türkiye)

MUSTAFA ALPER ERGİN, (Hacettepe Üniversitesi, Sağlık Hizmetleri Meslek Yüksek Okulu Ankara, Türkiye)

Barış BORAL, (Hacettepe Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Ankara, Türkiye)

Burçin ŞENER, (Hacettepe Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Ankara, Türkiye)

AYŞE GÜLŞEN HASÇELİK (Hacettepe Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Ankara, Türkiye)

Mikrobiyoloji Bülteni

7 0

Yıl: 2014 Cilt: 48 Sayı: 1 Sayfa Aralığı: 59 - 69 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 29-07-2022

İnvazif enfeksiyonlara neden olan GSBL pozitif enterobacteriaceae izolatlarında karbapenem direnci

Öz:

Bu çalışmada 2005-2009 yılları arasında Hacettepe Üniversitesi Hastanesinde invazif enfeksiyonlardan izole edilen Enterobacteriaceae türlerinde karbapenem direnç varlığının fenotipik ve genotipik olarak gösterilmesi amaçlanmıştır. Çalışmaya, BD Phoenix (Sparks, ABD) sistemiyle geniş spektrumlu beta-laktamaz (GSBL) pozitif olarak tespit edilen 153’ü Escherichia coli, 47’si Klebsiella pneumoniae, 10’u Klebsiella oxytoca olmak üzere toplam 210 kan izolatı dahil edilmiştir. İzolatların imipenem, meropenem ve ertapeneme karşı duyarlılıkları, CLSI (Clinical Laboratory Standards Institute) önerilerine uygun şekilde mikrodilüsyon yöntemiyle, doripenem duyarlılığı ise E-test (bioMerieux, Hazelwood, ABD) yöntemiyle araştırılmıştır. Çalışmada karbapeneme dirençli olarak tespit edilen izolatlarda fenotipik doğrulama testleri uygulanmış ve polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) yöntemiyle blaAmpC’ blaCTX-M, blaKPC, blaNDM, blaOXA, blaIMP ve blaVIM a p a antibiyotik direnç genlerinin varlığı araştırılmıştır. Çalışmamızda, GSBL üreten 210 Enterobacteriaceae kan izolatının 23 (%11)’ünde karbapenem direnci saptanmış; imipenem, meropenem ve ertapenem direnci sırasıyla %5.7 (n= 12), %1.9 (n= 4) ve %2.4 (n= 5) olarak belirlenmiştir. İzolatlara karşı en etkin karbapenem grubu antibiyotiğin doripenem (direnç %1) olduğu gözlenmiştir. Yirmi üç izolatın yedisi sefotaksim/klavulanik asit (CTX/CLA) ve seftazidim/klavulanik asit (CAZ/CLA) kombine disk difüzyon yöntemiyle GSBL negatif bulunurken, CTX/CLA diskine boronik asit (BA) ilavesiyle yapılan modifiye kombine disk difüzyon yönteminde altı izolatın GSBL pozitif olduğu tespit edilmiştir. Modifiye Hodge testi (MHT) ve/veya ertapenem-BA kombine disk difüzyon testleriyle pozitif olarak saptanan üç izolatın birinde blaOXA-48, diğerinde blaAmpC geni saptanmıştır. Fenotipik olarak pAmpC varlığı tespit edilen üç a K.pneumoniae izolatının birinde blaAmpC geni gösterilmiştir. Bütün antibiyotikler için MİK değeri 256 μg/ e a ml olan ve meropenem-BA, MHT, imipenem-EDTA, seftazidim-CAZ/CLA, sefoksitin-BA pozitif olan bir K.pneumoniae izolatında blaOXA-48 gen varlığı saptanmıştır. Beş izolatta blaOXA-1 ve bir izolatta blaOXA-10 e OX 8 gen varlığı gösterilmiştir. İki izolat blaCTX-M pozitif olarak bulunmuş; izolatların hiçbirinde blaIMP, blaVIM ve a P blaNDM-1 genleri tespit edilmemiştir. Sonuç olarak, dört yıllık sürede izole edilen invazif Enterobacteriaceae türlerinin karbapenemlere olan direnç değerleri düşük düzeyde bulunmuştur. İzolatlardaki direnç, genel- likle blaOXA tipi karbapenemazlara bağlıdır ve bu izolatlarda blaKPC ve blaNDM varlığı saptanmamıştır.

Anahtar Kelime:

Konular: Biyoloji Mikrobiyoloji Biyoteknoloji ve Uygulamalı Mikrobiyoloji

Carbapenem resistance in ESBL positive enterobacteriaceae isolates causing invasive infections

Öz:

The aim of this study was to investigate the presence of carbapenem resistance in Enterobacteriaeceae isolates recovered from invasive infections, in Hacettepe University Hospital, Ankara, Turkey, between 2005-2009, by phenotypic and genotypic methods. A total of 210 non-duplicated Escherichia coli (n= 153), Klebsiella pneumoniae (n= 47) and Klebsiella oxytoca (n= 10) isolates which were all determined e a to be extended-spectrum beta-lactamase (ESBL) positive with the BD Phoenix automated identification and antibiotic susceptibility system (Sparks, USA), were included in the study. The isolates were recov- ered from patients with bloodstream infections. Susceptibility of the isolates to imipenem, meropenem and ertapenem was detected with microdilution method according to the standards of Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) minimal inhibitory concentration (MIC) breakpoints. Doripenem susceptibility was detected by the E-test (bioMerieux, Hazelwood, USA). All isolates which were found to be non-susceptible to any of the carbapenem antibiotics tested, were characterized by the phenotypic confirmatory tests and the presence of the resistance genes; blaAmpC, blaCTX-M, blaKPC, blaNDM, blaOXA, a blaIMP ve blaVIM were screened by polymerase chain reaction (PCR). Among the 210 ESBL-producing a Enterobacteriaceae blood isolates, 23 (11%) were identified as non-susceptible to any of the carbap- e enems tested. Resistance rates for imipenem, meropenem and ertapenem were 5.7% (n= 12), 1.9% (n= 4) and 2.4% (n= 5), respectively. Doripenem was more active than the other carbapenems, with a resistance rate of 1.0%. Seven of 23 isolates were ESBL negative with cefotaxime/clavulanic acid (CTX/ CLA) and ceftazidime/clavulanic acid (CAZ/CLA) combined disk diffusion test, however, six of them were ESBL positive with the addition of boronic acid (BA) to CTX/CLA. Among the three isolates positive for Modifiye Hodge test (MHT) and/or ertapenem-BA tests, blaOXA-48 was detected in one and blaAmpC in the other. Phenotypic pAmpC activity was present in three K.pneumoniae isolates of which one was positive for blaAmpC gene. One K.pneumoniae isolate resistant to all carbapenems with MICs > 256 μg/ a e ml and positive for phenotypic meropenem-BA, MHT, imipenem-EDTA, ceftazidime-CAZ/CLA, cefoxitin- BA production, was found to inhabit blaOXA-48 gene. Five isolates were positive for blaOXA-1 and one for blaOXA-10. Two isolates were positive for blaCTX-M, however blaIMP, blaVIM and blaNDM-1 genes were not detected among the isolates. In conclusion, carbapenem non-susceptibility which was low among the Enterobacteriaceae strains isolated in our center, was mostly attributed to the presence of blaOXA typecarbapenemases and no accumulation of blaKPC and blaNDM were detected.

Anahtar Kelime:

Konular: Biyoloji Mikrobiyoloji Biyoteknoloji ve Uygulamalı Mikrobiyoloji

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Bibliyografik

1. Nordmann P, Naas T, Poirel L. Global spread of carbapenemase-producing Enterobacteriaceae. Emerg Infect Dis 2011; 17(10): 1791-8.
2. Miriagou V, Cornaglia G, Edelstein M, et al. Acquired carbapenemases in gram-negative bacterial patho- gens: detection and surveillance issues. Clin Microbiol Infect 2010; 16(2): 112-22.
3. Clinical and Laboratory Standards Institute. Performance standards for antimicrobial susceptibility testing. 22nd Informational Supplement. CLSI Document M100-S19, 2009. CLSI, Wayne, PA.
4. Clinical and Laboratory Standards Institute. Performance standards for antimicrobial susceptibility testing. 22nd Informational Supplement. CLSI Document M100-S22, 2012. CLSI, Wayne, PA.
5. Tsakris A, Poulou A, Pournaras S, et al. A simple phenotypic method for the differentiation of metallo-beta- lactamases and class A KPC carbapenemases in Enterobacteriaceae clinical isolates. J Antimicrob Chemother 2010; 65(8): 1664-71.
6. Song W, Bae IK, Lee YN, Lee CH, Lee SH, Jeong SH. Detection of extended-spectrum beta-lactamases by using boronic acid as an AmpC-lactamase inhibitor in clinical isolates of Klebsiella spp. and Escherichia coli. J Clin Microbiol 2007; 45(4): 1180-4.
7. Costa D, Poeta P, Saenz Y, et al. Prevalence of antimicrobial resistance and resistance genes in faecal Esch- erichia coli isolates recovered from healthy pets. Vet Microbiol 2008; 127(1-2): 97-105.
8. Perez-Perez FJ, Hanson ND. Detection of plasmid-mediated AmpC beta-lactamase genes in clinical isolates by using multiplex PCR. J Clin Microbiol 2002; 40(6): 2153-62.
9. Kaiser DM, Castanheira M, Jones RN, Tenover F, Lynfield R. Trends in Klebsiella pneumoniae carbapenemase- positive K.pneumoniae in US hospitals: report from the 2007-2009 SENTRY Antimicrobial Surveillance Program. Diagn Microbiol Infect Dis 2013; 76(3): 356-60.
10. Leblebicioğlu H, Cakir N, Celen M, Kurt H, Baris H, Laeuffer J; Turkish COMPACT Study Group. Comparative activity of carbapenem testing (the COMPACT study) in Turkey. BMC Infect Dis 2012; 12: 42.
11. Valenza G, Seifert H, Decker-Burgard S, Laeuffer J, Morrissey I, Mutters R. Comparative activity of carbape- nem testing (COMPACT) study in Germany. Int J Antimicrob Agents 2012; 39(3): 255-8.
12. Kiratisin P, Chongthaleong A, Tan TY, et al. Comparative in vitro activity of carbapenems against major gram-negative pathogens: results of Asia-Pacific surveillance from the COMPACT II study. Int J Antimicrob Agents 2012; 39(4): 311-6.
13. Jacoby GA. AmpC beta-lactamases. Clin Microbiol Rev 2009; 22(1): 161-82.
14. Baykal A, Çöplü N, Şimşek H, Esen B, Gür D. Kan izolatı E.coli ve K.pneumoniae suşlarında genişlemiş- spektrumlu beta-laktamaz, KPC-tip karbapenemaz ve plazmid aracılı AmpC beta-laktamaz varlığının araştırılması. Mikrobiyol Bul 2012; 46(2): 159-69.
15. Birgy A, Bidet P, Genel N, et al. Phenotypic screening of carbapenemases and associated beta-lactamase in carbapenem-resistant Enterobacteriaceae. J Clin Microbiol 2012; 50(4): 1295-302.
16. Girlich D, Poirel L, Nordmann P. Value of the modified Hodge test for detection of emerging carbapen- emases in Enterobacteriaceae. J Clin Microbiol 2012; 50(2): 477-9.
17. Gomez E, Urban C, Mariano N, et al. Phenotypic and genotypic screening and clonal analysis of carbapen- em-resistant Klebsiella pneumoniae at a single hospital. Microb Drug Resist 2011; 17(2): 251-7.
18. Doumith M, Ellington MJ, Livermore DM, Woodford N. Molecular mechanisms disrupting porin expression in ertapenem-resistant Klebsiella and Enterobacter spp. clinical isolates from the UK. J Antimicrob Chemother 2009; 63(4): 659-67.
19. Baroud M, Dandache I, Araj GF, et al. Underlying mechanisms of carbapenem resistance in extended-spec- trum beta-lactamase-producing Klebsiella pneumoniae and Escherichia coli isolates at a tertiary care centre in Lebanon: role of OXA-48 and NDM-1 carbapenemases. Int J Antimicrob Agents 2013; 41(1): 75-9.
20. Poirel L, Heritier C, Tolün V, Nordmann P. Emergence of oxacillinase-mediated resistance to imipenem in Klebsiella pneumoniae. Antimicrob Agents Chemother 2004; 48(1): 15-22.
21. Patel A, Bonomo RA. Stormy waters ahead: global emergence of carbapenemases. Front Microbiol 2013; 4: 48.
22. Canton R, Akova M, Carmelli Y, et al. Rapid evolution and spread of carbapenemases among Enterobacteria- ceae in Europe. Clin Microbiol Infect 2012; 18(5): 413-31.
23. Gupta V, Bansal N, Singla N, Chander J. Occurence and phenotypic detection of class A carbapenemases among Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae blood isolates at a tertiary care center. J Microbiol Immunol Infect 2013; 46(2): 104-8.
24. Tzouvelekis LS, Markogiannakis A, Psichogiou M, Tassios PT, Daikos GL. Carbapenemases in Klebsiella pneu- moniae and other Enterobacteriaceae: an evolving crisis of global dimensions. Clin Microbiol Rev 2012; 25(4): 682-707.

APA	ESER KÖSEOĞLU Ö, ULUDAĞ ALTUN H, ERGİN M, Boral B, ŞENER B, HASÇELİK A (2014). İnvazif enfeksiyonlara neden olan GSBL pozitif enterobacteriaceae izolatlarında karbapenem direnci. , 59 - 69.
Chicago	ESER KÖSEOĞLU Özgen,ULUDAĞ ALTUN Hatice,ERGİN MUSTAFA ALPER,Boral Baris,ŞENER Burçin,HASÇELİK AYŞE GÜLŞEN İnvazif enfeksiyonlara neden olan GSBL pozitif enterobacteriaceae izolatlarında karbapenem direnci. (2014): 59 - 69.
MLA	ESER KÖSEOĞLU Özgen,ULUDAĞ ALTUN Hatice,ERGİN MUSTAFA ALPER,Boral Baris,ŞENER Burçin,HASÇELİK AYŞE GÜLŞEN İnvazif enfeksiyonlara neden olan GSBL pozitif enterobacteriaceae izolatlarında karbapenem direnci. , 2014, ss.59 - 69.
AMA	ESER KÖSEOĞLU Ö,ULUDAĞ ALTUN H,ERGİN M,Boral B,ŞENER B,HASÇELİK A İnvazif enfeksiyonlara neden olan GSBL pozitif enterobacteriaceae izolatlarında karbapenem direnci. . 2014; 59 - 69.
Vancouver	ESER KÖSEOĞLU Ö,ULUDAĞ ALTUN H,ERGİN M,Boral B,ŞENER B,HASÇELİK A İnvazif enfeksiyonlara neden olan GSBL pozitif enterobacteriaceae izolatlarında karbapenem direnci. . 2014; 59 - 69.
IEEE	ESER KÖSEOĞLU Ö,ULUDAĞ ALTUN H,ERGİN M,Boral B,ŞENER B,HASÇELİK A "İnvazif enfeksiyonlara neden olan GSBL pozitif enterobacteriaceae izolatlarında karbapenem direnci." , ss.59 - 69, 2014.
ISNAD	ESER KÖSEOĞLU, Özgen vd. "İnvazif enfeksiyonlara neden olan GSBL pozitif enterobacteriaceae izolatlarında karbapenem direnci". (2014), 59-69.

APA	ESER KÖSEOĞLU Ö, ULUDAĞ ALTUN H, ERGİN M, Boral B, ŞENER B, HASÇELİK A (2014). İnvazif enfeksiyonlara neden olan GSBL pozitif enterobacteriaceae izolatlarında karbapenem direnci. Mikrobiyoloji Bülteni, 48(1), 59 - 69.
Chicago	ESER KÖSEOĞLU Özgen,ULUDAĞ ALTUN Hatice,ERGİN MUSTAFA ALPER,Boral Baris,ŞENER Burçin,HASÇELİK AYŞE GÜLŞEN İnvazif enfeksiyonlara neden olan GSBL pozitif enterobacteriaceae izolatlarında karbapenem direnci. Mikrobiyoloji Bülteni 48, no.1 (2014): 59 - 69.
MLA	ESER KÖSEOĞLU Özgen,ULUDAĞ ALTUN Hatice,ERGİN MUSTAFA ALPER,Boral Baris,ŞENER Burçin,HASÇELİK AYŞE GÜLŞEN İnvazif enfeksiyonlara neden olan GSBL pozitif enterobacteriaceae izolatlarında karbapenem direnci. Mikrobiyoloji Bülteni, vol.48, no.1, 2014, ss.59 - 69.
AMA	ESER KÖSEOĞLU Ö,ULUDAĞ ALTUN H,ERGİN M,Boral B,ŞENER B,HASÇELİK A İnvazif enfeksiyonlara neden olan GSBL pozitif enterobacteriaceae izolatlarında karbapenem direnci. Mikrobiyoloji Bülteni. 2014; 48(1): 59 - 69.
Vancouver	ESER KÖSEOĞLU Ö,ULUDAĞ ALTUN H,ERGİN M,Boral B,ŞENER B,HASÇELİK A İnvazif enfeksiyonlara neden olan GSBL pozitif enterobacteriaceae izolatlarında karbapenem direnci. Mikrobiyoloji Bülteni. 2014; 48(1): 59 - 69.
IEEE	ESER KÖSEOĞLU Ö,ULUDAĞ ALTUN H,ERGİN M,Boral B,ŞENER B,HASÇELİK A "İnvazif enfeksiyonlara neden olan GSBL pozitif enterobacteriaceae izolatlarında karbapenem direnci." Mikrobiyoloji Bülteni, 48, ss.59 - 69, 2014.
ISNAD	ESER KÖSEOĞLU, Özgen vd. "İnvazif enfeksiyonlara neden olan GSBL pozitif enterobacteriaceae izolatlarında karbapenem direnci". Mikrobiyoloji Bülteni 48/1 (2014), 59-69.