ÇEŞİTLİ SERVİKAL PATOLOJİYE SAHİP KADINLARDA HUMAN PAPİLLOMAVİRUS (HPV) PREVALANSI VE FİLOGENETİK ANALİZİ

ÖZKAN, Seçil; BOZDAYI, Gülendam; TAŞKIRAN, Çağatay; ONAN, MEHMET ANIL; Alp, Gulcin

ÇEŞİTLİ SERVİKAL PATOLOJİYE SAHİP KADINLARDA HUMAN PAPİLLOMAVİRUS (HPV) PREVALANSI VE FİLOGENETİK ANALİZİ

Gülçin Alp AVCI, (Gazi Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Ankara, Türkiye)

Gülendam BOZDAYI, (Gazi Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Ankara, Türkiye)

Çağatay TAŞKIRAN, (Gazi Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Kadın Hastalıkları ve Doğum Anabilim Dalı, Ankara, Türkiye)

Seçil ÖZKAN, (Gazi Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Halk Sağlığı Anabilim Dalı, Ankara, Türkiye)

Mehmet Anıl ONAN (Gazi Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Kadın Hastalıkları ve Doğum Anabilim Dalı, Ankara, Türkiye)

Türk Jinekoloji ve Obstetrik Derneği Dergisi

4 1

Yıl: 2013 Cilt: 10 Sayı: 3 Sayfa Aralığı: 151 - 159 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 29-07-2022

ÇEŞİTLİ SERVİKAL PATOLOJİYE SAHİP KADINLARDA HUMAN PAPİLLOMAVİRUS (HPV) PREVALANSI VE FİLOGENETİK ANALİZİ

Öz:

Amaç: Bu çalışmada, çeşitli servikal patolojiye sahip hastalarda gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu ve DNA dizi analizi ile HPV tiplerinin sıklığının belirlenmesi ve filogenetik analizinin yapılması amaçlanmıştır. Gereç ve yöntemler: Çalışmaya Ocak-Ekim 2010 tarihleri arasında kolposkopi önerilen 77 adet hastaya ait servikal sürüntü örneği dahil edilmiştir. HPV DNA ve HPV tip 16 DNA' sı L1 bölgesi hedef alınarak gerçek zamanlı PCR ile belirlenmiştir. MY09/ 11 ürünlerinin amplifikasyonları gerçek zamanlı PCR ile GP5+/GP6+ primerleri, siyanin-5 işaretli HPV DNA ve HPV tip 16 DNA spesifik probları kullanılarak yapılmıştır. Dizi analizinde GP5+/GP6+ primerleri kullanılmıştır. Filogenetik analiz, Kimura'nın iki parametre yöntemi ile yapılmıştır. İstatistiksel analizinde ise Pearson'nun ki-kare ve odss ratio testlerinden yararlanılmıştır. Sonuç: Toplam 77 servikal örneğin 47 (prevalans %61)'si HPV DNA pozitif tespit edildi. Yetmiş yedi örneğin %52'si HPV 16; %4'ü HPV tip 16 ve tip 11; %1'i HPV tip 16 ve tip 6; ve %4'ü tiplendirilemeyen HPV DNA belirlenirken, %39'un da HPV'ye rastlanmadı. İnsan papillomavirus pozitif bulunan bireylerin yaşları 34-56 arasında olup, en fazla pozitişik %80,0 oranı ile 31-40 yaşları arasında belirlenmiştir. İnsan papillomavirus pozitişiğinin 41-50 yaşları arasında %52,2'e düştüğü, ancak 51-60 yaşları arasında tekrar %83,3'e yükselerek ikinci bir pik yaptığı görüldü. Ayrıca, 20 ASC-H'nin %60,0'ında; 36 ASC-US' un %63,8'inde; 9 HSIL'nin %100'ünde ve 12 LSIL'nin %25'inde HPV DNA pozitif olarak belirlendi. Yorum: Hastanemizde serviks kanseri ve prekanseröz lezyonları olan kadınlarda HPV genotip dağılımının araştırılması önemlidir. Gelişen teknolojik yöntemler kullanılarak İnsan papillomavirusunun erken tanısı, prekanseröz lezyonların invaziv kanser haline dönüşmesini önlemek için anahtar rol oynamaktadır.

Anahtar Kelime:

Konular: Biyoloji Genetik ve Kalıtım

PHYLOGENETIC ANALYSIS AND PREVALENCE OF HUMAN PAPILLOMAVIRUS (HPV) IN WOMEN WITH SEVERAL CERVICAL PATHOLOGIES

Öz:

Objective: To determinate the prevalence of HPV types in patients with cervical cancers in our legion by Real time PCR and DNA sequence analysis and to make phylogenetic analysis was aimed in this study. Material and methods: From January to October 2010, cervical swap samples of 77 patients directed to colposcopy were included in the study. HPV DNA and HPV type 16 were detected by Real Time polymerase chain reaction using

Anahtar Kelime:

Konular: Biyoloji Genetik ve Kalıtım

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık

1. Shope RE, Hurst EW. Infectious papillomatosis of rabits; with a note on the histopathology. J Exp Med 1933; 58: 607- 24.
2. Singer A, Ho L, Terry G, Kwie TS. Association of human papillomavirus with cervical cancer and precancer, In: A Mindel (eds), Genital Warts Human Papillomavirus Infection. Edward Arnold, London.1995; 105- 29.
3. Münger K, Baldwin A, Edwards KM et al. Mechanisms of human papillomavirus-induced oncogenesis. J Virol 2004; 78 (21): 11451- 60.
4. Howley PM. The molecular biology of papillomavirus transformation. Am J Pathol 1983; 113 (3): 414- 21.
5. Bosch FX, Lorincz A, Munoz N, et al. The causal relation between human papillomavirus and cervical cancer. J Clin Pathol 2002; 55: 244- 65.
6. Anna-Barbara Moscicki. Impact of HPV infection in adolescent populations. J Adoles Healt 37; 2005; 3- 9.
7. Hamont DW, Bekkers RLM, Massuger LFAG, Melchers WJG. Detection of management and follow-up of pre- malignen lesions and the role for human papillomavirus. Rev Med Virol 2008; 18: 117- 32.
8. Özgül N. Türkiye'de serviks kanserinin durumu ve servikal kanser tarama çalışmaları. http://ukdk.org/pdf/kitap/30.pdf [Erisim Tarihi: 01.02.2010].
9. Lowy DR, Schiller JT. Prophylactic human papillomavirus vaccines. J Clin Invest 2006; 116: 1167- 73.
10. Solomon D, Davey D, Kurman R et al. Forum Group Members; Bethesda 2001 Workshop. The 2001 Bethesda System: terminology for reporting results of cervical cytology. JAMA 2002; 287: 2114- 9.
11. Yarkın F, Vardar MA. HPV immunolojisi ve natürel enfeksiyonlar. Türkiye Klinikleri J Gynecol Obst-Special Topics 2009; 2 (1): 43- 7.
12. Yazıcı F, Çelik Ç. HPV ve ekstragenital organ karsinomları. Türkiye Klinikleri J Gynecol Obst-Special Topics 2009; 2 (1): 29- 33.
13. Maria TS, Paola L, Elvira B et al. Comparison of the digene hc2 assay and the roche amplicor Human papillomavirus (HPV) test for detection of high-risk hpv genotypes in cervical samples. J Clin Micro 2006; 44: 2141- 6.
14. Borysiewicz LK, Şander A, Nimako M, et al. A recombinatinant vaccinia virus encoding human papillomavirus types 16 and 18, E6 and E7 proteins as immunotherapy for cervical cancer. Lancet 1996; 347: 1523- 7.
15. Erkmen E, Şimsek M, Sapmaz E ve ark. Bölgemizdeki serviks kanseri vakalarında HPV 16 ve 18 genomlarının PCR yöntemi ile araştırılması. Jinekol Onkol Derg 2002; 5: 75- 9.
16. Lorincz AT. Screening for cervical cancer: new alternatives and research. Salud Publica Mex 2003; 45 (3): 376- 87.
17. Yavuzer D, Karadayı N, Erda¤ı A, Salepçi T, Balo¤lu H, Dabak R. Serviks kanseri ve prekanseröz lezyonlarında PCR ile HPV tiplemesi. Kartal E¤itim Araştırma Hastanesi Tıp Dergisi, 2009; 20(1): 1- 6.
18. Altun Z, Yarkın F, Vardar MA, U¤uz A. Çukurova Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesine başvuran kadınlarda genital human papilomavirus enfeksiyon prevalansı. Turkiye Klinikleri J Med Sci 2011; 31(2): 307- 14.
19. Şahiner F, Gümral R, Şener K, Yi¤it N, Dede M, Yapar M, Kubar A. Servikal sürüntü örneklerinde iki farklı yöntemle HPV DNA varlı¤ının araştırılması: MY09/11 Konsensus PCR ve Tipe özgül gerçek zamanlı PCR. Mikrobiol Bul 2012; 46(4): 624- 36.
20. Dunne EF, Unger ER; Sternberg M, et al. Prevalence of HPV infection among females in the United States. JAMA 2007; 297: 813- 9.
21. Al-Awadhi R, Chehadeh W and Kapila K. Prevalence of Human Papillomavirus Among Women With Normal Cervical Cytology in Kuwait. Med J Virol 2011; 83: 453- 60.
22. Batmaz G, Çetin A, Dane C, Görgen H, Dane B. Normal ve anormal servikal smear saptanan kadınlarda HPV DNA pozitişi¤i. Türk Jinekolojik Onkoloji Dergisi 2009; 1: 10- 14
23. Baseman JG, Koutsky LA. The epidemiology of human papillomavirus infections. J Clin Virol 2005; 32: 16- 24.
24. International Agency for Research on Cancer. IARC Handbooks of Cancer Prevention. Cervix Cancer Screening. Lyon: IARC Press, 2005.
25. International Collaboration of Epidemiological Studies of Cervical Cancer. Cervical carcinoma and reproductive factors: collaborative reanalysis of individual data on 16,563 women with cervical carcinoma and 33,542 women without cervical carcinoma from 25 epidemiological studies. Int J Cancer 2006; 119 (5): 1108- 24.
26. Schmeink CE, Melchers WJG, Hendriks JCM, et al. Human Papillomavirus Detection in Pregnant Women: A Prospective Matched Cohort Study. J of Women's Health 2012; 21(12): 1295- 01.
27. Winer RL, Hughes JP, Feng Q, et al. Prevalence and Risk Factors for Oncogenic Human Papillomavirus Infections in High-Risk Mid-Adult Women. Sexually Transmitted Diseases 2012; 39 (11): 848- 56.
28. Köse F, Turan T. Servikal kanser tümörogenezi ve HPV. Türkiye Klinikleri J Gynecol Obst-Special Topics 2009; 2 (1): 13- 8.
29. Ergünay K, Mısırlıoglu M, Pınar F, Tuncer ZS, Tuncer S, Ustaçelebi S. Human papillomavirus DNA in cervical samples with cytological abnormalities and typing of the virus. Mikrobiyol Bul 2007; 41 (2): 219- 6.
30. Castle PE, Sadorra M, Garcia F, Holladay EB, Kornegay J. Pilot Study of a Commercialized Human Papillomavirus (HPV) Genotyping Assay: Comparison of HPV Risk Group to Cytology and Histology. J Clin Micro 2006; 3915- 17.

APA	Alp G, BOZDAYI G, TAŞKIRAN Ç, ÖZKAN S, ONAN M (2013). ÇEŞİTLİ SERVİKAL PATOLOJİYE SAHİP KADINLARDA HUMAN PAPİLLOMAVİRUS (HPV) PREVALANSI VE FİLOGENETİK ANALİZİ. , 151 - 159.
Chicago	Alp Gulcin,BOZDAYI Gülendam,TAŞKIRAN Çağatay,ÖZKAN Seçil,ONAN MEHMET ANIL ÇEŞİTLİ SERVİKAL PATOLOJİYE SAHİP KADINLARDA HUMAN PAPİLLOMAVİRUS (HPV) PREVALANSI VE FİLOGENETİK ANALİZİ. (2013): 151 - 159.
MLA	Alp Gulcin,BOZDAYI Gülendam,TAŞKIRAN Çağatay,ÖZKAN Seçil,ONAN MEHMET ANIL ÇEŞİTLİ SERVİKAL PATOLOJİYE SAHİP KADINLARDA HUMAN PAPİLLOMAVİRUS (HPV) PREVALANSI VE FİLOGENETİK ANALİZİ. , 2013, ss.151 - 159.
AMA	Alp G,BOZDAYI G,TAŞKIRAN Ç,ÖZKAN S,ONAN M ÇEŞİTLİ SERVİKAL PATOLOJİYE SAHİP KADINLARDA HUMAN PAPİLLOMAVİRUS (HPV) PREVALANSI VE FİLOGENETİK ANALİZİ. . 2013; 151 - 159.
Vancouver	Alp G,BOZDAYI G,TAŞKIRAN Ç,ÖZKAN S,ONAN M ÇEŞİTLİ SERVİKAL PATOLOJİYE SAHİP KADINLARDA HUMAN PAPİLLOMAVİRUS (HPV) PREVALANSI VE FİLOGENETİK ANALİZİ. . 2013; 151 - 159.
IEEE	Alp G,BOZDAYI G,TAŞKIRAN Ç,ÖZKAN S,ONAN M "ÇEŞİTLİ SERVİKAL PATOLOJİYE SAHİP KADINLARDA HUMAN PAPİLLOMAVİRUS (HPV) PREVALANSI VE FİLOGENETİK ANALİZİ." , ss.151 - 159, 2013.
ISNAD	Alp, Gulcin vd. "ÇEŞİTLİ SERVİKAL PATOLOJİYE SAHİP KADINLARDA HUMAN PAPİLLOMAVİRUS (HPV) PREVALANSI VE FİLOGENETİK ANALİZİ". (2013), 151-159.

APA	Alp G, BOZDAYI G, TAŞKIRAN Ç, ÖZKAN S, ONAN M (2013). ÇEŞİTLİ SERVİKAL PATOLOJİYE SAHİP KADINLARDA HUMAN PAPİLLOMAVİRUS (HPV) PREVALANSI VE FİLOGENETİK ANALİZİ. Türk Jinekoloji ve Obstetrik Derneği Dergisi, 10(3), 151 - 159.
Chicago	Alp Gulcin,BOZDAYI Gülendam,TAŞKIRAN Çağatay,ÖZKAN Seçil,ONAN MEHMET ANIL ÇEŞİTLİ SERVİKAL PATOLOJİYE SAHİP KADINLARDA HUMAN PAPİLLOMAVİRUS (HPV) PREVALANSI VE FİLOGENETİK ANALİZİ. Türk Jinekoloji ve Obstetrik Derneği Dergisi 10, no.3 (2013): 151 - 159.
MLA	Alp Gulcin,BOZDAYI Gülendam,TAŞKIRAN Çağatay,ÖZKAN Seçil,ONAN MEHMET ANIL ÇEŞİTLİ SERVİKAL PATOLOJİYE SAHİP KADINLARDA HUMAN PAPİLLOMAVİRUS (HPV) PREVALANSI VE FİLOGENETİK ANALİZİ. Türk Jinekoloji ve Obstetrik Derneği Dergisi, vol.10, no.3, 2013, ss.151 - 159.
AMA	Alp G,BOZDAYI G,TAŞKIRAN Ç,ÖZKAN S,ONAN M ÇEŞİTLİ SERVİKAL PATOLOJİYE SAHİP KADINLARDA HUMAN PAPİLLOMAVİRUS (HPV) PREVALANSI VE FİLOGENETİK ANALİZİ. Türk Jinekoloji ve Obstetrik Derneği Dergisi. 2013; 10(3): 151 - 159.
Vancouver	Alp G,BOZDAYI G,TAŞKIRAN Ç,ÖZKAN S,ONAN M ÇEŞİTLİ SERVİKAL PATOLOJİYE SAHİP KADINLARDA HUMAN PAPİLLOMAVİRUS (HPV) PREVALANSI VE FİLOGENETİK ANALİZİ. Türk Jinekoloji ve Obstetrik Derneği Dergisi. 2013; 10(3): 151 - 159.
IEEE	Alp G,BOZDAYI G,TAŞKIRAN Ç,ÖZKAN S,ONAN M "ÇEŞİTLİ SERVİKAL PATOLOJİYE SAHİP KADINLARDA HUMAN PAPİLLOMAVİRUS (HPV) PREVALANSI VE FİLOGENETİK ANALİZİ." Türk Jinekoloji ve Obstetrik Derneği Dergisi, 10, ss.151 - 159, 2013.
ISNAD	Alp, Gulcin vd. "ÇEŞİTLİ SERVİKAL PATOLOJİYE SAHİP KADINLARDA HUMAN PAPİLLOMAVİRUS (HPV) PREVALANSI VE FİLOGENETİK ANALİZİ". Türk Jinekoloji ve Obstetrik Derneği Dergisi 10/3 (2013), 151-159.