Yedi Yıllık Sürede Klinik Örneklerden İzole Edilen Staphylococcus aureus Suşlarında mecC ve Panton-Valentine Lökosidin Gen Varlığının Araştırılması
Yıl: 2015 Cilt: 49 Sayı: 4 Sayfa Aralığı: 594 - 599 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 29-07-2022
Yedi Yıllık Sürede Klinik Örneklerden İzole Edilen Staphylococcus aureus Suşlarında mecC ve Panton-Valentine Lökosidin Gen Varlığının Araştırılması
Öz: Klinik mikrobiyoloji laboratuvarlarında metisiline dirençli Staphylococcus aureus (MRSA)'un saptanması ve tanımlanması, uygun tedavi seçimi ve epidemiyolojik verilerin elde edilmesi için önemlidir. mecC geni, mecA genine yaklaşık %69 DNA benzerliği gösteren bir mecA homoloğudur ve PBP2a/2' proteinine yaklaşık %63 benzerlik gösteren proteini kodlamaktadır. Çeşitli çalışmalar, mecC pozitif MRSA izolatlarının, çapraz kontaminasyon ile çiftlik hayvanlarından insanlara bulaştığını desteklemektedir. Panton-Valentine lökosidini (PVL) ise, S.aureus'un potent sitotoksini olup, önemli bir virülans faktörü olarak kabul edilmektedir. Bu çalışmada, klinik örneklerden izole edilen S.aureus suşlarında mecC ve pvl gen varlığının ve prevalansının araştırılması amaçlanmıştır. Çalışmaya, Ocak 2007-Aralık 2014 tarihleri arasında hastanemizde izole edilmiş olan 1177'si metisiline duyarlı S.aureus (MSSA) ve 523'ü MRSA olmak üzere toplam 1700 S.aureus izolatı dahil edilmiştir. İzolatlar, konvansiyonel yöntemler ve BD Phoenix otomatize sistemi (BD Diagnostic Instrument Systems, ABD) ile tanımlanmıştır. Antibiyotik duyarlılık testi, oksasilin (1 ?g) ve sefoksitin (30 ?g) için Kirby-Bauer disk difüzyon yöntemiyle CLSI standartlarına göre yapılmıştır. mecA gen varlığı gerçek zamanlı PCR; pvl ve mecC gen varlığı ise konvansiyonel PCR yöntemi ile araştırılmıştır. Suşların izole edildiği hastaların %44.6 (759/1700)'sı poliklinik hastası ve %65.8 (1119/1700)'i erkek olup, yaş ortalaması 39.7 yıldır. Çalışmamızda değerlendirilen 1700 izolatın 523 (%30.7)'ünde mecA geni pozitif bulunmuş; hiçbir izolatta mecC geni tespit edilmemiştir. MSSA izolatlarının %1.9 (23/1177)'u ve MRSA izolatlarının %1.7 (9/523)'sinde olmak üzere, toplam 32 (%1.8) izolatta pvl geni pozitif bulunmuştur. PVL pozitif S.aureus'ların %56.2 (18/32)'sinin, deri ve yumuşak doku enfeksiyonu örneklerinden izole edildiği belirlenmiştir. Saptanan PVL pozitifl ik oranı, ülkemizde daha önce yapılan çalışmalar ile benzer bulunmuştur. Bu çalışma, ulaşılabilen kaynaklara göre, ülkemizde mecC tespiti ile ilgili olarak yapılan ilk çalışmadır. Çalışmamızda, mecC geni taşıyan S.aureus izolatı saptanmamış olsa da, bölgesel epidemiyolojik verilerin hızla değişebileceği göz ardı edilmemelidir. Sonuç olarak, ülkemizde mecC geninin araştırılmasına yönelik, hayvan izolatlarının da tarandığı çok merkezli çalışmalara gerek olduğu düşünülmüştür
Anahtar Kelime: Konular:
Investigation of the Presence of mecC and Panton-Valentine Leukocidin Genes in Staphylococcus aureus Strains Isolated from Clinical Specimens During Seven Years Period
Öz: Detection and identifi cation of methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) in clinical microbiology laboratories are important for the selection of appropriate treatment and obtaining epidemiological data. mecC gene, is a mecA homologue, showing almost 69% DNA similarity with the mecA gene and the encoded protein by this gene shows almost 63% similarity with the PBP2a/2' protein. Several studies indicated that mecC positive MRSA strains can be transmitted from the livestock to humans by cross contamination. Panton-Valentine leukocidin (PVL), a potent cytotoxin of S.aureus is also considered as an important virulence factor. The aim of this study was to determine the existence and prevalence of mecC and pvl genes among S.aureus strains isolated from clinical specimens. A total of 1700 S.aureus isolates including 1177 methicillin-susceptible S.aureus (MSSA) and 523 MRSA, isolated in our hospital between January 2007 to December 2014, were included in the study. The isolates were identifi ed by both conventional methods and BD Phoenix automated system (BD Diagnostic Instrument Systems, USA). Antibiotic susceptibility testing was performed by Kirby-Bauer disk diffusion method with oxacillin (1 ?g) and cefoxitin (30 ?g) according to the CLSI standards. The presence of mecA gene was investigated by the use of real-time PCR, and the presence of pvl and mecC genes were detected by conventional PCR method. Among the patients, 44.6% (759/1700) were outpatients, 65.8% (1119/1700) were male and the mean age of of patients was 39.7 years. Of 1700 isolates evaluated in this study, 523 (30.7%) were positive for mecA gene, however all of them were negative for mecC gene. A total of 32 (1.8%) isolates were positive for pvl gene including 23 (1.9%) out of 1177 MSSA and nine (1.7%) out of 523 MRSA strains. Eighteen (56.2%) of the PVL-positive S.aureus strains were isolated from skin and soft tissue infections. The frequency of PVL detected in this study was similar to the data of previous studies in our country. To the best of our knowledge, this is the fi rst study for the determination of the mecC in our country. Although the mecC gene positive S.aureus has not been detected in our study, it should be kept in mind that the regional epidemiological conditions can vary quickly. In conclusion, multicenter studies are needed for the screening of mecC gene including the animal isolates, in Turkey
Anahtar Kelime: Konular:
Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Bibliyografik
- Ariza-Miguel J, Hernández M, Fernández-Natal I, Rodríguez-Lázaro D. Methicillin-resistant Staphylococcus aureus harboring mecC in livestock in Spain. J Clin Microbiol 2014; 52(11): 4067-9.
- Gillet Y, Issartel B, Vanhems P, et al. Association between Staphylococcus aureus strains carrying gene for Panton-Valentine leukocidin and highly lethal necrotising pneumonia in young immunocompetent patients. Lancet 2002; 359(9308): 753-9.
- Clinical and Laboratory Standards Institute. Performance standards for antimicrobial susceptibility testing. 22nd Informational Supplement. CLSI M100-S22, 2012. CLSI, Wayne, PA.
- Kilic A, Muldrew KL, Tang YW, Basustaoglu AC. Triplex real-time polymerase chain reaction assay for simultaneous detection of Staphylococcus aureus and coagulase-negative staphylococci and determination of methicillin resistance directly from positive blood culture bottles. Diagn Microbiol Infect Dis 2010; 66(4): 349-55.
- Stegger M, Andersen PS, Kearns A, et al. Rapid detection, differentiation and typing of methicillin-resistant Staphylococcus aureus harbouring either mecA or the new mecA homologue mecA(LGA251). Clin Microbiol Infect 2012; 18(4): 395-400.
- Skov R, Larsen AR, Kearns A, et al. Phenotypic detection of mecC-MRSA: cefoxitin is more reliable than oxacillin. J Antimicrob Chemother 2014; 69(1): 133-5.
- Becker K, Ballhausen B, Köck R, Kriegeskorte A. Methicillin resistance in Staphylococcus isolates: the "mec alphabet" with specifi c consideration of mecC, a mec homolog associated with zoonotic S.aureus lineages. Int J Med Microbiol 2014; 304(7): 794-804.
- Harrison EM, Paterson GK, Holden MT, et al. Whole genome sequencing identifi es zoonotic transmission of MRSA isolates with the novel mecA homologue mecC. EMBO Mol Med 2013; 5(4): 509-15.
- Petersen A, Stegger M, Heltberg O, et al. Epidemiology of methicillin-resistant Staphylococcus aureus carrying the novel mecC gene in Denmark corroborates a zoonotic reservoir with transmission to humans. Clin Microbiol Infect 2013; 19(1): E16-22.
- Schaumburg F, Köck R, Mellmann A, et al. Population dynamics among methicillin-resistant Staphylococcus aureus isolates in Germany during a 6-year period. J Clin Microbiol 2012; 50(10): 3186-92.
- Basset P, Prod'hom G, Senn L, Greub G, Blanc DS. Very low prevalence of methicillin-resistant Staphylococcus aureus carrying the mecC gene in western Switzerland. J Hosp Infect 2013; 83(3): 257-9.
- Ganesan A, Crawford K, Mende K, et al. Evaluation for a novel methicillin resistance (mecC) homologue in methicillin-resistant Staphylococcus aureus isolates obtained from injured military personnel. J Clin Microbiol 2013; 51(9):3073-5.
- Saeed K, Ahmad N, Dryden M, et al. Oxacillin-susceptible methicillin-resistant Staphylococcus aureus (OS-MRSA), a hidden resistant mechanism among clinically signifi cant isolates in the Wessex region/UK. Infection 2014; 42(5): 843-7.
- van der Mee-Marquet N, Poisson DM, Lavigne JP, et al. The incidence of Staphylococcus aureus ST8-USA300 among French pediatric inpatients is rising. Eur J Clin Microbiol Infect Dis 2015; 34(5): 935-42.
- Seidl K, Leimer N, Palheiros Marques M, et al. USA300 methicillin-resistant Staphylococcus aureus in Zurich, Switzerland between 2001 and 2013. Int J Med Microbiol 2014; 304(8): 1118-22.
- Waldenburger S, Vogel U, Goebeler M, Kolb-Mäurer A. Community-acquired skin infections caused by Staphylococcus aureus: what is the role of the Panton-Valentine leukocidin toxin? J Dtsch Dermatol Ges 2014; 12(1): 59-66.
- Dozois A, Thomsen I, Jimenez-Truque N, et al. Prevalence and molecular characteristics of methicillin- resistant Staphylococcus aureus among skin and soft tissue infections in an emergency department in Guyana. Emerg Med J 2014; pii: emermed-2013-203373. [Epub ahead of print].
- Borbón-Esquer EM, Villaseñor-Sierra A, Martínez-López E, Jáuregui-Lomeli JJ, Villaseñor-Martínez R, Ruiz- Briseño Mdel R. SCCmec types and pvl gene in methicillin-resistant Staphylococcus aureus strains from children hospitalized in a tertiary care hospital in Mexico. Scand J Infect Dis 2014; 46(7): 523-7.
- Rezaei M, Moniri R, Mousavi SG. Molecular analysis and susceptibility pattern of methicillin-resistant Staphylococcus aureus strains in emergency department patients and related risk factors in Iran. J Hosp Infect 2015; 89(3): 186-91.
- Tekeli A, Koyuncu E, Dolapçi I, Akan OA, Karahan ZC. Molecular characteristics of methicillin-resistant Staphylococcus aureus strains isolated from blood cultures between 2002-2005 in Ankara University Hospital. Mikrobiyol Bul 2009; 43(1): 1-10.
- Gülmez D, Sancak B, Ercis S, Karakaya J, Hasçelik G. Investigation of SCCmec types and Panton-Valentine leukocidin in community-acquired and nosocomial Staphylococcus aureus strains: comparing skin and soft tissue infections to the other infections. Mikrobiyol Bul 2012; 46(3): 341-51.
- Bozdoğan B, Yıldız O, Oryaşın E, et al. t030 is the most common spa type among methicillin-resistant Staphylococcus aureus strains isolated from Turkish hospitals. Mikrobiyol Bul 2013; 47(4): 571-81.
- Yılmaz S, Kılıç A, Karagöz A, et al. Investigation of various virulence factors among the hospital and community-acquired Staphylococcus aureus isolates by real-time PCR method. Mikrobiyol Bul 2012; 46(4): 532-45.
| APA | Kiliç A, DOĞAN E, KAYA S, BAYSALLAR M (2015). Yedi Yıllık Sürede Klinik Örneklerden İzole Edilen Staphylococcus aureus Suşlarında mecC ve Panton-Valentine Lökosidin Gen Varlığının Araştırılması. , 594 - 599. |
| Chicago | Kiliç Abdullah,DOĞAN Eyüp,KAYA Sinem,BAYSALLAR Mehmet Yedi Yıllık Sürede Klinik Örneklerden İzole Edilen Staphylococcus aureus Suşlarında mecC ve Panton-Valentine Lökosidin Gen Varlığının Araştırılması. (2015): 594 - 599. |
| MLA | Kiliç Abdullah,DOĞAN Eyüp,KAYA Sinem,BAYSALLAR Mehmet Yedi Yıllık Sürede Klinik Örneklerden İzole Edilen Staphylococcus aureus Suşlarında mecC ve Panton-Valentine Lökosidin Gen Varlığının Araştırılması. , 2015, ss.594 - 599. |
| AMA | Kiliç A,DOĞAN E,KAYA S,BAYSALLAR M Yedi Yıllık Sürede Klinik Örneklerden İzole Edilen Staphylococcus aureus Suşlarında mecC ve Panton-Valentine Lökosidin Gen Varlığının Araştırılması. . 2015; 594 - 599. |
| Vancouver | Kiliç A,DOĞAN E,KAYA S,BAYSALLAR M Yedi Yıllık Sürede Klinik Örneklerden İzole Edilen Staphylococcus aureus Suşlarında mecC ve Panton-Valentine Lökosidin Gen Varlığının Araştırılması. . 2015; 594 - 599. |
| IEEE | Kiliç A,DOĞAN E,KAYA S,BAYSALLAR M "Yedi Yıllık Sürede Klinik Örneklerden İzole Edilen Staphylococcus aureus Suşlarında mecC ve Panton-Valentine Lökosidin Gen Varlığının Araştırılması." , ss.594 - 599, 2015. |
| ISNAD | Kiliç, Abdullah vd. "Yedi Yıllık Sürede Klinik Örneklerden İzole Edilen Staphylococcus aureus Suşlarında mecC ve Panton-Valentine Lökosidin Gen Varlığının Araştırılması". (2015), 594-599. |
| APA | Kiliç A, DOĞAN E, KAYA S, BAYSALLAR M (2015). Yedi Yıllık Sürede Klinik Örneklerden İzole Edilen Staphylococcus aureus Suşlarında mecC ve Panton-Valentine Lökosidin Gen Varlığının Araştırılması. Mikrobiyoloji Bülteni, 49(4), 594 - 599. |
| Chicago | Kiliç Abdullah,DOĞAN Eyüp,KAYA Sinem,BAYSALLAR Mehmet Yedi Yıllık Sürede Klinik Örneklerden İzole Edilen Staphylococcus aureus Suşlarında mecC ve Panton-Valentine Lökosidin Gen Varlığının Araştırılması. Mikrobiyoloji Bülteni 49, no.4 (2015): 594 - 599. |
| MLA | Kiliç Abdullah,DOĞAN Eyüp,KAYA Sinem,BAYSALLAR Mehmet Yedi Yıllık Sürede Klinik Örneklerden İzole Edilen Staphylococcus aureus Suşlarında mecC ve Panton-Valentine Lökosidin Gen Varlığının Araştırılması. Mikrobiyoloji Bülteni, vol.49, no.4, 2015, ss.594 - 599. |
| AMA | Kiliç A,DOĞAN E,KAYA S,BAYSALLAR M Yedi Yıllık Sürede Klinik Örneklerden İzole Edilen Staphylococcus aureus Suşlarında mecC ve Panton-Valentine Lökosidin Gen Varlığının Araştırılması. Mikrobiyoloji Bülteni. 2015; 49(4): 594 - 599. |
| Vancouver | Kiliç A,DOĞAN E,KAYA S,BAYSALLAR M Yedi Yıllık Sürede Klinik Örneklerden İzole Edilen Staphylococcus aureus Suşlarında mecC ve Panton-Valentine Lökosidin Gen Varlığının Araştırılması. Mikrobiyoloji Bülteni. 2015; 49(4): 594 - 599. |
| IEEE | Kiliç A,DOĞAN E,KAYA S,BAYSALLAR M "Yedi Yıllık Sürede Klinik Örneklerden İzole Edilen Staphylococcus aureus Suşlarında mecC ve Panton-Valentine Lökosidin Gen Varlığının Araştırılması." Mikrobiyoloji Bülteni, 49, ss.594 - 599, 2015. |
| ISNAD | Kiliç, Abdullah vd. "Yedi Yıllık Sürede Klinik Örneklerden İzole Edilen Staphylococcus aureus Suşlarında mecC ve Panton-Valentine Lökosidin Gen Varlığının Araştırılması". Mikrobiyoloji Bülteni 49/4 (2015), 594-599. |
