İdrar Kültürlerinden İzole Edilen Toplum Kökenli Escherichia coli Suşlarında Antibiyotik Direnci

DENK, Affan; SAĞMAK TARTAR, AYŞE

İdrar Kültürlerinden İzole Edilen Toplum Kökenli Escherichia coli Suşlarında Antibiyotik Direnci

Affan DENK, (Fırat Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Elazığ, Türkiye)

Ayşe SAĞMAK TARTAR (Sağlık Bakanlığı, Cizre Devlet Hastanesi, Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Bölümü, Şırnak, Türkiye)

Fırat Üniversitesi Sağlık Bilimleri Tıp Dergisi

2 1

Yıl: 2015 Cilt: 29 Sayı: 2 Sayfa Aralığı: 51 - 55 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 29-07-2022

İdrar Kültürlerinden İzole Edilen Toplum Kökenli Escherichia coli Suşlarında Antibiyotik Direnci

Öz:

Amaç: Üriner sistem enfeksiyonları (ÜSE), klinikte en sık karşılaşılan toplum kökenli bakteriyel enfeksiyonlardır. Bu çalışmada, toplum kökenli ÜSE etkenlerinden en sık izole edilen Escherichia coli suşlarının özellikle ampirik tedavide sık kullanılan antibiyotiklere karşı direnç durumlarının araştırılması amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Toplum kökenli ÜSE tanısı konulan hastalardan uygun şartlarda alınan idrar kültürleri Fırat Üniversitesi Hastanesi Enfeksiyon Hastalıkları Laboratuarı'na gönderildi. Son bir yıl içerisinde enfeksiyon etkeni olarak izole edilen 222 E. coli suşu çalışmaya dahil edildi. İdrar örnekleri %5 koyun kanlı agar ve Eosin Metilen Blue agar besiyerlerine ekilerek 37°C'de 18-24 saat inkübe edildi. İdrarda >105 cfu/mL üreme olması pozitif sonuç olarak kabul edildi. Suşların identifikasyonunda konvansiyonel yöntemler kullanıldı. İzolatların antibiyotik duyarlılıkları Clinical and Laboratory Standards Institute kriterlerine göre Kirby-Bauer disk difüzyon yöntemi ile araştırıldı. Bulgular: Çalışmada E. coli suşlarına karşı en etkili antibiyotikler sırasıyla; fosfomisin, nitrofurantoin ve amikasin bulundu. Direnç oranı en yüksek olanlar ise sırasıyla; ampisilin, trimetoprim-sulfametoksazol ve seftriakson idi. Sonuç: Toplum kökenli enfeksiyonlarda ampirik tedavide kullanılacak antibiyotikleri seçerken ülkemizde hatta bölgemizde direnç oranlarını iyi bilmemiz gereklidir. Bunun için mikroorganizmaların, özellikle sık karşılaşılan etkenlerin yerel duyarlılıklarının belirli dönemlerde araştırılması önem arz etmektedir

Anahtar Kelime:

Konular: Mikrobiyoloji Biyoteknoloji ve Uygulamalı Mikrobiyoloji Farmakoloji ve Eczacılık Tıbbi Laboratuar Teknolojisi

Antibiotic Resistance in Community-Acquired Escherichia coli Strains Isolated from Urine Culture

Öz:

Objective: Urinary tract infection (UTI) is the most common encountered community-acquired bacterial infections in clinic. In this study, it was aimed to investigate resistance profiles of the Escherichia coli strains which are most frequently isolated from the community-acquired UTI, against commonly used antibiotics for empiric therapy. Materials and Methods: Urine samples appropriately taken from patients who were diagnosed as community-acquired UTI were sent to Fırat University Hospital Infectious Diseases laboratory. Totally 222 E. coli strains isolated as the agent of infection within the previous year were included in this study. Each sample was inoculated on 5 % sheep blood agar and Eosin Methylene Blue (EMB) and incubated at 37°C for 18-24 hr. Growth of >=105 cfu/mL was considered as a positive culture result. The bacteria grown on the plates were identified by conventional methods. Antibiotic susceptibility of the isolates were investigated by use of Kirby-Bauer disk diffusion method according to the criteria of Clinical and Laboratory Standards Institute. Results: The most effective antibiotics against E. coli in the study were found fosfomycin, nitrofurantoin, and amikacin, respectively. The highest resistance rates were detected as ampicillin, trimethoprim-sulfamethoxazole, and ceftriaxone, respectively. Conclusion: We need to have a good knowledge about the resistance rates of microorganisms in our country and even in our region when choosing antibiotics for empirical therapy of community-acquired infections. Therefore it is important to investigate local sensitivity rates of most frequently encountered microorganisms in certain periods

Anahtar Kelime:

Konular: Mikrobiyoloji Biyoteknoloji ve Uygulamalı Mikrobiyoloji Farmakoloji ve Eczacılık Tıbbi Laboratuar Teknolojisi

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık

Mamıkoğlu L, İnan D. İdrar yolu enfeksiyonları. In: Willke Topçu A, Söyletir G, Doğanay M, (Editörler). Enfeksiyon Hastalıkları ve Mikrobiyolojisi. İstanbul: Nobel Tıp Kitabevleri, 2008: 1487-1506.
Sobel JD, Kaye D. Urinary tract infections. In: Mandell GL, Bennett JE, Dolin R, (Editors). Mandell, Douglas and Bennett's Diseases. 7th Edition, Philadelphia: Churchill Livingstone, 2010: 957-985.
Taşbakan MI, Pullukçu H, Yamazhan T, Arda B, Ulusoy S. Toplum kökenli üriner sistem infeksiyonlarından soyutlanan suşlarında fosfomisinin in-vitro etkinliğinin diğer antibiyotiklerle karşılaştırılması. ANKEM Derg 2004; 18: 216-219.
Arman D, Ağalar C, Dizbay M, ve ark. Birinci basamak sağlık merkezlerinde toplum kökenli alt üriner sistem enfeksiyonları: Etkenler ve antimikrobiyal duyarlılıkları. JInfect Microb Antimicrob 2012; 1: 10.
Etienne M, Lefebvre E, Frebourg N, et al. Antibiotic treatment of acute uncomplicated cystitis based on rapid urine test and local epidemiology: Lessons from a primary care series. BMC Infect Dis 2014; 14: 137. 6.
Pullukçu H, Aydemir Ş, Taşbakan MI, et al. Nitrofurantoinin idrar kültürlerinden soyutlanan Escherichia coli suşlarına in vitro etkinliği. İnfeksiyon Derg 2007; 21: 197-200.
Clinical and Laboratory Standarts Institute. Performance standarts for antimicrobial susceptibility testing; Tweenty- first informational supplement. M100-S21. Wayne, PA: CLSI, 2011.
Chomarat M. Resistance of bacteria in urinary tract infections. Int J Antimicrob Agent 2000; 16: 483-487.
Kahlmeter G, Poulsen HO. Antimicrobial susceptibility of Escherichia coli from community-acquired urinary tract infections in Europe: The ECO.SENS study revisited. Int J Antimicrob Agents 2012; 39: 45-51.
Zhanel GG, Karlowsky JA, Harding GK, et al. A Canadian National Surveillance Study of Urinary Tract Isolates from Outpatients: Comparison of the activities of trimetoprim- sulfamethoxazole, ampicillin, mecillinam, nitrofurantoin, and ciprofloxacin. Antimicrob Agents Chemother 2000; 44: 1089-1092.
Naber KG, Schito G, Botto H, Palou J, Mazzei T. Surveillance study in Europe and Brazil on clinical aspects and Antimicrobial Resistance Epidemiology in Females with Cystitis (ARESC): Implications for empiric therapy. Eur Urol 2008; 54: 1164-1175.
İnci M, Yula E, Köksaldı Motor V, ve ark. Nitrofurantoin ve fosfomisinin idrar yolu enfeksiyonu etkeni olan E. coli izolatlarına in vitro etkinliği. Yeni Tıp Dergisi 2013; 30: 75- 78.
Aral M, Kireçci E, Doğan SŞ. İdrar örneklerinden izole edilen gram negatif bakteriler ve antibiyotiklere direnç oranlarının retrospektif olarak değerlendirilmesi. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Derg 2011; 41: 139-142.
Küçükbayrak A, Behçet M, Güler S, Özdemir D. Üriner semptomu olan poliklinik hastalarının idrarında üreyen E.coli suşlarının antibiyotik duyarlılığı. Tıp Araştırmaları Dergisi 2006; 4: 18-21.
Bozkurt H, Güdücüoğlu H, Gülmez S, Aygül K, İzci H,Berktaş. Erişkin yaş grubu İidrar kültürlerinden izole edilen Escherichia coli suşlarının antimikrobiyallere duyarlılıkları. Van Tıp Derg 2005; 12: 232-235.
Gazi H, Sürücüoğlu S, Kurutepe S. İdrar kültürlerinden izole edilen Gram negatif bakterilerde antibiyotiklere direnç. ANKEM Derg 2007; 21: 19-22.
Göker G, Kaya I, Aydın D, Gürler N. Üriner sistemden izole edilen Escherichia coli, Klebsiella ve Enterokok cinsi bakterilerde fosfomisin duyarlılığının araştırılması. ANKEM Derg 2007; 21: 219-222.
Uyanık MH, Hancı H, Yazgı H. Üriner sistem infeksiyonlarından soyutlanan toplum kökenli Escherichia coli antibiyotiklerin in-vitro etkinliği. ANKEM Derg 2009; 23: 172-176.
Otağ F, Yıldız Ç, Delialioğlu N. İdrardan soyutlanan E. colisuşlarında antibiyotik direnci. ANKEM Derg 2003; 17: 384- 387.
Demirci M, Cicioğlu Arıdoğan B, Arda M. Poliklinik hastalarının idrar kültürlerinden izole edilen Gram-negatif çomakların antibiyotiklere duyarlılığı. ANKEM Derg 2000; 14: 576-579.
Arca EA, Karabiber N. Üriner sistem Escherichia coli izolatlarının fosfomisin trometamol ve çeşitli antibiyotiklere karşı duyarlılıklarının karşılaştırılması. Mikrobiyol Bul 2007; 41: 115-119.
Türkmen L. İdrar örneklerinden izole edilen Gram negatif bakterilerin değişik antibiyotiklere duyarlılığı. İnönü Üniversitesi Tıp Fakültesi Dergisi 2002; 9: 185-189.
Erden S, Çalangu S. Poliklinik hastalarında üriner sistem infeksiyonlarından izole edilen Escherichia coli suşlarının çeşitli antibiyotiklere in vitro duyarlılıkları. İstanbul Tıp Fakültesi Mecmuası 2002; 65: 147-149.
Bayram Y, Eren H, Berktaş M. İdrar örneklerinden izole edilen bakteriyel patojenlerin dağılımı ve GSBL pozitif ve negatif Escherichia coli suşlarının fosfomisin ve diğer antimikrobiyallere duyarlılık paterni. ANKEM Derg 2011; 25: 232-236.
Tas T, Mengeloglu Z, Kocoglu E, Bucak Ö. In vitro activity of fosfomycin against Escherichia coli strains isolated from recurrent urinary tract infections. SEEHSJ 2013; 3: 147- 151.
Deveci Ö, Yula E, Tekin A. İdrar kültürlerinden izole edilen suşlarında beta-laktamaz sıklığı ve antibiyotik direnci. Klinik ve Deneysel Araştırmalar Dergisi; 1: 182-186.
Köksaldı Motor V, Tutanç M, Arıca V, Arıca S, Ay B. Üropatojen Escherichia coli suşlarının üriner sistem infeksiyonlarının tedavisinde sık kullanılan antibakteriyel ajanlara duyarlılıkları. ANKEM Derg 2010; 24: 198-201.
Kaygusuz S, Apan TZ, Kılıç D. Toplum kökenli üriner sistem infeksiyonu etkeni Gram negatif bakterilerde çeşitli antibiyotiklere direnç. ANKEM Derg 2001; 15: 753-759.
Tekin A, Deveci Ö, Dal T, ve ark. Üropatojen Escherichia coli izolatlarına fosfomisin ve bazı antibiyotiklerin in vitro etkinliği. ANKEM Derg 2012; 26: 61-68.
Çıkman A, Gündem NS, Gülhan B, ve ark. İdrar kültürlerinden soyutlanan Enterobacteriaceae türlerinin GSBL üretimi ile ertapenem ve diğer antibiyotiklere direncinin belirlenmesi. Dicle Tıp Derg 2014; 41: 474-478.
Mengeloğlu FZ, Demircan F, Oduncu MK. İdrar kültürlerinden soyutlanan Escherichia coli izolatlarının fosfomisine karşı in-vitro duyarlılıklarının değerlendirilmesi. ANKEM Derg 2011; 25: 99-102.
Köken G, Aşık G, Çiftci İH, ve ark. Toplum kökenli üriner sistem enfeksiyonu etkeni Escherichia coli suşlarında fosfomisin trometamol etkinliği. ANKEM Derg 2008; 22: 23- 27.
Kurutepe S, Surucuoglu S, Sezgin C, et al. Increasing antimicrobial resistance in Escherichia coli isolates from community-acquired urinary tract infections during 1998- 2003 in Manisa, Turkey. Jpn J Infect Dis 2005; 58: 159- 161.
Raz R, Chazan B, Kennes Y. Israeli Urinary Tract Infection Group. Empiric use of trimethoprim-sulfamethoxazole (TMP-SMX) in the treatment of women with uncomplicated urinary tract infections in a geographical area with a high prevalence of TMP-SMX-resistant uropathogens. Clin Infect Dis 2002; 34: 1165-1169.
Arslan H, Azap OK, Ergonul O. Urinary Tract Infection Study Group. Risk factors for ciprofloxacin resistance among Escherichia coli strains isolated from community- acquired urinary tract infections in Turkey. J Antimicrob Chemother 2005; 56: 914-918.
Aykan ŞB, Çiftci İH. Türkiye'de idrar kültürlerinden izole edilen Escherichia coli suşlarının antibiyotiklere direnç durumu: Bir meta-analiz. Mikrobiyol Bul 2013; 47: 603-618.
Tekin A, Dal T, Deveci O, et al. In vitro efficacy of nitrofurantoin and some antibiotics in Escherichia coli strains isolated from urine cultures. The New Journal of Medicine 2012; 29: 88-91.
Marchese A, Bozzolasco M, Gualco L, et al. Effect of fosfomycin alone and in combination with N-acetylcysteine on E. coli biofilms. Int J Antimicrob Agents 2003; 22: 95- 100.

APA	DENK A, SAĞMAK TARTAR A (2015). İdrar Kültürlerinden İzole Edilen Toplum Kökenli Escherichia coli Suşlarında Antibiyotik Direnci. , 51 - 55.
Chicago	DENK Affan,SAĞMAK TARTAR AYŞE İdrar Kültürlerinden İzole Edilen Toplum Kökenli Escherichia coli Suşlarında Antibiyotik Direnci. (2015): 51 - 55.
MLA	DENK Affan,SAĞMAK TARTAR AYŞE İdrar Kültürlerinden İzole Edilen Toplum Kökenli Escherichia coli Suşlarında Antibiyotik Direnci. , 2015, ss.51 - 55.
AMA	DENK A,SAĞMAK TARTAR A İdrar Kültürlerinden İzole Edilen Toplum Kökenli Escherichia coli Suşlarında Antibiyotik Direnci. . 2015; 51 - 55.
Vancouver	DENK A,SAĞMAK TARTAR A İdrar Kültürlerinden İzole Edilen Toplum Kökenli Escherichia coli Suşlarında Antibiyotik Direnci. . 2015; 51 - 55.
IEEE	DENK A,SAĞMAK TARTAR A "İdrar Kültürlerinden İzole Edilen Toplum Kökenli Escherichia coli Suşlarında Antibiyotik Direnci." , ss.51 - 55, 2015.
ISNAD	DENK, Affan - SAĞMAK TARTAR, AYŞE. "İdrar Kültürlerinden İzole Edilen Toplum Kökenli Escherichia coli Suşlarında Antibiyotik Direnci". (2015), 51-55.

APA	DENK A, SAĞMAK TARTAR A (2015). İdrar Kültürlerinden İzole Edilen Toplum Kökenli Escherichia coli Suşlarında Antibiyotik Direnci. Fırat Üniversitesi Sağlık Bilimleri Tıp Dergisi, 29(2), 51 - 55.
Chicago	DENK Affan,SAĞMAK TARTAR AYŞE İdrar Kültürlerinden İzole Edilen Toplum Kökenli Escherichia coli Suşlarında Antibiyotik Direnci. Fırat Üniversitesi Sağlık Bilimleri Tıp Dergisi 29, no.2 (2015): 51 - 55.
MLA	DENK Affan,SAĞMAK TARTAR AYŞE İdrar Kültürlerinden İzole Edilen Toplum Kökenli Escherichia coli Suşlarında Antibiyotik Direnci. Fırat Üniversitesi Sağlık Bilimleri Tıp Dergisi, vol.29, no.2, 2015, ss.51 - 55.
AMA	DENK A,SAĞMAK TARTAR A İdrar Kültürlerinden İzole Edilen Toplum Kökenli Escherichia coli Suşlarında Antibiyotik Direnci. Fırat Üniversitesi Sağlık Bilimleri Tıp Dergisi. 2015; 29(2): 51 - 55.
Vancouver	DENK A,SAĞMAK TARTAR A İdrar Kültürlerinden İzole Edilen Toplum Kökenli Escherichia coli Suşlarında Antibiyotik Direnci. Fırat Üniversitesi Sağlık Bilimleri Tıp Dergisi. 2015; 29(2): 51 - 55.
IEEE	DENK A,SAĞMAK TARTAR A "İdrar Kültürlerinden İzole Edilen Toplum Kökenli Escherichia coli Suşlarında Antibiyotik Direnci." Fırat Üniversitesi Sağlık Bilimleri Tıp Dergisi, 29, ss.51 - 55, 2015.
ISNAD	DENK, Affan - SAĞMAK TARTAR, AYŞE. "İdrar Kültürlerinden İzole Edilen Toplum Kökenli Escherichia coli Suşlarında Antibiyotik Direnci". Fırat Üniversitesi Sağlık Bilimleri Tıp Dergisi 29/2 (2015), 51-55.