Kan Kültürlerinde İzole Edilerek Tanımlanan Mikroorganizmaların ve Antibiyotik Direnç Oranlarının Belirlenmesi

AŞIK, Gülşah; YOLDAŞ, Özlem; DEMİR, CENGİZ; Kesli, Recep; Er, Halil

Kan Kültürlerinde İzole Edilerek Tanımlanan Mikroorganizmaların ve Antibiyotik Direnç Oranlarının Belirlenmesi

Halil ER, (Muş Devlet Hastanesi)

Gülşah AŞIK, (Afyon Kocatepe Üniversitesi Tıp Fakültesi)

Özlem YOLDAŞ, (Afyon Kocatepe Üniversitesi Tıp Fakültesi)

Cengiz DEMİR, (Afyon Kocatepe Üniversitesi Tıp Fakültesi)

Recep KEŞLİ (Afyon Kocatepe Üniversitesi Tıp Fakültesi)

Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi

4 0

Yıl: 2015 Cilt: 45 Sayı: 1 Sayfa Aralığı: 48 - 54 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 29-07-2022

Kan Kültürlerinde İzole Edilerek Tanımlanan Mikroorganizmaların ve Antibiyotik Direnç Oranlarının Belirlenmesi

Öz:

Amaç: Sepsis, mikroorganizmaların ve toksinlerinin kana karışımı sonucu gelişen, hayatı tehdit eden ve çok hızlı ilerleyen klinik bir tablodur. Bu çalışmanın amacı, Afyon Kocatepe Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi'nde yatan hastalara ait kan kültürlerinden sepsis etkeni olarak izole edilen mikroorganizmaların tiplendirilmesi ve antibiyotik direnç oranları belirlenmesidir. Gereç ve Yöntem: Kan kültürü örnekleri BACT/ALERT 3D (BioMérieux, Marcy I'Etoile, Fransa) otomatize sistemi ile 5 gün inkübe edilmiştir. Mikroorganizmaların identifikasyonu konvansiyonel yöntemler ve BD Phoenix otomatize sistem (Becton Dickinson, Sparks, Maryland, ABD) ile yapılmıştır. Antibiyotik duyarlılıkları CLSI önerileri doğrultusunda Kirby-Bauer disk difüzyon yöntemi ile belirlenmiştir. Bulgular: Çalışmaya dâhil edilen 4262 kan kültüründen 765 (%17.9)'i bakteriyemi ve sepsis etkeni olarak değerlendirilmiştir. İzole edilen mikroorganizmalar arasında ilk sırayı Staphlococcus aureus (n:293, %38.3) alırken, bunu koagülaz negatif Stafilokoklar (KNS) (n:139, %18.2), Escherichia coli (n:93, %12.1), Enterococcus spp. (n:56, %7.3), Klebsiella pneumoniae (n:54, %7.1), Acinetobacter baumannii (n:37, %4.8), Pseudomonas aeruginosa (n:31, %4.1), Brucella spp. (n:25, %3.3), Candida spp. (n:25; %3.3), Streptococcus pneumoniae (n:7; %0.9) ve Serratia marcescens (n:5, %0.6) izlemiştir. S. aureus ve KNS üreyen örneklerde metisilin direnci sırası ile %71.7 ve %59.0 olarak tespit edilmiştir. Enterokoklarda ise %5.4 oranında vankomisin direncine rastlanmıştır. Enterobacteriaceae türlerinde en yüksek oranda direnç seftazidime karşı görülürken, karbapenemlerin en etkili antibiyotik grubu olduğu belirlenmiştir. Nonfermentetif bakterilerde ise aminoglikozidlerin en etkili antibiyotik grubu olduğu belirlenmiştir. Sonuç: Kan kültürlerinden izole edilen mikroorganizmalar ve bunların antibiyotik duyarlılıkları bölgelere ve hastanelere göre farklılık göstermektedir. Bu nedenle her hastanenin belli aralıklarla sepsis etkeni olan mikroorganizma dağılımı ve antibiyotik duyarlılıklarını raporlaması gerektiği düşünülmektedir

Anahtar Kelime:

Konular: Biyoloji Mikrobiyoloji Biyoteknoloji ve Uygulamalı Mikrobiyoloji Farmakoloji ve Eczacılık Tıbbi Laboratuar Teknolojisi

Determination of the Microorganisms Isolated from Blood Cultures and Their Antibiotic Susceptibility Rates

Öz:

Aim: Sepsis is a serious, life-threatening condition that progresses very quickly due to the spread of microorganisms and their toxins in the blood. The aim of this study was to determine the distribution and antibiotic susceptibilities of the microorganisms isolated from blood cultures at Afyon Kocatepe University Medical Faculty Hospital, Turkey. Materials and Methods: Blood culture samples were incubated in BACT/ALERT 3D automated system (Biomerieux, Marcy L'Etoile, France) for 5 days. Identification of the microorganisms was performed by conventional methods and the BD Phoenix automated system (Becton Dickinson, Sparks, Maryland, USA). Antibiotic susceptibilities were determined by the Kirby-Bauer disk diffusion method in accordance with CLSI recommendations. Results: Among the 4262 blood cultures, 765 (17.9%) revealed growth of microorganisms considered as causative agents of bacteremia and sepsis. The most frequently isolated microorganism was Staphylococcus aureus (n:293, 38.3%) followed by coagulase negative staphylococci (CNS) (n:139, 18.2%), Escherichia coli (n:93, 12.1%), Enterococcus spp. (n:56, 7.3%), Klebsiella pneumoniae (n:54, 7.1%), Acinetobacter baumannii (n:37, 4.8%), Pseudomonas aeruginosa (n:31, 4.1%), Brucella spp. (n:25, 3.3%), Candida spp. (n:25, 3.3%), Streptococcus pneumoniae (n:7, 0.9%) and Serratia marcescens (n:5, 0.6%). Methicillin resistance was determined in 71.7% of S. aureus and 59.0% of CNS strains. The rate of vancomycin resistance in enterococci was 5.4%. The highest rates of resistance in Enterobacteriaceae were against ceftazidime. Carbapenems were determined to be the most effective antibiotic group against Enterobacteriaceae. Aminoglycosides were the most effective group of antibiotics in nonfermentative bacteria.Conclusion: The distribution of the microorganisms isolated from blood cultures and their antibiotic susceptibility profiles vary in each hospital and geographical area. Thus, periodical report of antibiotic susceptibility profiles of blood pathogens is of crucial importance for the determination of empirical treatment protocols

Anahtar Kelime:

Konular: Biyoloji Mikrobiyoloji Biyoteknoloji ve Uygulamalı Mikrobiyoloji Farmakoloji ve Eczacılık Tıbbi Laboratuar Teknolojisi

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık

1. Köksal F, Samastı M. Kan kültüründen izole edilen stafilokoklarda antibiyotik direnci. ANKEM Derg 2002;16:10-3.
2. Negussie A, Mulugeta G, Bedru A, Ali I, Shimeles D, Lema T, Aseffa A. Bacteriological profile and antimicrobial susceptibility pattern of blood culture isolates among septicemia suspected children in selected hospitals Addis Ababa, Ethiopia. Int J Biol Med Res 2015; 6:4709-17.
3. Weinstein MP. Current blood culture methods and systems: clinical concepts, technology, and interpretation of results. Clin Infect Dis 1996; 23:40-6. http://dx.doi.org/10.1093/clinids/23.1.40
4. Gül Yurtsever S, Baran N, Afşar i, Yalçın MA, Kurultay N, Türker M. İzmir Atatürk Eğitim ve Araştırma Hastanesi'nde kan kültürlerinden izole edilen mikroorganizmalar ve antibiyotiklere karşı duyarlı- lıkları. Klimik Derg 2006; 19:56-9.
5. Hall MJ, Williams SN, DeFrances CJ, Golosinskiy A. Inpatient care for septicemia or sepsis: A challenge for patients and hospitals. NCHS Data Brief 2011; 62:1-8.
6. Khaleel ME, Lone DS, Munir M, Khan JK, Zahra KT, Hanif A. A Study of Microbial Isolates from Blood at a University Teaching Hospital. Annals of King Edward Medical University 2010; 16:194-7.
7. Clinical and Laboratory Standards Institute: Performance Standards for Antimicrobial Susceptibility Testing, Twentieth Informational Supplement, M100- S20, CLSI, Wayne, PA, 2010.
8. Doğanay M, Meşe EA. Sepsis. Willke Topçu A, Söyletir G, Doğanay M. Enfeksiyon Hastalıkları ve Mikrobiyolojisi. Nobel Tıp Kitabevleri, İstanbul, 2008: 877-97.
9. Sümerkan B. Nozokomiyal sepsis. Etiyoloji ve mikrobiyolojik tanı. Hastane Enfeksiyon Derg 1998; 2:182-7.
10. Kim HJ, Lee NY, Kim S, et al. Characteristics of microorganisms isolated from blood cultures at nine university hospitals in Korea during 2009. Korean J Clin Microbiol 2011; 14:48-54. http://dx.doi.org/10.5145/KJCM.2011.14.2.48
11. Öksüz Ş, Yavuz T, İdris Ş, Yıldırım M, Akgünoğlu M, Kaya D, Öztürk E. Kan kültürlerinden izole edilen mikroorganizmalar ve antibiyotiklere duyarlılıkları. Turk Mikrobiyol Cem Derg 2008; 38:117-21.
12. Ece G. Kan kültüründe üreyen izolatların dağılımı ve antibiyotik duyarlılık profilinin incelenmesi. Haseki Tıp Bülteni 2013; 51:151-6. http://dx.doi.org/10.4274/Haseki.1044
13. Yüce P, Demirdağ K, Kalkan A, Özden M, Denk A, Kılıç SS. Kan kültürlerinde izole edilen mikroorganizmalar ve antibiyotik duyarlılıkları. ANKEM Derg 2005; 19:17-21.
14. Duman Y, Kuzucu Ç, Çuğlan SS. Kan kültürlerinden izole edilen bakteriler ve antimikrobiyal duyarlılıkları. Erciyes Tıp Dergisi 2011; 33:189-96.
15. Yılmaz S, Gümral R, Güney M ve ark. İki yıllık dönemde kan kültürlerinden izole edilen mikroorganizmalar ve antibiyotik duyarlılıkların değerlendirilmesi. Gülhane Tıp Dergisi 2013; 55:247-52.
16. Demirbakan H, Dağlar D, Yıldırım Ç ve ark. Kan kültürlerinden izole edilen bakteriler ve antibiyotiklere duyarlılıkları. Turk Mikrobiyol Cem Derg 2005; 35:183-8.

APA	Er H, AŞIK G, YOLDAŞ Ö, DEMİR C, Kesli R (2015). Kan Kültürlerinde İzole Edilerek Tanımlanan Mikroorganizmaların ve Antibiyotik Direnç Oranlarının Belirlenmesi. , 48 - 54.
Chicago	Er Halil,AŞIK Gülşah,YOLDAŞ Özlem,DEMİR CENGİZ,Kesli Recep Kan Kültürlerinde İzole Edilerek Tanımlanan Mikroorganizmaların ve Antibiyotik Direnç Oranlarının Belirlenmesi. (2015): 48 - 54.
MLA	Er Halil,AŞIK Gülşah,YOLDAŞ Özlem,DEMİR CENGİZ,Kesli Recep Kan Kültürlerinde İzole Edilerek Tanımlanan Mikroorganizmaların ve Antibiyotik Direnç Oranlarının Belirlenmesi. , 2015, ss.48 - 54.
AMA	Er H,AŞIK G,YOLDAŞ Ö,DEMİR C,Kesli R Kan Kültürlerinde İzole Edilerek Tanımlanan Mikroorganizmaların ve Antibiyotik Direnç Oranlarının Belirlenmesi. . 2015; 48 - 54.
Vancouver	Er H,AŞIK G,YOLDAŞ Ö,DEMİR C,Kesli R Kan Kültürlerinde İzole Edilerek Tanımlanan Mikroorganizmaların ve Antibiyotik Direnç Oranlarının Belirlenmesi. . 2015; 48 - 54.
IEEE	Er H,AŞIK G,YOLDAŞ Ö,DEMİR C,Kesli R "Kan Kültürlerinde İzole Edilerek Tanımlanan Mikroorganizmaların ve Antibiyotik Direnç Oranlarının Belirlenmesi." , ss.48 - 54, 2015.
ISNAD	Er, Halil vd. "Kan Kültürlerinde İzole Edilerek Tanımlanan Mikroorganizmaların ve Antibiyotik Direnç Oranlarının Belirlenmesi". (2015), 48-54.

APA	Er H, AŞIK G, YOLDAŞ Ö, DEMİR C, Kesli R (2015). Kan Kültürlerinde İzole Edilerek Tanımlanan Mikroorganizmaların ve Antibiyotik Direnç Oranlarının Belirlenmesi. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi, 45(1), 48 - 54.
Chicago	Er Halil,AŞIK Gülşah,YOLDAŞ Özlem,DEMİR CENGİZ,Kesli Recep Kan Kültürlerinde İzole Edilerek Tanımlanan Mikroorganizmaların ve Antibiyotik Direnç Oranlarının Belirlenmesi. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi 45, no.1 (2015): 48 - 54.
MLA	Er Halil,AŞIK Gülşah,YOLDAŞ Özlem,DEMİR CENGİZ,Kesli Recep Kan Kültürlerinde İzole Edilerek Tanımlanan Mikroorganizmaların ve Antibiyotik Direnç Oranlarının Belirlenmesi. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi, vol.45, no.1, 2015, ss.48 - 54.
AMA	Er H,AŞIK G,YOLDAŞ Ö,DEMİR C,Kesli R Kan Kültürlerinde İzole Edilerek Tanımlanan Mikroorganizmaların ve Antibiyotik Direnç Oranlarının Belirlenmesi. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi. 2015; 45(1): 48 - 54.
Vancouver	Er H,AŞIK G,YOLDAŞ Ö,DEMİR C,Kesli R Kan Kültürlerinde İzole Edilerek Tanımlanan Mikroorganizmaların ve Antibiyotik Direnç Oranlarının Belirlenmesi. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi. 2015; 45(1): 48 - 54.
IEEE	Er H,AŞIK G,YOLDAŞ Ö,DEMİR C,Kesli R "Kan Kültürlerinde İzole Edilerek Tanımlanan Mikroorganizmaların ve Antibiyotik Direnç Oranlarının Belirlenmesi." Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi, 45, ss.48 - 54, 2015.
ISNAD	Er, Halil vd. "Kan Kültürlerinde İzole Edilerek Tanımlanan Mikroorganizmaların ve Antibiyotik Direnç Oranlarının Belirlenmesi". Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi 45/1 (2015), 48-54.