Akciğer Kanserli Hastalarda Plazma DNA Metiltransferaz ve Metil- CpG'ye Bağlanan Protein Seviyelerinin Değerlendirilmesi

Değirmenci, İrfan; Metintas, Muzaffer; saydam, faruk; AKYILDIZ ÜSTÜNER, DERYA; AK, Güntülü Akdoğan; Ozbayer, Cansu

Akciğer Kanserli Hastalarda Plazma DNA Metiltransferaz ve Metil- CpG'ye Bağlanan Protein Seviyelerinin Değerlendirilmesi

Cansu ÖZBAYER, (Dumlupınar Üniversitesi, Kütahya Sağlık Yüksekokulu, Kütahya, Türkiye)

DERYA AKYILDIZ ÜSTÜNER, (Eskişehir Osmangazi Üniversitesi, Sağlık Hizmetleri Meslek Yüksek Okulu Eskişehir, Türkiye)

Güntülü Akdoğan AK, (Eskişehir Osmangazi Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Göğüs Hastalıkları Anabilim Dalı, Eskişehir, Türkiye)

Faruk SAYDAM, (Recep Tayyip Erdoğan Üniversitesi, Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı, Rize, Türkiye)

Muzaffer METİNTAŞ, (Eskişehir Osmangazi Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Göğüs Hastalıkları Anabilim Dalı, Eskişehir, Türkiye)

İrfan DEĞİRMENCİ (Eskişehir Osmangazi Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı, Eskişehir, Türkiye)

Dicle Tıp Dergisi

3 0

Yıl: 2017 Cilt: 44 Sayı: 1 Sayfa Aralığı: 57 - 64 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 29-07-2022

Akciğer Kanserli Hastalarda Plazma DNA Metiltransferaz ve Metil- CpG'ye Bağlanan Protein Seviyelerinin Değerlendirilmesi

Öz:

Amaç: Akciğer kanseri, akciğer doku hücrelerinin kontrolsüz çoğalmasıyla oluşan ölümcül bir hastalıktır. Çevresel faktörlerle birlikte genetik ve epigenetik değişikliklerin kanser gelişimine neden olduğu bilinmektedir. DNA metilasyonu en önemli epigenetik değişimlerden biri olup, DNA metiltransferaz (DNMT) enzimleri tarafından katalizlenir ve metile-CpG'ye bağlanan proteinler (MBD1, MBD2, MeCP2 vb) yardımıyla gerçekleşir. Çalışmamızda metilasyon ilişkili proteinlerin plazma seviyeleri ile akciğer kanseri riski arasındaki ilişkinin araştırılması amaçlanmıştır. Yöntemler: Araştırmamızda DNMT1, DNMT2 (TRDMT1), DNMT3A, DNMT3B, MeCP2, MBD1 ve MBD2 seviyeleri, 90 akciğer kanseri hastası (küçük hücreli dışı: 78, küçük hücreli:12) ve 90 kontrol bireyden elde edilen plazma örneklerinde Sandwich-ELISA yöntemi ile ölçüldü. Sonuçlar uygun istatistiksel yöntemler ile değerlendirildi. Bulgular: Kontrol ve akciğer kanserli hastaların DNMT3a, MBD2 ve MeCP2 seviyeleri arasında fark bulunmamıştır (p>0.05). DNMT1, TRDMT1, DNMT3b ve MBD1 seviyeleri ise kontrol ile karşılaştırıldığında akciğer kanserli bireylerde anlamlı oranda yüksek bulunmuştur (p<0.05). Sonuç: Araştırmamız sonucunda yüksek DNMT1, TRDMT1, DNMT3b ve MBD1 plazma seviyeleri ile akciğer kanseri arasında önemli bir ilişkili bulunmuştur. Bulgularımız, hastalığın erken tanısına yönelik araştırmalara katkı sağlayabileceği gibi, metilasyon ilişkili proteinlerin moleküler tanı aracı olarak ta kullanılabileceğini desteklemektedir

Anahtar Kelime:

Konular: Solunum Sistemi Hematoloji Onkoloji Biyokimya ve Moleküler Biyoloji Tıbbi Laboratuar Teknolojisi

Evaluation of Plasma DNA Methyltransferases and Methy-CpG Binding Protein Levels in Patients with Lung Cancer

Öz:

Objective: Lung cancer is a fatal disease caused by uncontrolled growth of lung tissue cells. It has been known that environmental factors, genetic and epigenetic changes are lead to tumorigenesis. DNA methylation is one of the important epigenetic changes, catalyzed by DNA methyltransferases (DNMTs) and performed with methyl-CpG binding proteins (MBD1, MBD2, MeCP2 etc.). In this study we aimed to determine the association between plasma levels of methylation associated proteins and lung cancer risk. Methods: The plasma levels of DNMT1, DNMT2 (TRDMT1), DNMT3A, DNMT3B, MeCP2, MBD1 and MBD2 measured with Sandwich-ELISA method in 90 of lung cancer patients (non-small cell: 78, small cell: 12) and 90 of healthy controls. Statistical analysis was performed with appropriate statistical methods. Results: When comparing the DNMT3a, MBD2 and MeCP2 levels, no significant differences were found between lung cancer patients and controls (p>0.05). The plasma concentration of DNMT1, TRDMT1, DNMT3b and MBD1 were found to be significantly high in lung cancer patients (p<0.05). Conclusion: As a result of our research, we found a significant relation between increased plasma levels of DNMT1, TRDMT1, DNMT3b and MBD1 and lung cancer. It is considered that our findings may contribute to researches for the early diagnosis of lung cancer and support the using of methylation associated proteins as molecular markers.

Anahtar Kelime:

Konular: Solunum Sistemi Hematoloji Onkoloji Biyokimya ve Moleküler Biyoloji Tıbbi Laboratuar Teknolojisi

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık

Yaykaşlı KO, Hatipoğlu ÖF, Ertuğrul K, Yaykaşlı E. Epigenetik mekanizmalar ve kanser. Dicle Tıp Dergisi. 2012; 14:58-68.
Kaymak A: Farklı kanserlerin hücre hatlarında demetilasyon oluşturulması ile tümör süpresör ve stamp ailesi gen ifade değişikliklerinin incelenmesi. Yüksek Lisans Tezi. İzmir: Ege Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü; 2012.
Novik K, Nimmrich I, Genc B, et al. Epigenomics: genome-wide study of methylation phenomena. Current issues in molecular biology. 2002;4:111-28.
Onay H: Konvansiyonel renal hücreli kanser oluşumunda durumunun araştırılması. Doktora Tezi. İzmir: Ege Üniversitesi 2006. olan genlerin metilasyon
Çelik S: Kronik miyeloid lösemili hastalarda dap kinaz geninin metilasyon analizleri. Yüksek Lisans Tezi. Ankara: Ankara Üniversitesi, Biyoteknoloji Enstitüsü; 2007.
Zakhari S. Alcohol metabolism and epigenetics changes. Alcohol research: current reviews. 2013; 35:6- 16.
Subramaniam D, Thombre R, Dhar A, Anant S. DNA methyltransferases: a novel target for prevention and therapy. Frontiers in oncology. 2014; doi: 10.3389/ fonc.2014.00080
Robertson KD. DNA methylation and chromatin- unraveling the tangled web. Oncogene. 2002; 21:5361- 79.
Alberts B, Johnson A, Lewis J, et al.: Molecular biology of the cell, 4th edition edn. New York: Garland Science; 2002.
Bozkurt S: Imatinib mesilat-dirençli ve dirençsiz kronik myeloid lösemi hücre hatlarında bim ve bid proapoptotik genlerinin polikomb grup proteinleri tarafından epigenetik regülasyonu. Doktora Tezi. Ankara: Ankara Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü 2010.
Varol N: Akut Lösemilerde Socs-1 Geninin Metilasyon Analizi. Yüksek Lisans Tezi. Ankara: Ankara Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü 2007.
Goll MG, Kirpekar F, Maggert KA, et al. Methylation of tRNAAsp by the DNA methyltransferase homolog Dnmt2. Science. 2006;311:395-8.
Bodur E, Demirpençe E. Kodlamayan RNA'lar ve gen susturumu. Hacettepe Tıp Dergisi. 2010; 41:82-9.
Parry L, Clarke AR. The roles of the methyl-CpG binding proteins in cancer. Genes & cancer. 2011; 2:618-30.
Wade PA. Methyl CpG-binding proteins and transcriptional repression. Bioessays. 2001;23:1131-7.
Sayin DB. Methylation and cancer: Review. Turkiye Klinikleri Journal of Medical Sciences. 2008;28:513-24.
Garzon R, Liu S, Fabbri M, et al. MicroRNA-29b induces global DNA hypomethylation and tumor suppressor gene reexpression in acute myeloid leukemia by targeting directly DNMT3A and 3B and indirectly DNMT1. Blood. 2009; 113:6411-8.
Tang M, Xu W, Wang Q, et al. Potential of DNMT and its epigenetic regulation for lung cancer therapy. Current genomics. 2009; 10:336-52.
Belinsky SA, Klinge DM, Stidley CA et al. Inhibition of DNA methylation and histone deacetylation prevents murine lung cancer. Cancer Res. 2003;63:7089-93.
Lin X, Nelson WG. Methyl-CpG-binding domainprotein-2 mediates transcriptional repression associated with hypermethylated GSTP1 CpG islands in MCF-7 breast cancer cells. Cancer Res. 2003; 63:498-504.
Ballestar E, Paz MF, Valle L, et al. Methyl-CpG binding proteins identify novel sites of epigenetic inactivation in human cancer. The EMBO journal. 2003; 22:6335-45.
Kanai Y, Ushijima S, Kondo Y, et al. DNA methyltransferase expression and DNA methylation of CPG islands and peri-centromeric satellite regions in human colorectal and stomach cancers. Int J Cancer. 2001; 91:205-12.
Kim H, Kwon YM, Kim JS, et al. Elevated mRNA levels of DNA methyltransferase-1 as an independent prognostic factor in primary nonsmall cell lung cancer. Cancer. 2006; 107:1042-9.
Schaefer M, Hagemann S, Hanna K, Lyko F. Azacytidine inhibits RNA methylation at DNMT2 target sites in human cancer cell lines. Cancer Res. 2009; 69:8127-32.
Lin RK, Hsu HS, Chang JW, et al. Alteration of DNA methyltransferases contributes to 5´ CpG methylation and poor prognosis in lung cancer. Lung Cancer. 2007; 55:205-13.
Shen H, Wang L, Spitz MR, et al. A novel polymorphism methyltransferase-3B promoter is associated with an increased risk of lung cancer. Cancer Res. 2002; 62:4992-5. human cytosine DNA
Liu Z, Wang L, Wang L-E, et al. Polymorphisms of the DNMT3B gene and risk of squamous cell carcinoma of the head and neck: A case-control study. Cancer Lett. 2008; 268:158-65.
Sandhu R, Rivenbark AG, Coleman WB. Enhancement of chemotherapeutic efficacy in hypermethylator breast cancer cells through targeted and pharmacologic inhibition of DNMT3b. Breast Cancer Res Treat. 2012; 131:385-99.
Chen MF, Lu MS, Lin PY, et al. The role of DNA methyltransferase 3b in esophageal squamous cell carcinoma. Cancer. 2012; 118:4074-89.
Patra SK, Patra A, Zhao H, et al. Methyl-CpG-DNA binding proteins in human prostate cancer: expression of CXXC sequence containing MBD1 and repression of MBD2 and MeCP2. Biochemical and biophysical research communications. 2003; 302:759-66.

APA	Ozbayer C, AKYILDIZ ÜSTÜNER D, AK G, saydam f, Metintas M, Değirmenci İ (2017). Akciğer Kanserli Hastalarda Plazma DNA Metiltransferaz ve Metil- CpG'ye Bağlanan Protein Seviyelerinin Değerlendirilmesi. , 57 - 64.
Chicago	Ozbayer Cansu,AKYILDIZ ÜSTÜNER DERYA,AK Güntülü Akdoğan,saydam faruk,Metintas Muzaffer,Değirmenci İrfan Akciğer Kanserli Hastalarda Plazma DNA Metiltransferaz ve Metil- CpG'ye Bağlanan Protein Seviyelerinin Değerlendirilmesi. (2017): 57 - 64.
MLA	Ozbayer Cansu,AKYILDIZ ÜSTÜNER DERYA,AK Güntülü Akdoğan,saydam faruk,Metintas Muzaffer,Değirmenci İrfan Akciğer Kanserli Hastalarda Plazma DNA Metiltransferaz ve Metil- CpG'ye Bağlanan Protein Seviyelerinin Değerlendirilmesi. , 2017, ss.57 - 64.
AMA	Ozbayer C,AKYILDIZ ÜSTÜNER D,AK G,saydam f,Metintas M,Değirmenci İ Akciğer Kanserli Hastalarda Plazma DNA Metiltransferaz ve Metil- CpG'ye Bağlanan Protein Seviyelerinin Değerlendirilmesi. . 2017; 57 - 64.
Vancouver	Ozbayer C,AKYILDIZ ÜSTÜNER D,AK G,saydam f,Metintas M,Değirmenci İ Akciğer Kanserli Hastalarda Plazma DNA Metiltransferaz ve Metil- CpG'ye Bağlanan Protein Seviyelerinin Değerlendirilmesi. . 2017; 57 - 64.
IEEE	Ozbayer C,AKYILDIZ ÜSTÜNER D,AK G,saydam f,Metintas M,Değirmenci İ "Akciğer Kanserli Hastalarda Plazma DNA Metiltransferaz ve Metil- CpG'ye Bağlanan Protein Seviyelerinin Değerlendirilmesi." , ss.57 - 64, 2017.
ISNAD	Ozbayer, Cansu vd. "Akciğer Kanserli Hastalarda Plazma DNA Metiltransferaz ve Metil- CpG'ye Bağlanan Protein Seviyelerinin Değerlendirilmesi". (2017), 57-64.

APA	Ozbayer C, AKYILDIZ ÜSTÜNER D, AK G, saydam f, Metintas M, Değirmenci İ (2017). Akciğer Kanserli Hastalarda Plazma DNA Metiltransferaz ve Metil- CpG'ye Bağlanan Protein Seviyelerinin Değerlendirilmesi. Dicle Tıp Dergisi, 44(1), 57 - 64.
Chicago	Ozbayer Cansu,AKYILDIZ ÜSTÜNER DERYA,AK Güntülü Akdoğan,saydam faruk,Metintas Muzaffer,Değirmenci İrfan Akciğer Kanserli Hastalarda Plazma DNA Metiltransferaz ve Metil- CpG'ye Bağlanan Protein Seviyelerinin Değerlendirilmesi. Dicle Tıp Dergisi 44, no.1 (2017): 57 - 64.
MLA	Ozbayer Cansu,AKYILDIZ ÜSTÜNER DERYA,AK Güntülü Akdoğan,saydam faruk,Metintas Muzaffer,Değirmenci İrfan Akciğer Kanserli Hastalarda Plazma DNA Metiltransferaz ve Metil- CpG'ye Bağlanan Protein Seviyelerinin Değerlendirilmesi. Dicle Tıp Dergisi, vol.44, no.1, 2017, ss.57 - 64.
AMA	Ozbayer C,AKYILDIZ ÜSTÜNER D,AK G,saydam f,Metintas M,Değirmenci İ Akciğer Kanserli Hastalarda Plazma DNA Metiltransferaz ve Metil- CpG'ye Bağlanan Protein Seviyelerinin Değerlendirilmesi. Dicle Tıp Dergisi. 2017; 44(1): 57 - 64.
Vancouver	Ozbayer C,AKYILDIZ ÜSTÜNER D,AK G,saydam f,Metintas M,Değirmenci İ Akciğer Kanserli Hastalarda Plazma DNA Metiltransferaz ve Metil- CpG'ye Bağlanan Protein Seviyelerinin Değerlendirilmesi. Dicle Tıp Dergisi. 2017; 44(1): 57 - 64.
IEEE	Ozbayer C,AKYILDIZ ÜSTÜNER D,AK G,saydam f,Metintas M,Değirmenci İ "Akciğer Kanserli Hastalarda Plazma DNA Metiltransferaz ve Metil- CpG'ye Bağlanan Protein Seviyelerinin Değerlendirilmesi." Dicle Tıp Dergisi, 44, ss.57 - 64, 2017.
ISNAD	Ozbayer, Cansu vd. "Akciğer Kanserli Hastalarda Plazma DNA Metiltransferaz ve Metil- CpG'ye Bağlanan Protein Seviyelerinin Değerlendirilmesi". Dicle Tıp Dergisi 44/1 (2017), 57-64.