Aydın, Balıkesir ve Gzmir illerinde zeytin ağaçlarındaki viral hastalık etmenlerinin tanılanması ve bulunma durumlarının belirlenmesi1

ERKAN, Semih; Erilmez, Serpil

Aydın, Balıkesir ve Gzmir illerinde zeytin ağaçlarındaki viral hastalık etmenlerinin tanılanması ve bulunma durumlarının belirlenmesi1

Serpil ERİLMEZ, (Bornova Zirai Mücadele AraGtırma Enstitüsü, İzmir)

Semih ERKAN (E.Ü. Ziraat Fakültesi Bitki Koruma Bölümü, İzmir)

Bitki Koruma Bülteni

0 0

Yıl: 2014 Cilt: 54 Sayı: 1 Sayfa Aralığı: 45 - 67 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 29-07-2022

Aydın, Balıkesir ve Gzmir illerinde zeytin ağaçlarındaki viral hastalık etmenlerinin tanılanması ve bulunma durumlarının belirlenmesi1

Öz:

Bu çalışma 2009 ve 2010 yılları arasında Aydın, Balıkesir ve İzmir illerinde yaygın olarak zeytin yetiştiriciliği yapılan üretim alanlarındaki virüs hastalıklarının belirlenmesi ve toplanan örneklerde virüslerin bulunma durumlarının ortaya konması amacıyla 2009 yılında Aydın (157) ve İzmir (136) illerinden 293 örnek, 2010 yılında ise Balıkesir ilinden 82 örnek olmak üzere toplam 375 örnek alınarak yürütülmüştür. Zeytin örneklerindeki viral etmenlerin tanılanması biyolojik, serolojik ve moleküler yöntemler kullanılarak yapılmıştır. Arabis mosaic virus (ArMV), Cucumber mosaic virus (CMV), Cherry leafroll virus (CLRV) ve Strawberry latent ringspot virus (SLRSV) adlı etmenlere ait tanı kitleri kullanılarak, örnekler DAS-ELISA yöntemine göre testlenmiştir. Bu virüslere ek olarak, örneklerde Olive latent-1 virus (OLV-1), Olive latent-2 virus (OLV-2),Olive latent-3 virus (OLV-3), Olive latent ringspot virus (OLRSV) ve Olive leaf yellowing-associated virus (OLYaV) adlı virüslerin varlığı RT-PCR yöntemi ile araştırılmıştır. RT-PCR sonuçları, 2009 ve 2010 yıllarında Aydın, Balıkesir ve İzmir illerinden toplanarak testlenen toplam 375 bitki örneğinde %55.73 oranında viral enfeksiyon bulunduğunu ve bu oranın Aydın ilinde %22.66, Balıkesir ilinde %11.46 ve İzmir ilinde ise %21.60 düzeyinde olduğunu ortaya koymuştur. DAS-ELISA sonuçlarına göre; örneklerin %12.80"inde ArMV ve sadece 1 örnekte ise SLRSV enfeksiyonunun var olduğu ve test edilen diğer virüslerin ise bulunmadığı saptanmıştır. RT-PCR testi sonucunda, örneklerin %22.93"ünde ArMV, %9.60"ında CMV, %10.66"sında CLRV ve %9.06"sında SLRSV enfeksiyonlarının var olduğu görülmüştür. Buna ek olarak, 9 örnekte CMV+ CLRV, 4 örnekte ise ArMV+CLRV karışık enfeksiyon şeklinde tespit edilirken, tüm örneklerde OLV-1, OLV-2, OLV-3, OLRSV ve OLYaV"nin bulunmadığı belirlenmiştir.

Anahtar Kelime:

Konular: Biyoloji Ziraat Mühendisliği

The identification of virus diseases in olive trees in Aydın, Balıkesir and Gzmir provinces and the determination of their present status

Öz:

The present study was carried out to determine the presence and prevalence of the viralagents in olive production areas of Aydın, Balıkesir and Gzmir in 2009-2010. In 2009,totally 293 samples were collected from Aydın (157) and Izmir (136) provinces. In 2010,with collected 82 samples from Balıkesir, the total sample number in the research hasreached to 375. To identify viral agents, the biological, serological and molecular methodswere applied to collected olive samples. DAS-ELISA method was used to detect Arabismosaic virus (ArMV), Cucumis mosaic virus (CMV), Cherry leafroll virus (CLRV) andStrawberry latent ringspot virus (SLRSV). Also, the existence of Olive latent-1 virus(OLV-1), Olive latent-2 virus (OLV-2), Olive latent-3 virus (OLV-3), Olive latent ringspotvirus (OLRSV) and Olive leaf yellowing-associated virus (OLYaV) in the samples wasanalysed by RT-PCR molecular method. The results of RT-PCR analyses showed that theincidence of virus infection was 55.73%in total 375 olive samples from Aydın, Balıkesirand Izmir in 2009 and 2010. According to individual provinces, it was 22.66% in Aydın,11.46 in Balıkesir and 21.60% in Izmir. DAS-ELISA results revealed that infection rate ofArMV was 12.8% in total samples and only 1 sample was found to be infected withSLRSV while other tested viruses were not present. According to the data from RT-PCRtests, infection rates in all tested samples were 22.93%, 9.60%, 10.66% and 9.06% forArMV, CMV, CLRV and SLRSV, respectively. Moreover, it was ascertained that 9samples were infected by CMV + CLRV and 4 samples by ArMV + CLRV as mixedinfections. Other viruses including OLV-1, OLV-2, OLV-3, OLRSV and OLYaV were notdetected in all samples.

Anahtar Kelime:

Konular: Biyoloji Ziraat Mühendisliği

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık

Alabdullah A., El Beaino T., Saponari M., Hallak H. and Digiaro M., 2005. Preliminary evaluation of the status of olive-infecting viruses in Syria. EPPO Bulletin, 35 (2): 249-252.
Alabdullah A., Elbeaino T., Minafra A., Digiaro M. and Martelli G.P., 2009. Detection and variability of olive latent virus 3 in the mediterranean region. J. Plant Pathol., 91 (3): 521-525.
Anonim 2010. http://www.tuik.gov.tr. (EriGim Tarihi: 01 Temmuz 2012) Anonymous 2010. http://faostat.fao.org/site/567/DesktopDefault.aspx?PageID=567#ancor (EriGim Tarihi: 05 Nisan 2012)
Beler Ö. ve Açıkgöz S., 2005. Ege ve Marmara Bölgelerindeki zeytin fidanlıkları ve ağaçlarında görülen bazı virüs hastalıklarının Elisa testi ile saptanması. ADÜ Ziraat Fakültesi Dergisi, 2(1) : 79-84.
Bora T. ve Karaca G., 1970. Kültür Bitkilerinde Hastalığın ve Zararın Ölçülmesi. Ege Üniv. Ziraat Fak., Yardımcı Ders Kitabı, No: 167, 43 p.
Brunt A.A., Crabtree K., Dallwitz M.J., Gibbs A.J., Watson L. and Zurcher E.J., 1996.
`Plant Viruses Online: Descriptions and Lists from the VIDE Database. Version: 20 th August 1996. URL http://biology.anu.edu.au/Groups/MES/vide/ (EriGim tarihi: 25 Ağustos 2012)
Candresse T., Lannneau T., Revers F., Grasseau N., Macquaire G., German S., Malinowsky T. and Dunez J. 1995. An Immunocapture PCR assay adapted to the detection and the analysis of the moleculer varibality of apple chlorotic leafspotvirus. Acta Hortic., 386: 136-147.
Cardoso J.M.S., Felix M.R.,Clara M.I.E and Oliveira S. 2005. The complete genome sequence of a new necrovirus isolated from Olea europea L. Archives of Virology, 150: 815-823.
Clark M.F. and Adams A.N., 1977. Characteristics of the Microplate Method of EnzymeLinked Immunosorbent Assay for the Detection of Plant Viruses. J. Gen. Virology, 34, 475-483.
Clark M.F.1981. Immunosorbent Assays in Plant Pathology. Ann. Rev. Phytopathol.,19, 83-106.
Çağlayan K., Faggioli F. and Barba M. 2011. Viruses, phytoplasmas and diseases of unknown etiology of olive viruses. In: Virus and Virus-like Diseases of Pome and Stone Fruits (Eds. A. Hadidi, M. Barba, T. Candresse, W. Jelkmann). APS Press. p. 289-297.
Çağlayan K., Fidan U., Tarla G., and Gazel M. 2004, First report of olive viruses in Turkey. J. Plant Pathol., 86 (1): 89-90.
ÇavuGoğlu A., 1980. Ege Bölgesinin Belli BaGlı Yerli ve Yabancı Zeytin ÇeGitlerinin Pomolojik Özellikleri Üzerinde AraGtırmalar. Sonuç Raporu. Zeytincilik AraGtırma Enstitüsü, Gzmir.
Demirci M. ve BölükbaGı B., 2003. Akdeniz Beslenme Tarzında Zeytinyağının Önemi. Türkiye 1. Zeytinyağı ve Sofralık Zeytin Sempozyumu Bildirileri, Gzmir, s. 41-48.
Erkan S., Özaktan H., Yorgancı Ü. ve YoltaG T. 1992. Sanayi Domatesi Tohum Örneklerinde Domates Mozaik Virüsü ve Bakteriyel Solgunluk Etmenlerinin Bulunma Durumunun Saptanması Üzerinde AraGtırmalar. Sanayi Domatesi Üretimini GeliGtirme Projesi (SANDOM) Yayın No: 6, s. 45-50.
Faggioli F. and Barba M. 1995. An elongated virus isolated from olive (Olea europaea). Acta Hortic., 386, p. 593-599.
Faggioli F., Ferretti L., Albanese G., Sciarroni R., Pasquini G., Lumia V. and Barba M. 2005. Distribution of olive tree viruses in Italy as revealed by one-step RT-PCR. J. Plant Pathol., 87 (1): 49-55.
Felix M.R. and Clara M.I.E. 2006. Characterization of viruses occurring on Olea europaea L. In: Techniques in Diagnosis of Plant Viruses (Eds. Rao G.P., Valverde A., Dovas C.I.), pp. 173-216, Studium Press, Houston, TX, USA.
Fidan Ü. ve Ertem G. 1995. Ege Bölgesi"ndeki zeytin ağaçlarında virüs hastalıklarının ELISA yöntemi ile belirlenmesi üzerinde araGtırmalar. VII. Türkiye Fitopatoloji Kongresi, Adana, s. 555.
Foissac X., Savalle-Dumas L., Gentit P., Dulucq M.J. and Candresse T. 2001. Polyvalent detection of fruit tree Tricho, Capillo, and Foveaviruses by nested RTPCR using degenerated and inosine-containing primers (PDO RT-PCR). Acta Hortic., 550: 37- 44.
Gallitelli D. and Savino V., 1985. Olive latent virus 1. A single RNA spherical virus isolated from olive in Apulia (southern Italy). Ann. Appl. Biol., 106: 295-303.
Grieco F., Saponari M., Alkowni R, Savino V. and Martelli G.P. 2000. Molecular detection of olive viruses. Bulletin OEPP/EPPO Bulletin, 30: 469-473.
Kreuzer H. and Massey A. 1996, Recombinant DNA and biotechnology, A guide for students. American Society for Microbiology. Washington D.C., 542.
MacKenzie D.J., McLean M.A., Mukerji S. and Green M., 1997. Improved RNA extraction from woody plants for the detection of viral pathogens by reverse transcriptionpolymerase chain reaction. Plant Disease, 81: 222-226.
Marte M., Gadani F., Savino V. and Rugini E. 1986. Strawberry latent ringspot virus associated with a new disease of olive in central Italy. Plant Disease, 70: 171-172.
Martelli G.P. and Gallitelli D. 1985. Virus diseases of olive. Italia Agricola 122: 150-156.
Martelli G.P. 1999. Infectious diseases and certification of olive: An overview. Bulletin OEPP/EPPO Bulletin, 29: 127-133.
Matthews R.E.F. 1991. Plant Virology, 3rd ed., Acad. Pres, New York, 897 p.
Merciega V., Boscia D. and Savino V. 1996. Comparison of five isolates of Olive latent virus 1. Pytopathol. Mediterr., 35: 1-8.
Nogay A. 1983. Marmara bölgesi Cucurbitaceae familyası kültür bitkilerinde görülen virüs hastalıklarının tanılanması, tohumla geçiG durumlarının ve konukçu dizilerinin saptanması üzerinde araGtırmalar. Doktora Tezi, Ege Üni. Fen Bil. Ens.,Gzmir,120 s.
Öztürk F. 2008. Türkiye"de ve Dünyada Zeytincilik Sektörü. Zeytincilik AraGtırma Enstitüsü, Bilgisayar Kayıtları "BasılmamıG" (Gzmir-2008).
Sabanadzovic S., Abou G.N., Notte P., Savino V., Scarito G. and Martelli G.P. 1999.
Partial molecular characterisation and RT-PCR detection of a putative closterovirus associated with olive leaf yellowing. J. Plant Pathol., 81: 37-45.
Savino V., Barba M., Gallitelli D. and Martelli G.P. 1979. Two nepoviruses isolated from olive in Italy. Pytopathol. Mediterr., 18: 135-142.
Savino V. and Gallitelli D. 1981. Cherry leafroll virus in olive. Pytopathol. Mediterr., 20: 202-203.
Savino V. and Gallitelli D. 1983. Isolation of cucumber mosaic virus from olive in Italy. Pytopathol. Mediterr., 22: 76-77.
Savino V., Gallitelli D. and Barba M. 1983. Olive latent ringspot virus, a newly recognized virus infecting olive in Italy. Ann. Appl. Biol., 103: 243-249.
Savino V., Sabanadzovic S., Scarito G., Laviola C. and Martelli G.P. 1996. Two olive yellows of possible origin in Sicily. Informatore Fitopatologico, 46 (5): 55-59.
Tarla G. ve Çağlayan K. 1998. Hatay yöresinde yetiGen zeytin ağaçlarında görülen bazı virüs hastalıklarının serolojik olarak saptanması. VII. Türkiye Fitopatoloji Kongresi, Ankara, s. 239-243.
Triolo E., Materazzi A. and Toni S. 1996. An isolate of Tobacco mosaic tobamovirus from Olea europaea. Advances in Horticultural Science, 10: 39-45.
UlubaG Serçe Ç., Yalçın S., Gazel M., Çağlayan K. and Faggioli F. 2007. First report of Olive latent virus-1 from olive trees in Turkey. J. Plant Pathol., 89 (3):73.
UlubaG Serçe Ç., Yalçın S., Gazel M. ve Çağlayan K. 2009. Doğu Akdeniz Bölgesi zeytin ağaçlarında Strawberry latent ringspot virus (SLRSV)"ün saptanması ve karakterizasyonu. Türkiye III. Bitki Koruma Kongresi Bildirileri, s.174.
Valverde K.A., Nameth S.T. and Jordan R.L. 1990. Analysis of double-stranded RNA for plant virus diagnosis. Plant Disease, 74: 255-258.
Yalçın S., UlubaG Serçe Ç., Çağlayan K. ve Gazel M. 2007. Doğu Akdeniz Bölgesi zeytin ağaçlarındaki virüslerin RT-PCR ile belirlenmesi. Türkiye II. Bitki Koruma Kongresi Bildirileri, s. 307.
Yorgancı Ü. 1975. Gzmir ilinde domateslerdeki virüs hastalıkları yayılma ve zarar durumları, elde edilen izolatlarla biyolojik ve serolojik araGtırmalar. E.Ü. Ziraat Fakültesi Fitopatoloji ve Zirai Botanik Kürsüsü, Bornova, 102 s.
Youssef S.A., Moawed S.M., El-Sayed M. and Shalaby A.A. 2010. Detection of olive tree viruses in Egypt by one-step RT-PCR. 21st International Conference on Virus and other Graft Transmissible Diseases of Fruit Crops, 427 p.

APA	Erilmez S, ERKAN S (2014). Aydın, Balıkesir ve Gzmir illerinde zeytin ağaçlarındaki viral hastalık etmenlerinin tanılanması ve bulunma durumlarının belirlenmesi1. , 45 - 67.
Chicago	Erilmez Serpil,ERKAN Semih Aydın, Balıkesir ve Gzmir illerinde zeytin ağaçlarındaki viral hastalık etmenlerinin tanılanması ve bulunma durumlarının belirlenmesi1. (2014): 45 - 67.
MLA	Erilmez Serpil,ERKAN Semih Aydın, Balıkesir ve Gzmir illerinde zeytin ağaçlarındaki viral hastalık etmenlerinin tanılanması ve bulunma durumlarının belirlenmesi1. , 2014, ss.45 - 67.
AMA	Erilmez S,ERKAN S Aydın, Balıkesir ve Gzmir illerinde zeytin ağaçlarındaki viral hastalık etmenlerinin tanılanması ve bulunma durumlarının belirlenmesi1. . 2014; 45 - 67.
Vancouver	Erilmez S,ERKAN S Aydın, Balıkesir ve Gzmir illerinde zeytin ağaçlarındaki viral hastalık etmenlerinin tanılanması ve bulunma durumlarının belirlenmesi1. . 2014; 45 - 67.
IEEE	Erilmez S,ERKAN S "Aydın, Balıkesir ve Gzmir illerinde zeytin ağaçlarındaki viral hastalık etmenlerinin tanılanması ve bulunma durumlarının belirlenmesi1." , ss.45 - 67, 2014.
ISNAD	Erilmez, Serpil - ERKAN, Semih. "Aydın, Balıkesir ve Gzmir illerinde zeytin ağaçlarındaki viral hastalık etmenlerinin tanılanması ve bulunma durumlarının belirlenmesi1". (2014), 45-67.

APA	Erilmez S, ERKAN S (2014). Aydın, Balıkesir ve Gzmir illerinde zeytin ağaçlarındaki viral hastalık etmenlerinin tanılanması ve bulunma durumlarının belirlenmesi1. Bitki Koruma Bülteni, 54(1), 45 - 67.
Chicago	Erilmez Serpil,ERKAN Semih Aydın, Balıkesir ve Gzmir illerinde zeytin ağaçlarındaki viral hastalık etmenlerinin tanılanması ve bulunma durumlarının belirlenmesi1. Bitki Koruma Bülteni 54, no.1 (2014): 45 - 67.
MLA	Erilmez Serpil,ERKAN Semih Aydın, Balıkesir ve Gzmir illerinde zeytin ağaçlarındaki viral hastalık etmenlerinin tanılanması ve bulunma durumlarının belirlenmesi1. Bitki Koruma Bülteni, vol.54, no.1, 2014, ss.45 - 67.
AMA	Erilmez S,ERKAN S Aydın, Balıkesir ve Gzmir illerinde zeytin ağaçlarındaki viral hastalık etmenlerinin tanılanması ve bulunma durumlarının belirlenmesi1. Bitki Koruma Bülteni. 2014; 54(1): 45 - 67.
Vancouver	Erilmez S,ERKAN S Aydın, Balıkesir ve Gzmir illerinde zeytin ağaçlarındaki viral hastalık etmenlerinin tanılanması ve bulunma durumlarının belirlenmesi1. Bitki Koruma Bülteni. 2014; 54(1): 45 - 67.
IEEE	Erilmez S,ERKAN S "Aydın, Balıkesir ve Gzmir illerinde zeytin ağaçlarındaki viral hastalık etmenlerinin tanılanması ve bulunma durumlarının belirlenmesi1." Bitki Koruma Bülteni, 54, ss.45 - 67, 2014.
ISNAD	Erilmez, Serpil - ERKAN, Semih. "Aydın, Balıkesir ve Gzmir illerinde zeytin ağaçlarındaki viral hastalık etmenlerinin tanılanması ve bulunma durumlarının belirlenmesi1". Bitki Koruma Bülteni 54/1 (2014), 45-67.