Otomatize İdantifikasyon Sisteminin İmmün Trombositopenili Bir Hastadaki Fungemi Etkeni Candida lusitaniae’yi Candida famata Olarak Hatalı Biçimde Tanımlaması

ÖĞÜNÇ, MERAL DİLARA; ERES-SARITAŞ, Zübeyde; Er, Halil; ÖNGÜT, Gözde; ÖZHAK BAYSAN, Betil; Merdin, Alparslan; YAPICI, oktay

Otomatize İdantifikasyon Sisteminin İmmün Trombositopenili Bir Hastadaki Fungemi Etkeni Candida lusitaniae’yi Candida famata Olarak Hatalı Biçimde Tanımlaması

Oktay YAPICI, (Manisa Devlet Hastanesi, İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Kliniği, Manisa, Türkiye)

Halil ER, (Akdeniz Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Antalya, Türkiye)

Zübeyde ERES-SARITAŞ, (Akdeniz Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Antalya, Türkiye)

Betil ÖZHAK BAYSAN, (Akdeniz Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Antalya, Türkiye)

Meral Dilara ÖĞÜNÇ, (Akdeniz Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Antalya, Türkiye)

Gözde ÖNGÜT, (Akdeniz Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Antalya, Türkiye)

Alparslan MERDİN (Dr. Abdurrahman Yurtaslan Ankara Onkoloji Eğitim ve Araştırma Hastanesi, Hematoloji Kliniği ve Kemik İliği Nakli Ünitesi, Ankara, Türkiye)

Klimik Dergisi

8 2

Yıl: 2017 Cilt: 30 Sayı: 3 Sayfa Aralığı: 149 - 152 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 29-07-2022

Otomatize İdantifikasyon Sisteminin İmmün Trombositopenili Bir Hastadaki Fungemi Etkeni Candida lusitaniae’yi Candida famata Olarak Hatalı Biçimde Tanımlaması

Öz:

Candida türleri arasında antifungal direnç farklılıkları görüldüğünden, C. albicans'ın yanı sıra albicans dışı türlerin doğru biçimde tanımlanması, mortalitesi yüksek olan Candida infeksiyonlarının tedavisi için önemlidir. Bu yazıda, immünosüprese hastalar için fırsatçı patojen olan C. lusitaniae'nin, VITEK®2 (bioMérieux, Marcy l'Etoile, Fransa) otomatize idantifikasyon sistemiyle hatalı biçimde C. famata olarak tanımlandığı bir fungemi olgusu sunulmuştur. İzolatın konvansiyonel yöntemlerle C. lusitaniae olarak adlandırılması üzerine, tanımlama gerek MALDI-TOF/MS (Bruker Daltonics, Bremen, Almanya) gerekse Phoenix 100 (Becton Dickinson, Sparks, MD, ABD) otomatize sistemi kullanılarak doğrulanmıştır. Bu olgu da göstermektedir ki klinik önemi olan Candida türlerinin çoğunun konvansiyonel yöntemlerle tanımlanabilmesine karşılık, otomatize sistemlerle, özellikle nadir görülen türler her zaman doğru biçimde tanımlanamayabilir. Bu nedenle tanımlamada otomatize sistemlerle birlikte konvansiyonel tanı yöntemleri de kullanılmalı, gerektiğinde daha ileri moleküler tanı yöntemlerine başvurulmalıdır.Klimik Dergisi 2017; 30(3): 149-52

Anahtar Kelime:

Konular: Mikrobiyoloji Biyoteknoloji ve Uygulamalı Mikrobiyoloji

Misidentified Candida lusitaniae, Causative Agent of Fungemia, as Candida famata by Automated Identification System in a Patient With Immune Thrombocytopenia

Öz:

Since Candida species have different antifungal resistance characteristics, accurate identification of non-albicans Candida besides C. albicans is important for treatment of Candida infections with high mortality. In this report, a case of fungemia due to C. lusitaniae an opportunist pathogen for immunosuppressed patients, misidentified as C. famata by VITEK® 2 (bioMérieux, Marcy l'Etoile, France) automated identification system was presented. Since isolate was identified as C. lusitaniae by conventional methods, its identification was confirmed using both MALDI-TOF/MS (Bruker Daltonics, Bremen, Germany) and Phoenix 100 (Becton Dickinson, Sparks, MD, USA) automated system. This case demonstrated that even though most of the clinically important Candida species can be identified by conventional methods, automated systems do not always make accurate identifications for rare species in particular. For this reason, conventional diagnostic methods should also be used together with automated systems, and further molecular diagnostic methods should be applied if necessary.Klimik Dergisi 2017; 30(3): 149-52

Anahtar Kelime:

Konular: Mikrobiyoloji Biyoteknoloji ve Uygulamalı Mikrobiyoloji

Belge Türü: Makale Makale Türü: Olgu Sunumu Erişim Türü: Erişime Açık

1. Ortega M, Marco F, Soriano A, et al. Candida species bloodstream infection: epidemiology and outcome in a single institution from 1991 to 2008. J Hosp Infect. 2011; 77(2): 157-61.
2. Nucci M, Queiroz-Telles F, Tobón AM, Restrepo A, Colombo AL. Epidemiology of opportunistic fungal infections in Latin America. Clin Infect Dis. 2010; 51(5): 561-70.
3. Miceli MH, Díaz JA, Lee SA. Emerging opportunistic yeast infections. Lancet Infect Dis. 2011; 11(2): 142-51.
4. Cruciani M. Serpelloni G. Management of Candida infections in the adult intensive care unit. Expert Opin Pharmacother. 2008; 9(2): 175-91.
5. McKinnon PS, Goff DA, Kern JW, et al. Temporal assessment of Candida risk factors in the surgical intensive care unit. Arch Surg. 2001; 136(12): 1401-8.
6. Karabıçak N, Uludağ Altun H, Karatuna O, et al. Mikrobiyoloji laboratuvarlarında maya türlerinin tanımlanmasında sık kullanılan ticari sistemlerin değerlendirilmesi: çok merkezli bir çalışma. Mikrobiyol Bül. 2015; 49(2): 210-20.
7. Bizzini A, Greub G. Matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry, a revolution in clinical microbial identification. Clin Microbiol Infect. 2010; 16(11): 1614- 9.
8. Lacroix C, Gicquel A, Sendid B, et al. Evaluation of two matrixassisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) systems for the identification of Candida species. Clin Microbiol Infect. 2014; 20(2): 153-8.
9. Kim HY, Huh HJ, Choi R, Ki CS, Lee NY. Three cases of candidiasis misidentified as Candida famata by the Vitek 2 system. Ann Lab Med. 2015; 35(1): 175-7.
10. Kim TH, Kweon OJ, Kim HR, Lee MK. Identification of uncommon Candida species using commercial identification systems. J Microbiol Biotechnol. 2016; 26(12): 2206-13.
11. Castanheira M, Woosley LN, Diekema DJ, Jones RN, Pfaller MA. Candida guilliermondii and other species of Candida misidentified as Candida famata: assessment by Vitek 2, DNA sequencing analysis, and matrix-assisted laser desorption ionization–time of flight mass spectrometry in two global antifungal surveillance programs. J Clin Microbiol. 2013; 51(1): 117-24.
12. Pfaller MA, Diekema DJ. Epidemiology of invasive candidiasis: a persistent public health problem. Clin Microbiol Rev. 2007; 20(1): 133-63.
13. Alp Ş, Sancak B, Arıkan S. Candida türlerinin amfoterisin B duyarlılığının E-test ve iki farklı besiyeri ile önerilmiş olan direnç sınır değerlerine göre araştırılması. Mikrobiyol Bül. 2008; 42(2): 293-30.
14. Hawkins JL, Baddour LM. Candida lusitaniae infections in the era of fluconazole availability. Clin Infect Dis. 2003; 36(2): 14-8.

APA	YAPICI o, Er H, ERES-SARITAŞ Z, ÖZHAK BAYSAN B, ÖĞÜNÇ M, ÖNGÜT G, Merdin A (2017). Otomatize İdantifikasyon Sisteminin İmmün Trombositopenili Bir Hastadaki Fungemi Etkeni Candida lusitaniae’yi Candida famata Olarak Hatalı Biçimde Tanımlaması. , 149 - 152.
Chicago	YAPICI oktay,Er Halil,ERES-SARITAŞ Zübeyde,ÖZHAK BAYSAN Betil,ÖĞÜNÇ MERAL DİLARA,ÖNGÜT Gözde,Merdin Alparslan Otomatize İdantifikasyon Sisteminin İmmün Trombositopenili Bir Hastadaki Fungemi Etkeni Candida lusitaniae’yi Candida famata Olarak Hatalı Biçimde Tanımlaması. (2017): 149 - 152.
MLA	YAPICI oktay,Er Halil,ERES-SARITAŞ Zübeyde,ÖZHAK BAYSAN Betil,ÖĞÜNÇ MERAL DİLARA,ÖNGÜT Gözde,Merdin Alparslan Otomatize İdantifikasyon Sisteminin İmmün Trombositopenili Bir Hastadaki Fungemi Etkeni Candida lusitaniae’yi Candida famata Olarak Hatalı Biçimde Tanımlaması. , 2017, ss.149 - 152.
AMA	YAPICI o,Er H,ERES-SARITAŞ Z,ÖZHAK BAYSAN B,ÖĞÜNÇ M,ÖNGÜT G,Merdin A Otomatize İdantifikasyon Sisteminin İmmün Trombositopenili Bir Hastadaki Fungemi Etkeni Candida lusitaniae’yi Candida famata Olarak Hatalı Biçimde Tanımlaması. . 2017; 149 - 152.
Vancouver	YAPICI o,Er H,ERES-SARITAŞ Z,ÖZHAK BAYSAN B,ÖĞÜNÇ M,ÖNGÜT G,Merdin A Otomatize İdantifikasyon Sisteminin İmmün Trombositopenili Bir Hastadaki Fungemi Etkeni Candida lusitaniae’yi Candida famata Olarak Hatalı Biçimde Tanımlaması. . 2017; 149 - 152.
IEEE	YAPICI o,Er H,ERES-SARITAŞ Z,ÖZHAK BAYSAN B,ÖĞÜNÇ M,ÖNGÜT G,Merdin A "Otomatize İdantifikasyon Sisteminin İmmün Trombositopenili Bir Hastadaki Fungemi Etkeni Candida lusitaniae’yi Candida famata Olarak Hatalı Biçimde Tanımlaması." , ss.149 - 152, 2017.
ISNAD	YAPICI, oktay vd. "Otomatize İdantifikasyon Sisteminin İmmün Trombositopenili Bir Hastadaki Fungemi Etkeni Candida lusitaniae’yi Candida famata Olarak Hatalı Biçimde Tanımlaması". (2017), 149-152.

APA	YAPICI o, Er H, ERES-SARITAŞ Z, ÖZHAK BAYSAN B, ÖĞÜNÇ M, ÖNGÜT G, Merdin A (2017). Otomatize İdantifikasyon Sisteminin İmmün Trombositopenili Bir Hastadaki Fungemi Etkeni Candida lusitaniae’yi Candida famata Olarak Hatalı Biçimde Tanımlaması. Klimik Dergisi, 30(3), 149 - 152.
Chicago	YAPICI oktay,Er Halil,ERES-SARITAŞ Zübeyde,ÖZHAK BAYSAN Betil,ÖĞÜNÇ MERAL DİLARA,ÖNGÜT Gözde,Merdin Alparslan Otomatize İdantifikasyon Sisteminin İmmün Trombositopenili Bir Hastadaki Fungemi Etkeni Candida lusitaniae’yi Candida famata Olarak Hatalı Biçimde Tanımlaması. Klimik Dergisi 30, no.3 (2017): 149 - 152.
MLA	YAPICI oktay,Er Halil,ERES-SARITAŞ Zübeyde,ÖZHAK BAYSAN Betil,ÖĞÜNÇ MERAL DİLARA,ÖNGÜT Gözde,Merdin Alparslan Otomatize İdantifikasyon Sisteminin İmmün Trombositopenili Bir Hastadaki Fungemi Etkeni Candida lusitaniae’yi Candida famata Olarak Hatalı Biçimde Tanımlaması. Klimik Dergisi, vol.30, no.3, 2017, ss.149 - 152.
AMA	YAPICI o,Er H,ERES-SARITAŞ Z,ÖZHAK BAYSAN B,ÖĞÜNÇ M,ÖNGÜT G,Merdin A Otomatize İdantifikasyon Sisteminin İmmün Trombositopenili Bir Hastadaki Fungemi Etkeni Candida lusitaniae’yi Candida famata Olarak Hatalı Biçimde Tanımlaması. Klimik Dergisi. 2017; 30(3): 149 - 152.
Vancouver	YAPICI o,Er H,ERES-SARITAŞ Z,ÖZHAK BAYSAN B,ÖĞÜNÇ M,ÖNGÜT G,Merdin A Otomatize İdantifikasyon Sisteminin İmmün Trombositopenili Bir Hastadaki Fungemi Etkeni Candida lusitaniae’yi Candida famata Olarak Hatalı Biçimde Tanımlaması. Klimik Dergisi. 2017; 30(3): 149 - 152.
IEEE	YAPICI o,Er H,ERES-SARITAŞ Z,ÖZHAK BAYSAN B,ÖĞÜNÇ M,ÖNGÜT G,Merdin A "Otomatize İdantifikasyon Sisteminin İmmün Trombositopenili Bir Hastadaki Fungemi Etkeni Candida lusitaniae’yi Candida famata Olarak Hatalı Biçimde Tanımlaması." Klimik Dergisi, 30, ss.149 - 152, 2017.
ISNAD	YAPICI, oktay vd. "Otomatize İdantifikasyon Sisteminin İmmün Trombositopenili Bir Hastadaki Fungemi Etkeni Candida lusitaniae’yi Candida famata Olarak Hatalı Biçimde Tanımlaması". Klimik Dergisi 30/3 (2017), 149-152.