Genişlemiş Spektrumlu Beta-Laktamaz (GSBL) Üreten Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae Suşlarının GSBL Genlerinin Araştırılması
Yıl: 2018 Cilt: 23 Sayı: 3 Sayfa Aralığı: 116 - 123 Metin Dili: Türkçe DOI: 10.5578/flora.67296 İndeks Tarihi: 29-04-2019
Genişlemiş Spektrumlu Beta-Laktamaz (GSBL) Üreten Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae Suşlarının GSBL Genlerinin Araştırılması
Öz: Giriş: Genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz (GSBL) üreten Enterobacteriaceae üyeleri tüm dünyada önemli bir sağlık sorunudur. Buçalışmada yaklaşık dört yıllık süre içinde izole edilen Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae suşlarında GSBL direnç genlerinin saptanmasıamaçlanmıştır.Materyal ve Metod: Ocak 2008-Ekim 2012 tarihleri arasında çeşitli klinik örneklerden izole edilen ve GSBL ürettiği saptanan 100 E.coli ve 100 K. pneumoniae suşu bu çalışmaya alınmıştır. Suşların tanımlanması klasik bakteriyolojik yöntemler ve BD Phoenix (BectonDickinson, ABD) otomatize tanımlama cihazı kullanılarak yapılmıştır. Suşların CTX-M, TEM, SHV, VEB, GES, PER ve OXA beta-laktamazgenleri polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) ile araştırılmıştır.Bulgular: K. pneumoniae suşlarının beta-laktamaz genleri sırasıyla; CTX-M %99, SHV %91, TEM %71, OXA-10 grup %10 ve OXA-2grup %5 oranında bulunmuştur. E. coli suşlarında CTX-M %92, TEM %70, SHV %21 ve OXA-2 grup %3 oranında bulunmuştur. E.coli suşlarında GSBL direnç geni saptanan 98 suşta yalnız CTX-M %25.5 (25/98); sadece TEM pozitif olanlar %2 (2/98) ve sadeceSHV pozitif olanlar %2 (2/98) olarak saptanmıştır. K. pneumoniae suşlarında ESBL direnç geni saptanan 100 suşta yalnız CTX-M %3(3/100) oranında bulunmuştur. Diğer direnç genlerinin tek başına bulunduğu herhangi bir suş saptanmamıştır. Çalışmamızda taradığımızGES, VEB ve PER türü beta-laktamaz genleri ise hiçbir suşta saptanmıştır.Sonuç: Çalışmamızda, GSBL üreten suşlarda CTX-M yüksek oranda bulunmuştur. Bunun olası nedeninin CTX-M türü genlerin gösterdiğihızlı yayılım özelliği olduğu düşünülmüştür. GSBL genlerinin tanımlanması direnç epidemiyolojisinin ortaya konulması, uygun tedavistratejilerinin geliştirilmesi ve önleyici tedbirlerin doğru planlanması açısından önemlidir.
Anahtar Kelime: Konular:
Investigation of Extended Spectrum Beta-Lactamase (ESBL) Genes in ESBL-Producing Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae Strains
Öz: Introduction: Extended spectrum beta-lactamase (ESBL)-producing Enterobacteriaceae is an important health problem all over the world. In this study, it was aimed to determine the ESBL genes in Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae strains isolated for approximately four-year period. Materials and Methods: A total 100 ESBL-producing E. coli and 100 ESBL-producing K. pneumoniae strains which were isolated between January 2008 and October 2012 were included into this study. The strains were identified using classical bacteriologic methods and BD Phoenix (Becton Dickinson, US) automatized bacterial identification device. CTX-M, TEM, SHV, VEB, GES, PER and OXA beta-lactamase genes were analyzed with the PCR method. Results: The beta-lactamase genes detected in ESBL-positive K. pneumoniae strains were as follows: 99% for CTX-M, 91% for SHV, 71% for TEM, 10% for OXA-10 group, and 5% for OXA-2 group. In E. coli strains, the prevalence of CTX-M was 92%; TEM was 70%, SHV was 21%, and OXA-2 group was 3%. CTX-M alone was found to be positive in 25 of the 98 (25.5%) in E. coli strains; TEM alone was found to be positive in 2 of 98 (2%) and SHV alone was found in 2 of 98 (2%). CTX-M alone was found positive in 3 of 100 (3%) K. pneumoniae strains. No other resistance genes alone were found in the strains. No GES, VEB and PER-producing strains were determined in this study. Conclusion: In the study, high prevalence of CTX-M beta-lactamase was found in ESBL-producing strains. It was thought that the high potential of mobility with CTX-M genes was the most possible reason for this result. Determination of ESBL genes will be useful to understand resistance epidemiology, develop effective therapeutic strategies, and plan the appropriate preventive measurements.
Anahtar Kelime: Konular:
Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık
- Akyar I, Kocagöz S, Kocagöz T, Sarıgüzel Sar N, Gültekin M, Ercis S ve ark. Beş yılda izole edilen 15434 Escherichia coli ve 3178 Klebsiella spp. suşunda genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz üretiminin yıllara, kliniklere ve örnek türlerine dağılımı. ANKEM Dergisi 2010;24(1):34-41.
- Shah AA, Hasan F, Ahmed S, Hameed A. Characteristics, epidemiology and clinical importance of emerging strains of Gram-negative bacilli producing extended-spectrum beta-lactamases. Res Microbiol 2004;155(6):409-21.
- Paterson DL, Bonomo RA. Extended-spectrum beta-lactamases: a clinical update. Clin Microbiol Rev 2005;18(4):657- 86.
- Stürenburg E, Mack D. Extended-spectrum beta-lactamases: implications for the clinical microbiology laboratory, therapy, and infection control. J Infect 2003;47(4):273-95.
- Bush K. The evolution of beta lactamases. Ciba Found Symp 1997;207:152-63.
- Poirel L, Le Thomas I, Naas T, Karim A, Nordmann P. Biochemical sequence analyses of GES-1, a novel class A extended-spectrum beta-lactamase, and the class 1 integron In52 from Klebsiella pneumoniae. Antimicrob Agents Chemother 2000;44(3):622-32.
- Delbrück H, Bogaerts P, Kupper MB, Rezende de Castro R, Bennink S, Glupczynski Y, et al. Kinetic and crystallographic studies of extended-spectrum GES-11, GES-12, and GES-14 beta-lactamases. Antimicrob Agents Chemother 2012;56(11):5618-25.
- Kiratisin P, Apisarnthanarak A, Laesripa C, Saifon P. Molecular characterization and epidemiology of extended-spectrum-beta-lactamase-producing Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae isolates causing health care-associated infection in Thailand, where the CTX-M family is endemic. Antimicrob Agents Chemother 2008;52(8):2818-24.
- Pitout JD, Laupland KB. Extended-spectrum beta-lactamase-producing Enterobacteriaceae: an emerging public-health concern. Lancet Infect Dis 2008;8(3):159-66.
- Giamarellou H. Multidrug resistance in gram-negative bacteria that produce extended-spectrum beta-lactamase (ESBLs). Clin Microbiol Infect 2005;11(Suppl 4):1-16.
- Esen Ş, Eroğlu C, Sünbül M, Leblebicioğlu H. Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae suşlarında TEM ve SHV türü beta-laktamazların sıklığı. Mikrobiyol Bul 2001;35:37-43.
- Martinez P, Garzón D, Mattar S. CTX-M-producing Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae isolated from community-acquired urinary tract infections in Valledupar, Colombia. Braz J Infect Dis 2012;16(5):420-5.
- Stürenburg E, Mack D. Extended-spectrum beta-lactamases: implications for the clinical microbiology laboratory, therapy, and infection control. J Infect 2003;47(4):273-95.
- Öksüz L, Gürler N. Escherichia coli ve Klebsiella spp. suşlarında genişlemiş spektrumlu beta-laktamazların tiplendirilmesi ve plazmid profil analizi. Mikrobiyol Bul 2009;43:183-94.
- Nakhaei Moghaddam M, Forghanifard MM, Moshrefi S. Prevalence and molecular characterization of plasmid-mediated extended-spectrum beta-lactamase genes (blaTEM, blaCTX and blASHV) among urinary Escherichia coli clinical isolates in Mashhad, Iran. Iran J Basic Med Sci 2012;15(3):833-9.
- Rastegar M, Golalipoor M, Mansoursamaei N. Detection of extended spectrum b-lactamases in urinary isolates of Klebsiella pneumoniae in relation to Bla, Bla and Bla Gene carriage. Iran J Public Health 2012;41(3):127-32.
- Sedighi M, Halajzadeh M, Ramazanzadeh R, Amirmozafari N, Heidary M, Pirouzi S. Molecular detection of beta-lactamase and integron genes in clinical strains of Klebsiella pneumoniae by multiplex polymerase chain reaction. Rev Soc Bras Med Trop 2017;50(3):321-8.
- Bonnet R. Growing group of extended-spectrum ß-lactamases: the CTXM enzymes. Antimicrob Agents Chemother 2004;48(1):1-14.
- Gür D, Gülay Z, Arıkan Akan O et al. Türkiye’de hastane izolatı gram-negatif bakterilerde yeni beta-laktam antibiyotiklere direnç ve ESBL tipleri: çok merkezli Hitit sürveyansını. Mikrobiyol Bul 2008;42:537-44.
- Hazirolan G, Mumcuoglu I, Altan G, Özmen BB, Aksu N, Karahan ZC. Fecal carriage of extended-spectrum beta-lactamase and ampc beta-lactamase-producing enterobacteriaceae in a turkish community. Niger J Clin Pract 2018;21:81-6.
- Wienke M, Pfeifer Y, Weissgerber P, Marschal M, Autenrieth IB, Gröbner S. In vitro activity of tigecycline and molecular characterization of extended-spectrumbeta-lactamase-producing Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae isolates from a university hospital in south-western Germany. Chemotherapy 2012;58(3):241-8.
- Poirel L, Naas T, Nordmann P. Diversity, epidemiology, and genetics of class D beta-lactamases. Antimicrob Agents Chemother 2010;54(1):24-38.
- Görgeç S. (uzmanlık tezi) Genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz üreten nozokomiyal Escherichia coli izolatlarında beta-laktamaz genleri ve klonal ilişkinin araştırılması. İnönü üniversitesi. Malatya 2012.
- Bhattacharjee A, Sen MR, Anupurba S, Prakash P, Nath G. Detection of OXA-2 group extended-spectrum-beta-lactamase-producing clinical isolates of Escherichia coli from India. J Antimicrob Chemother 2007;60(3):703-4.
| APA | BEKTAŞ A, Guducuoglu H, Gursoy N, BERKTAŞ M, Sumbul B, Parlak M, Otlu B, TEKEREKOĞLU M (2018). Genişlemiş Spektrumlu Beta-Laktamaz (GSBL) Üreten Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae Suşlarının GSBL Genlerinin Araştırılması. , 116 - 123. 10.5578/flora.67296 |
| Chicago | BEKTAŞ Abdullah,Guducuoglu Huseyin,Gursoy Nafia Canan,BERKTAŞ Mustafa,Sumbul Bilge,Parlak Mehmet,Otlu Baris,TEKEREKOĞLU Mehmet Sait Genişlemiş Spektrumlu Beta-Laktamaz (GSBL) Üreten Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae Suşlarının GSBL Genlerinin Araştırılması. (2018): 116 - 123. 10.5578/flora.67296 |
| MLA | BEKTAŞ Abdullah,Guducuoglu Huseyin,Gursoy Nafia Canan,BERKTAŞ Mustafa,Sumbul Bilge,Parlak Mehmet,Otlu Baris,TEKEREKOĞLU Mehmet Sait Genişlemiş Spektrumlu Beta-Laktamaz (GSBL) Üreten Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae Suşlarının GSBL Genlerinin Araştırılması. , 2018, ss.116 - 123. 10.5578/flora.67296 |
| AMA | BEKTAŞ A,Guducuoglu H,Gursoy N,BERKTAŞ M,Sumbul B,Parlak M,Otlu B,TEKEREKOĞLU M Genişlemiş Spektrumlu Beta-Laktamaz (GSBL) Üreten Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae Suşlarının GSBL Genlerinin Araştırılması. . 2018; 116 - 123. 10.5578/flora.67296 |
| Vancouver | BEKTAŞ A,Guducuoglu H,Gursoy N,BERKTAŞ M,Sumbul B,Parlak M,Otlu B,TEKEREKOĞLU M Genişlemiş Spektrumlu Beta-Laktamaz (GSBL) Üreten Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae Suşlarının GSBL Genlerinin Araştırılması. . 2018; 116 - 123. 10.5578/flora.67296 |
| IEEE | BEKTAŞ A,Guducuoglu H,Gursoy N,BERKTAŞ M,Sumbul B,Parlak M,Otlu B,TEKEREKOĞLU M "Genişlemiş Spektrumlu Beta-Laktamaz (GSBL) Üreten Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae Suşlarının GSBL Genlerinin Araştırılması." , ss.116 - 123, 2018. 10.5578/flora.67296 |
| ISNAD | BEKTAŞ, Abdullah vd. "Genişlemiş Spektrumlu Beta-Laktamaz (GSBL) Üreten Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae Suşlarının GSBL Genlerinin Araştırılması". (2018), 116-123. https://doi.org/10.5578/flora.67296 |
| APA | BEKTAŞ A, Guducuoglu H, Gursoy N, BERKTAŞ M, Sumbul B, Parlak M, Otlu B, TEKEREKOĞLU M (2018). Genişlemiş Spektrumlu Beta-Laktamaz (GSBL) Üreten Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae Suşlarının GSBL Genlerinin Araştırılması. Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi, 23(3), 116 - 123. 10.5578/flora.67296 |
| Chicago | BEKTAŞ Abdullah,Guducuoglu Huseyin,Gursoy Nafia Canan,BERKTAŞ Mustafa,Sumbul Bilge,Parlak Mehmet,Otlu Baris,TEKEREKOĞLU Mehmet Sait Genişlemiş Spektrumlu Beta-Laktamaz (GSBL) Üreten Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae Suşlarının GSBL Genlerinin Araştırılması. Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi 23, no.3 (2018): 116 - 123. 10.5578/flora.67296 |
| MLA | BEKTAŞ Abdullah,Guducuoglu Huseyin,Gursoy Nafia Canan,BERKTAŞ Mustafa,Sumbul Bilge,Parlak Mehmet,Otlu Baris,TEKEREKOĞLU Mehmet Sait Genişlemiş Spektrumlu Beta-Laktamaz (GSBL) Üreten Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae Suşlarının GSBL Genlerinin Araştırılması. Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi, vol.23, no.3, 2018, ss.116 - 123. 10.5578/flora.67296 |
| AMA | BEKTAŞ A,Guducuoglu H,Gursoy N,BERKTAŞ M,Sumbul B,Parlak M,Otlu B,TEKEREKOĞLU M Genişlemiş Spektrumlu Beta-Laktamaz (GSBL) Üreten Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae Suşlarının GSBL Genlerinin Araştırılması. Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi. 2018; 23(3): 116 - 123. 10.5578/flora.67296 |
| Vancouver | BEKTAŞ A,Guducuoglu H,Gursoy N,BERKTAŞ M,Sumbul B,Parlak M,Otlu B,TEKEREKOĞLU M Genişlemiş Spektrumlu Beta-Laktamaz (GSBL) Üreten Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae Suşlarının GSBL Genlerinin Araştırılması. Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi. 2018; 23(3): 116 - 123. 10.5578/flora.67296 |
| IEEE | BEKTAŞ A,Guducuoglu H,Gursoy N,BERKTAŞ M,Sumbul B,Parlak M,Otlu B,TEKEREKOĞLU M "Genişlemiş Spektrumlu Beta-Laktamaz (GSBL) Üreten Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae Suşlarının GSBL Genlerinin Araştırılması." Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi, 23, ss.116 - 123, 2018. 10.5578/flora.67296 |
| ISNAD | BEKTAŞ, Abdullah vd. "Genişlemiş Spektrumlu Beta-Laktamaz (GSBL) Üreten Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae Suşlarının GSBL Genlerinin Araştırılması". Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi 23/3 (2018), 116-123. https://doi.org/10.5578/flora.67296 |
