Karbapeneme Dirençli Enterik Bakterilerde İsepamisin, Kloramfenikol ve Minosiklin Duyarlılığının Araştırılması

AYGÜN, Gökhan; BAKIR, Esra; Taner, Zeynep; BORSA, Barış Ata; KUŞKUCU, Mert Ahmet; KARAKULLUKÇU, ASİYE; ozalp, cengiz

Karbapeneme Dirençli Enterik Bakterilerde İsepamisin, Kloramfenikol ve Minosiklin Duyarlılığının Araştırılması

Asiye KARAKULLUKÇU, (Gümüşhane Üniversitesi, Sağlık Hizmetleri Meslek Yüksekokulu, Gümüşhane, Türkiye)

Barış Ata BORSA, (Yeditepe Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, İstanbul, Türkiye)

Mert Ahmet KUŞKUCU, (İstanbul Üniversitesi, Cerrahpaşa Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, İstanbul, Türkiye)

Esra BAKIR, (İstanbul Üniversitesi, Cerrahpaşa Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, İstanbul, Türkiye)

Zeynep TANER, (İstanbul Üniversitesi, Cerrahpaşa Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, İstanbul, Türkiye)

Veli Cengiz ÖZALP, (İstanbul Kemerburgaz Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı, İstanbul, Türkiye)

Gökhan AYGÜN (İstanbul Üniversitesi, Cerrahpaşa Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, İstanbul, Türkiye)

Klimik Dergisi

10 1

Yıl: 2018 Cilt: 31 Sayı: 1 Sayfa Aralığı: 50 - 55 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 24-07-2019

Karbapeneme Dirençli Enterik Bakterilerde İsepamisin, Kloramfenikol ve Minosiklin Duyarlılığının Araştırılması

Öz:

Amaç: Bu çalışmada, karbapeneme dirençli enterik bakteri(KDE)’lerin direnç özelliklerinin belirlenmesi ve ileriye yönelikalternatif tedavi seçeneklerinin değerlendirilmesi amaçlanmıştır.Yöntemler: Ekim 2014-Temmuz 2015 tarihleri arasında, yatanhastalardan rutin olarak elde edilen rektal sürüntü örnekleriçalışmaya alındı. İzole edilen enterik bakteriler standard konvansiyonelmikrobiyolojik yöntemlerle idantifiye edildi. Saptanankarbapenem direnci meropenem Etest® (bioMérieux,Marcy l'Etoile, Fransa) yöntemiyle doğrulanıp, direnç mekanizmalarıMAST-ID™ Discs (Mast Diagnostics Ltd, Bootle,Merseyside, Birleşik Krallık) karbapenemaz aktivite testdiskleriyle araştırıldı. Kökenlerin duyarlılıkları, disk difüzyonyöntemiyle isepamisin, kloramfenikol ve minosiklin diskleri(Oxoid, Basingstoke, Hampshire, Birleşik Krallık) kullanılarakdeğerlendirildi.Bulgular: Çalışma dönemi içerisinde laboratuvara gönderilen3323 rektal örnekten, her hastaya ait bir köken olmak üzere toplam84 (%2.5) KDE izole edildi. Bu kökenlerin 74 (%88)'ü Klebsiellapneumoniae ve 10 (%12)'u Escherichia coli idi. Kökenlerin66 (%78.5)’sında OXA-48, 11 (%13.1)’inde OXA-48 + metallo-β-laktamaz (MBL), 1 (%1.2)’inde sadece MBL, 1 (%1.2)’inde sadeceAmpC + porin kaybı saptanırken, hiçbirinde KPC pozitifliğisaptanmadı; 5 (%6)'inde ise test edilen direnç mekanizmalarındanhiçbirine rastlanmadı. Toplam 84 KDE'nin 80 (%95.2)’iisepamisine, 77 (%91.6)’si kloramfenikole ve 14 (%16.6)’ü minosiklineduyarlı olarak saptandı.Sonuçlar: Türkiye'de endemik olan OXA-48 tipi, çalışmada daen çok tespit edilen karbapenemaz oldu. KDE'lere bağlı infekÖzgün siyonların tedavisinde isepamisin ve kloramfenikol gündemegelebilecek antibiyotikler olabilir.Klimik Dergisi 2018; 31(1): 50-5.

Anahtar Kelime:

Konular: Biyoloji Mikrobiyoloji

Investigation of Isepamicin, Chloramphenicol and Minocycline Sensitivity in Carbapenem-Resistant Enterobacteriaceae

Öz:

Objective: In this study, we aimed to determine the resistance mechanisms of carbapenem-resistant Enterobacteriaceae (CRE), and evaluate the prospective alternative treatment options. Methods: Between October 2014 and July 2015, rectal swabs routinely obtained from hospitalized patients were included in the study. The isolated Gram-negative enteric bacteria were identified to the species level by using standard conventional microbiological methods. Determined carbapenem resistance in enteric bacteria was confirmed by using meropenem Etest® (bioMérieux, Marcy l'Etoile, France), and the resistance mechanisms were investigated with MAST-ID™ Discs (Mast Diagnostics Ltd, Bootle, Merseyside, UK). Antibiotic susceptibilities of the CRE were determined by disk diffusion method using isepamicin, chloramphenicol, and minocycline disks (Oxoid, Basingstoke, Hampshire, UK). Results: Of the 3,323 rectal swabs sent to the laboratory during the study period, totally 84 (2.5%) CRE were isolated with one strain from each patient. Of the 84 CRE, 74 (88%) were Klebsiella pneumoniae and 10 (12%) were Escherichia coli. Among the 84 CRE, 66 (78.5%) with OXA-48, 11 (13.1%) with OXA- 48 + metallo-β-lactamase (MBL), 1 (1.2%) with only MBL and 1 (1.2%) with AmpC + porin loss were detected, none of the strains were positive for KPC. In 5 (6%) strains, none of the resistance mechanisms were found. Of the 84 CRE, 80 (95.2%), 77 (91.6%) and 14 (16.6%) were found to be susceptible to isepamicin, chloramphenicol and minocycline, respectively. Conclusions: The OXA-48 type, endemic in Turkey, was also the most commonly detected carbapenemase in the study. It has been observed that isepamicin and chloramphenicol can be the potential antibiotics in the treatment of KDE-related infections. Klimik Dergisi 2018; 31(1): 50-5.

Anahtar Kelime:

Konular: Biyoloji Mikrobiyoloji

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık

1. Nordmann P, Naas T, Poirel L. Global spread of carbapenemase- producing Enterobacteriaceae. Emerg Infect Dis. 2011; 17(10): 1791-8. [CrossRef]
2. Patel JB, Rasheed JK, Kitchel B. Carbapenemases in Enterobacteriaceae: activity, epidemiology, and laboratory detection. Clin Microbiol News. 2009; 31(8): 55-62. [CrossRef]
3. Falagas ME, Bliziotis IA, Kasiakou SK, Samonis G, Athanassopoulou P, Michalopoulos A. Outcome of infections due to pandrug-resistant (PDR) gram-negative bacteria. BMC Infect Dis. 2005; 5: 24. [CrossRef]
4. Gülmez D, Woodford N, Palepou MFI, et al. Carbapenem-resistant Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae isolates from Turkey with OXA-48-like carbapenemases and outer membrane protein loss. Int J Antimicrob Agents. 2008; 31(6): 523-6. [CrossRef]
5. Livermore DM, Warner M, Mushtaq S, Doumith M, Zhang J, Woodford N. What remains against carbapenem-resistant Enterobacteriaceae? Evaluation of chloramphenicol, ciprofloxacin, colistin, fosfomycin, minocycline, nitrofurantoin, temocillin and tigecycline. Int J Antimicrob Agents. 2011; 37(5): 415-9. [CrossRef]
6. Winn W, Allen S, Janda W, et al., eds. Koneman’s Color Atlas and Textbook of Diagnostic Microbiology. 6th ed. Baltimore, MD: Lippincott Williams & Wilkins, 2006: 211-302.
7. Bauer AW, Kirby WM, Sherris JC, Turck M. Antibiotic susceptibility testing by a standardized single disk method. Am J Clin Pathol. 1966; 45(4): 493-6. [CrossRef]
8. Breakpoint tables for interpretation of MICs and zone diameters. Version 6.0, valid from 2016-01-01 [İnternet]. Basel: European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing [erişim 20 Temmuz 2017]. http://www.eucast.org/fileadmin/src/ media/PDFs/EUCAST_files/Breakpoint_tables/v_6.0_Breakpoint_ table.pdf.
9. Doyle D, Peirano G, Lascols C, Lloyd T, Church DL, Pitout JD. Laboratory detection of Enterobacteriaceae that produce carbapenemases. J Clin Microbiol. 2012; 50(12): 3877-80. [CrossRef]
10. Comité de l’Antibiogramme de la Société Française de Microbiologie. Recommandations 2010. Edition de Janvier 2010 [İnternet]. Paris: Société Française de Microbiologie [erişim 20 Temmuz 2017]. http://www.sfm-microbiologie.org/UserFiles/files/ casfm_2010.pdf.
11. Fritsche TR, Sader HS, Toleman MA, Walsh TR, Jones RN. Emerging metallo-beta-lactamase-mediated resistances: a summary report from the worldwide SENTRY antimicrobial surveillance program. Clin Infect Dis. 2005; 41(Suppl. 4): S276-8. [CrossRef]
12. Deshpande LM, Jones RN, Fritsche TR, Sader HS. Occurrence and characterization of carbapenemase-producing Enterobacteriaceae: report from the SENTRY Antimicrobial Surveillance Program (2000-2004). Microb Drug Resist. 2006; 12(4): 223-30. [CrossRef]
13. Poirel L, Heritier C, Tolün V, Nordmann P. Emergence of oxacillinase- mediated resistance to imipenem in Klebsiella pneumoniae. Antimicrob Agents Chemother. 2004; 48(1): 15-22. [CrossRef]
14. Aktas Z, Bal C, Midilli K, Poirel L, Nordmann P. First IMP-1- producing Klebsiella pneumoniae isolate in Turkey. Clin Microbiol Infect. 2006; 12(7): 695-6. [CrossRef]
15. Demir Y, Zer Y, Karaoglan I. Investigation of VIM, IMP, NDM-1, KPC and OXA-48 enzymes in Enterobacteriaceae strains. Pak J Pharm Sci. 2015; 28(3 Suppl.): 1127-33.
16. Carrër A, Poirel L, Eraksoy H, Cagatay AA, Badur S, Nordmann P. Spread of OXA-48-positive carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae isolates in Istanbul, Turkey. Antimicrob Agents Chemother. 2008; 52(8): 2950-4. [CrossRef]
17. Labarca J, Poirel L, Ozdamar M, Turkoglü S, Hakko E, Nordmann P. KPC-producing Klebsiella pneumoniae, finally targeting Turkey. New Microbes New Infect. 2014; 2(2): 50-1. [CrossRef]
18. Kuskucu MA, Karakullukcu A, Ailiken M, Otlu B, Mete B, Aygun G. Investigation of carbapenem resistance and the first identification of Klebsiella pneumoniae carbapenemase (KPC) enzyme among Escherichia coli isolates in Turkey: A prospective study. Travel Med Infect Dis. 2016; 14(6): 572-6. [CrossRef]
19. Doyle D, Peirano G, Lascols C, Lloyd T, Church DL, Pitout JD. Laboratory detection of Enterobacteriaceae that produce carbapenemases. J Clin Microbiol. 2012; 50(12): 3877-80. [CrossRef]
20. Osei Sekyere J, Govinden U, Essack SY. Review of established and innovative detection methods for carbapenemase-producing Gram-negative bacteria. J Appl Microbiol. 2015; 119(5): 1219-33. [CrossRef]
21. Arias CA, Murray BE. Antibiotic-resistant bugs in the 21st century--a clinical super-challenge. N Engl J Med. 2009; 360(5): 439-43. [CrossRef]
22. Giamarellou H, Poulakou G. Multidrug-resistant Gram-negative infections: what are the treatment options? Drugs. 2009; 69(14): 1879-901. [CrossRef]
23. Castanheira M, Sader HS, Deshpande LM, Fritsche TR, Jones RN. Antimicrobial activities of tigecycline and other broadspectrum antimicrobials tested against serine carbapenemaseand metallo-beta-lactamase-producing Enterobacteriaceae: report from the SENTRY Antimicrobial Surveillance Program. Antimicrob Agents Chemother. 2008; 52(2): 570-3. [CrossRef]
24. Zhi C, Lv L, Yu LF, Doi Y, Liu JH. Dissemination of the mcr-1 colistin resistance gene. Lancet Infect Dis. 2016; 16(3): 292-3. [CrossRef]
25. Du H, Chen L, Tang YW, Kreiswirth BN. Emergence of the mcr-1 colistin resistance gene in carbapenem-resistant Enterobacteriaceae. Lancet Infect Dis. 2016; 16(3): 287-8. [CrossRef]
26. Özdemir D, Willke Topçu A. Aminoglikozitler. In: Willke Topçu A, Söyletir G, Doğanay M, eds. Enfeksiyon Hastalıkları ve Mikrobiyolojisi. 4. baskı. İstanbul: Nobel Tıp Kitabevleri, 2017: 283-90.
27. Mıstık R. Aminoglikozid antibiyotikler ve günde tek doz kullanımları. Klimik Derg. 2000; 13(2): 43-5.
28. Över U, Gür D, Ünal S, Miller GH, Aminoglycoside Resistance Study Group. The changing nature of aminoglycoside resistance mechanisms and prevalence of newly recognized resistance mechanisms in Turkey. Clin Microbiol Infect. 2001; 7(9): 470-8. [CrossRef]
29. Belgian Isepamicin Multicenter Study Group. Comparative in vitro activity of isepamicin and other antibiotics against gramnegative bacilli from intensive care units (ICU) in Belgium. Acta Clin Belg. 2001; 56(5): 307-15. [CrossRef]
30. Küçükateş E, Kansız E, Gültekin N. Gram-negatif bakterilerde isepamisin, amikasin ve gentamisine karşı direnç. İnfeks Derg. 2007; 21(1): 21-5.
31. Salvatore M, Meyers BR. Tetracyclines and chloramphenicol. In: Mandell GL, Bennett JE, Dolin R, eds. Mandell, Douglas, and Bennett’s Principles and Practice of Infectious Diseases. 6th ed. Philadelphia: Churchill Livingstone, 2010: 385-401. [CrossRef]
32. Parry CM, Hien TT, Dougan G, White NJ, Farrar JJ. Typhoid fever. N Engl J Med. 2002; 347(22): 1770-82. [CrossRef]
33. Sood S, Kapil A, Das B, Jain Y, Kabra SK. Re-emergence of chloramphenicol-sensitive Salmonella typhi. Lancet. 1999; 353(9160): 1241-2. [CrossRef]
34. Messick CR, Pendland SL. In vitro activity of chloramphenicol alone and in combination with vancomycin, ampicillin, or RP 59500 (quinupristin/dalfopristin) against vancomycin-resistant enterococci. Diagn Microbiol Infect Dis. 1997; 29(3): 203-5. [CrossRef]
35. Hoban DJ, Biedenbach DJ, Mutnick AH, Jones RN. Pathogen of occurrence and susceptibility patterns associated with pneumonia in hospitalized patients in North America: results of the SENTRY Antimicrobial Surveillance Study (2000). Diagn Microbiol Infect Dis. 2003; 45(4): 279-85. [CrossRef]
36. Saivin S, Houin G. Clinical pharmacokinetics of doxycycline and minocycline. Clin Pharmacokinet. 1988; 15(6): 355-66. [CrossRef]
37. Kelesidis T, Karageorgopoulos DE, Kelesidis I, Falagas ME. Tigecycline for the treatment of multidrug-resistant Enterobacteriaceae: a systematic review of the evidence from microbiological and clinical studies. J Antimicrob Chemother. 2008; 62(5): 895-904. [CrossRef]

APA	KARAKULLUKÇU A, BORSA B, KUŞKUCU M, BAKIR E, Taner Z, ozalp c, AYGÜN G (2018). Karbapeneme Dirençli Enterik Bakterilerde İsepamisin, Kloramfenikol ve Minosiklin Duyarlılığının Araştırılması. , 50 - 55.
Chicago	KARAKULLUKÇU ASİYE,BORSA Barış Ata,KUŞKUCU Mert Ahmet,BAKIR Esra,Taner Zeynep,ozalp cengiz,AYGÜN Gökhan Karbapeneme Dirençli Enterik Bakterilerde İsepamisin, Kloramfenikol ve Minosiklin Duyarlılığının Araştırılması. (2018): 50 - 55.
MLA	KARAKULLUKÇU ASİYE,BORSA Barış Ata,KUŞKUCU Mert Ahmet,BAKIR Esra,Taner Zeynep,ozalp cengiz,AYGÜN Gökhan Karbapeneme Dirençli Enterik Bakterilerde İsepamisin, Kloramfenikol ve Minosiklin Duyarlılığının Araştırılması. , 2018, ss.50 - 55.
AMA	KARAKULLUKÇU A,BORSA B,KUŞKUCU M,BAKIR E,Taner Z,ozalp c,AYGÜN G Karbapeneme Dirençli Enterik Bakterilerde İsepamisin, Kloramfenikol ve Minosiklin Duyarlılığının Araştırılması. . 2018; 50 - 55.
Vancouver	KARAKULLUKÇU A,BORSA B,KUŞKUCU M,BAKIR E,Taner Z,ozalp c,AYGÜN G Karbapeneme Dirençli Enterik Bakterilerde İsepamisin, Kloramfenikol ve Minosiklin Duyarlılığının Araştırılması. . 2018; 50 - 55.
IEEE	KARAKULLUKÇU A,BORSA B,KUŞKUCU M,BAKIR E,Taner Z,ozalp c,AYGÜN G "Karbapeneme Dirençli Enterik Bakterilerde İsepamisin, Kloramfenikol ve Minosiklin Duyarlılığının Araştırılması." , ss.50 - 55, 2018.
ISNAD	KARAKULLUKÇU, ASİYE vd. "Karbapeneme Dirençli Enterik Bakterilerde İsepamisin, Kloramfenikol ve Minosiklin Duyarlılığının Araştırılması". (2018), 50-55.

APA	KARAKULLUKÇU A, BORSA B, KUŞKUCU M, BAKIR E, Taner Z, ozalp c, AYGÜN G (2018). Karbapeneme Dirençli Enterik Bakterilerde İsepamisin, Kloramfenikol ve Minosiklin Duyarlılığının Araştırılması. Klimik Dergisi, 31(1), 50 - 55.
Chicago	KARAKULLUKÇU ASİYE,BORSA Barış Ata,KUŞKUCU Mert Ahmet,BAKIR Esra,Taner Zeynep,ozalp cengiz,AYGÜN Gökhan Karbapeneme Dirençli Enterik Bakterilerde İsepamisin, Kloramfenikol ve Minosiklin Duyarlılığının Araştırılması. Klimik Dergisi 31, no.1 (2018): 50 - 55.
MLA	KARAKULLUKÇU ASİYE,BORSA Barış Ata,KUŞKUCU Mert Ahmet,BAKIR Esra,Taner Zeynep,ozalp cengiz,AYGÜN Gökhan Karbapeneme Dirençli Enterik Bakterilerde İsepamisin, Kloramfenikol ve Minosiklin Duyarlılığının Araştırılması. Klimik Dergisi, vol.31, no.1, 2018, ss.50 - 55.
AMA	KARAKULLUKÇU A,BORSA B,KUŞKUCU M,BAKIR E,Taner Z,ozalp c,AYGÜN G Karbapeneme Dirençli Enterik Bakterilerde İsepamisin, Kloramfenikol ve Minosiklin Duyarlılığının Araştırılması. Klimik Dergisi. 2018; 31(1): 50 - 55.
Vancouver	KARAKULLUKÇU A,BORSA B,KUŞKUCU M,BAKIR E,Taner Z,ozalp c,AYGÜN G Karbapeneme Dirençli Enterik Bakterilerde İsepamisin, Kloramfenikol ve Minosiklin Duyarlılığının Araştırılması. Klimik Dergisi. 2018; 31(1): 50 - 55.
IEEE	KARAKULLUKÇU A,BORSA B,KUŞKUCU M,BAKIR E,Taner Z,ozalp c,AYGÜN G "Karbapeneme Dirençli Enterik Bakterilerde İsepamisin, Kloramfenikol ve Minosiklin Duyarlılığının Araştırılması." Klimik Dergisi, 31, ss.50 - 55, 2018.
ISNAD	KARAKULLUKÇU, ASİYE vd. "Karbapeneme Dirençli Enterik Bakterilerde İsepamisin, Kloramfenikol ve Minosiklin Duyarlılığının Araştırılması". Klimik Dergisi 31/1 (2018), 50-55.