Staphylococcus aureus Suşlarında Metisilin Direncinin Klasik ve Moleküler Yöntemlerle Araştırılması
Yıl: 2018 Cilt: 31 Sayı: 1 Sayfa Aralığı: 30 - 33 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 24-07-2019
Staphylococcus aureus Suşlarında Metisilin Direncinin Klasik ve Moleküler Yöntemlerle Araştırılması
Öz: Amaç: Bu çalışmanın amacı, Staphylococcus aureus suşlarındametisilin direncinin belirlenmesinde kullanılan çeşitli klasikyöntemlerle genotipik bir yöntem olan mecA geni varlığının kıyaslanmasıdır.Yöntemler: Çalışmaya çeşitli klinik örneklerden izole edilen 86metisiline dirençli S. aureus (MRSA) ve 30 metisiline duyarlı S.aureus (MSSA) suşu dahil edildi. Suşların metisilin dirençlerioksasilin ve sefoksitin disk difüzyon testiyle belirlendi. Metisilindirenci için MRSA kromojenik agarda kolonilerin üreyipüremediklerine bakıldı. Polimeraz zincir reaksiyonuyla araştırılanmecA geni varlığı altın standard test olarak kabul edildive diğer sonuçların duyarlılık, özgüllük, pozitif prediktif değer(PPD) ve negatif prediktif değer (NPD)’leri buna göre hesaplandı.Bulgular: Duyarlılık, özgüllük, PPD ve NPD yüzdeleri sefoksitindisk difüzyon testi için sırasıyla %98.7, %81.6, %91.7, %96.9;oksasilin disk difüzyon testi için sırasıyla %100, %78.9, %90.7,%100; MRSA kromojenik agar 24. saatlik değerlendirme için sırasıyla%45.8, %63.2, %70.2, %38.0; 48. saatlik değerlendirmeiçin sırasıyla %51.4, %63.2, %72.5, %40.7 idi.Sonuçlar: MRSA sorununun yüksek olduğu hastanelerde gerekli önlemlerinalınabilmesi açısından mecA geninin araştırılması en doğrusonuca ulaşmada önemlidir. Sefoksitin ve oksasilin disk difüzyon yöntemlerisonuçları birbirine yakın bulunduğundan sefoksitin diski olmadığıdurumlarda oksasilinin de bir alternatif olabileceğini düşünmekteyiz.MRSA saptanması için kromojenik agarın kullanılması durumundaihtiyatlı davranılması uygun olacaktır. Klimik Dergisi 2018; 31(1): 30-3.
Anahtar Kelime: Konular:
Detection of Methicillin Resistance in Staphylococcus aureus Isolates by Classical and Molecular Methods
Öz: Objective: This study was planned to detect methicillin resistance in Staphylococcus aureus strains by conventional phenotypic methods and polymerase chain reaction for mecA gene and to compare the results of these tests for their sensitivity and specificity. Methods: Eighty six methicillin-resistant S. aureus (MRSA) and 30 methicillin-sensitive S. aureus (MSSA) strains from various clinical samples were included in this study. Methicillin resistance was detected by oxacillin and cefoxitin disk diffusion method. Presence of colonies on MRSA chromogenic agar was looked for methicillin resistance. The presence of the mecA gene investigated by polymerase chain reaction is considered to be the gold standard test, and sensitivity, specificity, positive predictive value (PPV) and negative predictive value (NPV) were calculated accordingly. Results: The percentage of sensitivity, specificity, PPV and NPV were 98.7%, 81.6%, 91.7%, 96.9% for the cefoxitin disk diffusion test, respectively; 100%, 78.9%, 90.7%, 100% for the oxacillin disk diffusion test, respectively; 45.8%, 63.2%, 70.2%, 38.0% for the 24-hour evaluation MRSA chromogenic agar, respectively; 51.4%, 63.2%, 72.5%, 40.7% for the 48-hour evaluation, respectively. Conclusions: Investigation of mecA is crucial for taking the necessary precautions in hospitals where the MRSA is a common problem. The results for cefoxitin and oxacillin disk diffusion method were found close to each other; hence, we think that oxacillin disk can be an alternative instead of cefoxitin disk. Results based on chromogenic agar should be interpreted with caution. Klimik Dergisi 2018; 31(1): 30-3.
Anahtar Kelime: Konular:
Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık
- 1. Shittu A, Oyedara O, Abegunrin F, et al. Characterization of methicillin- susceptible and -resistant staphylococci in the clinical setting: a multicentre study in Nigeria. BMC Infect Dis. 2012; 12: 286. [CrossRef]
- 2. Maina EK, Kiiyukia C, Wamae CN, Waiyaki PG, Kariuki S. Characterization of methicillin-resistant Staphylococcus aureus from skin and soft tissue infections in patients in Nairobi, Kenya. Int J Infect Dis. 2013; 17(2): 115-9. [CrossRef]
- 3. Çiftçi İH, Altındiş M, Çetinkaya Z, Aşık G, Aktepe OC. Klinik örneklerden izole edilen stafilokoklarda mecA varlığının araştırılması. Kocatepe Tıp Derg. 2009; 10(1): 17-20.
- 4. Vural A, Afşar İ, Kurultay N, Demirci M. Staphylococcus aureus’da metisilin direncinin saptanmasında disk difüzyon, oksasilin agar tarama, mikrodilüsyon ve PBP2A lateks aglütinasyon testlerinin karşılaştırılması. Ankem Derg. 2011; 25(3): 145-9. [CrossRef]
- 5. Felten A, Grandy B, Lagrange PH, Casin I. Evaluation of three techniques for detection of low-level methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA): a disk diffusion method with cefoxitin and moxalactam, the Vitek 2 system, and the MRSA-screen latex agglutination test. J Clin Microbiol. 2002; 40(8): 2766-71. [CrossRef]
- 6. Telli M, Sümerkan B, Eşel D. Staphylococcus aureus’ta metisilin direncinin belirlenmesinde sefoksitin disk, oksasilin disk, oksasilin agar tarama ve PBP2a lateks testlerinin karşılaştırılması. İnfeks Derg. 2006; 20(2): 93-6.
- 7. Clinical and Laboratory Standards Institute. Performance Standards for Antimicrobial Susceptibility Testing. 18th Informational Supplement. CLSI Document M100-S18, Wayne, PA: CLSI, 2008.
- 8. Clinical and Laboratory Standards Institute. Performance Standards for Antimicrobial Susceptibility Testing. Twenty-Second Informational Supplement. M100-S22, Wayne, PA: CLSI, 2012.
- 9. Clinical and Laboratory Standards Institute. Performance Standards for Antimicrobial Susceptibility Testing. Seventeenth Informational Supplement, M100-S17, Wayne, PA: CLSI, 2007.
- 10. Geha DJ, Uhl JR, Gustaferro CA, Persing DH. Multiplex PCR for identification of methicillin-resistant staphylococci in the clinical laboratory. J Clin Microbiol. 1994; 32(7): 1768-72.
- 11. Sancak B. Staphylococcus aureus ve antibiyotik direnci. Mikrobiyol Bül. 2011; 45(3): 565-76.
- 12. Uzun B, Karataş Şener AG, Güngör S, Afşar İ, Yüksel Ergin Ö, Demirci M. Staphylococcus aureus suşlarındaki metisilin direncinin belirlenmesinde sefoksitin disk difüzyon testi, otomatize sistem ve kromojenik besiyerinin karşılaştırılması. Mikrobiyol Bül. 2013; 47(1): 11-8. [CrossRef]
- 13. Peksel H. Hastane Kökenli Koagülaz Negatif Stafilokok Suşlarında Oksasilin Direncinin Moleküler ve Geleneksel Yöntemlerle Araştırılması [Uzmanlık Tezi]. İzmir: Dokuz Eylül Üniversitesi Tıp Fakültesi İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, 2006.
- 14. Cauwelier B, Gordts B, Descheemaecker P, Van Landuyt H. Evaluation of a disk diffusion method with cefoxitin (30 microg) for detection of methicillin-resistant Staphylococcus aureus. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2004; 23(5): 389-92. [CrossRef]
- 15. Velasco D, del Mar Tomas M, Cartelle M, et al. Evaluation of different methods for detecting methicillin (oxacillin) resistance in Staphylococcus aureus. J Antimicrob Chemother. 2005; 55(3): 379-82. [CrossRef]
- 16. Özel G, Aslan V, Bahar Erdem G, Çağatay M, Şencan İ, Mert A. Stafilokoklarda metisilin duyarlılığının belirlenmesinde oksasilin, sefoksitin, seftizoksim ve moksalaktam disk difüzyon yöntemlerinin karşılaştırılması. Mikrobiyol Bül. 2011; 45(2): 258-65.
- 17. Boutiba-Ben Boubaker I, Ben Abbes R, Ben Abdallah H, et al. Evaluation of a cefoxitin disk diffusion test for the routine detection of methicillin-resistant Staphylococcus aureus. Clin Microbiol Infect. 2004; 10(8): 762-5. [CrossRef]
- 18. Anand KB, Agrawal P, Kumar S, Kapila K. Comparison of cefoxitin disc diffusion test, oxacillin screen agar, and PCR for mecA gene for detection of MRSA. Indian J Med Microbiol. 2009; 27(1): 27- 9.
- 19. Turaç Biçer A. Hastane İzolatı Staphylococcus aureus ve Koagülaz Negatif Staphylococcus Suşlarında Metisilin Direncinin Farklı Yöntemlerle Araştırılması [Uzmanlık Tezi]. Adana: Çukurova Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, 2009.
- 20. Gülmez D. Antimikrobiyal direnci belirlemede fenotipik yöntemler veya klasik yöntemler. Ankem Derg. 2014; 28(2): 221-8.
- 21. Özen NS, Dağlar D, Özhak Baysan B, et al. Metisilin dirençli Staphylococcus aureus suşlarının saptanmasında MRSA ID kromojenik besiyerinin değerlendirilmesi. Ankem Derg. 2011; 25(1): 31-4.
- 22. Van Hal SJ, Stark D, Lockwood B, Marriott D, Harkness J. Methicillin- resistant Staphylococcus aureus (MRSA) detection: comparison of two molecular methods (IDI-MRSA PCR assay and genotype MRSA direct PCR assay) with three selective MRSA agars (MRSA ID, MRSASelect and CHROMagar MRSA) for use with infection-control swabs. J Clin Microbiol. 2007; 45(8): 2486- 90. [CrossRef]
- 23. Diederen BM, van Leest ML, van Duijn I, Willemse P, van Keulen PH, Kluytmans JA. Performance of MRSA ID, a new chromogenic medium for detection of methicillin-resistant Staphylococcus aureus. J Clin Microbiol. 2006; 44(2): 586-8. [CrossRef]
- 24. Hedin G, Fang H. Evaluation of two new chromogenic media, CHROMagar MRSA and S.aureus ID, for identifying Staphylococcus aureus and screening methicillin-resistant S.aureus. J Clin Microbiol. 2005; 43(8): 4242-4. [CrossRef]
- 25. Al-Mussawi AA. Detection of Staphylococcus aureus and methicillin resistant Staphylococcus aureus (MRSA) from human clinical specimens using conventional biochemical tests and chromogenic media. Indian Journal of Applied Research. 2014; 4(2): 7-9. [CrossRef]
- 26. Antimicrobial susceptibility testing. EUCAST disk diffusion method. Version 5.0. January 2015 [İnternet]. Basel: European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing [erişim 20 Temmuz 2017]. http://www.eucast.org/fileadmin/src/media/ PDFs/EUCAST_files/Disk_test_documents/Manual_v_5.0_EUCAST_ Disk_Test.pdf.
- 27. Susceptibility [İnternet]. Birmingham: British Society of Antimicrobial Chemotherapy [erişim 20 Temmuz 2017]. http://www. bsac.org.uk/stewardship-surveillance/susceptibility/.
- 28. Recommandations 2014 [İnternet]. Paris, Fransa: Comité de l’antibiogramme de la Société Française de Microbiologie [erişim 20 Temmuz 2017]. http://www.sfm-microbiologie.org/User- Files/files/casfm/CASFM_EUCAST_V1_0_2014(1).pdf.
APA | Hancı H, AYYILDIZ A, BALTACI M, İgan H, UYANIK M, ADIGUZEL A (2018). Staphylococcus aureus Suşlarında Metisilin Direncinin Klasik ve Moleküler Yöntemlerle Araştırılması. , 30 - 33. |
Chicago | Hancı Hayrunisa,AYYILDIZ Ahmet,BALTACI MUSTAFA OZKAN,İgan Hakan,UYANIK Muhammet Hamidullah,ADIGUZEL Ahmet Staphylococcus aureus Suşlarında Metisilin Direncinin Klasik ve Moleküler Yöntemlerle Araştırılması. (2018): 30 - 33. |
MLA | Hancı Hayrunisa,AYYILDIZ Ahmet,BALTACI MUSTAFA OZKAN,İgan Hakan,UYANIK Muhammet Hamidullah,ADIGUZEL Ahmet Staphylococcus aureus Suşlarında Metisilin Direncinin Klasik ve Moleküler Yöntemlerle Araştırılması. , 2018, ss.30 - 33. |
AMA | Hancı H,AYYILDIZ A,BALTACI M,İgan H,UYANIK M,ADIGUZEL A Staphylococcus aureus Suşlarında Metisilin Direncinin Klasik ve Moleküler Yöntemlerle Araştırılması. . 2018; 30 - 33. |
Vancouver | Hancı H,AYYILDIZ A,BALTACI M,İgan H,UYANIK M,ADIGUZEL A Staphylococcus aureus Suşlarında Metisilin Direncinin Klasik ve Moleküler Yöntemlerle Araştırılması. . 2018; 30 - 33. |
IEEE | Hancı H,AYYILDIZ A,BALTACI M,İgan H,UYANIK M,ADIGUZEL A "Staphylococcus aureus Suşlarında Metisilin Direncinin Klasik ve Moleküler Yöntemlerle Araştırılması." , ss.30 - 33, 2018. |
ISNAD | Hancı, Hayrunisa vd. "Staphylococcus aureus Suşlarında Metisilin Direncinin Klasik ve Moleküler Yöntemlerle Araştırılması". (2018), 30-33. |
APA | Hancı H, AYYILDIZ A, BALTACI M, İgan H, UYANIK M, ADIGUZEL A (2018). Staphylococcus aureus Suşlarında Metisilin Direncinin Klasik ve Moleküler Yöntemlerle Araştırılması. Klimik Dergisi, 31(1), 30 - 33. |
Chicago | Hancı Hayrunisa,AYYILDIZ Ahmet,BALTACI MUSTAFA OZKAN,İgan Hakan,UYANIK Muhammet Hamidullah,ADIGUZEL Ahmet Staphylococcus aureus Suşlarında Metisilin Direncinin Klasik ve Moleküler Yöntemlerle Araştırılması. Klimik Dergisi 31, no.1 (2018): 30 - 33. |
MLA | Hancı Hayrunisa,AYYILDIZ Ahmet,BALTACI MUSTAFA OZKAN,İgan Hakan,UYANIK Muhammet Hamidullah,ADIGUZEL Ahmet Staphylococcus aureus Suşlarında Metisilin Direncinin Klasik ve Moleküler Yöntemlerle Araştırılması. Klimik Dergisi, vol.31, no.1, 2018, ss.30 - 33. |
AMA | Hancı H,AYYILDIZ A,BALTACI M,İgan H,UYANIK M,ADIGUZEL A Staphylococcus aureus Suşlarında Metisilin Direncinin Klasik ve Moleküler Yöntemlerle Araştırılması. Klimik Dergisi. 2018; 31(1): 30 - 33. |
Vancouver | Hancı H,AYYILDIZ A,BALTACI M,İgan H,UYANIK M,ADIGUZEL A Staphylococcus aureus Suşlarında Metisilin Direncinin Klasik ve Moleküler Yöntemlerle Araştırılması. Klimik Dergisi. 2018; 31(1): 30 - 33. |
IEEE | Hancı H,AYYILDIZ A,BALTACI M,İgan H,UYANIK M,ADIGUZEL A "Staphylococcus aureus Suşlarında Metisilin Direncinin Klasik ve Moleküler Yöntemlerle Araştırılması." Klimik Dergisi, 31, ss.30 - 33, 2018. |
ISNAD | Hancı, Hayrunisa vd. "Staphylococcus aureus Suşlarında Metisilin Direncinin Klasik ve Moleküler Yöntemlerle Araştırılması". Klimik Dergisi 31/1 (2018), 30-33. |