Karpal Tünel Sendromu Temelli Elektronik Sağlık Kayıt Sisteminin Geliştirilmesi

ZINNUROGLU, MURAT; Akarkamçı(Kaya), Hilal; Talan, Mehmet İbrahim; Alcan, Veysel; Canal, Mehmet Rahmi

Karpal Tünel Sendromu Temelli Elektronik Sağlık Kayıt Sisteminin Geliştirilmesi

Mehmet İbrahim TALAN, (Abidinpaşa Mesleki ve Teknik Anadolu Lisesi, Bilişim Teknolojileri Alanı, Ankara, Türkiye)

Mehmet Rahmi CANAL, (İnönü Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, Biyomedikal Mühendisliği Bölümü, Malatya, Türkiye)

Veysel ALCAN, (Tarsus Üniversitesi, Teknoloji Fakültesi, Yazılım Mühendisliği Bölümü, Mersin, Türkiye)

Murat ZİNNUROĞLU, (Gazi Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Fiziksel Tıp ve Rehabilitasyon Anabilim Dalı, Ankara, Türkiye)

Hilal KAYA (Yıldırım Beyazıt Üniversitesi, Mühendislik ve Doğa Bilimleri Fakültesi, Bilgisayar Mühendisliği Bölümü, Ankara, Türkiye)

Politeknik Dergisi

2 0

Yıl: 2019 Cilt: 22 Sayı: 4 Sayfa Aralığı: 847 - 853 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 18-12-2019

Karpal Tünel Sendromu Temelli Elektronik Sağlık Kayıt Sisteminin Geliştirilmesi

Öz:

Karpal tünel sendromunun (KTS) tanısında, fiziksel muayene, klinik testler ve elektrofizyolojik yöntemler kullanılmaktadır. Fakat pratikte uygulanan klinik ve elektrofizyolojik testlerde klinik ve laboratuvarlar için bir standart bulunmamaktadır. Bundan dolayı Elektronik Sağlık Kaydı (ESK) sistemlerinde, veri parçalanması veya uyumsuzluklar meydana gelebilmektedir. Ayrıca bu ESK sistemlerinde, ikincil kullanım ve farklı biyomedikal araştırma hedefleri dikkate alınmamakta ve rutin dökümantasyon işlemi sırasında, eksik, hatalı, tutarsız veri girişleri ve hatalı kodlamaları yapılabilmektedir. Bu çalışma ile, KTS tanısında farklı klinik ve merkezlerce de kullanılabilecek bir ESK sisteminin geliştirilmesi ve böylelikle standartlaştırılmış, kaliteli, öngörücü, önleyici, kişiselleştirilmiş ve gerçek zamanlı katılımcı bir KTS biyomedikal veri ambarının oluşturulması hedeflenmiştir. KTS tabanlı ESK sistemi, Microsoft Visual Studio C# programlama dili kullanılarak geliştirilmiştir. Ayrıca; yeni hasta kaydı esnasında KTS ön tanısı için WEKA programı kullanılarak veri madenciliği yöntemine dayalı bir klinik karar destek sistemi (KKDS) ile desteklenmiştir. Geliştirilen ESK sistemi, klinik ve elektrofizyoloijk test sonuçlarının yanısıra hassas tıp yaklaşımı çerçevesinde genetik ve çevresel varyantların da tek bir veri tabanına entegre edilmesine imkan tanımakta ve ikincil kullanım amacıyla geniş ölçekli doğru eksiksiz ve aynı standartta bir veri ambarı sunabilmektedir.

Anahtar Kelime:

Konular: Tıbbi İnformatik Bilgisayar Bilimleri, Yazılım Mühendisliği Bilgisayar Bilimleri, Bilgi Sistemleri Bilgisayar Bilimleri, Yapay Zeka

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık

[1] Atroshi I., Gummesson C, Johnsson R., Ornstein E., Ranstam J. Rosen I., “Prevalence of carpal tunnel syndrome in a general population”, JAMA, 282: 153-158, (1999).
[2] Nordstrom D.L., DeStefano F., Vierkant R.A., LaydeP.M., “Incidence of diagnosed carpal tunnel syndrome in a general population”, Epidemiology, 9: 342-345, (1998).
[3] Ghavanini M.R., Haghighat M., “Carpal tunnel syndrome: reappraisal of five clinical tests”, Electromyogr Clin Neurophysiol, 38: 437-441, (1998).
[4] Gellman H., Gelberman R.H., Tan A.M., Botte M.J., “Carpal tunnel syndrome. An evaluation of the provocative diagnostic tests”,J Bone Joint Surg Am, 68: 735-757, (1986) .
[5] Tetro A.M., Evanoff B.A., Hollstien S.B., Gelberman R.H., “A new provocative test for carpal tunnel syndrome. Assessment of wrist flexion and nerve compression” J Bone Joint Surg Br, 80: 493-498, (1998).
[6]Levine D.W., Simmons B.P., Koris M.J. et al., “A self-administered questionnaire for the assessment of severity ofsymptoms and functional status in carpal tunnel syndrome”, J Bone Joint Surg Am, 75:1585–1592, (1993).
[7] Jablecki C.K., Andary M.T., So Y.T., Wilkins D.E., Williams F.H., “Literature review of the usefulness of nerve conduction studies and electromyography for the evaluation of patients with carpal tunnel syndrome”, Muscle Nerve, 16:1392-1414, (1993).
[8] Aminoff M.J., “Electromyography in Clinical Practice 2th ed”, Churchill Livingstone Inc, USA, (1987).
[9] Bodofsky E.B., “Diagnosing mild carpal tunnel syndrome with interpolation”, Electromyogr Clin Neurophysiol, 44:379-383, (2004).
[10] Kohara N., “Clinical and Electrophysiological Findings in Carpal Tunnel Syndrome”, Brain Nerve, 59: 1229-1238, (2007).
[11] Shortliff E.H. and Climine J.J., “Biomedıcal Informatics: Computer Applications In Health Care & Bıomedicine”, Springer, Newyok USA, (2006).
[12] Gubbia J., Buyya R., Marusica S., Palaniswami M., “Internet of Things (IoT): A vision, architectural elements, and future directions”, Future Generation Computer Systems, 29: 1645-1660, (2013).
[13] Hanauer D.A., Ramakrishnan N., “Modeling temporal relationships in large scale clinical associations”, J Am Med Inform Assoc, 20: 332-341, (2013).
[14] Mullins I.M., Siadaty M.S., Lyman J., et al., “Data mining and clinical data repositories: insights from a 667,000 patient data set”, Comput Biol Med, 36: 1351-77,(2006).
[15] Wright A., Chen E.S., Maloney F.L., “An automated technique for identifying associations between medications, laboratory results and problems”, J Biomed Inform, 43: 891-901, (2010).
[16] Hoffman S., and Podgurski A., “Big Bad Data: Law, Public Health, and Biomedical Databases”, J.L. Med. & Ethıcs, 41: 56-60, (2013).
[17] Jensen P.B., Jensen L.J., Brunak S., “Mining electronic health records: towards better research applications and clinical care”, Nat Rev Genet, 13: 395-405, (2012).
[18] Ramakrishnan N., Hanauer D., Keller B., “Mining Electronic Health Records”, Computer, 43: 77-81, (2010).
[19] Kalra D., Musen M., Smıth B., Ceusters W., “Argos Policy Brief on Semantic Interoperability”,Studies in health technology and informatics, 170: 1-15, (2011).
[20] Phan J.H., Quo C.F., Cheng C., Wang M.D., “Multiscale integration of omic, imaging, and clinical data in biomedical informatics”, IEEE Rev Biomed Eng5: 74-87, (2012).
[21] Talan M.I., Canal M.R., Zinnuroğlu M., Alcan V., “Tıbbi Veri Ambarı Kullanarak Veri Madenciliği Sınıflandırma Algoritmalarının Karşılaştırılması”, 1st International Turkish World Engineering and Science Congress, Antalya, 7-10, (2017).
[22] Hakim A.J., Cherkas L., El Zayat S., MacGregor A.J., Spector T.D., “The genetic contribution to carpal tunnel syndrome in women: a twin study”, Spector Arthritis Rheum,47: 275-279, (2002).
[23] Lozano-Calderón S., Anthony S., Ring D., “The quality and strength of evidence for etiology: example of carpal tunnel syndrome”, J Hand Surg Am,33: 525-538, (2008).
[24] Bland J.D.P., “Carpal tunnel syndrome”, Curr Opin in Int Med, 4: 578-582, (2005).
[25] Becker J., Nora D.B., Gomes I., Stringari F.F., Seitensus R., PanossoJ.S., “An evaluation of gender, obesity, age and diabetes mellitus as risk factors for carpal tunnel syndrome”, Clin Neurophysiol, 113: 1429-1434, (2002).
[26] Lam N., Thurston A., “Association of obesity, gender, age and occupation with carpal tunnel syndrome”, Aust N Z J Surg, 68: 190-193, (1998).
[27]Reinstein L., “Hand dominance in carpal tunnel syndrome”, Arch Phys Med Rehabil, 62: 202-203, (1981).
[28]İnternet: The Precision Medicine Initiative, https://obamawhitehouse.archives.gov/node/333101 Son Erişim Tarihi: 15.08.2018.
[29]Jameson J.L., Longo D.L., “Precision Medicine-Personalized, Problematic, and Promising”, Obstetrical & Gynecological Survey, 70: 612-614, (2015)
[30] Weiskopf N.G., Hripcsak G., Swaminathan S., Weng C., “Defining and measuring completeness of electronic health records for secondary use”, J Biomed Inform, 46: 830-836, (2013).
[31] Chan K.S.,Fowles J.B., Weiner J.P., “Electronic Health Recordsand the Reliability andvalidity of quality measures: a review of the literature”, Med Care Res Rev, 67: 503-527, (2010).
[32] Sullivan P., Goldmann D., “The promise of comparative effectiveness research”, JAMA, 305: 400-401, (2011).
[33] Fernandes L., O’Connor M., Weaver V., “Big data, bigger outcomes: Healthcare is embracing the big data movement, hoping to revolutionize HIM by distilling vast collection of data for specific analysis”, J Ahıma, 83: 38-43, (2012).
[34] Harper E.M., “The economic value of health care data”, Nurs Adm Q, 37: 105-108, (2013).
[35] Kulynych J. and Greely H.T., “Clinical genomics, big data, and electronic medical records: reconciling patient rights with research when privacy and science collide”, J Law Biosci, 4: 94-132, (2017).
[36] Kayaalp M., “Patient Privacy in the Era of Big Data”, Balkan Med J, 35: 8-17, (2018).

APA	Talan M, Canal M, Alcan V, ZINNUROGLU M, Akarkamçı(Kaya) H (2019). Karpal Tünel Sendromu Temelli Elektronik Sağlık Kayıt Sisteminin Geliştirilmesi. , 847 - 853.
Chicago	Talan Mehmet İbrahim,Canal Mehmet Rahmi,Alcan Veysel,ZINNUROGLU MURAT,Akarkamçı(Kaya) Hilal Karpal Tünel Sendromu Temelli Elektronik Sağlık Kayıt Sisteminin Geliştirilmesi. (2019): 847 - 853.
MLA	Talan Mehmet İbrahim,Canal Mehmet Rahmi,Alcan Veysel,ZINNUROGLU MURAT,Akarkamçı(Kaya) Hilal Karpal Tünel Sendromu Temelli Elektronik Sağlık Kayıt Sisteminin Geliştirilmesi. , 2019, ss.847 - 853.
AMA	Talan M,Canal M,Alcan V,ZINNUROGLU M,Akarkamçı(Kaya) H Karpal Tünel Sendromu Temelli Elektronik Sağlık Kayıt Sisteminin Geliştirilmesi. . 2019; 847 - 853.
Vancouver	Talan M,Canal M,Alcan V,ZINNUROGLU M,Akarkamçı(Kaya) H Karpal Tünel Sendromu Temelli Elektronik Sağlık Kayıt Sisteminin Geliştirilmesi. . 2019; 847 - 853.
IEEE	Talan M,Canal M,Alcan V,ZINNUROGLU M,Akarkamçı(Kaya) H "Karpal Tünel Sendromu Temelli Elektronik Sağlık Kayıt Sisteminin Geliştirilmesi." , ss.847 - 853, 2019.
ISNAD	Talan, Mehmet İbrahim vd. "Karpal Tünel Sendromu Temelli Elektronik Sağlık Kayıt Sisteminin Geliştirilmesi". (2019), 847-853.

APA	Talan M, Canal M, Alcan V, ZINNUROGLU M, Akarkamçı(Kaya) H (2019). Karpal Tünel Sendromu Temelli Elektronik Sağlık Kayıt Sisteminin Geliştirilmesi. Politeknik Dergisi, 22(4), 847 - 853.
Chicago	Talan Mehmet İbrahim,Canal Mehmet Rahmi,Alcan Veysel,ZINNUROGLU MURAT,Akarkamçı(Kaya) Hilal Karpal Tünel Sendromu Temelli Elektronik Sağlık Kayıt Sisteminin Geliştirilmesi. Politeknik Dergisi 22, no.4 (2019): 847 - 853.
MLA	Talan Mehmet İbrahim,Canal Mehmet Rahmi,Alcan Veysel,ZINNUROGLU MURAT,Akarkamçı(Kaya) Hilal Karpal Tünel Sendromu Temelli Elektronik Sağlık Kayıt Sisteminin Geliştirilmesi. Politeknik Dergisi, vol.22, no.4, 2019, ss.847 - 853.
AMA	Talan M,Canal M,Alcan V,ZINNUROGLU M,Akarkamçı(Kaya) H Karpal Tünel Sendromu Temelli Elektronik Sağlık Kayıt Sisteminin Geliştirilmesi. Politeknik Dergisi. 2019; 22(4): 847 - 853.
Vancouver	Talan M,Canal M,Alcan V,ZINNUROGLU M,Akarkamçı(Kaya) H Karpal Tünel Sendromu Temelli Elektronik Sağlık Kayıt Sisteminin Geliştirilmesi. Politeknik Dergisi. 2019; 22(4): 847 - 853.
IEEE	Talan M,Canal M,Alcan V,ZINNUROGLU M,Akarkamçı(Kaya) H "Karpal Tünel Sendromu Temelli Elektronik Sağlık Kayıt Sisteminin Geliştirilmesi." Politeknik Dergisi, 22, ss.847 - 853, 2019.
ISNAD	Talan, Mehmet İbrahim vd. "Karpal Tünel Sendromu Temelli Elektronik Sağlık Kayıt Sisteminin Geliştirilmesi". Politeknik Dergisi 22/4 (2019), 847-853.