Farklı klinik örneklerden izole edilen çoğul dirençli Acinetobacter baumannii izolatlarında tigesiklin, kolistin direncinin disk difüzyon, E-test ve otomatize sistem yöntemleri ile karşılaştırılması

Kaya, Esra; ORHAN, Zarife; koparal, murat yavuz; PAKÖZ, Nuriye İsmihan Ece; KAYIŞ, ARZU

doi:10.5505/TurkHijyen.2018.13334

Farklı klinik örneklerden izole edilen çoğul dirençli Acinetobacter baumannii izolatlarında tigesiklin, kolistin direncinin disk difüzyon, E-test ve otomatize sistem yöntemleri ile karşılaştırılması

Nuriye İsmihan Ece PAKÖZ, (Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Kahramanmaraş, Türkiye)

Esra KAYA, (Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı, Kahramanmaraş, Türkiye)

Zarife ORHAN, (Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi, Sağlık Hizmetleri Meslek Yüksekokulu, Kahramanmaraş, Türkiye)

Arzu KAYIŞ, (Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi, Sağlık Hizmetleri Meslek Yüksekokulu, Kahramanmaraş, Türkiye)

Murat Yavuz Koparal (Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı, Kahramanmaraş, Türkiye)

Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi

2 0

Yıl: 2018 Cilt: 75 Sayı: 2 Sayfa Aralığı: 109 - 116 Metin Dili: Türkçe DOI: 10.5505/TurkHijyen.2018.13334 İndeks Tarihi: 20-07-2020

Farklı klinik örneklerden izole edilen çoğul dirençli Acinetobacter baumannii izolatlarında tigesiklin, kolistin direncinin disk difüzyon, E-test ve otomatize sistem yöntemleri ile karşılaştırılması

Öz:

Amaç: Acinetobacter türleri doğada yaygınolarak bulunan Gram negatif kokobasillerdir. Hastaneenfeksiyonlarına ve toplumsal kaynaklı enfeksiyonlarayol açabilen bu bakterinin tedavisinde kullanılanantibiyotik seçeneklerinin giderek azalması endişeyaratmaktadır. Son yıllarda özellikle yoğun bakımüniteleri başta olmak üzere hastane enfeksiyonlarındaen sık izole edilen etkenlerin başında A. baumanniisuşları gelmektedir. Çoğul antimikrobiyal direnç,polimiksinler gibi eski ve tigesiklin gibi yeniantibiyotiklerin araştırılıp geliştirilmesini zorunlukılmıştır. Gram negatif bakterilerde gelişen çoğul dirençfenotipleri nedeniyle polipeptit yapılı bir antibiyotikolan kolistinin (polimiksin E) önemi tekrar artmayabaşlamıştır. Ancak, ülkemizde çoğul dirençli suşlarakarşı bu antibiyotiğin etkinliğini bildiren çalışma sayısıoldukça kısıtlıdır. Tigesiklin, A. baumannii’nin de içindebulunduğu dirençli Gram negatif bakterilerin nedenolduğu enfeksiyonların tedavisinde ümit veren yeni,yarı sentetik bir tetrasiklindir.Yöntem: Çalışmamız, Şubat 2011 - Şubat 2012tarihleri arasında Kahramanmaraş Üniversitesi TıpFakültesi Hastanesi Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarınaçeşitli kliniklerden gönderilen farklı örneklerdensoyutlanan 100 adet çoğul dirençli A. baumannii izolatıile yapılmıştır. Bakterilerin tanımlanması konvansiyonelmikrobiyolojik yöntemler ve tam otomatik bakteritanımlama sistemi Vitek-2 (bioMérieux, Fransa)kullanılarak yapılmıştır. Çoğul dirençli olduğu saptanan100 A. baumannii suşunun kolistin ve tigesikline karşıduyarlılıkları Vitek-2 (bioMérieux Fransa), disk difüzyonve E-test yöntemleriyle test edilmiştir.Bulgular: Sonuç olarak disk difüzyon yöntemi iletest edilen çoğul dirençli suşların %88’i kolistine, %84’ütigesikline duyarlı bulunmuştur. Vitek-2 (bioMérieuxFransa) yöntemi ile test edilen çoğul dirençli suşlarınise %100’ü kolistine, %92’si ise tigesikline duyarlıbulunurken; E-test yöntemi ile tigesiklin ve kolistine%100 duyarlılık tespit edilmiştir.Sonuç: Disk difüzyon, E test ve otomatizesistem yöntemlerinin birbirleri ile uyumunukarşılaştırdığımızda; E test ve otomatize sistemsonuçlarının disk difüzyona göre daha uyumlu olduğugözlenmiştir. Kolistin ve tigesiklinin A. baumannii’yekarşı etkinliği oldukça yüksek bulunmuştur.

Anahtar Kelime:

Comparison of disc diffusion, E-test and automated system methods for the determination of resistance to tigecycline and colistin by multiple resistant Acinetobacter baumannii isolates which isolated from different samples

Öz:

Objective: Acinetobacter ssp., Gram negative cocobacilli, are widely found in nature. The decrease in treatment options against this organism which can lead nosocomial and community-acquired infections is a concern. In recent years, A. baumannii strains are among the most frequently isolated organisms in hospital infections, especially intensive care units. Multiple antimicrobial resistance has forced to be explored and improved antibiotics such as tigecycline and polymyxins (antibiotics such as tigecylines (new) and polymyxins (old)). Due to the multiple resistance phenotypes that developed in Gram negative bacteria, the importance of colistin (polymyxin E), an antibiotic with a polypeptide structure, has begun to increase. However, the number of studies reporting the efficacy of this antibiotic against multiple-resistant strains is rather limited in our country. Tigecycline is a new, semisynthetic tetracycline that promises to treat infections caused by resistant Gram negative bacteria, including A. baumannii. Methods: Our study was carried out with 100 multiple-resistant A. baumannii strains isolatedfrom different samples sent from different clinics to Kahramanmaraş University, Medical Faculty Hospital, Medical Microbiology Laboratory between February 2011 and February 2012. Identification of the bacteria was carried out using conventional microbiological methods and a fully automated bacterial identification system Vitek 2 (bioMérieux, France). Sensitivities of 100 multidrug resistant A. baumannii strains to colistin and tigecycline were tested by Vitek 2 (bioMeriéux, France), disc diffusion and E-test methods. Results: As a result, 88% of the multiple-resistant strains tested by disk diffusion method were found to be sensitive to colistin and 84% to tigecycline. While 100% of the multi-resistant strains tested by Vitek 2 (bioMérieux, France) were found to be sensitive to colistin and 92% to tigecycline; 100% sensitivity to tigecycline and colistin was detected by E-test method. Conclusion: When we compared the compatibility of disc diffusion, E-test and automated system methods with each other, E-test and automated system results were observed to be more compatible than disc diffusion method. The effectiveness of colistin and tigecycline against A. baumannii was found to be quite effective.

Anahtar Kelime:

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık

1. Özgür Akın FE. Çoğul dirençli A. baumannii izolatlarında kolistin, polimiksin B ve tigesiklin direncinin E-test, disk difüzyon ve buyyon mikrodilüsyon yöntemleri ile karşılaştırması. Uzmanlık Tezi, Gaziantep Üniversitesi Tıp Fakültesi, 2009.
2. Schreckenberger PC, Von Graevenitz A. Acinetobacter, Achromobacter, Alcaligenes. In: Baron EJ, Pfaller MA, Tenover FC, Yolken RH, eds. Manual of Clinical Microbiology. Washington DC. ASM Pres, 2000: 749-60.
3. Garrity GM, Bell JA, Lilburn TG. Taxonomic Outline of The Procaryotes. Begery’s Manual of Systematic Bacteriology. 2nd ed. New York: Springer-Verlag, 2004.
4. Munoz-Price L, Weinstein R. Acinetobacter infection. N Engl J Med, 2008: 358:1271-81. doi: 10.1056/NEJMra070741.
5. Speller DCE, Humphreys H. Hospital-acquired infection. In: Collier L, Balows A, Sussman M, eds. Microbiology and Microbial Infections. London: Arnold, 1998: 187–229.
6. Demirtürk N, Demirdal T. Antibiyotiklerde direnç sorunu. Kocatepe Tıp Derg, 2004: 5(2):17-21.
7. Falagas ME, Koletsi PK, Bliziotis IA. The diversity of definitions of multidrug-resistant (MDR) and pandrug-resistant (PDR) Acinetobacter baumannii and Pseudomonas aeruginosa. J Med Microbiol, 2006; 55:1619-29.
8. Kwon KT, Oh WS, Song JH, Chang HH, Jung SI, Kim SW, et al. Impact of imipenem resistance on mortality in patients with Acinetobacter bacteraemia. J Antimicrob Chemother, 2007: 59(3):525- 30.
9. Hsueh PR, Teng LJ, Chen CY, Chen WH, Yu CJ, Ho SW, et al. Pandrug-resistant Acinetobacter baumannii causing nosocomial infections in a university hospital, Taiwan. Emer Infec Dis, 2002; 8(8):827-32.
10. Anonymous. Performance Standards for Antimicrobial Susceptibility Testing; Twenty-First Informational Supplemen. M100-S21. Vol. 31. No 5. Wayne, Pa: Clinical and Laboratory Standards Institute, 2011.
11. Murray PR, Rosenthal KS, Pfaller MA. Tıbbi Mikrobiyoloji. Başustaoğlu AÇ, ed. Ankara: Atlas Kitapçılık, 2010; 199-210.
12. Bergogne-Berezin E, Towner KJ. Acinetobacter spp. as nosocomial pathogens: microbiological, clinical, and epidemiological features. Clin Microbiol Rev, 1996; 9(2):148-65.
13. Towner K. The genus Acinetobacter. Prokaryotes, 2006; 6:746-58.
14. Güzel Kurtoğlu M, Opuş A, Kaya M, Keşli R, Güzelanat A, Yüksekkaya Ş. Bir eğitim ve araştırma hastanesindeki klinik örneklerden izole edilen Acinetobacter baumannii suşlarında antibakteriyel direnç (2008-2010). ANKEM, 2011; 25(1):35-41.
15. Sesli Çetin E, Tetik T, Kaya S, Cicioğlu- Arıdoğan B. Polimiksin B’nin imipeneme dirençli Acinetobacter baumannii suşlarına karşı in-vitro aktivitesi. ANKEM, 2011; 25(2):94-8.
16. Çalışkan A. Acinetobacterlerde direnç ve klonal ilişkinin araştırılması. Uzmanlık tezi. İnönü Üniversitesi Tıp Fakültesi. 2008.
17. Villers D1, Espaze E, Coste-Burel M, Giauffret F, Ninin E, Nicolas F, et al. Nosocomial Acinetobacter baumannii infections: microbiological and clinical epidemiology, Ann Intern Med, 1998; 129(3):182-9.
18. Balcı M, Bitirgen M, Kandemir B, Türk Arıbaş, E, Erayman İ. Nozokomiyal A. baumannii suşlarının antibiyotik duyarlılığı. ANKEM, 2010; 24(1): 28-33.
19. Arıkan Akan Ö, Uysal S. Çoklu dirençli Acinetobacter baumannii ve karbapenem dirençli Klebsiella pneumoniae izolatlarında tigesiklinin in vitro etkinlik durumu. Mikrobiyoloji Bül, 2008; 2: 209-15.
20. Richet H, Fournier PE. Nosocomial Infections caused by Acinetobacter baumannii: a major threat worldwide. Infect Control Hosp Epidemiol, 2006; 27:759-61.
21. Navon Venezia S, Ben Ami R, Carmeli Y. Update on Pseudomonas aeruginosa and Acinetobacter baumannii infections in the healthcare setting. Curr Opin Infect Dis, 2005; 8:306-13.
22. Akıncı E, Mumcuoğlu İ, Öngörü P, Bayazıt FN, Ersoy S, Erbay A, et al. In vitro activity of tigecycline against Acinetobacter baumannii strains isolated from nosocomial infections. Turk J Med Sci, 2008; 38(6):583-6.

APA	PAKÖZ N, Kaya E, ORHAN Z, KAYIŞ A, koparal m (2018). Farklı klinik örneklerden izole edilen çoğul dirençli Acinetobacter baumannii izolatlarında tigesiklin, kolistin direncinin disk difüzyon, E-test ve otomatize sistem yöntemleri ile karşılaştırılması. , 109 - 116. 10.5505/TurkHijyen.2018.13334
Chicago	PAKÖZ Nuriye İsmihan Ece,Kaya Esra,ORHAN Zarife,KAYIŞ ARZU,koparal murat yavuz Farklı klinik örneklerden izole edilen çoğul dirençli Acinetobacter baumannii izolatlarında tigesiklin, kolistin direncinin disk difüzyon, E-test ve otomatize sistem yöntemleri ile karşılaştırılması. (2018): 109 - 116. 10.5505/TurkHijyen.2018.13334
MLA	PAKÖZ Nuriye İsmihan Ece,Kaya Esra,ORHAN Zarife,KAYIŞ ARZU,koparal murat yavuz Farklı klinik örneklerden izole edilen çoğul dirençli Acinetobacter baumannii izolatlarında tigesiklin, kolistin direncinin disk difüzyon, E-test ve otomatize sistem yöntemleri ile karşılaştırılması. , 2018, ss.109 - 116. 10.5505/TurkHijyen.2018.13334
AMA	PAKÖZ N,Kaya E,ORHAN Z,KAYIŞ A,koparal m Farklı klinik örneklerden izole edilen çoğul dirençli Acinetobacter baumannii izolatlarında tigesiklin, kolistin direncinin disk difüzyon, E-test ve otomatize sistem yöntemleri ile karşılaştırılması. . 2018; 109 - 116. 10.5505/TurkHijyen.2018.13334
Vancouver	PAKÖZ N,Kaya E,ORHAN Z,KAYIŞ A,koparal m Farklı klinik örneklerden izole edilen çoğul dirençli Acinetobacter baumannii izolatlarında tigesiklin, kolistin direncinin disk difüzyon, E-test ve otomatize sistem yöntemleri ile karşılaştırılması. . 2018; 109 - 116. 10.5505/TurkHijyen.2018.13334
IEEE	PAKÖZ N,Kaya E,ORHAN Z,KAYIŞ A,koparal m "Farklı klinik örneklerden izole edilen çoğul dirençli Acinetobacter baumannii izolatlarında tigesiklin, kolistin direncinin disk difüzyon, E-test ve otomatize sistem yöntemleri ile karşılaştırılması." , ss.109 - 116, 2018. 10.5505/TurkHijyen.2018.13334
ISNAD	PAKÖZ, Nuriye İsmihan Ece vd. "Farklı klinik örneklerden izole edilen çoğul dirençli Acinetobacter baumannii izolatlarında tigesiklin, kolistin direncinin disk difüzyon, E-test ve otomatize sistem yöntemleri ile karşılaştırılması". (2018), 109-116. https://doi.org/10.5505/TurkHijyen.2018.13334

APA	PAKÖZ N, Kaya E, ORHAN Z, KAYIŞ A, koparal m (2018). Farklı klinik örneklerden izole edilen çoğul dirençli Acinetobacter baumannii izolatlarında tigesiklin, kolistin direncinin disk difüzyon, E-test ve otomatize sistem yöntemleri ile karşılaştırılması. Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi, 75(2), 109 - 116. 10.5505/TurkHijyen.2018.13334
Chicago	PAKÖZ Nuriye İsmihan Ece,Kaya Esra,ORHAN Zarife,KAYIŞ ARZU,koparal murat yavuz Farklı klinik örneklerden izole edilen çoğul dirençli Acinetobacter baumannii izolatlarında tigesiklin, kolistin direncinin disk difüzyon, E-test ve otomatize sistem yöntemleri ile karşılaştırılması. Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi 75, no.2 (2018): 109 - 116. 10.5505/TurkHijyen.2018.13334
MLA	PAKÖZ Nuriye İsmihan Ece,Kaya Esra,ORHAN Zarife,KAYIŞ ARZU,koparal murat yavuz Farklı klinik örneklerden izole edilen çoğul dirençli Acinetobacter baumannii izolatlarında tigesiklin, kolistin direncinin disk difüzyon, E-test ve otomatize sistem yöntemleri ile karşılaştırılması. Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi, vol.75, no.2, 2018, ss.109 - 116. 10.5505/TurkHijyen.2018.13334
AMA	PAKÖZ N,Kaya E,ORHAN Z,KAYIŞ A,koparal m Farklı klinik örneklerden izole edilen çoğul dirençli Acinetobacter baumannii izolatlarında tigesiklin, kolistin direncinin disk difüzyon, E-test ve otomatize sistem yöntemleri ile karşılaştırılması. Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi. 2018; 75(2): 109 - 116. 10.5505/TurkHijyen.2018.13334
Vancouver	PAKÖZ N,Kaya E,ORHAN Z,KAYIŞ A,koparal m Farklı klinik örneklerden izole edilen çoğul dirençli Acinetobacter baumannii izolatlarında tigesiklin, kolistin direncinin disk difüzyon, E-test ve otomatize sistem yöntemleri ile karşılaştırılması. Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi. 2018; 75(2): 109 - 116. 10.5505/TurkHijyen.2018.13334
IEEE	PAKÖZ N,Kaya E,ORHAN Z,KAYIŞ A,koparal m "Farklı klinik örneklerden izole edilen çoğul dirençli Acinetobacter baumannii izolatlarında tigesiklin, kolistin direncinin disk difüzyon, E-test ve otomatize sistem yöntemleri ile karşılaştırılması." Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi, 75, ss.109 - 116, 2018. 10.5505/TurkHijyen.2018.13334
ISNAD	PAKÖZ, Nuriye İsmihan Ece vd. "Farklı klinik örneklerden izole edilen çoğul dirençli Acinetobacter baumannii izolatlarında tigesiklin, kolistin direncinin disk difüzyon, E-test ve otomatize sistem yöntemleri ile karşılaştırılması". Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi 75/2 (2018), 109-116. https://doi.org/10.5505/TurkHijyen.2018.13334