İdrar Kültüründen İzole Edilen Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae Suşlarının Antibiyotik Direnç Oranları: Dört Yıllık Analiz

ÇEKEN, Nihan; duran, hülya; ATİK, tkulaatik

İdrar Kültüründen İzole Edilen Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae Suşlarının Antibiyotik Direnç Oranları: Dört Yıllık Analiz

Hülya DURAN, (Balıkesir Devlet Hastanesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarı Balıkesir, Türkiye)

Nihan ÇEÇEN, (Balıkesir Devlet Hastanesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarı Balıkesir, Türkiye)

Tuğba KULA ATİK (Balıkesir Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı Balıkesir, Türkiye)

ANKEM Dergisi

173 10

Yıl: 2020 Cilt: 34 Sayı: 2 Sayfa Aralığı: 41 - 47 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 24-10-2020

İdrar Kültüründen İzole Edilen Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae Suşlarının Antibiyotik Direnç Oranları: Dört Yıllık Analiz

Öz:

Üriner sistem enfeksiyonları (ÜSE) her yaş grubunda en sık görülen enfeksiyonlardandır. ÜSE’deen sık izole edilen etken Escherichia coli’dir. Gram negatif bakteriler arasında Klebsiella pneumoniaeE.coli’den sonra en sık izole edilen ikinci patojendir. Tedavi genellikle ampirik başlanmaktadır.Bu çalışmada idrar kültürlerinden izole edilen E.coli ve K.pneumoniae türlerininantimikrobiyal direnç oranlarının araştırılması ve ampirik antibiyotik seçimine yol gösterilmesiamaçlanmıştır.2016-2019 yılları arasında, ayaktan ve yatan hastalardan Balıkesir Devlet Hastanesi (400yataklı) mikrobiyoloji laboratuvarına gönderilen idrar örnekleri analiz edilmiş, E.coli veK.pneumoniae suşları çalışmaya dahil edilmiştir. Antibiyotik direnç durumları retrospektif olarakincelenmiştir. Bakteri tanımlaması ve antibiyotik duyarlılık testleri konvansiyonel yöntemlerve otomatize sistemler kullanılarak yapılmıştır.Çalışma süresinde 18.888 idrar örneği değerlendirilmiş ve 5.547’sinde (% 29,4) üreme raporlanmıştır.İdrar kültürlerinden en sık izole edilen mikroorganizmalar E.coli (% 55,6) ve K.pneumoniae(% 14,2) olarak tespit edilmiştir. İzole edilen E.coli suşlarının en dirençli olduğu antibiyotikampisilin (% 64,7), K.pneumoniae’nın ise amoksisilin-klavulanat (% 64,7) olarak saptanmıştır.Direnç oranları E.coli ve K.pneumoniae türlerinde sırasıyla şu şekildedir: siprofloksasin % 42,9ve % 58,5, trimetoprim/sülfometoksazol % 42,6 ve % 53,3, seftriakson % 38,5 ve % 57,2. E.colisuşlarında amoksisilin-klavulanata % 42,3, nitrofurantoine % 7,6 direnç saptanmıştır. İzolatlarınen duyarlı olduğu antibiyotiklerin karbapenemler ve amikasin olduğu bulunmuştur. Ayrıcadirenç oranlarının yıldan yıla değiştiği gözlenmiştir.Antibiyotik direncinin artması ÜSE’lerin tedavisini zorlaştırmaktadır. Yapılan çalışmalar, bölgeselolarak antimikrobiyal ajanlara direnç profilini görmek ve ampirik tedaviye karar vermek içinyararlı olacaktır.

Anahtar Kelime:

Antibiotic Resistance Rates of Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae Strains Isolated from Urine Culture: A Four-Year Analysis

Öz:

Urinary system infections (UTIs) are among the most common infections in all age groups. Escherichia coli is the most frequently isolated microorganism in UTI. Among Gram negative bacteria, Klebsiella pneumoniae is the second most common pathogen isolated after E.coli. Treatment is generally started empirically. The aim of this study was to investigate the antimicrobial resistance rates of E.coli and K.pneumoniae species isolated urine cultures and to guide empirical antibiotic selection. Urine samples from outpatients and hospitalized patients that were submitted of the microbiology laboratory of Balıkesir State Hospital (400 beds) between 2016 and 2019 years, were analyzed, E.coli and K.pneumoniae strains were included in this study. Antibiotic resistance was analyzed retrospectively. Bacterial identification and antibiotic susceptibility tests were performed using conventional methods and automated systems. During the study period, 18,888 urine samples were evaluated and growth was reported in 5,547 (29.4 %). The most common isolated microorganisms from urine cultures was E.coli (55.6 %), and K.pneumoniae (14.2 %). E.coli strains showed the highest resistance to ampicillin (64.7 %) and K.pneumoniae showed the highest resistance to amoxicillin-clavulanate (64.7 %). Resistance rates in E.coli and K.pneumoniae, respectively, were as follows: ciprofloxacin 42.9 % and 58,5 %, trimethoprim/sulphametoxazole 42.6 % and 53.3 %, ceftriaxone 38,5 % and 57.2 %. E.coli strains showed resistance to amoxicillin-clavulanate (42.3 %) and nitrofurantoin (7.6 %). The most effective antibiotics for all isolates were carbapenems and amikacin. Also, the resistance rates changed year by year. Urinary tract infections are becoming difficult to treat because antibiotic resistance rates are increasing. The data generated will be useful to decide empiric therapy on the local epidemiological resistance profile of the antimicrobial agents.

Anahtar Kelime:

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık

1. Aktar GS, Ayaydın Z, Onur AR, Vural DG, Temiz H. Resistance rates against various antimicrobials in Escherichia coli strains isolated from urine samples. Kocaeli Med J. 2018;7(1):8-13.
2. Alpay Y, Yavuz MT, Aslan T, Büyükzengin B. Genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz pozitif Escherichia coli ile oluşan komplike olmayan üriner sistem infeksiyonlarının tedavisinde oral antibiyotikler karbapenemlere alternatif olabilir mi? ANKEM Derg. 2017;31(3):85-91. https://doi.org/10.5222/ankem.2017.085
3. Asena M. Bir araştırma hastanesinde kan ve idrar kültür sonuçlarının değerlendirilmesi. Dicle Tıp Derg. 2020;47(1):208-15. https://doi.org/10.5798/dicletip.706140
4. Aşgın N, Eroğlu S, Çakmaklıoğulları EK. Gebelikte üriner sistem infeksiyonlarının ampirik tedavisinde hangi antibiyotikler ilk seçenek olmalıdır? ANKEM Derg. 2018;32(3):94-102. https://doi.org/10.5222/ankem.2018.1820
5. Carlsen S, Krall SP, Xu KT, Tomanec A, Farias D, Richman P. Sensitivity of urinary pathogens for patients discharged from the emergency department compared with the hospital antibiogram. BMC Emergency Medicine. 2019;19:50. https://doi.org/10.1186/s12873-019-0264-z
6. Cordoba G, Holm A, Hansen F, Hammerum AM, Bjerrum L. Prevalence of antimicrobial resistant Escherichia coli from patients with suspected urinary tract infection in primary care, Denmark. BMC Infectious Diseases. 2017;17:670 https://doi.org/10.1186/s12879-017-2785-y
7. Demirel A. Özel bir hastanede gram-negatif bakteri izolatlarında antibiyotik direncinin değerlendirilmesi. Bakırköy Tıp Derg. 2019;15(3):292-8. https://doi.org/10.4274/BTDMJB.galenos.2019. 20190418092629
8. Denk A, Tartar AS. İdrar kültürlerinden izole edilen toplum kökenli Escherichia coli suşlarında antibiyotik direnci. FÜ Sağ Bil Tıp Derg. 2015;29(2):51-5. http://www.fusabil.org
9. Esmaili K, Mohebi R, Sadeghifard N, et al. What about urinary tract infections and its antibiotic resistance bacteria in Ilam, Iran?, Infect Disord Drug Targets. 2018;18(3):214-7. https://doi.org/10.2174/1871526518666180622162229
10. European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing. Breakpoint tables for interpretation of MICs and zone diameters Version 9.0, http://www.eucast. org /fileadmin/src/media/PDFs/EUCAST_files/ Breakpoint_tables/v_9.0_Breakpoint_Tables.pdf. (erişim tarihi: 24.04.2020)
11. Jadoon SA , Ahmed A, Irshad R. Spectrum of bacterial culture and drug sensitivityvs resistance in uncomplicated urinary tract infectıon. J Ayub Med Coll Abbottabad. 2018;30(3):432-8. http://www.jamc.ayubmed.edu.pk
12. Karabay O, Baştuğ A, Öztürk R, ve ark. Antibiyotik tüketimi, direnç verileri ve önlem stratejileri. Mediterr J Infect Microb Antimicrob 2018;7(35):1-39. http://dx.doi.org/10.4274/mjima.2018.35
13. Karamanlıoğlu D, Yıldız PA, Kaya M, Sarı N. İdrar kültürlerinden izole edilen enterik bakterilerde genişlemiş spektrumlu β-laktamaz oluşturma sıklığı ve antibiyotik duyarlılıkları. Klimik Derg. 2019;32(3):233-9. https://doi.org/10.5152/kd.2019.68
14. Klinik örnekten sonuç raporuna uygulama rehberi, üriner sistem örnekleri, s.21, KLİMUD, Ankara (2015).
15. Kömürlüoğlu A, Aykaç K, Özsürekçi Y, ve ark. Gram negatif idrar yolu enfeksiyonu etkenlerinin antibiyotik direnç dağılımı: tek merkez deneyimi. Türkiye Çocuk Hast Derg. 2018;12(1):10-7. https://doi.org/10.12956/tjpd.2017.279
16. Kuru C, Çakmaklıoğulları EK. Karabük ili ve çevresinde idrar kültürlerinden izole edilen Escherichia coli suşlarının antibiyotik duyarlılıkları. Online Türk Sağlık Bilimleri Derg. 2020;5(1):17-24. https://doi.org/10.26453/otjhs.53037
17. Mert D, Çeken S, Ertek M. İdrar yolu enfeksiyonlarında kültürden izole edilen bakteriler ve antibiyotik duyarlılıkları. Turk Hij Den Biyol Derg, 2020;77(1):25-32. https://doi.org/10.5505/TurkHijyen.2019.57984
18. Soydan S, Karadağ G, Çalışkan E, Kale E. Üriner sistem enfeksiyonlarından izole edilen Escherichia coli kökenlerinde fosfomisin, nitrofurantoin ve siprofloksasin duyarlılığının in vitro olarak değerlendirilmesi. Mediterr J Infect Microb Antimicrob. 2015;4:3. http://www.10.4274/mjima.2015.3
19. Temoçin F, Köse H. Poliklinik hastalarının idrar kültürlerinden izole edilen Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae suşlarının genişlemiş spektrumlu betalaktamaz üretim oranları ve antibiyotik duyarlılıklarının değerlendirilmesi. ANKEM Derg. 2018;32(3):79- 86. https://doi.org/10.5222/ankem.2018.1811
20. Tosun Aİ, Demirci M, Yılmaz M, ve ark. İdrar yolu infeksiyonlarindan izole edilen Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae suşlarının antimikrobiyal direnç oranları. ANKEM Derg. 2016;30(1):1-6. https://doi.org/10.5222/ankem.2016.001
21. Tulara NK. Nitrofurantoin and fosfomycin for extended spectrum beta-lactamases producing Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae. J Glob Infect Dis. 2018;10(1):19-21. https://doi.org/10.4103/jgid.jgid_72_17
22. Uslu M, Bağcıoğlu M, Tekdoğan ÜY, Kocaaslan R, Çeçen K. Kars bölgesindeki idrar yolu enfeksiyonlarının epidemiyolojisi ve antibiyotik dirençleri. Kafkas J Med Sci. 2019;9(2):90-6. https://doi.org/10.5505/kjms.2019.26937
23. Yıldız SS, Kaşkatepe B, Avcıküçük H, Şanal L, Erdem G, Çöplü N. Escherichia coli idrar izolatlarında sıvı mikrodilüsyon yöntemi ile fosfomisin duyarlılığının belirlenmesi ve üriner sistem enfeksiyonlarında sık kullanılan diğer antibiyotiklerle karşılaştırılması. Türk Hij Den Biyol Derg. 2018;75(1):29-36. https://doi.org/10.5505/TurkHijyen.2018.87094

APA	duran h, ÇEKEN N, ATİK t (2020). İdrar Kültüründen İzole Edilen Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae Suşlarının Antibiyotik Direnç Oranları: Dört Yıllık Analiz. , 41 - 47.
Chicago	duran hülya,ÇEKEN Nihan,ATİK tkulaatik İdrar Kültüründen İzole Edilen Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae Suşlarının Antibiyotik Direnç Oranları: Dört Yıllık Analiz. (2020): 41 - 47.
MLA	duran hülya,ÇEKEN Nihan,ATİK tkulaatik İdrar Kültüründen İzole Edilen Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae Suşlarının Antibiyotik Direnç Oranları: Dört Yıllık Analiz. , 2020, ss.41 - 47.
AMA	duran h,ÇEKEN N,ATİK t İdrar Kültüründen İzole Edilen Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae Suşlarının Antibiyotik Direnç Oranları: Dört Yıllık Analiz. . 2020; 41 - 47.
Vancouver	duran h,ÇEKEN N,ATİK t İdrar Kültüründen İzole Edilen Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae Suşlarının Antibiyotik Direnç Oranları: Dört Yıllık Analiz. . 2020; 41 - 47.
IEEE	duran h,ÇEKEN N,ATİK t "İdrar Kültüründen İzole Edilen Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae Suşlarının Antibiyotik Direnç Oranları: Dört Yıllık Analiz." , ss.41 - 47, 2020.
ISNAD	duran, hülya vd. "İdrar Kültüründen İzole Edilen Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae Suşlarının Antibiyotik Direnç Oranları: Dört Yıllık Analiz". (2020), 41-47.

APA	duran h, ÇEKEN N, ATİK t (2020). İdrar Kültüründen İzole Edilen Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae Suşlarının Antibiyotik Direnç Oranları: Dört Yıllık Analiz. ANKEM Dergisi, 34(2), 41 - 47.
Chicago	duran hülya,ÇEKEN Nihan,ATİK tkulaatik İdrar Kültüründen İzole Edilen Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae Suşlarının Antibiyotik Direnç Oranları: Dört Yıllık Analiz. ANKEM Dergisi 34, no.2 (2020): 41 - 47.
MLA	duran hülya,ÇEKEN Nihan,ATİK tkulaatik İdrar Kültüründen İzole Edilen Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae Suşlarının Antibiyotik Direnç Oranları: Dört Yıllık Analiz. ANKEM Dergisi, vol.34, no.2, 2020, ss.41 - 47.
AMA	duran h,ÇEKEN N,ATİK t İdrar Kültüründen İzole Edilen Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae Suşlarının Antibiyotik Direnç Oranları: Dört Yıllık Analiz. ANKEM Dergisi. 2020; 34(2): 41 - 47.
Vancouver	duran h,ÇEKEN N,ATİK t İdrar Kültüründen İzole Edilen Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae Suşlarının Antibiyotik Direnç Oranları: Dört Yıllık Analiz. ANKEM Dergisi. 2020; 34(2): 41 - 47.
IEEE	duran h,ÇEKEN N,ATİK t "İdrar Kültüründen İzole Edilen Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae Suşlarının Antibiyotik Direnç Oranları: Dört Yıllık Analiz." ANKEM Dergisi, 34, ss.41 - 47, 2020.
ISNAD	duran, hülya vd. "İdrar Kültüründen İzole Edilen Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae Suşlarının Antibiyotik Direnç Oranları: Dört Yıllık Analiz". ANKEM Dergisi 34/2 (2020), 41-47.