Karbapeneme Dirençli Enterobacteriaceae İzolatlarının 2015-2018 Yılları Arasındaki Antibiyotik Direnci

Tanriverdi Çaycı, Yeliz; Bıyık, İlknur; çınar, canberk; BIRINCI, ASUMAN

doi:10.5222/TMCD.2020.134

Karbapeneme Dirençli Enterobacteriaceae İzolatlarının 2015-2018 Yılları Arasındaki Antibiyotik Direnci

Yeliz TANRIVERDİ ÇAYCI, (Girilmemişş)

İlknur BIYIK, (Girilmemişş)

Canberk ÇINAR, (Girilmemişş)

Asuman BİRİNCİ (Girilmemişş)

Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi

6 0

Yıl: 2020 Cilt: 50 Sayı: 3 Sayfa Aralığı: 134 - 140 Metin Dili: Türkçe DOI: 10.5222/TMCD.2020.134 İndeks Tarihi: 15-11-2020

Karbapeneme Dirençli Enterobacteriaceae İzolatlarının 2015-2018 Yılları Arasındaki Antibiyotik Direnci

Öz:

Amaç: Bu çalışma, Ondokuz Mayıs Üniversitesi Hastanesi Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarı’nagönderilen Enterobacteriaceae izolatları belirlenip, bu ajanlara karşı oldukça etkili olankarbapenemlere karşı oluşan 3 yıllık süre içindeki antibiyotik direnç değişimi bulmak amaçlanmıştır.Yöntem: Laboratuvara 2015-2018 yılları arasında gönderilmiş olan klinik örneklerden izoleedilmiş toplam 11.264 Enterobacteriaceae üyesi izole edilmiştir. Klinik örneklerin %5 koyunkanlı agar ve EMB agar besiyerlerine ekimi yapılmıştır. Bakteri türlerinin tanımlanmasındaVitek MS (BioMérieux, Fransa) ve bakterilerin antibiyotik duyarlılığının belirlenmesindeVitek2 (BioMérieux, Fransa) Compact otomatize sistemleri kullanılmıştır.Bulgular: Çalışmaya, 13 Haziran 2015 ve 13 Haziran 2018 yılları arasında gönderilmiş olanklinik örnekler retrospektif olarak değerlendirilerek elde ettiğimiz toplam 11.264Enterobacteriaceae üyesinden 518 (%4.59)’inin karbapenem dirençli izolat olduğu belirlenmiş ve yıllara göre dağılımı belirlenmiştir. 2015’te direnç oranı %4.62, 2018’de ise bu oran%5.79’dur. İzolatların gönderildiği kliniklere ve örnek türlerine göre dağılımına bakıldığında,en yüksek sıklığın %71.62 ile Dâhiliye Servisinde ve %52.32 ile idrar örneklerinde olduğubelirlenmiştir.Sonuç: Çalışmamızda, karbapenem direncinin en sık olarak Klebsiella türlerinde olduğusaptanmıştır. Karbapenem dirençli izolatlarda amikasin direncinin yüksek olduğu görülmüştür. Direnç durumunun hastanelerde aktif sürveyansla takip edilmesi uygun tedavi seçeneğinin belirlenmesi açısından önem göstermektedir

Anahtar Kelime:

Antimicrobial Resistance of Carbapenem-Resistant Enterobacteriaceae Isolates Between the Years of 2015-2018

Öz:

Objective: The aim of this study was to determine the changes in carbapenem resistance of Enterobacteriaceae isolated from the samples sent to Ondokuz Mayıs University Hospital Medical Microbiology Laboratory in a 3-year period. Method: A total of 11264 Enterobacteriaceae strains isolated from the clinical samples sent to the laboratory between 2015-2018 were assessed. Clinical specimens were grown on 5% sheep blood agar and EMB agar media. Vitek MS (BioMérieux, France) automated system was used for the identification of bacterial species and Vitek2 Compact (BioMérieux, France) automated system for the determination of antibiotic susceptibility of bacteria. Results: Growth of different clinical specimens sent between 13 June 2015 and 13 June 2018 were evaluated retrospectively. Of the 11264 Enterobacteriaceae isolates, 518 (4.59%) were found to be carbapenem resistant. It was determined that the frequency of resistance was 4.62% in 2015 and 5.79% in 2018. When the distribution of the isolates according to the clinics and sample types was examined, the highest rate was identified in the internal medicine department with 71.62% and in urine samples with 52.32%. Conclusion: In our study carbapenem resistance was mostly identified in Klebsiella species. Amikacin susceptibility was found to be higher in carbapenem- resistant isolates. It is important to monitor the resistance status with active surveillance in hospitals in order to determine the appropriate treatment option.

Anahtar Kelime:

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık

1. EUCAST uzman kuralları. [https://www.tmconline.org/ userfiles/file/EUCAST_Uzman_Kurallari_Surum_3_1. pdf] (Erişim tarihi: 01 Nisan 2018)
2. Nordmann P, Naas T, Poirel L. Global spread of carbapenemase-producing Enterobacteriaceae. Emerg Infect Dis. 2011;17(10):1791-8. https://doi.org/10.3201/eid1710.110655
3. Kılıç Ü, Demiray T, Altındiş M. Karbapenemaz üreten Enterobacteriaceace İzolatlarının saptanmasında fenotipik ve genotipik metotlar. Ankem Derg. 2016;30(2):62-75. https://doi.org/10.5222/ankem.2016.062
4. Levinson W. Tıbbi mikrobiyoloji ve immünoloji. Şener B, Esen B. (Çev.Editörleri). Güneş Kitabevi; 2018.
5. Gür D, Hascelik G, Aydin N, et al. Antimicrobial resistance in Gram-negative hospital isolates: results of the Turkish HITIT-2 Surveillance Study of 2007. J Chemother. 2009;21(4):383-9. https://doi.org/10.1179/joc.2009.21.4.383
6. Pfeifer Y, Cullik A, Witte W. Resistance to cephalosporins and carbapenems in Gram-negative bacterial pathogens. Int J Med Microbiol. 2010;300(6):371-9. https://doi.org/10.1016/j.ijmm.2010.04.005
7. Altınkanat Gelmez G, Söyletir G. Genişlemiş spektrumlu beta laktamaz üreten Enterobacteriaceae’larda mutant engelleme konsantrasyonunun saptanması. Experimed. 2018;8(1):1-6. https://doi.org/10.26650/experimed.2018.377256
8. Köseoğlu Eser Ö, Altun Uludağ H, Ergin A, Boral B, Şener B, Hasçelik G. İnvazif enfeksiyonlara neden olan GSBL pozitif Enterobacteriaceae izolatlarında karbapenem direnci. Mikrobiyol Bul. 2014;48(1):59- 69. https://doi.org/10.5578/mb.7181
9. Paterson DL. Resistance in Gram-negative bacteria: Enterobacteriaceae. Am J Infect Control. 2006; 34(5Suppl1):S64-73. https://doi.org/10.1016/j.ajic.2006.05.238
10. Falagas ME, Bliziotis IA, Kasiakou SK, Samonis G, Athanassopoulou P, Michalopoulos A. Outcome of infections due to pandrug-resistant (PDR) Gramnegative bacteria. BMC Infect Dis. 2005;5:24. https://doi.org/10.1186/1471-2334-5-24
11. Oteo J, Delgado-Iribarren A, Vega D, et al. Emergence of imipenem resistance in clinical Escherichia coli during therapy. Int J Antimicrob Agents. 2008;32(6): 534-7. https://doi.org/10.1016/j.ijantimicag.2008.06.012
12. Nordmann P, Dortet L, Poirel L. Carbapenem resistance in Enterobacteriaceae: here is the storm. Trends Mol Med. 2012;18(5):263-72. https://doi.org/10.1016/j.molmed.2012.03.003
13. Song W, Suh B, Choi JY, et al. In vivo selection of carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae by OmpK36 loss during meropenem treatment. Diagn Microbiol Infect Dis. 2009;65(4):447-9. https://doi.org/10.1016/j.diagmicrobio.2009.08.010
14. Michalopoulos A, Virtzili S, Rafailidis P, Chalevelakis G, Damala M, Falagas ME. Intravenous fosfomycin for the treatment of nosocomial infections caused by carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae in critically ill patients: a prospective evaluation. Clin Microbiol Infect. 2010;16(2):184-6. https://doi.org/10.1111/j.1469-0691.2009.02921.x
15. Pillai DR, Melano R, Rawte P, et al. Klebsiella pneumoniae carbapenemase, Canada. Emerg Infect Dis. 2009;15(5):827-9. https://doi.org/10.3201/eid1505.081536
16. Centers for Disease Control and Prevention (CDC). Vital signs: carbapenem-resistant Enterobacteriaceae. MMWR Morb Mortal Wkly Rep. 2013;62(9):165-70.
17. Morrill HJ, Pogue JM, Kaye KS, LaPlante KL. Treatment options for carbapenem-resistant Enterobacteriaceae infections. Open Forum Infect Dis. 2015;2:ofv050. https://doi.org/10.1093/ofid/ofv050
18. CDC. Antibiotic resistance threats in the United States, 2013. Centers for Disease Control and Prevention. http://www.cdc.gov/drugresistance/threat-report2013/pdf/ar-threats-2013-508.pdf [Erişim tarihi: 10 Nisan 2018]
19. Yamazhan T. Karbapenemazlar: Tedavi yaklaşımları. Ankem Derg. 2014;28(Ek 2):E77-80.
20. Kuzucu Ç, Yetkin F, Görgeç S, Ersoy Y. Genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz üreten Escherichia coli ve Klebsiella spp. suşlarının ertapenem ve diğer karbapenemlere karşı duyarlılıklarının araştırılması. Mikrobiyol Bul. 2011;45(1):28-35.
21. Jacoby GA, Munoz-Price LS. The new beta-lactamases. N Engl J Med. 2005;352(4):380-91. https://doi.org/10.1056/NEJMra041359
22. Poirel L, Heritier C, Tolun V, Nordmann P. Emergence of oxacillinase-mediated resistance to imipenem in Klebsiella pneumoniae. Antimicrob Agents Chemother. 2004;48(1):15-22. https://doi.org/10.1128/aac.48.1.15-22.2004
23. Carrer A, Poirel L, Eraksoy H, Cagatay AA, Badur S, Nordmann P. Spread of OXA-48-positive carbapenemresistant Klebsiella pneumoniae isolates in Istanbul, Turkey. Antimicrob Agents Chemother. 2008;52(8): 2950-4. https://doi.org/10.1128/AAC.01672-07
24. Gülmez D, Woodford N, Palepou MFI, et al. Carbapenem-resistant Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae isolates from Turkey with OXA-48-like carbapenemases and outermembrane protein loss. Int J Antimicrob Agents. 2008;31(6):523-6. https://doi.org/10.1016/j.ijantimicag.2008.01.017
25. Falagas ME, Tansarli GS, Karageorgopoulos DE, Vardakas KZ. Deaths attributable to carbapenem resistant Enterobacteriaceae infections. Emerg Infect Dis. 2014;20(7):1170-5 https://doi.org/10.3201/eid2007.121004
26. Nabarro LE, Veeraraghavan B. Combination therapy for carbapenem-resistant Enterobacteriaceae: increasing evidence, unanswered questions, potential solutions. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2015;34(12):2307-11. https://doi.org/10.1007/s10096-015-2486-7
27. Gupta N, Limbago BM, Patel JB, Kallen AJ. Carbapenemresistant Enterobacteriaceae: epidemiology and prevention. Clin Infect Dis. 2011;53(1):60-7. https://doi.org/10.1093/cid/cir202
28. Wiener-Well Y, Rudensky B, Yinnon AM, et al. Carriage rate of carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae in hospitalised patients during a national outbreak. J Hosp Infect. 2010;74(4):344-9. https://doi.org/10.1016/j.jhin.2009.07.022
29. Kaygusuz S, Apan TZ, Kılıç D. Toplum kökenli üriner sistem infeksiyonu etkeni Gram-negatif bakterilerde çeşitli antibiyotiklere direnç. Ankem Derg. 2001;15(4):753-759.
30. Kizirgil A, Yakupoğulları Y, Şenol FF, Aşçı Toraman Z. Kan kültürü örneklerinde genişlemiş spektrumlu betalaktamaz üreten enterik basillerin prevalansı ve antibiyotik duyarlılıklarının araştırılması. Infeks Derg. 2005;19(1):111-4.
31. Yetkin G, Kuzucu Ç, Çalışkan A, Ay S. Kan kültürlerinde üreyen Escherichia coli’lerin antibiyotik duyarlılıkları, GSBL oranları ve hastane birimlerine göre dağılımı. İnönü Üniv Tıp Fak Derg. 2006;13(3):147-50.
32. Castanheira M, Davis AP, Mendes RE, Serio AW, Krause KM, Flamm RK. In vitro activity of plazomicin against Gram-Negative and Gram-Positive isolates collected from United States hospitals and comparative activity of aminoglycosides against carbapenem-resistant Enterobacteriaceae and isolates carrying carbapenemase genes. Antimicrob Agents Chemother. 2018;62(8):00313-18. https://doi.org/10.1128/AAC.00313-18
33. Karakullukçu A, Borsa BA, Kuşkucu MA, ve ark. Karbapeneme dirençli enterik bakterilerde isepamisin, kloramfenikol ve minosiklin duyarlılığının araştırılması. Klimik Derg. 2018;31(1):50-5. https://doi.org/10.5152/kd.2018.13
34. Över U, Gür D, Ünal S, et al. The changing nature of aminoglycoside resistance mechanisms and prevalence of newly recognized resistance mechanisms in Turkey. Clin Microbiol Infect. 2001;7(9):470-8. https://doi.org/10.1046/j.1198-743x.2001.00284.x
35. Livermore DM, Warner M, Mushtaq S, Doumith M, Zhang J, Woodford N. What remains against carbapenem-resistant Enterobacteriaceae? Evaluation of chloramphenicol, ciprofloxacin, colistin, fosfomycin, minocycline, nitrofurantoin, temocillin and tigecycline. Int J Antimicrob Agents. 2011;37(5):415-9. https://doi.org/10.1016/j.ijantimicag.2011.01.012
36. Arias CA, Murray BE. Antibiotic-resistant bugs in the 21st century-a clinical super-challenge. N Engl J Med. 2009;360(5):439-43. https://doi.org/10.1056/NEJMp0804651
37. Du H, Chen L, Tang YW, Kreiswirth BN. Emergence of the mcr-1 colistin resistance gene in carbapenemresistant Enterobacteriaceae. Lancet Infect Dis. 2016;16(3):287-8. https://doi.org/10.1016/S1473-3099(16)00056-6
38. Toptan H, Altındiş, M. Bir ilaç monografi: MeropenemVaborbaktam. J Biotechinol & Strategic Health Res. 2018;2(1):50-7.
39. Shirley M. Ceftazidime-avibactam: A review in the treatment of serious Gram-negative bacterial infections. Drugs. 2018;78(6):675-92. https://doi.org/10.1007/s40265-018-0902-x
40. Kılıç Ü, Demiray T, Altındiş M. Karbapenemaz üreten Enterobacteriaceae izolatlarının saptanmasında fenotipik ve genotipik metotlar. Ankem Derg. 2016;30(2):62-75. https://doi.org/10.5222/ankem.2016.062

APA	Tanriverdi Çaycı Y, Bıyık İ, çınar c, BIRINCI A (2020). Karbapeneme Dirençli Enterobacteriaceae İzolatlarının 2015-2018 Yılları Arasındaki Antibiyotik Direnci. , 134 - 140. 10.5222/TMCD.2020.134
Chicago	Tanriverdi Çaycı Yeliz,Bıyık İlknur,çınar canberk,BIRINCI ASUMAN Karbapeneme Dirençli Enterobacteriaceae İzolatlarının 2015-2018 Yılları Arasındaki Antibiyotik Direnci. (2020): 134 - 140. 10.5222/TMCD.2020.134
MLA	Tanriverdi Çaycı Yeliz,Bıyık İlknur,çınar canberk,BIRINCI ASUMAN Karbapeneme Dirençli Enterobacteriaceae İzolatlarının 2015-2018 Yılları Arasındaki Antibiyotik Direnci. , 2020, ss.134 - 140. 10.5222/TMCD.2020.134
AMA	Tanriverdi Çaycı Y,Bıyık İ,çınar c,BIRINCI A Karbapeneme Dirençli Enterobacteriaceae İzolatlarının 2015-2018 Yılları Arasındaki Antibiyotik Direnci. . 2020; 134 - 140. 10.5222/TMCD.2020.134
Vancouver	Tanriverdi Çaycı Y,Bıyık İ,çınar c,BIRINCI A Karbapeneme Dirençli Enterobacteriaceae İzolatlarının 2015-2018 Yılları Arasındaki Antibiyotik Direnci. . 2020; 134 - 140. 10.5222/TMCD.2020.134
IEEE	Tanriverdi Çaycı Y,Bıyık İ,çınar c,BIRINCI A "Karbapeneme Dirençli Enterobacteriaceae İzolatlarının 2015-2018 Yılları Arasındaki Antibiyotik Direnci." , ss.134 - 140, 2020. 10.5222/TMCD.2020.134
ISNAD	Tanriverdi Çaycı, Yeliz vd. "Karbapeneme Dirençli Enterobacteriaceae İzolatlarının 2015-2018 Yılları Arasındaki Antibiyotik Direnci". (2020), 134-140. https://doi.org/10.5222/TMCD.2020.134

APA	Tanriverdi Çaycı Y, Bıyık İ, çınar c, BIRINCI A (2020). Karbapeneme Dirençli Enterobacteriaceae İzolatlarının 2015-2018 Yılları Arasındaki Antibiyotik Direnci. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi, 50(3), 134 - 140. 10.5222/TMCD.2020.134
Chicago	Tanriverdi Çaycı Yeliz,Bıyık İlknur,çınar canberk,BIRINCI ASUMAN Karbapeneme Dirençli Enterobacteriaceae İzolatlarının 2015-2018 Yılları Arasındaki Antibiyotik Direnci. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi 50, no.3 (2020): 134 - 140. 10.5222/TMCD.2020.134
MLA	Tanriverdi Çaycı Yeliz,Bıyık İlknur,çınar canberk,BIRINCI ASUMAN Karbapeneme Dirençli Enterobacteriaceae İzolatlarının 2015-2018 Yılları Arasındaki Antibiyotik Direnci. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi, vol.50, no.3, 2020, ss.134 - 140. 10.5222/TMCD.2020.134
AMA	Tanriverdi Çaycı Y,Bıyık İ,çınar c,BIRINCI A Karbapeneme Dirençli Enterobacteriaceae İzolatlarının 2015-2018 Yılları Arasındaki Antibiyotik Direnci. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi. 2020; 50(3): 134 - 140. 10.5222/TMCD.2020.134
Vancouver	Tanriverdi Çaycı Y,Bıyık İ,çınar c,BIRINCI A Karbapeneme Dirençli Enterobacteriaceae İzolatlarının 2015-2018 Yılları Arasındaki Antibiyotik Direnci. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi. 2020; 50(3): 134 - 140. 10.5222/TMCD.2020.134
IEEE	Tanriverdi Çaycı Y,Bıyık İ,çınar c,BIRINCI A "Karbapeneme Dirençli Enterobacteriaceae İzolatlarının 2015-2018 Yılları Arasındaki Antibiyotik Direnci." Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi, 50, ss.134 - 140, 2020. 10.5222/TMCD.2020.134
ISNAD	Tanriverdi Çaycı, Yeliz vd. "Karbapeneme Dirençli Enterobacteriaceae İzolatlarının 2015-2018 Yılları Arasındaki Antibiyotik Direnci". Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi 50/3 (2020), 134-140. https://doi.org/10.5222/TMCD.2020.134