Üriner Sistem Enfeksiyonu Etkeni Escherichia coli İzolatlarının Çeşitli Antibiyotiklere Direnç Oranlarının Değerlendirilmesi
Yıl: 2020 Cilt: 50 Sayı: 3 Sayfa Aralığı: 172 - 177 Metin Dili: Türkçe DOI: 10.5222/TMCD.2020.172 İndeks Tarihi: 15-11-2020
Üriner Sistem Enfeksiyonu Etkeni Escherichia coli İzolatlarının Çeşitli Antibiyotiklere Direnç Oranlarının Değerlendirilmesi
Öz: Amaç: Hem dünyada hem de ülkemizde Escherichia coli üriner sistem enfeksiyonlarının en sıknedenidir. Gelişen bakteriyel direnç mekanizmaları bu enfeksiyonların tedavisini de kısıtlamaktadır. Tedavide kullanılacak antibiyotiklerin doğru bir antibiyotik duyarlılık testi sonucuna görebelirlenmesi gelişen antibiyotik direncini kontrol altına almakta büyük önem taşımaktadır.Hastanemizde görülen üriner sistem enfeksiyonları etkeni olan E. coli izolatlarının çeşitli antibiyotiklere karşı duyarlılıklarının ve direnç durumlarının belirlenmesi amaçlanmıştır.Yöntem: 01.01.2018-01.11.2019 tarihleri arasında, hastanemiz mikrobiyoloji laboratuvarınakomplike olmayan üriner sistem enfeksiyonu ön tanısı ile gönderilen idrar örnekleri hastane arşivinden retrospektif olarak incelenmiştir. İdrar kültür örneklerinde üreme saptanan örneklerinbakteri tanımlanmasında ve antibiyotik duyarlılıklarının tespitinde tam otomatize cihaz (Vitek 2,bioMérieux, Fransa) kullanılmıştır. Antibiyotik duyarlılıkları “European Committee on AntimicrobialSusceptibility Testing” (EUCAST) 2018 standartlarına uygun olarak minimal inhibitör konsantrasyonlarına göre yorumlanmıştır.Bulgular: Toplam 22.774 idrar örneğinden 1.962’sinde (%9) üreme saptanmıştır. Bunlardan1.466’sı (%75) E. coli olarak tanımlanmıştır. İzolatların antibiyotik dirençleri incelendiğinde,%81’inde ampisilin, %18’inde gentamisin, %40’ında trimetoprim-sülfametoksazol, %4’ünde nitrofurantoin, %4’ünde fosfomisin, %46’sında amoksisilin-klavulanik asit, %42’sinde sefiksim,%41’inde siprofloksasin, %5’inde amikasin, %2’sinde imipenem direnci saptanmıştır.Sonuç: Bu çalışmada, etkeni E. coli olan üriner sistem enfeksiyonlarının tedavisinde ampirik olarakampisilin, amoksisilin klavulanik asit antibiyotiklerinin kullanımının uygun olmayacağı, fosfomisin, nitrofurantoin antibiyotiklerinin tercih edilmesinin daha uygun olacağı anlaşılmıştır
Anahtar Kelime: Evaluation of Resistance Rates of Escherichia coli Isolates of Urinary Tract Infection to Various Antibiotics
Öz: Objective: Escherichia coli is the most common cause of urinary tract infections both in the world and in our country. Increase in bacterial resistance mechanisms also limit the treatment of these infections. Selection of antibiotics to be used according to an accurate antibiotic susceptibility test result is of great importance in controle of antibiotic resistance. We aimed to determine the susceptibility and resistance in E. coli, which is one of the pathogens in urinary tract infection in our hospital, to various antibiotics. Method: Between 01.01.2018-01.11.2019, urine samples obtained from patients with an uncomplicated diagnosis of urinary tract infections, sent to the microbiology laboratory of our hospital, were analyzed retrospectively through the hospital archive. Fully automated device (Vitek2, bioMerieux, France) was used to identify bacteria in the urine culture and to determine antibiotic susceptibilities. Antibiotic susceptibility tests reults were interpreted according to minimal inhibitory concentrations in accordance with the European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST) 2018 standards. Results: Out of a total of 22,774 urine samples, reproduction was detected in 1,962 (9%). Of these, 1466 (75%) were identified as E. coli. The analysis of the antibiotic susceptibility test results have indicated that isolates were resistant to ampicillin in 81%, gentamicin in 18%, trimethoprimsulfamethoxazole in 40%, nitrofurantoin in 4%, phosphomycin in 4%, amoxicillin-clavulanic acid in 46%, cefixime in 42%, ciprofloxacin in 41%, amikacin in 5%, imipenem in 2%. Conclusion: In this study, it was understood that the use of ampicillin, amoxicillin clavulanic acid would not be appropriate, and phosphomycin and nitrofurantoin would be more appropriate in the treatment of urinary tract infections with the effect of E. coli.
Anahtar Kelime: Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık
- 1. Hilt EE, McKinley K, Pearce MM, et al. Urine is not sterile: Use of enhanced urine culture techniques to detect resident bacterial flora in the adult female bladder. J Clin Microbiol. 2014;52(3):871-6. https://doi.org/10.1128/JCM.02876-13
- 2. Price TK, Dune T, Hilt EE, et al. The clinical urine culture: Enhanced techniques improve detection of clinically relevant microorganisms. J Clin Microbiol. 2016;54(5):1216-22. https://doi.org/10.1128/JCM.00044-16
- 3. Aykan BŞ, Çiftci İH. Türkiye’de idrar kültürlerinden izole edilen Escherichia coli suşlarının antibiyotiklere direnç durumu: Bir meta-analiz. Mikrobiyol Bul. 2013;47(4): 603-18. https://doi.org/10.5578/mb.6383
- 4. Süzük S, Kaşkatepe B, Avcıküçük H, Aksaray S, Başustaoğlu A. CLSI’dan EUCAST’e geçişte üriner sistem enfeksiyonu etkeni Escherichia coli izolatlarının antibiyotik duyarlılıklarının karşılaştırılması. Mikrobiyol Bul. 2015;49(4):494-501. https://doi.org/10.5578/mb.10106
- 5. Şahin K, Altan G. Kinolon dirençli Escherichia coli izolatlarında diğer antibiyotiklere direnç oranlarının araştırılması. J Biotechnol Strateg Health Res. 2019;3(3):197-202. https://doi.org/10.34084/bshr.611956
- 6. EUCAST. European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing. Breakpoint tables for interpretation of MICs and zone diameters. Version 8.1, valid from 2018-05-15 [http://www.eucast.org/ast_of_bacteria/ pre-viou]. (erişim tarihi 1 Kasım 2019).
- 7. Aral M, Kireçci E, Doğan SŞ. İdrar örneklerinden izole edilen gram negatif bakteriler ve antibiyotiklere direnç oranlarının retrospektif olarak değerlendirilmesi. Turk Mikrobiyol Cemiy Derg. 2011;41(4):139-42. https://doi.org/10.5222/TMCD.2011.139
- 8. Sağlam HS, Öğütlü A, Demiray V, Karabay O. Üriner enfeksiyonlarda toplum kökenli Escherichia coli’nin yeri ve gelişen antibiyotik direnci. Nobel Med. 2012;8(1):67-71.
- 9. Zengin K, Tanık S, Albayrak S, Taken K, Pirinççi N. Van bölgesi’ndeki üriner sistem enfeksiyon etkenleri ve antibiyotik duyarlılıkları. Bozok Tıp Derg. 2014;4(1):1-5. https://doi.org/10.16919/btd.30666
- 10. Denk A, Tartar AS. İdrar kültürlerinden izole edilen toplum kökenli Escherichia coli suşlarında antibiyotik direnci. Fırat Üniversitesi Sağlık Bilimleri Tıp Derg. 2015;29(2):51-5.
- 11. Gül S, Ecemiş E, Kaçmaz B, Kaygusuz S, Ayaşlıoğlu E, Kılıç D. İdrar kültürlerinden izole edilen bakteriler ve antibiyotik duyarlılıkları. Kırıkkale Üniversitesi Tıp Fakültesi Derg. 2016;16(3):17-21. https://doi.org/10.24938/kutfd.124899
- 12. Sobel JD, Kaye D. Urinary Tract Infections. In: Mandell GL, Bennett JE, Dolin R, eds. Principles and Practice of Infectious Diseases. 7th ed. Philadelphia: Churchill Livingstone, 2010:957-83.
- 13. Etienne M, Lefebvre E, Frebourg N, et al. Antibiotic treatment of acute uncomplicated cystitis based on rapid urine test and local epidemiology: Lessons from a primary care series. BMC Infect Dis 2014;14:137. https://doi.org/10.1186/1471-2334-14-137
- 14. Gupta K, Hooton TM, Naber KG, et al. International clinical practice guidelines for the treatment of acute uncomplicated cystitis and pyelonephritis in women: A 2010 update by the Infectious Diseases Society of America and the European Society for Microbiology and Infectious Diseases. Clin Infect Dis. 2011;52(5): e103-20. https://doi.org/10.1093/cid/ciq257
- 15. Taşbakan MI, Pullukçu H, Sipahi OR, Yamazhan T, Arda B, Ulusoy S. A pooled analysis of the resistance patterns of Escherichia coli strains isolated from urine cultures in Turkey: A comparison of the periods 1997- 2001 and 2002-2007. Turkish J Med Sci. 2011;41(3):557- 64. https://doi.org/10.3906/sag-1006-893
- 16. Van der Bij AK, Van Dijk K, Muilwijk J, et al. Clinical breakpoint changes and their impact on surveillance of antimicrobial resistance in Escherichia coli causing bacteraemia. Clin Microbiol Infect. 2012;18(11):E466- 72. https://doi.org/10.1111/j.1469-0691.2012.03996.x
- 17. Maçin S, Akyön Yılmaz Y, Özden Ö, Gür D. Pseudomonas aeruginosa, Acinetobacter baumannii ve Escherichia coli izolatlarının antibiyotik duyarlılık test sonuçlarının EUCAST ve CLSI’ya göre yorumlanması: Hacettepe deneyimi. Turk Mikrobiyol Cemiy Derg. 2017;47(1):21-5. https://doi.org/10.5222/tmcd.2017.021
- 18. Kaki R, Elligsen M, Walker S, Simor A, Palmay L, Daneman N. Impact of antimicrobial stewardship in critical care: A systematic review. J Antimicrob Chemother 2011;66(6):1223-30. https://doi.org/10.1093/jac/dkr137
- 19. Mehnert-Kay SA. Diagnosis and management of uncomplicated urinary tract infections. Am Fam Physician. 2005;72(3):451-56.
- 20. Nguyen T. Bacterial infections of the urinary tract. In: Tanagho EA, McAninch JW. (eds.) Smith’s & Tanako’s General Urology, 16th Ed., McGraw Hill, 2004:203-27.
- 21. Coşkun USŞ, Coşkun G. Bir devlet hastanesinde poliklinik hastalarına ait idrar örneklerinden izole edilen genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz pozitif Escherichia coli suşlarının prevalans ve antibiyotik duyarlılıklarının belirlenmesi. Kocatepe Tıp Derg. 2015;16(1):25-30. https://doi.org/10.18229/ktd.27083
- 22. Bayram Y, Eren H, Berktas M. İdrar örneklerinden izole edilen bakteriyel patojenlerin dağılımı ve GSBL pozitif ve negatif Escherichia coli suşlarının fosfomisin ve diğer antimikrobiyallere duyarlılık paterni. Ankem Derg. 2012;25(4):232-36. https://doi.org/10.5222/ankem.2011.232
- 23. Varışlı AN, Cetin Hazırolan G, Kocagul Celikbas A, Aksoy A. Resistance patterns of gram negative bacteria in urinary tract infections and efficacy of empirical treatment in noncomplicated cases: Retrospective cohort study of 2180 women. J Surg Med. 2018;2(2):99- 104. https://doi.org/10.28982/josam.399562
- 24. Tekin A, Deveci Ö, Dal T, et al. Üropatojen Escherichia coli izolatlarına fosfomisin ve bazı antibiyotiklerin in vitro etkinliği. Ankem Derg. 2012;26(2):61-8. https://doi.org/10.5222/ankem.2012.061
- 25. Aşgın N, Kal Çakmaklıoğulları E. Karabük ilinde toplum kökenli pediatrik üriner sistem enfeksiyonlarından izole edilen E. coli suşlarının in-vitro antibiyotik direnç profili. J Contemp Med. 2017;7(3):241-5. https://doi.org/10.16899/gopctd.349939
- 26. Bryce A, Hay AD, Lane IF, Thornton HV, Wootton M, Costelloe C. Global prevalence of antibiotic resistance in paediatric urinary tract infections caused by Escherichia coli and association with routine use of antibiotics in primary care: Systematic review and meta-analysis. BMJ. 2016;352. https://doi.org/10.1136/bmj.i939
- 27. Çoban B, Ülkü N, Kaplan H, Topal B, Erdoğan H, Baskın E. Çocuklarda idrar yolu enfeksiyonu etkenleri ve antibiyotik dirençlerinin beş yıllık değerlendirmesi. Turk Ped Arş. 2014;49(2):124-29. https://doi.org/10.5152/tpa.2014.1505
- 28. Öztürk CE, Kaya AD, Göçmen Ş, Arslan E. Toplum kaynaklı idrar yolu infeksiyonu etkeni olan Escherichia coli izolatlarının fosfomisin ile idrar yolu infeksiyonlarında sık kullanılan antibiyotiklere duyarlılıkları. Ankem Derg. 2008;22(2):81-4.
| APA | Avcıoğlu F, behcet m (2020). Üriner Sistem Enfeksiyonu Etkeni Escherichia coli İzolatlarının Çeşitli Antibiyotiklere Direnç Oranlarının Değerlendirilmesi. , 172 - 177. 10.5222/TMCD.2020.172 |
| Chicago | Avcıoğlu Fatma,behcet mustafa Üriner Sistem Enfeksiyonu Etkeni Escherichia coli İzolatlarının Çeşitli Antibiyotiklere Direnç Oranlarının Değerlendirilmesi. (2020): 172 - 177. 10.5222/TMCD.2020.172 |
| MLA | Avcıoğlu Fatma,behcet mustafa Üriner Sistem Enfeksiyonu Etkeni Escherichia coli İzolatlarının Çeşitli Antibiyotiklere Direnç Oranlarının Değerlendirilmesi. , 2020, ss.172 - 177. 10.5222/TMCD.2020.172 |
| AMA | Avcıoğlu F,behcet m Üriner Sistem Enfeksiyonu Etkeni Escherichia coli İzolatlarının Çeşitli Antibiyotiklere Direnç Oranlarının Değerlendirilmesi. . 2020; 172 - 177. 10.5222/TMCD.2020.172 |
| Vancouver | Avcıoğlu F,behcet m Üriner Sistem Enfeksiyonu Etkeni Escherichia coli İzolatlarının Çeşitli Antibiyotiklere Direnç Oranlarının Değerlendirilmesi. . 2020; 172 - 177. 10.5222/TMCD.2020.172 |
| IEEE | Avcıoğlu F,behcet m "Üriner Sistem Enfeksiyonu Etkeni Escherichia coli İzolatlarının Çeşitli Antibiyotiklere Direnç Oranlarının Değerlendirilmesi." , ss.172 - 177, 2020. 10.5222/TMCD.2020.172 |
| ISNAD | Avcıoğlu, Fatma - behcet, mustafa. "Üriner Sistem Enfeksiyonu Etkeni Escherichia coli İzolatlarının Çeşitli Antibiyotiklere Direnç Oranlarının Değerlendirilmesi". (2020), 172-177. https://doi.org/10.5222/TMCD.2020.172 |
| APA | Avcıoğlu F, behcet m (2020). Üriner Sistem Enfeksiyonu Etkeni Escherichia coli İzolatlarının Çeşitli Antibiyotiklere Direnç Oranlarının Değerlendirilmesi. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi, 50(3), 172 - 177. 10.5222/TMCD.2020.172 |
| Chicago | Avcıoğlu Fatma,behcet mustafa Üriner Sistem Enfeksiyonu Etkeni Escherichia coli İzolatlarının Çeşitli Antibiyotiklere Direnç Oranlarının Değerlendirilmesi. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi 50, no.3 (2020): 172 - 177. 10.5222/TMCD.2020.172 |
| MLA | Avcıoğlu Fatma,behcet mustafa Üriner Sistem Enfeksiyonu Etkeni Escherichia coli İzolatlarının Çeşitli Antibiyotiklere Direnç Oranlarının Değerlendirilmesi. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi, vol.50, no.3, 2020, ss.172 - 177. 10.5222/TMCD.2020.172 |
| AMA | Avcıoğlu F,behcet m Üriner Sistem Enfeksiyonu Etkeni Escherichia coli İzolatlarının Çeşitli Antibiyotiklere Direnç Oranlarının Değerlendirilmesi. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi. 2020; 50(3): 172 - 177. 10.5222/TMCD.2020.172 |
| Vancouver | Avcıoğlu F,behcet m Üriner Sistem Enfeksiyonu Etkeni Escherichia coli İzolatlarının Çeşitli Antibiyotiklere Direnç Oranlarının Değerlendirilmesi. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi. 2020; 50(3): 172 - 177. 10.5222/TMCD.2020.172 |
| IEEE | Avcıoğlu F,behcet m "Üriner Sistem Enfeksiyonu Etkeni Escherichia coli İzolatlarının Çeşitli Antibiyotiklere Direnç Oranlarının Değerlendirilmesi." Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi, 50, ss.172 - 177, 2020. 10.5222/TMCD.2020.172 |
| ISNAD | Avcıoğlu, Fatma - behcet, mustafa. "Üriner Sistem Enfeksiyonu Etkeni Escherichia coli İzolatlarının Çeşitli Antibiyotiklere Direnç Oranlarının Değerlendirilmesi". Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi 50/3 (2020), 172-177. https://doi.org/10.5222/TMCD.2020.172 |
