Candida parapsilosis İzolatlarının Soğuk Saklama Koşullarına Dayanıklılığı: On Yıllık Stoklama Sonrası Canlandırma

Şahiner, Fatih; HOŞBUL, tugrul; GÜMRAL, Ramazan; Bektore, Bayhan; Tekin, Kemal

doi:10.5222/TMCD.2020.070

Candida parapsilosis İzolatlarının Soğuk Saklama Koşullarına Dayanıklılığı: On Yıllık Stoklama Sonrası Canlandırma

Tuğrul HOŞBUL, (Sağlık Bilimleri Üniversitesi, Gülhane Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Ankara, Türkiye)

Ramazan GÜMRAL, (Sağlık Bilimleri Üniversitesi, Gülhane Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Ankara, Türkiye)

Bayhan BEKTÖRE, (Alaaddi̇n Keykubat Üniversitesi, Alanya Eğiti ve Araştıma Hastanesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarı, Antalya, Türkiye)

Kemal TEKİN, (Sağlık Bilimleri Üniversitesi, Gülhane Eğitim ve Araştıma Hastanesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarı, Ankara, Türkiye)

Fatih ŞAHİNER (Sağlık Bilimleri Üniversitesi, Gülhane Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Ankara, Türkiye)

Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi

1 0

Yıl: 2020 Cilt: 50 Sayı: 2 Sayfa Aralığı: 70 - 77 Metin Dili: Türkçe DOI: 10.5222/TMCD.2020.070 İndeks Tarihi: 01-11-2020

Candida parapsilosis İzolatlarının Soğuk Saklama Koşullarına Dayanıklılığı: On Yıllık Stoklama Sonrası Canlandırma

Öz:

Amaç: Mikrobiyoloji laboratuvarlarında yürütülen araştırmalara farklı özelliklere sahip çok sayıdaki türün ve izolatın dâhil edilmesi çalışma verilerini değerli kılan önemli göstergelerden biridir.Bu amaçla her laboratuvar özgün bir suş koleksiyonu oluşturur. Bunun sürdürülebilirliği için tercihedilen saklama yöntemi izolatların uzun süreli saklanmasına ve hücrelerin canlı ve stabil kalmasına uygun olmalıdır. Bu çalışmada, Candida türlerinin soğukta saklama koşullarına olan dayanıklılıklarının tür düzeyinde incelenmesi amaçlanmıştır.Yöntem: Çalışmaya 10 yıldan daha uzun bir süredir laboratuvarımızda saklanan (-20°C’de boncuklu saklama tüpleri içerisinde) ve bu süre zarfında üzerlerinde herhangi bir canlandırma işlemiveya farklı bir çalışma yapılmayan, klinik örneklerden elde edilmiş 94 stok Candida izolatı dâhiledilmiştir. Çalışma örneklerinden sıvı ve katı besiyerlerine pasajlar alınarak canlanan suşlarıngüncel rutin tanı yöntemleriyle doğrulaması yapılmıştır.Bulgular: Çalışma izolatlarında canlanma oranı Candida parapsilosis için %59.1 (13/22), Candidaglabrata için %41.7 (5/12), Candida tropicalis için %25 (4/16) ve Candida albicans için %9.52(4/42) olarak bulundu. C. parapsilosis izolatlarının canlı kalma oranı, C. albicans ve C. tropicalisizolatları ile karşılaştırıldığında istatistiksel olarak anlamlı derecede yüksek bulundu (sırasıylap<0.0001 ve p=0.037).Sonuç: Bu çalışmada sunulan veriler yüksek sıcaklıklarda canlılığını sürdürebilen, soğuk koşullaraadapte olan ve hastane ortamlarında uzun süre canlılığını sürdürebilen bir tür olan C. parapsilosisizolatlarının soğuk saklama koşullarına C. albicans başta olmak üzere C. tropicalis ve C. glabratatürlerinden daha dayanıklı olduğunu desteklemektedir.

Anahtar Kelime:

Survival of Candida parapsilosis Isolates in Cold Storage Conditions: Recovery in Cultures After 10-Years of Storage

Öz:

Objective: Studies conducted in microbiology laboratories with the inclusion of huge amount and variety of species and isolates are important indicators that render them valuable. For this purpose, each laboratory creates its own unique strain collection. For the sustainability of this procedure, the preferred storage method should be suitable for long-term storage of the isolates that keep the cells alive and stable. In this study, it was aimed to investigate the viability of Candida species in cold storage conditions at species level. Method: The study included 94 stocks of Candida isolates obtained from clinical samples that had been stored in our laboratory for more than 10 years (in Cryobank vials with beads at -20°C) and had not undergone any recultivation or other recovery procedures during this period. Samples were passaged into liquid and solid media and recovered strains were confirmed with current routine diagnostic methods. Results: The recovery rate of the study isolates was found 59.1% (13/22) for Candida parapsilosis, 41.7% (5/12) for Candida glabrata, 25% (4/16) for Candida tropicalis, and 9.52% (4/42) for Candida albicans. The recovery rate of C. parapsilosis isolates was found to be significantly higher compared to C. albicans and C. tropicalis isolates (p<0.0001 and p=0.037, respectively). Conclusion: The data presented in this study support that C. parapsilosis isolates, which can survive at high temperatures, adapt to cold conditions and survive in hospital environments. They are also more stable under cold storage conditions than C. tropicalis C. glabrata, and especially C. albicans species.

Anahtar Kelime:

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık

1. Şahiner F, Ergünay K, Özyurt M, Ardıç N, Hoşbul T, Haznedaroğlu T. Hastane enfeksiyonu etkeni olarak izole edilen Candida suşlarının genotipik ve fenotipik olarak tanımlanması. Mikrobiyol Bul. 2011;45(3):478-88.
2. Turner SA, Butler G. The Candida pathogenic species complex. Cold Spring Harb Perspect Med. 2014;4(9):a019778. https://doi.org/10.1101/cshperspect.a019778
3. Pfaller MA, Diekema DJ. Epidemiology of invasive candidiasis: a persistent public health problem. Clin Microbiol Rev. 2007;20(1):133-63. https://doi.org/10.1128/CMR.00029-06
4. Neji S, Hadrich I, Trabelsi H, et al. Virulence factors, antifungal susceptibility and molecular mechanisms of azole resistance among Candida parapsilosis complex isolates recovered from clinical specimens. J Biomed Sci. 20174;24(1):67. https://doi.org/10.1186/s12929-017-0376-2
5. Qi L, Fan W, Xia X, et al. Nosocomial outbreak of Candida parapsilosis sensu stricto fungaemia in a neonatal intensive care unit in China. J Hosp Infect. 2018;100(4):e246-52. https://doi.org/10.1016/j.jhin.2018.06.009
6. Ting JY, Roberts A, Synnes A, et al. Invasive fungal infections in neonates in Canada: Epidemiology and outcomes. Pediatr Infect Dis J. 2018;37(11):1154-9. https://doi.org/10.1097/INF.0000000000001968
7. Tavanti A, Davidson AD, Gow NA, Maiden MC, Odds FC. Candida orthopsilosis and Candida metapsilosis spp. nov. to replace Candida parapsilosis groups II and III. J Clin Microbiol. 43(1):284-92. https://doi.org/10.1128/JCM.43.1.284-292.2005
8. Borghi E, Sciota R, Iatta R, Biassoni C, Montagna MT, Morace G. Characterization of Candida parapsilosis complex strains isolated from invasive fungal infections. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2011;30(11):1437-41. https://doi.org/10.1007/s10096-011-1242-x
9. Kaplan E, İlkit M, de Hoog GS. Candida parapsilosis’in ekstrem koşullara toleransında tuz ve sıcaklık stres direncinin etkisi. Turk Mikrobiyoloji Cemiy Derg 2019;49(1):24-9. https://doi.org/10.5222/TMCD.2019.024
10. Silva S, Negri M, Henriques M, Oliveira R, Williams DW, Azeredo J. Candida glabrata, Candida parapsilosis and Candida tropicalis: Biology, epidemiology, pathogenicity and antifungal resistance. FEMS Microbiol Rev. 2012;36(2):288-305. https://doi.org/10.1111/j.1574-6976.2011.00278.x
11. Dögen A, Sav H, Gonca S, et al. Candida parapsilosis in domestic laundry machines. Med Mycol. 20171; 55(8):813-9. https://doi.org/10.1093/mmy/myx008
12. Aldave AJ, DeMatteo J, Glasser DB, et al. Report of the Eye Bank Association of America Medical Advisory Board Subcommittee on fungal infection after corneal transplantation. Cornea. 2013;32(2):149-54. https://doi.org/10.1097/ICO.0b013e31825e83bf
13. Edelstein SL, DeMatteo J, Stoeger CG, et al. Report of the Eye Bank Association of America Medical Review Subcommittee on adverse reactions reported from 2007 to 2014. Cornea. 2016;35:917-26. https://doi.org/10.1097/ICO.0000000000000869
14. Tran KD, Aldrich BT, D’Amato Tóthová J, et al. Efficacy and safety of various amphotericin B concentrations on Candida albicans in cold storage conditions. Cornea. 2020;39(1):110-7. https://doi.org/10.1097/ICO.0000000000002019
15. Ritterband DC, Shah MK, Meskin SW, et al. Efficacy and safety of voriconazole as an additive in Optisol GS: a preservation medium for corneal donor tissue. Cornea. 2007;26(3):343-7. https://doi.org/10.1097/ICO.0b013e31802d82e8
16. Maráz A, Kovács M. Food spoilage by cold-adapted yeast. In: Cold-adapted Yeasts. Biodiversity, Adaptation Strategies and Biotechnological Significance. Buzzini, Pietro, Margesin, Rosa (Eds.), Springer-Verlag, Berlin Heidelberg, 2014:497-532. https://doi.org/10.1007/978-3-662-45759-7_23
17. Nakasone KK, Peterson SW, Jong SC. Preservation and distribution of fungal cultures. In: Mueller G, Foster M, Bils G (eds). Biodiversity of fungi. 1st Ed. Inventory and monitoring methods. Amsterdam: Elsevier Academic Press, 2004:37-47. https://doi.org/10.1016/B978-012509551-8/50006-4
18. Yücel A, Kantarcıoğlu AS. Mantar stok kültürlerinin üç farklı yöntemle karşılaştırılması. Cerrahpaşa J Med. 2000;31(1):7-15.
19. Agnes DS, Onions HS. A comparison of some preservation techniques for fungi. Trans Brit Mycol Soc. 1983;81(3):535-40. https://doi.org/10.1016/S0007-1536(83)80122-3
20. Espinel-Ingroff A, Montero D, Martin-Mazuelos E. Long-term preservation of fungal isolates in commercially prepared cryogenic microbank vials. J Clin Microbiol. 2004;42(3):1257-9. https://doi.org/10.1128/JCM.42.3.1257-1259.200
21. McGinnis MR, Padhye AA, Ajello L. Storage of stock cultures of filamentous fungi, yeasts and some aerobic Actinomycetes in sterile distilled water. Appl Microbiol. 1974;28(2)218-22. https://doi.org/10.1128/AEM.28.2.218-222.1974
22. Pasarell L, McGinnis MR. Viability of fungal culturesmaintained at -70 degrees C. J Clin Microbiol. 1992;30(4):1000-4. https://doi.org/10.1128/JCM.30.4.1000-1004.1992
23. Kramer CL, Mix AJ. Deep freeze storage of fungus cultures. Trans Kans Acad Sci. 1957;60:54-64. https://doi.org/10.2307/3627003
24. Odds FC. Long-term preservation of pathogenic yeasts in water. J Med Vet Mycol. 1991;29(6):413-5. https://doi.org/10.1080/02681219180000651
25. Carmichael JW. Viability of mold cultures stored at -20°C. Mycologia. 1962;54(4):432-6. https://doi.org/10.1080/00275514.1962.12025019

APA	HOŞBUL t, GÜMRAL R, Bektore B, Tekin K, Şahiner F (2020). Candida parapsilosis İzolatlarının Soğuk Saklama Koşullarına Dayanıklılığı: On Yıllık Stoklama Sonrası Canlandırma. , 70 - 77. 10.5222/TMCD.2020.070
Chicago	HOŞBUL tugrul,GÜMRAL Ramazan,Bektore Bayhan,Tekin Kemal,Şahiner Fatih Candida parapsilosis İzolatlarının Soğuk Saklama Koşullarına Dayanıklılığı: On Yıllık Stoklama Sonrası Canlandırma. (2020): 70 - 77. 10.5222/TMCD.2020.070
MLA	HOŞBUL tugrul,GÜMRAL Ramazan,Bektore Bayhan,Tekin Kemal,Şahiner Fatih Candida parapsilosis İzolatlarının Soğuk Saklama Koşullarına Dayanıklılığı: On Yıllık Stoklama Sonrası Canlandırma. , 2020, ss.70 - 77. 10.5222/TMCD.2020.070
AMA	HOŞBUL t,GÜMRAL R,Bektore B,Tekin K,Şahiner F Candida parapsilosis İzolatlarının Soğuk Saklama Koşullarına Dayanıklılığı: On Yıllık Stoklama Sonrası Canlandırma. . 2020; 70 - 77. 10.5222/TMCD.2020.070
Vancouver	HOŞBUL t,GÜMRAL R,Bektore B,Tekin K,Şahiner F Candida parapsilosis İzolatlarının Soğuk Saklama Koşullarına Dayanıklılığı: On Yıllık Stoklama Sonrası Canlandırma. . 2020; 70 - 77. 10.5222/TMCD.2020.070
IEEE	HOŞBUL t,GÜMRAL R,Bektore B,Tekin K,Şahiner F "Candida parapsilosis İzolatlarının Soğuk Saklama Koşullarına Dayanıklılığı: On Yıllık Stoklama Sonrası Canlandırma." , ss.70 - 77, 2020. 10.5222/TMCD.2020.070
ISNAD	HOŞBUL, tugrul vd. "Candida parapsilosis İzolatlarının Soğuk Saklama Koşullarına Dayanıklılığı: On Yıllık Stoklama Sonrası Canlandırma". (2020), 70-77. https://doi.org/10.5222/TMCD.2020.070

APA	HOŞBUL t, GÜMRAL R, Bektore B, Tekin K, Şahiner F (2020). Candida parapsilosis İzolatlarının Soğuk Saklama Koşullarına Dayanıklılığı: On Yıllık Stoklama Sonrası Canlandırma. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi, 50(2), 70 - 77. 10.5222/TMCD.2020.070
Chicago	HOŞBUL tugrul,GÜMRAL Ramazan,Bektore Bayhan,Tekin Kemal,Şahiner Fatih Candida parapsilosis İzolatlarının Soğuk Saklama Koşullarına Dayanıklılığı: On Yıllık Stoklama Sonrası Canlandırma. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi 50, no.2 (2020): 70 - 77. 10.5222/TMCD.2020.070
MLA	HOŞBUL tugrul,GÜMRAL Ramazan,Bektore Bayhan,Tekin Kemal,Şahiner Fatih Candida parapsilosis İzolatlarının Soğuk Saklama Koşullarına Dayanıklılığı: On Yıllık Stoklama Sonrası Canlandırma. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi, vol.50, no.2, 2020, ss.70 - 77. 10.5222/TMCD.2020.070
AMA	HOŞBUL t,GÜMRAL R,Bektore B,Tekin K,Şahiner F Candida parapsilosis İzolatlarının Soğuk Saklama Koşullarına Dayanıklılığı: On Yıllık Stoklama Sonrası Canlandırma. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi. 2020; 50(2): 70 - 77. 10.5222/TMCD.2020.070
Vancouver	HOŞBUL t,GÜMRAL R,Bektore B,Tekin K,Şahiner F Candida parapsilosis İzolatlarının Soğuk Saklama Koşullarına Dayanıklılığı: On Yıllık Stoklama Sonrası Canlandırma. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi. 2020; 50(2): 70 - 77. 10.5222/TMCD.2020.070
IEEE	HOŞBUL t,GÜMRAL R,Bektore B,Tekin K,Şahiner F "Candida parapsilosis İzolatlarının Soğuk Saklama Koşullarına Dayanıklılığı: On Yıllık Stoklama Sonrası Canlandırma." Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi, 50, ss.70 - 77, 2020. 10.5222/TMCD.2020.070
ISNAD	HOŞBUL, tugrul vd. "Candida parapsilosis İzolatlarının Soğuk Saklama Koşullarına Dayanıklılığı: On Yıllık Stoklama Sonrası Canlandırma". Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi 50/2 (2020), 70-77. https://doi.org/10.5222/TMCD.2020.070