Çevresel Örneklerde Arcobacter butzleri'ye Spesifik Litik Etkili Fajların Araştırılması

Acik, Mehmet Nuri; CETINKAYA, BURHAN; KARAGÜLLE, BURCU

Çevresel Örneklerde Arcobacter butzleri'ye Spesifik Litik Etkili Fajların Araştırılması

Burcu KARAGÜLLE, (Fırat Üniversitesi, Veteriner Fakültesi, Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Elazığ, Türkiye)

Mehmet Nuri AÇIK, (Bingöl Üniversitesi, Veteriner Fakültesi, Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Bingöl, Türkiye)

Burhan ÇETİNKAYA (Fırat Üniversitesi, Veteriner Fakültesi, Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Elazığ, Türkiye)

Fırat Üniversitesi Sağlık Bilimleri Veteriner Dergisi

2 1

Yıl: 2020 Cilt: 34 Sayı: 2 Sayfa Aralığı: 69 - 73 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 29-11-2020

Çevresel Örneklerde Arcobacter butzleri'ye Spesifik Litik Etkili Fajların Araştırılması

Öz:

Bu çalışmada, tavuk kümesleri ve sığır çiftliklerinden toplanan toprak, atık su, altlık, dışkı gibiçevresel örneklerde Arcobacter butzleri türüne spesifik fajların varlığı çift tabakalı agar yöntemikullanılarak araştırıldı. İncelenen 800 saha örneğinin iki tanesinde ilk izolasyonda gözle görülebilirnitelikte faj varlığını gösteren erimeler tespit edildi. Erimelerin olduğu agar kısmının her biri bistüriile kesilerek Tryptic Soya Broth besi yerlerine aktarıldı. İzole edilen fajları çoğaltmak amacıylayapılan daha sonraki birçok analizlerde, başlangıçta erime oluşturan iki fajın erime göstermediği veplak oluşturmadığı tespit edildi. Aynı analizler farklı kanatlı türlerinden izole edilen yedi A. butzlerisaha suşunda da denendi. Ancak herhangi pozitif bir sonuç elde edilemedi. Sonuç olarak toplanançevresel örneklerde A. butzleri’ye spesifik litik etkili fajların varlığı ile ilgili önemli ipuçları eldeedilmesine rağmen bununla ilgili kesin bir veriye ulaşılamadı. İzole edilen fajların profaj olmaihtimali dikkate alındığında, ileride yapılacak çalışmalarda bu konuya odaklanılması gerektiğikanaatine varıldı.

Anahtar Kelime:

Investigation of Lytic Phages Speciflc to Arcobacter butzleri in Environmental Samples

Öz:

In this study, the presence lytic phages specific to Arcobacter butzleri was investigated in environmental samples by using double layer agar method. In two of the 800 field samples examined, melts indicating the presence of visible phage were detected at the initial isolation. Each of the agar with melts was cut and transferred to Tryptic Soy Broth broths. In many subsequent analyzes to amplify the isolated phages, it was found that the two initially dissolving phages did not dissolve and did not form plaques. The same assays were tested in seven A. butzleri field strains isolated from different poultry species. However, no positive result was obtained. In conclusion, although there were important clues about the presence of lytic-effect phages specific to A. butzleri in the collected environmental samples, no definite data could be obtained. Considering the possibility of isolated phages to be prophage, further studies focusing on this subject are required.

Anahtar Kelime:

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık

1. Van den Abeele AM, Vogelaers D, Van Hende J, et al. Prevalence of Arcobacter Species among Humans, Belgium, 2008–2013. Emerg Infect Dis 2014; 20: 1731 - 1734.
2. Logan EF, Neill SD, Mackie DP. Mastitis in dairy cows associated with an aerotolerant Campylobacter. Vet Rec 1982; 110: 229-230.
3. Schroeder-Tucker L, Wesley IV, Kiehlbauch JA, et al. Phenotypic and ribosomal RNA characterization of Arcobacter species isolated from porcine aborted fetuses. J Vet Diagn Invest 1996; 8: 186-195.
4. Collado L, Figueras MJ. Taxonomy, epidemiology, and clinical relevance of the genus Arcobacter. Clin Microbiol Rev 2011; 24: 174-192.
5. Açik MN, Yüksel H, Ulucan A, et al. The first experimental research on the pathogenicity of Arcobacter butzleri in zebrafish. Vet Microbiol 2016; 189: 32-38.
6. Clark NM, Zhanel GG, Lynch III JP. Emergence of antimicrobial resistance among Acinetobacter species: a global threat. Curr Opin Crit Care 2016; 22: 491 -499.
7. Ryu S, Head MG, Kim BI, et al. Are we investing wisely? A systematic analysis of nationally funded antimicrobial resistance projects in Republic of Korea, 2003-2013. J Glob Antimicrob Resist 2016; 7: 90-94.
8. Abay S, Kayman T, Hizlisoy H, et al. In vitro antibacterial susceptibility of Arcobacter butzleri isolated from different sources. J Vet Med Sci 201 2; 74: 613-616.
9. Kayman T, Abay S, Hizlisoy H, et al. Emerging pathogen Arcobacter spp. in acute gastroenteritis: Molecular identification, antibiotic susceptibilities and genotyping of the isolated Arcobacters. J Med Microbiol 212; 61 : 1439- 1444.
10. Rahimi E. Prevalence and antimicrobial resistance of Arcobacter species isolated from poultry meat in Iran. British Poult Sci 2014; 55: 174-180.
11. Loc Carrillo CM, Connerton PL, Pearson T, et al. Freerange layer chickens as a source of Campylobcter bacteriophage. Antonie Van Leeuwenhoe 2007; 92: 275- 284.
12. Gencay YE, Birk T, Bronsted L, et al. Campylobacter jejuni Methods and Protocols. In: Butcher J, Stintzi A. (Editors). Methods for isolation, purification, and propagation of bacteriophages of Campylobacter jejuni. Chapter 3. Humana Press, New York: 2017: 19-28.
13. Hockett KL, Baltrus DA. Use of the soft-agar overlay technique to screen for bacterially produced inhibitory compounds. JoVE 2017; 119: e55064.
14. Smith HW, Huggins MB. Successful treatment of experimental Escherichia coli infections in mice using phage: Its general superiority over antibiotics. J Gen Microbiol 1982; 128: 307-318.
15. Spricigo DA, Bardina C, Cortés P, et al. Use of a bacteriophage cocktail to control Salmonella in food and the food industry. Int J Food Microbiol 2013; 165: 169-174.
16. Chan BK, Sistrom M, Wertz JE et al. Phage selection restores antibiotic sensitivity in MDR Pseudomonas aeruginosa. Sci Rep 2016; 6: 26717.
17. Wang Z, Zheng P, Ji W, et al. SLPW: A virulent bacteriophage targeting methicillin-resistant Staphylococcus aureus in vitro and in vivo. Front Microbiol 2016; 15: 934.
18. Jansen M, Wahida A, Latz S, et al. Enhanced antibacterial effect of the novel T4-like bacteriophage KARL-1 in combination with antibiotics against multi-drug resistant Acinetobacter baumannii. Sci Rep 2018; 8: 14140.
19. Tan D, Zhang Y, Cheng M, et al. Characterization of Klebsiella pneumoniae ST11 isolates and their interactions with lytic phages. Viruses 2019; 11 : 1080.
20. Carvalho CM, Gannon BW, Halfhide DE, et al. The in vivo efficacy of two administration routes of a phage cocktail to reduce numbers of Campylobacter coli and Campylobacter jejuni in chickens. BMC Microbiol 2010; 10: 232.
21. Fischer S, Kittler S, Klein G, et al. Impact of a single phage and a phage cocktail application in broilers on reduction of Campylobacter jejuni and development of resistance. PLoS One 2013; 8: e78543.
22. Jäckel C, Hammerl JA, Hertwig S. campylobacter phage ısolation and characterization: What we have learned so far. Methods Protoc 2019; 2: 18.
23. Makino K, Yokoyama K, Kubota Y, et al. Complete nucleotide sequence of the prophage VT2-Sakai carrying the verotoxin 2 genes of the enterohemorrhagic Escherichia coli O157:H7 derived from the Sakai outbreak. Genes Genet Syst 1999; 74: 227-239.
24. Yokoyama K, Makino K, Kubota Y, et al. Complete nucleotide sequence of the prophage VT1 -Sakai carrying the Shiga toxin 1 genes of the enterohemorrhagic Escherichia coli O157:H7 strain derived from the Sakai outbreak. Gene 2000; 258:127-139.

APA	KARAGÜLLE B, Acik M, CETINKAYA B (2020). Çevresel Örneklerde Arcobacter butzleri'ye Spesifik Litik Etkili Fajların Araştırılması. , 69 - 73.
Chicago	KARAGÜLLE BURCU,Acik Mehmet Nuri,CETINKAYA BURHAN Çevresel Örneklerde Arcobacter butzleri'ye Spesifik Litik Etkili Fajların Araştırılması. (2020): 69 - 73.
MLA	KARAGÜLLE BURCU,Acik Mehmet Nuri,CETINKAYA BURHAN Çevresel Örneklerde Arcobacter butzleri'ye Spesifik Litik Etkili Fajların Araştırılması. , 2020, ss.69 - 73.
AMA	KARAGÜLLE B,Acik M,CETINKAYA B Çevresel Örneklerde Arcobacter butzleri'ye Spesifik Litik Etkili Fajların Araştırılması. . 2020; 69 - 73.
Vancouver	KARAGÜLLE B,Acik M,CETINKAYA B Çevresel Örneklerde Arcobacter butzleri'ye Spesifik Litik Etkili Fajların Araştırılması. . 2020; 69 - 73.
IEEE	KARAGÜLLE B,Acik M,CETINKAYA B "Çevresel Örneklerde Arcobacter butzleri'ye Spesifik Litik Etkili Fajların Araştırılması." , ss.69 - 73, 2020.
ISNAD	KARAGÜLLE, BURCU vd. "Çevresel Örneklerde Arcobacter butzleri'ye Spesifik Litik Etkili Fajların Araştırılması". (2020), 69-73.

APA	KARAGÜLLE B, Acik M, CETINKAYA B (2020). Çevresel Örneklerde Arcobacter butzleri'ye Spesifik Litik Etkili Fajların Araştırılması. Fırat Üniversitesi Sağlık Bilimleri Veteriner Dergisi, 34(2), 69 - 73.
Chicago	KARAGÜLLE BURCU,Acik Mehmet Nuri,CETINKAYA BURHAN Çevresel Örneklerde Arcobacter butzleri'ye Spesifik Litik Etkili Fajların Araştırılması. Fırat Üniversitesi Sağlık Bilimleri Veteriner Dergisi 34, no.2 (2020): 69 - 73.
MLA	KARAGÜLLE BURCU,Acik Mehmet Nuri,CETINKAYA BURHAN Çevresel Örneklerde Arcobacter butzleri'ye Spesifik Litik Etkili Fajların Araştırılması. Fırat Üniversitesi Sağlık Bilimleri Veteriner Dergisi, vol.34, no.2, 2020, ss.69 - 73.
AMA	KARAGÜLLE B,Acik M,CETINKAYA B Çevresel Örneklerde Arcobacter butzleri'ye Spesifik Litik Etkili Fajların Araştırılması. Fırat Üniversitesi Sağlık Bilimleri Veteriner Dergisi. 2020; 34(2): 69 - 73.
Vancouver	KARAGÜLLE B,Acik M,CETINKAYA B Çevresel Örneklerde Arcobacter butzleri'ye Spesifik Litik Etkili Fajların Araştırılması. Fırat Üniversitesi Sağlık Bilimleri Veteriner Dergisi. 2020; 34(2): 69 - 73.
IEEE	KARAGÜLLE B,Acik M,CETINKAYA B "Çevresel Örneklerde Arcobacter butzleri'ye Spesifik Litik Etkili Fajların Araştırılması." Fırat Üniversitesi Sağlık Bilimleri Veteriner Dergisi, 34, ss.69 - 73, 2020.
ISNAD	KARAGÜLLE, BURCU vd. "Çevresel Örneklerde Arcobacter butzleri'ye Spesifik Litik Etkili Fajların Araştırılması". Fırat Üniversitesi Sağlık Bilimleri Veteriner Dergisi 34/2 (2020), 69-73.