KLİNİK ÖRNEKLERDEN CAMPYLOBACTER TÜRLERİNİN ÜRETİLMESİNİN ARAŞTIRILMASI VE ANTİBİYOTİK DUYARLILIKLARININ BELİRLENMESİ

Recep Borucu, (Şanlıurfa Eğitim ve Araştırma Hastanesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Şanlıurfa, Türkiye)
Yeliz Tanrıverdi Çaycı, (Ondokuz Mayıs Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Samsun, Türkiye)
Asuman Birinci (Ondokuz Mayıs Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Samsun, Türkiye)
Kocaeli Üniversitesi Sağlık Bilimleri Dergisi
0 0
Yıl: 2019 Cilt: 5 Sayı: 1 Sayfa Aralığı: 15 - 19 Metin Dili: Türkçe DOI: 10.30934/kusbed.455330 İndeks Tarihi: 01-02-2021

KLİNİK ÖRNEKLERDEN CAMPYLOBACTER TÜRLERİNİN ÜRETİLMESİNİN ARAŞTIRILMASI VE ANTİBİYOTİK DUYARLILIKLARININ BELİRLENMESİ

Öz:
Amaç: Campylobacter türleri insanda sistemik infeksiyon ve ishallerin önemli sebeplerindendir. Bu çalışmadaki amacımız Campylobacter üretiminisağlamak için uygun besiyerini araştırmak ve üretilecek bakterilere antimikrobiyal duyarlılık testleri çalışarak direnç profillerini tespit etmektir.Yöntem: Çalışmamıza 1 Mayıs-1 Ekim 2016 tarihleri arasında ishal yakınması ile başvuran hastalardan, mikrobiyoloji laboratuvarına kültür içingönderilen 405 gaita örneği çalışılmıştır. Campylobacter üretimi için Modifiye Charcoal Cephoperazone Deoxycholate Agar (mCCDA) ve Skirrowbesiyeri olmak üzere iki farklı besiyeri kullanılmıştır. Üreme görülen kültürlerdeki bakterilere konvansiyonel testler yapılmıştır ve Campylobacterşüpheli olanların Vitek MS ile tanımlaması yapılmıştır.Bulgular: İncelenen 405 dışkı örneğinin dokuzunda Campylobacter (%2,2) türü bakteri üremiştir. Bunların altısı Campylobacter jejuni, diğer üçtanesi ise Campylobacter coli olarak tanımlanmıştır. Elde edilen dokuz izolatın yedisi (%77,8) kan bazlı Skirrow besiyerinde üremiştir. Bu yediizolattan ikisi aynı zamanda kömür bazlı mCCDA besiyerinde de üremiştir. İki izolat (%22,2) ise sadece mCCDA besiyerinde üremiştir. İzole edilendokuz Campylobacter türü izolata EUCAST kılavuzunun önerileri doğrultusunda disk difüzyon yöntemiyle antibiyotik duyarlılığı çalışılmıştır. Testedilen antibiyotikler içinde eritromisin en duyarlı (%77,7), siprofloksasin ise en dirençli (%77,7) olarak bulunmuştur.Sonuç: Besiyeri olarak kan bazlı besiyerinin kömür bazlı besiyerine göre daha iyi üreme sağladığı görülmüştür. Antibiyotiklerden en duyarlı olarakbulunan eritromisin’in ilk tercih olarak kullanılması ve yüksek bulunan kinolon direncinin dikkate alınması gerektiği düşünülmektedir.
Anahtar Kelime:

INVESTIGATION OF GROWTH OF CAMPYLOBACTER SPECIES FROM CLINICAL SPECIMENS AND DETERMINATION OF THEIR ANTIMICROBIAL SUSCEPTIBILITY

Öz:
Objective: Campylobacter species are one of the major causes of systemic infections and diarrhea for humans. In this study we aimed to investigate the proper medium to ensure Campylobacter isolation and to identify the resistance profiles of the isolates by studying antimicrobial susceptibility tests. Methods: In the study 405 stool samples which were sent to the microbiology laboratory from the patients with diarrhea complaint between May 01, and October 01, 2016, had been tested. Two different mediums - Charcoal Cephoperazone Deoxycholate Agar (CCDA) and Skirrow - have been used for Campylobacter isolation. Conventional tests performed on bacteria in isolated cultures and suspected Campylobacter isolates were identified with Vitek MS. Results: Campylobacter spp (2.2%) growth has been detected in nine stool samples among the tested 405. Six of them were identified as Campylobacter jejuni and three as Campylobacter coli. Seven (77.8%) of the nine isolates has been obtained on blood-based Skirrow medium. Two of those seven isolates have been obtained on coal-based CCDA medium, too. Two isolates (22.2%) have been grown only on CCDA medium. Antibiotic susceptibility has been examined by using disc diffusion method in according to the EUCAST criteria, on nine isolated Campylobacter isolates. Erythromycin (77.7%) was most susceptible and ciprofloxacin (77.7%) was found to be most resistant. Conclusion: The blood-based medium provides better growth than coal-based medium. It is thought that erythromycin, which has been found to be most sensitive among the antibiotics, should be used as the first choice and high quinolone resistance should be taken into consideration.
Anahtar Kelime:

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık
  • 1. Hasçelik G. Campylobacter türleri. Topçu AW, Söyletir G, Doğanay M, Ed. İnfeksiyon Hastalıkları ve Mikrobiyolojisi. İstanbul, Nobel Tıp Kitabevleri; 2002:1638-42.
  • 2. Öngen B. Türkiye'de ishal etkenleri. ANKEM Derg. 2006;20(2):122-34.
  • 3. Blaser MJ, Allos BM. Campylobacter jejuni and related species. Mandell GL, Bennet JE, Dolin R, Eds. Principles and Practice of Infectious Diseases. Philadelphia, Elsevier Churchill Livingstone; 2005:2548-2557.
  • 4. Skirrow MB, Blaser MJ. Clinical aspects of Campylobacter infection. Nachamkin I, Blaser MJ, Eds. Campylobacter, (2nd ed.). Washington DC, ASM Pres; 2000:69-88.
  • 5. Crushell E, Harty S, Sharif F, Bourke B. Enteric Campylobacter:purging its secrets? Pediatr Res. 2004;55(1):3-12. doi:10.1203/01.PDR.0000099794.06260.71
  • 6. Jerris RC, Fields PI, Nicholson MA. Fecal culture for Campylobacter and related organisms. Garcia LS, Isenberg HD (Eds). Clinical Microbiology Prosedures Handbook (2nd ed.). Washington DC, ASM Press; 2010:3.8.2.1-3.8.2.16.
  • 7. Fitzgerald C, Nachamkin I. Campylobacter and Arcobacter. Versalovic J, Carroll KC, Funke G, Jorgensen JH, Landry ML, Warnock DW (Eds). Manual of Clinical Microbiology (10th ed.). Washingtojn DC, ASM Press; 2011:885-899.
  • 8. Kaakoush NO, Castaño-Rodríguez N, Mitchell HM, Man SM. Global epidemiology of Campylobacter infection. Clin Microbiol Rev. 2015;28(3):687- 720. doi:10.1128/CMR.00006-15
  • 9. Avcu G, Bal ZS, Saz U, Aydemir Ş, Vardar F. Prevalence of bacterial agents in children with acute gastroenteritis in the pediatric emergency department of Ege University School of Medicine. J Pediatr Inf. 2016;10:49-53. doi:10.5152/ced.2016.2301
  • 10. Kanan B, Akşit F. Akut gastroenteritli olgularda Campylobacter sıklığının araştırılması. İnfek Derg. 2003;17(1):11-14.
  • 11. Öngen B, Nazik H, Kaya I. Rutin dışkı kültürlerinde üretilen Campylobacter türleri ve antimikrobiyal duyarlılıkları: 5 yıllık sonuçların değerlendirilmesi. Ankem Derg. 2007;21(1):37-41.
  • 12. Yazıcı V, Gültekin B, Aydın N, Aral YZ, Aydoğdu A, Karaoğlu AÖ. Akut olguların dışkı örneklerinde bazı bakteri ve virüslerin araştırılması. Ankem Derg. 2009;23:59-65.
  • 13. Yıldız Ç. Mersin ilinde çocukluk çağı gastroenteritlerinde Campylobacter türlerinin görülme sıklığı [Doktora tezi]. Mersin: Mersin Üniversitesi; 2011.
  • 14. On SLW. Identification Methods for Campylobacters, Helicobacters and Related Organisms. Clinical Microbiology Reviews. 1996;9(3):405-422.
  • 15. Piersimioni C, Bornigi AS, Curzi L, De Sio G. Comparison of two selective media and a membrane filter technique for isolation of Campylobacter species from diarrhoeal stools. Eur J Clin Microbiol and Infect Dis. 1995;14:539-542.
  • 16. Engberg J, On SLW, Harrıngton CS, Gerner-Smidt P. Prevalence of Campylobacter, Arcobacter, Helicobacter, and Sutterella spp. in Human Fecal Samples as Estimated by a Reevaluation of Isolation Methods for Campylobacters. J Clin Microbiol. 2000;38(1):286-291.
  • 17. Polat E. Akut ishallerde Campylobacter jejuni ve diğer etyolojik ajanların hızlı tanısında moleküler yöntemlerin değeri [Uzmanlık tezi]. Adana: Çukurova Üniversitesi; 2008.
  • 18. Skirrow MB, Blaser MJ. Clinical aspects of Campylobacter infection. Nachamkin I, Blaser MJ, Eds. Campylobacter (2nd ed.). Washington DC, ASM Press; 2000:69-88.
  • 19. Lindmark H, Harbom B, Thebo L, et al. Genetic characterization and antibiotic resistance of Campylobacter jejuni isolated from meats, water, and humans in Sweden. J Clin Microbiol. 2004;42(2):700–706. doi:10.1128/JCM.42.2.700- 706.2004
  • 20. Taylor DE, Chang N. In vitro susceptibilities of Campylobacter jejuni and Campylobacter coli to azithromycin and erythromycin. Antimicrob Agents Chemother. 1991;35(9):1917-1918.
  • 21. Kuschner RA, Trofa AF, Thomas RJ. Use of azithromycin fort he treatment of Campylobacter enteritis in travelers to Thailand, an area where ciprofloxacin resistance is prevalent. Clin Infect Dis. 1995;21(2):536-541.
  • 22. Gallay A, Prouzet-Mauléon V, Kempf I, et al. Campylobacter antimicrobial drug resistance among humans, broiler chickens, and pigs, France. Emerg Infect Dis. 2007;13(2):259-66. doi:10.3201/eid1302.060587
  • 23. Goodman LJ, Trenholme GM, Kaplan RL, et al. Empiric antimicrobial therapy of domestically acquired acute diarrhea in urban adults. Arch Intern Med. 1990;150(3):541-6. doi:10.1001/archinte.1990.00390150047009
  • 24. Endtz HP, Mouton RP, Van der Reyden T, Ruijs GJ, Biever M, Van Klingeren B. Fluoroquinolone resistance in Campylobacter spp isolated from human stools and poultry products. Lancet. 1990;335:787.
  • 25. European Food Safety Authority; European Centre For Disease Prevention And Control. The European Union Summary Report on antimicrobial resistance in zoonotic and indicator bacteria from humans, animals and food in 2010. EFSA Journal. 2012;10(3):2598.https://ecdc.europa.eu/sites/portal/files/media/en/ publications/Publications/1203-SUR-ECDC-EFSA-report-antimicrobialresistance.pdf
  • 26. Hakanen AJ, Lehtopolku M, Siitonen A, Huovinen P, Kotilainen P. .Multidrug resistance in Campylobacter jejuni strains collected from Finnish patients during 1995-2000. J Antimicrob Chemother. 2003;52(6):1035-9. doi:10.1093/jac/dkg489
  • 27. Moore JE, Crowe M, Heaney N, Crothers E. Antibiotic resistance in Campylobacter spp. isolated from human faeces (1980-2000) and foods (1997- 2000) in Northern Ireland: an update. J Antimicrob Chemother. 2001;48(3):455-7. doi:10.1093/jac/48.3.455
APA BORUCU R, Tanriverdi Çaycı Y, BIRINCI A (2019). KLİNİK ÖRNEKLERDEN CAMPYLOBACTER TÜRLERİNİN ÜRETİLMESİNİN ARAŞTIRILMASI VE ANTİBİYOTİK DUYARLILIKLARININ BELİRLENMESİ. , 15 - 19. 10.30934/kusbed.455330
Chicago BORUCU RECEP,Tanriverdi Çaycı Yeliz,BIRINCI ASUMAN KLİNİK ÖRNEKLERDEN CAMPYLOBACTER TÜRLERİNİN ÜRETİLMESİNİN ARAŞTIRILMASI VE ANTİBİYOTİK DUYARLILIKLARININ BELİRLENMESİ. (2019): 15 - 19. 10.30934/kusbed.455330
MLA BORUCU RECEP,Tanriverdi Çaycı Yeliz,BIRINCI ASUMAN KLİNİK ÖRNEKLERDEN CAMPYLOBACTER TÜRLERİNİN ÜRETİLMESİNİN ARAŞTIRILMASI VE ANTİBİYOTİK DUYARLILIKLARININ BELİRLENMESİ. , 2019, ss.15 - 19. 10.30934/kusbed.455330
AMA BORUCU R,Tanriverdi Çaycı Y,BIRINCI A KLİNİK ÖRNEKLERDEN CAMPYLOBACTER TÜRLERİNİN ÜRETİLMESİNİN ARAŞTIRILMASI VE ANTİBİYOTİK DUYARLILIKLARININ BELİRLENMESİ. . 2019; 15 - 19. 10.30934/kusbed.455330
Vancouver BORUCU R,Tanriverdi Çaycı Y,BIRINCI A KLİNİK ÖRNEKLERDEN CAMPYLOBACTER TÜRLERİNİN ÜRETİLMESİNİN ARAŞTIRILMASI VE ANTİBİYOTİK DUYARLILIKLARININ BELİRLENMESİ. . 2019; 15 - 19. 10.30934/kusbed.455330
IEEE BORUCU R,Tanriverdi Çaycı Y,BIRINCI A "KLİNİK ÖRNEKLERDEN CAMPYLOBACTER TÜRLERİNİN ÜRETİLMESİNİN ARAŞTIRILMASI VE ANTİBİYOTİK DUYARLILIKLARININ BELİRLENMESİ." , ss.15 - 19, 2019. 10.30934/kusbed.455330
ISNAD BORUCU, RECEP vd. "KLİNİK ÖRNEKLERDEN CAMPYLOBACTER TÜRLERİNİN ÜRETİLMESİNİN ARAŞTIRILMASI VE ANTİBİYOTİK DUYARLILIKLARININ BELİRLENMESİ". (2019), 15-19. https://doi.org/10.30934/kusbed.455330
APA BORUCU R, Tanriverdi Çaycı Y, BIRINCI A (2019). KLİNİK ÖRNEKLERDEN CAMPYLOBACTER TÜRLERİNİN ÜRETİLMESİNİN ARAŞTIRILMASI VE ANTİBİYOTİK DUYARLILIKLARININ BELİRLENMESİ. Kocaeli Üniversitesi Sağlık Bilimleri Dergisi, 5(1), 15 - 19. 10.30934/kusbed.455330
Chicago BORUCU RECEP,Tanriverdi Çaycı Yeliz,BIRINCI ASUMAN KLİNİK ÖRNEKLERDEN CAMPYLOBACTER TÜRLERİNİN ÜRETİLMESİNİN ARAŞTIRILMASI VE ANTİBİYOTİK DUYARLILIKLARININ BELİRLENMESİ. Kocaeli Üniversitesi Sağlık Bilimleri Dergisi 5, no.1 (2019): 15 - 19. 10.30934/kusbed.455330
MLA BORUCU RECEP,Tanriverdi Çaycı Yeliz,BIRINCI ASUMAN KLİNİK ÖRNEKLERDEN CAMPYLOBACTER TÜRLERİNİN ÜRETİLMESİNİN ARAŞTIRILMASI VE ANTİBİYOTİK DUYARLILIKLARININ BELİRLENMESİ. Kocaeli Üniversitesi Sağlık Bilimleri Dergisi, vol.5, no.1, 2019, ss.15 - 19. 10.30934/kusbed.455330
AMA BORUCU R,Tanriverdi Çaycı Y,BIRINCI A KLİNİK ÖRNEKLERDEN CAMPYLOBACTER TÜRLERİNİN ÜRETİLMESİNİN ARAŞTIRILMASI VE ANTİBİYOTİK DUYARLILIKLARININ BELİRLENMESİ. Kocaeli Üniversitesi Sağlık Bilimleri Dergisi. 2019; 5(1): 15 - 19. 10.30934/kusbed.455330
Vancouver BORUCU R,Tanriverdi Çaycı Y,BIRINCI A KLİNİK ÖRNEKLERDEN CAMPYLOBACTER TÜRLERİNİN ÜRETİLMESİNİN ARAŞTIRILMASI VE ANTİBİYOTİK DUYARLILIKLARININ BELİRLENMESİ. Kocaeli Üniversitesi Sağlık Bilimleri Dergisi. 2019; 5(1): 15 - 19. 10.30934/kusbed.455330
IEEE BORUCU R,Tanriverdi Çaycı Y,BIRINCI A "KLİNİK ÖRNEKLERDEN CAMPYLOBACTER TÜRLERİNİN ÜRETİLMESİNİN ARAŞTIRILMASI VE ANTİBİYOTİK DUYARLILIKLARININ BELİRLENMESİ." Kocaeli Üniversitesi Sağlık Bilimleri Dergisi, 5, ss.15 - 19, 2019. 10.30934/kusbed.455330
ISNAD BORUCU, RECEP vd. "KLİNİK ÖRNEKLERDEN CAMPYLOBACTER TÜRLERİNİN ÜRETİLMESİNİN ARAŞTIRILMASI VE ANTİBİYOTİK DUYARLILIKLARININ BELİRLENMESİ". Kocaeli Üniversitesi Sağlık Bilimleri Dergisi 5/1 (2019), 15-19. https://doi.org/10.30934/kusbed.455330
Sayfa Oluşturulma Tarihi
17-04-2024 18:17

İLETİŞİM

TÜBİTAK ULAKBİM TR Dizin

Yüzüncüyıl, İşçi Blokları Mahallesi

Muhsin Yazıcıoğlu Caddesi No:51/C

06530 Çankaya / ANKARA +90 (312) 298 92 00

trdizin@tubitak.gov.tr

TÜBİTAK ULAKBİM Ulusal Akademik Ağ ve Bilgi Merkezi Cahit Arf Bilgi Merkezi © Tüm Hakları Saklıdır. Gizlilik Politikası Kullanım Şartları