KOAGÜLAZ-NEGATİF STAPHYLOCOCCUS (KNS) VE MACROCOCCUS CASEOLYTICUS SUŞLARININ BİYOFİLM OLUŞTURMA ÖZELLİKLERİNİN VE ADEZYON FAKTÖRLERİNİN ARAŞTIRILMASI

Gaye Asuman Yerli, (Süleyman Demirel Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, Gıda Mühendisliği Bölümü, Isparta, Türkiye)
Banu Özden Tuncer (Süleyman Demirel Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, Gıda Mühendisliği Bölümü, Isparta, Türkiye)
GIDA
15 1
Yıl: 2021 Cilt: 46 Sayı: 3 Sayfa Aralığı: 500 - 514 Metin Dili: Türkçe DOI: 10.15237/gida.GD20099 İndeks Tarihi: 03-06-2021

KOAGÜLAZ-NEGATİF STAPHYLOCOCCUS (KNS) VE MACROCOCCUS CASEOLYTICUS SUŞLARININ BİYOFİLM OLUŞTURMA ÖZELLİKLERİNİN VE ADEZYON FAKTÖRLERİNİN ARAŞTIRILMASI

Öz:
Bu çalışmada geleneksel fermente Türk sucuklarından izole edilmiş toplam 50 adet koagulaz-negatifStaphylococcus (KNS) ve 10 adet Macrococcus caseolyticus suşlarının biyofilm oluşturma özellikleri fenotipik olarakbelirlenmiş ve aynı zamanda suşlarda biyofilm oluşumu ile ilişkili genler ve adezyon genlerinin varlığımultipleks polimeraz zincir reaksiyonu (mPZR) ile araştırılmıştır. Fenotipik olarak slaym (slime) üretimiCongo Red agar (CRA), biyofilm üretim düzeyi mikrotitre plaka yöntemi ile belirlenmiştir. CRA besiyerindeslaym üreticisi olduğu belirlenen 33 suşun tamamının mikrotitre plaka yöntemi ile biyofilm üreticisi olduğutespit edilmiştir. KNS ve M. caseolyticus suşlarının 28’inin orta, 23’ünün zayıf ve 1’nin güçlü biyofilm üreticisiolduğu saptanmıştır. Sekiz suşta ise biyofilm üretiminin olmadığı tespit edilmiştir. mPZR denemeleri sonucubiyofilm üreticisi olduğu belirlenen KNS ve M. caseolyticus suşlarının %84.62’sinin araştırılan genlerden en azbirini içerdiği bulunmuştur. Suşların %66.67’sinde eno geni, %15.67’sinde icaA geni varlığı belirlenmiştir.Diğer taraftan biyofilm üreticisi olduğu belirlenen 8 suşun ise çalışma kapsamında araştırılan biyofilmgenlerinin hiçbirini içermediği tespit edilmiştir.
Anahtar Kelime:

INVESTIGATION OF BIOFILM FORMATION PROPERTIES AND ADHESION FACTORS OF COAGULASE-NEGATIVE STAPHYLOCOCCUS AND MACROCOCCUS CASEOLYTICUS STRAINS

Öz:
In this study, biofilm forming properties of 50 coagulase-negative Staphylococcus (CNS) and 10 Macrococcus caseolyticus strains isolated from traditional fermented Turkish sausages (sucuk) werephenotypically determined and also the presence of genes associated with biofilm formation and adhesion genes in the strains was investigated by multiplex polymerase chain reaction (mPZR). Slime production was determined on Congo Red agar (CRA) by phenotypically and biofilm production level was determined by microtiter plate method. All 33 strains determined to be slime producers in CRA medium were determined to be biofilm producers by microtiter plate method. It has been determined that 28 of KNS and M. caseolyticus strains are medium, 23 are weak and 1 is strong biofilm producers. Biofilm production was not detected in eight strains. As a result of mPZR experiments, 84.62 % of CNS and M. caseolyticus strains determined to be biofilm producers were found to be contain at least one of the genes investigated. eno gene was detected in 66.67% of the strains and the presence of icaA gene in 15.67% of the strains. On the other hand, it was determined that 8 strains determined to be biofilm producers do not contain any of the biofilm genes investigated within the scope of the study.
Anahtar Kelime:

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık
  • Atshan, S.S., Shamsudin, M.N., Sekawi, Z., Lung, L.T.T., Hamat, R.A., Karunanidhi, A., Ali., A.M., Ghaznavi-Rad, E., Ghasemzadeh-Moghaddam, H., Seng, J.S.C., Nathan, J.J., Pei, C.P. (2012). Prevalence of adhesion and regulation of biofilmrelated genes in different clones of Staphylococcus aureus. J Biomed Biotechnol, 976-972.
  • Azara, E., Longheu, C., Sanna, G., Tola, S. 2017. Biofilm formation and virulence factor analysis of Staphylococcus aureus isolates collected from ovine mastitis. J Appl Microbiol, 123: 372-379.
  • Brooks, J.D. and Flint, S.H. (2008). Biofilms in the food industry: problems and potential solutions. Int J Food Sci Technol, 43: 2163–2176.
  • Busconi, M., Zacconi, C., Scolari, G. (2014). Bacterial ecology of PDO copa and pancetta piancentina at the end of ripening and after MAP storage of sliced product. Int J Food Microbiol, 172: 13-20.
  • Cancilla, M.R., Powell, L.B., Hillier, A.J., Davidson, B.E. (1992). Rapid genomic fingerprinting of Lactococcus lactis strains by arbitrarily primed polymerase chain reaction with 32P and fluorescent labels. Appl Environ Microbiol, 58: 1772-1775.
  • Cramton, S.E., Gerke, C., Schnell, N.F., Nichols, W.W., Götz, F. (1999). The intercellular adhesion (ica) locus is present in Staphylococcus aureus and is required for biofilm formation. Infec Immun, 5427- 5433.
  • Cucarella, C., Solano, C., Valle, J., Amorena, B., Lasa, I., Penadés, J.R. (2001) Bap, a Staphylococcus aureus surface protein involved in biofilm formation Staphylococcus aureus surface protein involved in biofilm formation. Microbiology, 183: 2888-2896.
  • Darwish, S.F., Asfour, H.A.E. (2013). Investigation of biofilm forming ability in staphylococci causing bovine mastitis using phenotypic and genotypic assays. Sci World J, 378- 492.
  • Freeman D.J., Falkiner F.R., Keane C.T. (1989). New method for detecting slime production by coagulase-negative staphylococci. J Clinic Path, 42: 872-874.
  • Gajewska, J. Chajęcka-Wierzckowska, W. (2020). Biofilm formation ability and presence of adhesion genes among coagulase-negative and coagulase-positive staphylococci isolates from raw cow’s milk. Pathogens, 9:654.
  • Geniş, B., Tuncer, Y. (2018). Determination of antibiotic susceptibility and decarboxylase activity of coagulase-negative Staphylococcus and Macrococcus caseolyticus strains isolated from fermented Turkish sausage (Sucuk). J Food Proces and Preserv, 42: e13329.
  • Götz, F. (2002). Staphylococcus and biofilms. Mol Microbiol, 43(6): 1367-1378.
  • Kaban, G., Kaya, M. (2008). Identification of lactic acid bacteria and Gram-positive catalasepositive cocci isolated from naturally fermented sausage (Sucuk). J Food Sci, 73: 385-388.
  • Kesmen, Z., Yarimcan, B., Aslan, H., Yetim, H. (2014). Application of different molecular techniques for charavterization of catalasepositive cocci isolated from sucuk. J Food Sci, 79 (2): 222-228.
  • Khoramian, B., Jabalameli, F., Niasari-Naslaji, A., Taherikalani, M., Emaneini, M. (2015). Comparison of virulence factors and biofilm formation among Staphylococcus aureus strains isolated from human and bovine infections. Microbial Patho, 88: 73-77.
  • Kloos, W.E., Bannerman, T.L. (1994). Update on clinical significance of coagulase- negative 573 staphylococci. Clin Microbiol Rev, 7: 117-140
  • Kong, C., Chee, C.F., Richter, K., Thomas, N., Rahman, N.A., Nathan, S. (2018). Suppression of Staphylococcus aureus biofilm formation and virulence by a benzimidazole derivative, UMC162. Sci. Rep, 8: 1-16.
  • Leroy, F., Giammarino, P., Chacornac, J.P., Lebert, I., Talon, R. (2010). Biodiversity of indigenous staphylococci of naturally fermented dry sausages and manufacturing environments of small scale processing units. Food Microbiol, 27 (2): 294-301.
  • Los R., Sawicki R., Juda M., Stankevic M., Rybojad P., Sawicki M., Malm A., Ginalska G., (2010). A comparative analysis of phenotypic and genotypic methods for the determination of the biofilm-forming abilities of Staphylococcus epidermidis. FEMS Microbiol Lett, 310: 97-103.
  • Melo, P.D.C., Ferreira, L.M., Filho, A.N., Zafalon, L.F., Vicente, H.I.G., de Souza, V. (2013). Comparison of methods for the detection of biofilm formation by Staphylococcus aureus isolated from bovine subclinical mastitis. Braz J Microbiol, 44, 119–124.
  • Mariana, N. S., Salman S. A., Neela V., Zamberi, S. (2009). Evaluation of modified Congo red agar for detection of biofilm produced by clinical isolated of meticillin-resistance Staphylococcus aureus. African J Microbiol Res, 3(6): 330-338.
  • Oliveira, M., Bexiga, R., Nunes, S.F., Carneiro, C., Cavaco, L.M., Bernardo, F., Vilela, C.L. (2006). Biofilm-forming ability profiling of Staphylococcus aureus and Staphylococcus epidermidis mastitis isolates. Vet Microbiol, 118, 133–140.
  • Oniciuc, E.A., Cerca, N., Nicolau, A.I. (2016). Compositional analysis of biofilms formed by Staphylococcus aureus isolated from food sources. Front Microbiol, 7: 390.
  • Piette, A., Verschraegen, G. (2009) Role of coagulase-negative staphylococci in human disease. Vet Microbiol, 134 (1-2): 45.
  • Planchon, S., Gaillard-Martinie, B., Leroy, S., Bellon-Fontaine, M.N., Fadda, S., Talona, R. (2007) Surface properties and behaviour on abiotic surfaces of Staphylococcus carnosus, a genetically homogeneous species. Food Microbiol, 24: 44-51.
  • Ramos, G.L.P.A., Vigoder, H.C., Nascimento, J.S. (2021). Technological applications of Macrococcus caseolyticus and its impact on food safety. Curr Microbiol, 78: 11-16.
  • Rogers, K. L., Fey, P. D., Rupp, M. E. (2009). Coagulase-negative staphylococcal infections. Infect Dis Clin N Am, 23: 73-98.
  • Schlegelova J., Babak V., Holasova M., Konstantinova L., Necidova L., Šišak F., Vlkova H., Roubal P., Jaglic Z. (2010). Microbial contamination after sanitation of food contact surfaces in dairy and meat processing plants. Czech J Food Sci, 28: 450–461.
  • Seo, Y.S., Lee, D.Y., Rayamahji, N., Kang, M.L., Yoo, H.S. (2008). Biofilm-forming associated genotypic and phenotypic characteristic of Staphylococcus spp. isolated from animals and air. Research in Vet Microbiol, 92: 179-185.
  • Simojoki, H., Hyvönen, P., Plumed Ferrer, C., Taponen, S., Pyörala, S. (2012). Is the biofilm formation and slime producing ability of coagulase-negative staphylococci associated with the persistence and severity of intramammary infection? Vet Res, 158: 344-352.
  • Srednik, M.E., Tremblay, Y.D.N., Labrie, J., Archambault, M., Jacques, M., Cirelli, A.F., Gentilini, E.R. (2017). Biofilm formation and antimicrobial resistance genes of coagulasenegative staphylococci isolated from cows with mastitis in Argentina. FEMS Microbiol Lett, 364: 1- 8.
  • Stepanović, S., Vuković, D., Hola, V., Bonaventura, G.D., Djukić, S., Ćircović, I., Ruzicka, F. (2007). Quantification of biofilm in microtiter plates. Apmis, 115: 891-899.
  • Szweda P., Schielmann M., Milewski S., Frankowska A., Jalcubezak A. (2012). Biofilm production and presence of ica and bap genes in Staphylococcus aureus strains isolated from cows with mastitis in eastern Poland. Pol J Microbiol. 61: 65-9.
  • Şahin. R. (2007). Staphylococcus aureus suşlarında biofilm üretimi, biofilm pozitif ve negatif suşların genotipik ve fenotipik karakterlerinin karşılaştırılması, Pamukkale Üniveritesi Tıp Fakültesi Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Denizli.
  • Talon, R., Leroy, S. (2011). Diversity and Safety Hazards of Bacteria Involved in Meat Fermentations. Meat Science, 89, 303–309.
  • Toledo Arana, A., Valle, J., Solano, C., Arrizubieta, M.J., Cucarella, C., Lamata, M., Amorena, B., Leiva, J., Penades, J.R., Lasa, I. (2001). The enterococcal surface protein, Esp, is involved in Enterococcus faecalis biofilm formation. Appl Environ Microbiol, 67: 4538-4545.
  • Vasudevan, P., Nair M.K.M., Annamalai, T., Venkitanarayanan, K.S. (2003). Phenotypic and genotypic characterization of bovine mastitis isolates of Staphylococcus aureus for biofilm formation. Vet Microbiol, 92: 179-185.
  • Vautor E, Abadie G, Pont A, Thiery R. (2008) Evaluation of the presence of the bap gene in Staphylococcus aureus isolates recovered from human and animals species. Vet Microbiol, 127:407-11.
  • Yüksekdağ, Z.N., Baltacı, N. (2013). Staphylococcus aureus türlerinde biyofilm ve biyofilm oluşumundan sorumlu genler. Türk Mikrobiyol Cem Derg, 43(3): 77-83.
  • Zhou, S., Chao, X., Fei, M., Dai, Y., Liu, B. (2013). Analysis of S. epidermidis icaA and ica D genes by polymerase chain Reaction and slime production: a case control study, BMC Infec Dis, 13: 242.
APA Yerli G, ÖZDEN TUNCER B (2021). KOAGÜLAZ-NEGATİF STAPHYLOCOCCUS (KNS) VE MACROCOCCUS CASEOLYTICUS SUŞLARININ BİYOFİLM OLUŞTURMA ÖZELLİKLERİNİN VE ADEZYON FAKTÖRLERİNİN ARAŞTIRILMASI. , 500 - 514. 10.15237/gida.GD20099
Chicago Yerli Gaye Asuman,ÖZDEN TUNCER Banu KOAGÜLAZ-NEGATİF STAPHYLOCOCCUS (KNS) VE MACROCOCCUS CASEOLYTICUS SUŞLARININ BİYOFİLM OLUŞTURMA ÖZELLİKLERİNİN VE ADEZYON FAKTÖRLERİNİN ARAŞTIRILMASI. (2021): 500 - 514. 10.15237/gida.GD20099
MLA Yerli Gaye Asuman,ÖZDEN TUNCER Banu KOAGÜLAZ-NEGATİF STAPHYLOCOCCUS (KNS) VE MACROCOCCUS CASEOLYTICUS SUŞLARININ BİYOFİLM OLUŞTURMA ÖZELLİKLERİNİN VE ADEZYON FAKTÖRLERİNİN ARAŞTIRILMASI. , 2021, ss.500 - 514. 10.15237/gida.GD20099
AMA Yerli G,ÖZDEN TUNCER B KOAGÜLAZ-NEGATİF STAPHYLOCOCCUS (KNS) VE MACROCOCCUS CASEOLYTICUS SUŞLARININ BİYOFİLM OLUŞTURMA ÖZELLİKLERİNİN VE ADEZYON FAKTÖRLERİNİN ARAŞTIRILMASI. . 2021; 500 - 514. 10.15237/gida.GD20099
Vancouver Yerli G,ÖZDEN TUNCER B KOAGÜLAZ-NEGATİF STAPHYLOCOCCUS (KNS) VE MACROCOCCUS CASEOLYTICUS SUŞLARININ BİYOFİLM OLUŞTURMA ÖZELLİKLERİNİN VE ADEZYON FAKTÖRLERİNİN ARAŞTIRILMASI. . 2021; 500 - 514. 10.15237/gida.GD20099
IEEE Yerli G,ÖZDEN TUNCER B "KOAGÜLAZ-NEGATİF STAPHYLOCOCCUS (KNS) VE MACROCOCCUS CASEOLYTICUS SUŞLARININ BİYOFİLM OLUŞTURMA ÖZELLİKLERİNİN VE ADEZYON FAKTÖRLERİNİN ARAŞTIRILMASI." , ss.500 - 514, 2021. 10.15237/gida.GD20099
ISNAD Yerli, Gaye Asuman - ÖZDEN TUNCER, Banu. "KOAGÜLAZ-NEGATİF STAPHYLOCOCCUS (KNS) VE MACROCOCCUS CASEOLYTICUS SUŞLARININ BİYOFİLM OLUŞTURMA ÖZELLİKLERİNİN VE ADEZYON FAKTÖRLERİNİN ARAŞTIRILMASI". (2021), 500-514. https://doi.org/10.15237/gida.GD20099
APA Yerli G, ÖZDEN TUNCER B (2021). KOAGÜLAZ-NEGATİF STAPHYLOCOCCUS (KNS) VE MACROCOCCUS CASEOLYTICUS SUŞLARININ BİYOFİLM OLUŞTURMA ÖZELLİKLERİNİN VE ADEZYON FAKTÖRLERİNİN ARAŞTIRILMASI. GIDA, 46(3), 500 - 514. 10.15237/gida.GD20099
Chicago Yerli Gaye Asuman,ÖZDEN TUNCER Banu KOAGÜLAZ-NEGATİF STAPHYLOCOCCUS (KNS) VE MACROCOCCUS CASEOLYTICUS SUŞLARININ BİYOFİLM OLUŞTURMA ÖZELLİKLERİNİN VE ADEZYON FAKTÖRLERİNİN ARAŞTIRILMASI. GIDA 46, no.3 (2021): 500 - 514. 10.15237/gida.GD20099
MLA Yerli Gaye Asuman,ÖZDEN TUNCER Banu KOAGÜLAZ-NEGATİF STAPHYLOCOCCUS (KNS) VE MACROCOCCUS CASEOLYTICUS SUŞLARININ BİYOFİLM OLUŞTURMA ÖZELLİKLERİNİN VE ADEZYON FAKTÖRLERİNİN ARAŞTIRILMASI. GIDA, vol.46, no.3, 2021, ss.500 - 514. 10.15237/gida.GD20099
AMA Yerli G,ÖZDEN TUNCER B KOAGÜLAZ-NEGATİF STAPHYLOCOCCUS (KNS) VE MACROCOCCUS CASEOLYTICUS SUŞLARININ BİYOFİLM OLUŞTURMA ÖZELLİKLERİNİN VE ADEZYON FAKTÖRLERİNİN ARAŞTIRILMASI. GIDA. 2021; 46(3): 500 - 514. 10.15237/gida.GD20099
Vancouver Yerli G,ÖZDEN TUNCER B KOAGÜLAZ-NEGATİF STAPHYLOCOCCUS (KNS) VE MACROCOCCUS CASEOLYTICUS SUŞLARININ BİYOFİLM OLUŞTURMA ÖZELLİKLERİNİN VE ADEZYON FAKTÖRLERİNİN ARAŞTIRILMASI. GIDA. 2021; 46(3): 500 - 514. 10.15237/gida.GD20099
IEEE Yerli G,ÖZDEN TUNCER B "KOAGÜLAZ-NEGATİF STAPHYLOCOCCUS (KNS) VE MACROCOCCUS CASEOLYTICUS SUŞLARININ BİYOFİLM OLUŞTURMA ÖZELLİKLERİNİN VE ADEZYON FAKTÖRLERİNİN ARAŞTIRILMASI." GIDA, 46, ss.500 - 514, 2021. 10.15237/gida.GD20099
ISNAD Yerli, Gaye Asuman - ÖZDEN TUNCER, Banu. "KOAGÜLAZ-NEGATİF STAPHYLOCOCCUS (KNS) VE MACROCOCCUS CASEOLYTICUS SUŞLARININ BİYOFİLM OLUŞTURMA ÖZELLİKLERİNİN VE ADEZYON FAKTÖRLERİNİN ARAŞTIRILMASI". GIDA 46/3 (2021), 500-514. https://doi.org/10.15237/gida.GD20099
Sayfa Oluşturulma Tarihi
23-04-2024 18:1

İLETİŞİM

TÜBİTAK ULAKBİM TR Dizin

Yüzüncüyıl, İşçi Blokları Mahallesi

Muhsin Yazıcıoğlu Caddesi No:51/C

06530 Çankaya / ANKARA +90 (312) 298 92 00

trdizin@tubitak.gov.tr

TÜBİTAK ULAKBİM Ulusal Akademik Ağ ve Bilgi Merkezi Cahit Arf Bilgi Merkezi © Tüm Hakları Saklıdır. Gizlilik Politikası Kullanım Şartları