Yıl: 2020 Cilt: 25 Sayı: 4 Sayfa Aralığı: 506 - 515 Metin Dili: Türkçe DOI: 10.5578/flora.69469 İndeks Tarihi: 11-05-2021

Anaerop İnfeksiyon Saptanan Vakaların Klinik Özellikleri, Etkenlerin Tür Düzeyinde Dağılımı ve Anaerop Bakteremilerde Fatalite

Öz:
Giriş: Bu çalışmada infeksiyon etkeni olan anaerop bakterilerin tür düzeyinde dağılımlarının belirlenmesi, vakaların epidemiyolojik, klinik özelliklerinin incelenmesi ve anaerop bakteriyemi olgularında fatalitenin değerlendirilmesi amaçlandı.Materyal ve Metod: Çalışmaya, Ankara Numune Eğitim ve Araştırma Hastanesi Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarında, Ocak 2014-Şubat 2018 tarihleri arasında izole edilen anaerop bakterilerden klinik olarak etken kabul edilen 148 izolatın elde edilmiş olduğu klinik örnek gönderilen125 vaka dahil edildi. Anaerop değerlendirme istenen ve anaerop ekime uygun koşullarda laboratuvara gönderilen örneklerden Gram boyama hazırlanıp Schaedler agara ekim yapıldı. Uygun inkübasyondan sonra izole edilen anaerop bakterilerin tür düzeyindeki tanımlanması matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight (MALDI-TOF MS) cihazı kullanılarak gerçekleştirildi.Bulgular: Anaerop infeksiyonu olan 125 vakanın %60’ı erkek olup yaş ortalaması 52.7 ± 18.5 idi. İntraabdominal ve deri yumuşak doku infeksiyonu en sık infeksiyon kaynağıydı. Vakalardan gönderilen 128 klinik örnekte (78 apse, 50 kan kültürü) 148 anaerop bakteri tanımlandığı belirlendi. İzole edilen etkenler tür düzeyinde incelendiğinde en sık Bacteriodes spp., Actinomyces spp. ve Clostridium spp. türlerinin olduğu görüldü. Anaerop bakteremisi olan 50 vakanın kan kültürlerinden izole edilen en sık anaerop etkenler Bacteroides spp., Clostridium spp. olup intraabdominal infeksiyonlar en sık bakteremi kaynağıydı. Fusobacterium bakteremisinde en sık rastlanan tür Fusobacterium nucleatumdu (5/6; %83.3). F. nucleatum bakteremisi olan vakaların yaşlı olduğu ve sıklıkla malignitenin eşlik ettiği, Fusobacterium necrophorumda izole edilen vakanın genç oduğu, komorbiditesi olmadığı ve Lemiere sendromu tanısı aldığı gözlendi. Anaerop bakteremide fatalite %51 saptandı. Yoğun bakım ünitesinde takipli olan ve Charlson indeksi yüksek olan vakalarda fatalite anlamlı olarak daha yüksek belirlendi (p< 0.05).Sonuç: MALDI-TOF MS, çok kısa sürede verdiği güvenilir sonuçlarla anaerop bakterilerin tanımlanmasında önemli bir yöntem haline gelmiştir. Çalışmamızda en sık anaerop etkenin Bacteroides spp. olduğu, en sık infeksiyon odağının ise intraabdominal ve deri yumuşak doku infeksiyonu olduğu belirlendi. F. nucleatum bakteriyemisi olan vakaların yaşlı ve çoğunda malignite olduğu, F. necrophorumda izole edilen vakanın ise genç ve komorbiditesi olmadığı gözlendi. Çalışmamızda anaerop bakteremide fatalite (%51) yüksek belirlendi. Bu nedenle anaerop bakteremisi olan vakaların tanımlanması ve etkin tedavi verilebilmesi için anaerobik kan kültürü şişelerinin rutin kullanımının önemli olduğu düşünüldü.
Anahtar Kelime:

Clinical Features of Cases with Anaerobic Infection, Distribution of Anaerobic Bacteria and Fatality in Anaerobic Bacteremia

Öz:
Introduction: This study aimed to determine the distribution of anaerobic bacteria species, which are the causative agents of infection, in order to investigate the epidemiological and clinical characteristics of the cases and evaluate fatality in cases with an aerobic bacteremia. Materials and Methods: One hundred and twenty-five cases who were determined with 148 isolates of anaerobic bacteria were included into this study at Ankara Numune Training and Research Hospital Medical Microbiology Laboratory between January 2014-February 2018. The specimens requested to undergo anaerobic evaluation and transported to the laboratory under anaerobic suitable conditions were prepared with Gram staining and inoculated in the Schaedler agar. After appropriate incubation, the identification of isolated anaerobic bacteria at the level of species was performed by using matrix-assisted laser desorption time-of-flight (MALDI-TOF MS). Results: Of the 125 cases who had an anaerobic infection, 60% were males, and mean age was 52.69 ± 18.5 years. Intra-abdominal and skin and soft tissue infections were the most common source of infection. One hundred and twenty-eight clinical specimens (78 abscesses, 50 blood cultures) which were sent from cases were identified with 148 anaerobic bacteria species. We detected the most common isolated species as Bacteriodes spp., Actinomyces spp. and Clostridium spp., respectively. The most common anaerobic bacteria species isolated from blood cultures of 50 cases with anaerobic bacteremia were Bacteroides spp., Clostridium spp., and intra-abdominal infection was the most common source for anaerobic bacteremia. Fusobacterium nucleatum (5/6; 83.3%) was the most frequent species in Fusobacterium bacteremia. F. nucleatum bacteremia was detected in an older population and was often associated with underlying malignancy. F. necrophorum bacteremia occurred in a younger population without underlying comorbidities and was diagnosed as Lemierre’s syndrome. Fatality rate was 51% in anaerobic bacteremia. Fatality was significantly higher in patients who were followed up in the intensive care unit and had high Charlson index (p< 0.05). Conclusion: MALDI-TOF MS has become an important method for the identification of anaerobic bacteria with its reliable results in a very short time. The most common anaerobic microorganism was Bacteroides spp., and the two most frequent sources of infection were intraabdominal and skin and soft tissue infections. We observed that most of the cases with F. nucleatum bacteremia had malignancy and an older population. The case with F. necrophorum bacteremia was young and had no underlying comorbidities. In this study, fatality rate (51%) was detected high in anaerobic bacteremia. Therefore, the routine use of anaerobic blood culture bottles is important for the identification and for the effective treatment of cases with anaerobic bacteremia.
Anahtar Kelime:

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık
  • 1. Tunçkanat F. Anaerop bakteriler: Genel özellikler. In: Topçu AW, Söyletir G, Doğanay M. (eds). İnfeksiyon Hastalıkları ve Mikrobiyolojisi. 4. Baskı. İstanbul, Nobel Tıp Kitabevleri, 2017:2036-45.
  • 2. Cohen-Paradosu R, Kasper DL. Anaerobic infections: General concepts. In: Bennett JE, Dolin R, Blaser MJ (eds). Mandell, Douglas and Bennett’s Principles and Practice of Infectious Diseases. 8. edition. Philadelphia; Elsevier Saunders, 2015:2736-43.
  • 3. Demir C, Keşli R. Çeşitli klinik örneklerden izole edilen Gram negatif anaerop basillerin tiplendirilmesi ve antibiyotik direnç profillerinin E-Test yöntemi ile belirlenmesi. Mikrobiyol Bul 2018;52(1):72-9.
  • 4. Salonen JH, Eerola E, Meurman O. Clinical significance and outcome of anaerobic bacteremia. Clin Infect Dis 1998;26:1413-7.
  • 5. Nutritional anaemias. Report of a WHO scientific group. World Health Organ Tech Rep Ser 1968;405:5.
  • 6. Robert R, Deraignac A, Le Moal G, Ragot S, Grollier G. Prognostic factors and impact of antibiotherapy in 117 cases of anaerobic bacteremia. Eur J Clin Microbiol Infect Dis 2008;27:671-8.
  • 7. Naidoo S, Perovic O, Richards GA, Duse AG. Clinically significant anaerobic bacteria isolated from patients in a South African academic hospital: Antimicrobial susceptibility testing. S Afr Med J 2011;101:732-4.
  • 8. Doğan M, Baysal B. Çeşitli klinik örneklerden izole edilen anaerop bakterilerin tanımlanması ve antibiyotik duyarlılıklarının belirlenmesi. Mikrobiyol Bul 2010;44(2):211-9.
  • 9. Uysal EB, Çelik C, Alan Ç, Kaya H, Gözel MG, Bakıcı MZ. Klinik örneklerden izole edilen anaerobik bakteriler: Yedi yıllık değerlendirme. Cumhuriyet Tıp Derg 2014;36:327-31.
  • 10. Ercis S, Tunçkanat F, Hasçelik G. Anaerobik infeksiyon şüpheli hastalardan izole edilen anaerob bakteriler, Mikrobiyol Bült 2005;39:447-54.
  • 11. Kiremitçi A, Türkkan AA, Akgün Y, Durmaz G, Kaşifoğlu N. Klinik örneklerden anaerob bakterilerin soyutlanması ve antibiyotik duyarlılıklarının belirlenmesi. Ankem Derg 2008;22:132-44.
  • 12. Papaparaskevas J, Katsandri A, Pantazatou A, Stefanou I, Avlamis A, Legakis NJ, et al. Epidemiological characteristics of infections caused by Bacteroides, Prevotella and Fusobacterium species: A prospective observational study. Anaerobe 2011;15:113-7.
  • 13. Goldstein EJC, Snydman DR. Intra-abdominal infections: review of the bacteriology, antimicrobial susceptibility and the role of ertapenem in their therapy. J Antimicrob Chemother 2004;53(Suppl.):29-36.
  • 14. Le Moal G, Landron C, Grollier G, Bataille B, Roblot F, Nassans P, et al. Characteristics of brain abscess with isolation of anaerobic bacteria. Scand J Infect Dis 2003;35:318-21.
  • 15. Nagy E, Maier T, Urban E, Terhes G, Kostrzewa M. and on behalf of the ESCMID Study Group on Antimicrobial Resistance in Anaerobic Bacteria. Species identification of clinical isolates of Bacteroides by matrix-assistedlaser-desorption/ ionization time-of-flights mass spectrometry. Clin Microbiol Infect 2009;15:796-802.
  • 16. Culebras E, Rodriguez-Avial I, Betriu C, Gomez M, Picazo JJ. Rapid identification of clinical isolates of Bacteroides species by matrix-assisted laser-desorption time-of-flight mass spectrometry. Anaerobe 2012;18:163-5.
  • 17. Kornowski R, Schwartz D, Averbuch M, Levo Y, Berger S, Giladi M. Anaerobic bacteremia: a retrospective four-year. Analysis in general medicine and cancer patients. Infection 1993;21:241–4.
  • 18. Umemura T, Hamada Y, Yamagishi Y, Suematsu H, Mikamo H. Clinical characteristics associated with mortality of patients with anaerobic bacteremia. Anaerobe 2016;39:45- 50.
  • 19. Blairon L, De Gheldre Y, Delaere B, Sonet A, Bosly A, Glupczynski Y. A 62-month retrospective epidemiological survey of anaerobic bacteraemia in a university hospital. Clin Microbiol Infect 2006;12:527-32.
  • 20. Lassman B, Gustafson DR, Wood C, Rosenblatt JE. Reemergence of anaerobic bacteremia. Clin Infect Dis 2007;44:895-900.
  • 21. Zahar JR, Farhat H, Chachaty E, Meshaka P, Antoun S, Nitenberg G. Incidence and clinical significance of anaerobic bacteraemia in cancer patients: a 6-year retrospective study. Clin Microbiol Infect 2005;11:724–9.
  • 22. Keukeleire S, Wybo I, Naessens A, Echahidi F, Beken MV, Vandoorslaer K, et al. Anaerobic bacteraemia: a 10-year retrospective epidemiological survey. Anaerobe 2016;39:54-9.
  • 23. Umemura T, Yamagishi Y, Hamada Y, Suematsu H, Mikamo H. Investigation of the risk factors of anaerobic bacteremia in a casecontrol study. Jpn J Antibiot 2014;67:133-43.
  • 24. Lark RL, McNeil SA, Vander Hyde K, Noorani Z, Uberti J. Chenoweth C. Risk factors for anaerobic bloodstream infections in bone marrow transplant recipients. Clin Infect Dis 2001;33:338-43.
  • 25. Wilson JR, Limaye AP. Risk factors for mortality in patients with anaerobic bacteremia. Eur J Clin Microbiol Infect Dis 2004;23:310-6.
  • 26. Redondo MC, Arbo MD, Grindlinger J, Snydman DR. Attributable mortality of bacteremia associated with the Bacteroides fragilis group. Clin Infect Dis 1995;20:1492-946.
  • 27. Afra K, Laupland K, Leal J, Lloyd T, Gregson D. Incidence, risk factors, and outcomes of Fusobacterium species bacteremia. BMC Infect Dis 2013;13:264.
  • 28. Nohrström E, Mattila T, Pettilä V, Kuusela P, Carlson P, Kentala E, et al. Clinical spectrum of bacteraemi Fusobacterium infections: from septic shock to nosocomial bacteraemia. Scand J Infect Dis 2011;43:463–70.
  • 29. Yusuf E, Wybo I, Pierard D. Case series of patients with Fusobacterium nucleatum bacteremia with emphasis on the presence of cancer. Anaerobe 2016;39:1-3.
  • 30. Yang CC, Ye JJ, Hsu PC, Chang HJ, Cheng CW, Leu HS, et al. Characteristics and outcomes of Fusobacterium nucleatum bacteremiaea 6-year experience at a tertiary care hospital in northern Taiwan. Diagn Microbiol Infect Dis 2011;70:167-74.
APA Özdemir B, MUMCUOGLU I, Akıncı E, KAYA İ, Sertçelik A, Bodur H (2020). Anaerop İnfeksiyon Saptanan Vakaların Klinik Özellikleri, Etkenlerin Tür Düzeyinde Dağılımı ve Anaerop Bakteremilerde Fatalite. , 506 - 515. 10.5578/flora.69469
Chicago Özdemir Burcu,MUMCUOGLU IPEK,Akıncı Esragül,KAYA İlkem ACAR,Sertçelik Ahmet,Bodur Hurrem Anaerop İnfeksiyon Saptanan Vakaların Klinik Özellikleri, Etkenlerin Tür Düzeyinde Dağılımı ve Anaerop Bakteremilerde Fatalite. (2020): 506 - 515. 10.5578/flora.69469
MLA Özdemir Burcu,MUMCUOGLU IPEK,Akıncı Esragül,KAYA İlkem ACAR,Sertçelik Ahmet,Bodur Hurrem Anaerop İnfeksiyon Saptanan Vakaların Klinik Özellikleri, Etkenlerin Tür Düzeyinde Dağılımı ve Anaerop Bakteremilerde Fatalite. , 2020, ss.506 - 515. 10.5578/flora.69469
AMA Özdemir B,MUMCUOGLU I,Akıncı E,KAYA İ,Sertçelik A,Bodur H Anaerop İnfeksiyon Saptanan Vakaların Klinik Özellikleri, Etkenlerin Tür Düzeyinde Dağılımı ve Anaerop Bakteremilerde Fatalite. . 2020; 506 - 515. 10.5578/flora.69469
Vancouver Özdemir B,MUMCUOGLU I,Akıncı E,KAYA İ,Sertçelik A,Bodur H Anaerop İnfeksiyon Saptanan Vakaların Klinik Özellikleri, Etkenlerin Tür Düzeyinde Dağılımı ve Anaerop Bakteremilerde Fatalite. . 2020; 506 - 515. 10.5578/flora.69469
IEEE Özdemir B,MUMCUOGLU I,Akıncı E,KAYA İ,Sertçelik A,Bodur H "Anaerop İnfeksiyon Saptanan Vakaların Klinik Özellikleri, Etkenlerin Tür Düzeyinde Dağılımı ve Anaerop Bakteremilerde Fatalite." , ss.506 - 515, 2020. 10.5578/flora.69469
ISNAD Özdemir, Burcu vd. "Anaerop İnfeksiyon Saptanan Vakaların Klinik Özellikleri, Etkenlerin Tür Düzeyinde Dağılımı ve Anaerop Bakteremilerde Fatalite". (2020), 506-515. https://doi.org/10.5578/flora.69469
APA Özdemir B, MUMCUOGLU I, Akıncı E, KAYA İ, Sertçelik A, Bodur H (2020). Anaerop İnfeksiyon Saptanan Vakaların Klinik Özellikleri, Etkenlerin Tür Düzeyinde Dağılımı ve Anaerop Bakteremilerde Fatalite. Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi, 25(4), 506 - 515. 10.5578/flora.69469
Chicago Özdemir Burcu,MUMCUOGLU IPEK,Akıncı Esragül,KAYA İlkem ACAR,Sertçelik Ahmet,Bodur Hurrem Anaerop İnfeksiyon Saptanan Vakaların Klinik Özellikleri, Etkenlerin Tür Düzeyinde Dağılımı ve Anaerop Bakteremilerde Fatalite. Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi 25, no.4 (2020): 506 - 515. 10.5578/flora.69469
MLA Özdemir Burcu,MUMCUOGLU IPEK,Akıncı Esragül,KAYA İlkem ACAR,Sertçelik Ahmet,Bodur Hurrem Anaerop İnfeksiyon Saptanan Vakaların Klinik Özellikleri, Etkenlerin Tür Düzeyinde Dağılımı ve Anaerop Bakteremilerde Fatalite. Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi, vol.25, no.4, 2020, ss.506 - 515. 10.5578/flora.69469
AMA Özdemir B,MUMCUOGLU I,Akıncı E,KAYA İ,Sertçelik A,Bodur H Anaerop İnfeksiyon Saptanan Vakaların Klinik Özellikleri, Etkenlerin Tür Düzeyinde Dağılımı ve Anaerop Bakteremilerde Fatalite. Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi. 2020; 25(4): 506 - 515. 10.5578/flora.69469
Vancouver Özdemir B,MUMCUOGLU I,Akıncı E,KAYA İ,Sertçelik A,Bodur H Anaerop İnfeksiyon Saptanan Vakaların Klinik Özellikleri, Etkenlerin Tür Düzeyinde Dağılımı ve Anaerop Bakteremilerde Fatalite. Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi. 2020; 25(4): 506 - 515. 10.5578/flora.69469
IEEE Özdemir B,MUMCUOGLU I,Akıncı E,KAYA İ,Sertçelik A,Bodur H "Anaerop İnfeksiyon Saptanan Vakaların Klinik Özellikleri, Etkenlerin Tür Düzeyinde Dağılımı ve Anaerop Bakteremilerde Fatalite." Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi, 25, ss.506 - 515, 2020. 10.5578/flora.69469
ISNAD Özdemir, Burcu vd. "Anaerop İnfeksiyon Saptanan Vakaların Klinik Özellikleri, Etkenlerin Tür Düzeyinde Dağılımı ve Anaerop Bakteremilerde Fatalite". Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi 25/4 (2020), 506-515. https://doi.org/10.5578/flora.69469