Geç Dönemde Hastanede Gelişen Pnömoni Etkenlerinin Hızlı Moleküler Biyolojik Yöntemlerle Saptanması
Yıl: 2021 Cilt: 26 Sayı: 1 Sayfa Aralığı: 78 - 87 Metin Dili: Türkçe DOI: 10.5578/flora.20219907 İndeks Tarihi: 21-05-2021
Geç Dönemde Hastanede Gelişen Pnömoni Etkenlerinin Hızlı Moleküler Biyolojik Yöntemlerle Saptanması
Öz: Giriş: Hastaneye yatışı takip eden beşinci günden sonra ortaya çıkan geç dönemde hastanede gelişen pnömonilere (HGP) genellikle çok ilaca dirençli bakteriler neden olmaktadır. Etkenlerin geç saptanması, uygun antibiyotiğin zamanında başlanamaması HGP prognozunu olumsuz olarak etkilemektedir. Son yıllarda infeksiyon etkeni mikroorganizmaların hızlı moleküler yöntemlerle kısa sürede izole edilmesi, tedavinin daha erken ve etkin olarak başlanmasını sağlamaktadır. Bu çalışmada, HGP’de etkenlerin hızlı moleküler yöntemlerle saptan-ması ve sonuçların konvansiyonel yöntemlerle karşılaştırılması amaçlanmıştır.Materyal ve Metod: Ocak 2014 ile Ocak 2016 tarihleri arasında göğüs hastalıkları ile anestezi ve reanimasyon yoğun bakım ünitelerinde izlenen ve 2005 yılında yayımlanan ATS-IDSA kriterlerine göre HGP tanısı alan altmış iki hasta çalışmaya alınmıştır. HGP tanısı düşü-nüldüğü anda hastalardan bronkoskopik (BAL, BASP) ve nonbronkoskopik (mini-BAL) yöntemlerle alt solunum yolu örnekleri alınmıştır. Alınan örnekler hem konvansiyonel yöntemler ve hem de hızlı moleküler yöntemlerle bakteriyolojik etkenler açısından incelenmiştir.Bulgular: Hastanede gelişen pnömoni tanısı alan altmış iki hasta (kırk iki erkek, yaş ortalaması 69.7 ± 15.6) alınmıştır. Hastaların %95.2’sinde ek hastalık olup, otuz üç hastaya invaziv mekanik ventilasyon (İMV), 28 hastaya İMV + non-invaziv mekanik ventilasyon (NİV) uygulanmıştır. Konvansiyonel yöntem ile altmış iki hastanın kırkında (%64.5) bakteriyel etken saptanırken, polimeraz zincir reaksiyon (PZR) ile altmış iki hastanın elli yedisinde (%91.9) bakteriyel etken izole edilmiştir. Etken saptanması açısından konvansiyonel yöntem ile PZR yönteminin birbiriyle uyumlu olduğu gözlenmiştir (kappa: 0.797). Ayrıca, PZR ile etken saptanma oranının anlamlı olarak yüksek olduğu görülmüştür (p= 0.0004). Her iki yöntem ile en sık Acinetobacter baumannii saptanmıştır. İzlemde altmış iki hastanın kırk beşinde (%72.6) mortalite izlenmiştir.Sonuç: Geç dönemde ortaya çıkan HGP etkenlerinin saptanmasında konvansiyonel yöntemler ile PZR arasında uyumun iyi olduğu ve PZR ile daha fazla hastada etken saptanabileceği bu çalışmada gösterilmiştir.
Anahtar Kelime: The Detection of Causative Agents With Rapid Molecular Biological Medhods in Late Onset Hospital Acquired Pneumonia
Öz: Introduction: Late-onset hospital-acquired pneumonia (HAP) developing after the fifth day following admission to the hospital is usually caused by multi-drug resistant bacteria. Late detection of the agents and failure in starting the appropriate antibiotic treatment timely negatively affect HAP prognosis. Isolating infectious microorganisms in a short time by fast molecular methods in the last years has ensured that treatment can be started earlier and more effectively, which is thought to affect prognosis positively. In this study, it was aimed to determine the factors in HAP with rapid molecular methods and to compare the results with conventional methods.Materials and Methods: A total of 62 patients diagnosed with HAP according to the criteria of ATS/IDSA published in 2005 and followed-up in the intensive care units of Anesthesia and Reanimation Department and Chest Disease Departments between January 2014 and January 2016 were included into the study. Lower respiratory tract samples were obtained from patients after HAP diagnosis with bronchoscopic (bronchoalveolar lavage (BAL), bronchoscopic aspiration (BASP) and non-bronchoscopic (mini-BAL) methods. The samples were examined in terms of bacteriological agents with conventional methods and fast molecular methods.Results: Sixty-two patients (42 males, mean age: 69.7 ± 15.6) diagnosed with hospital-acquired pneumonia were included. Ninety-five point two percent of the patients had a comorbid disease. Invasive mechanical ventilation (IMV) was applied to 33 patients and non-in-vasive mechanical ventilation (NIV) was applied to 28 patients. In a total of 62 patients conventional methods and polymerase chain reaction (PCR) were used to detected in 40 (64.5%) and in 57 (91.9%) patients, respectively. It was observed that the conventional method and the PCR method were compatible with each other in terms of detecting the agent (kappa: 0.797). Besides, PCR was found to have a significantly higher rate of agent detection (p= 0.0004). Acinetobacter baumannii was detected most frequently with both methods. In the follow-up, mortality was observed in 45 (72.6%) of the 62 patients.Conclusion: As a result, it was shown in this study that there is a good agreement between conventional methods and PCR in the detection of late-onset HAP agents and that agents can be detected by PCR in more patients.
Anahtar Kelime: Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık
- 1. Türk Toraks Derneği: Erişkinlerde Hastanede Gelişen Pnömoni Tanı ve Tedavi Uzlaşı Raporu 2018.
- 2. Kalil AC, Metersky ML, Klompas M, Muscedere J, Sweeney DA, Palmer LB. Management of adults with hospital-acquired and ventilator-associated pneumonia: 2016 Clinical Practice Guidelines by the Infectious Diseases Society of America and the American Thoracic Society. Clin Infect Dis 2016;63(5):61-111.
- 3. Herkel T, Uvizla R, Doubravskaa L, Adamusa M, Gabrhelikb T, Sedlakovaet M-H, et al. Epidemiology of hospital-acquired pneumonia: Results of a Central European multicenter, prospective, observational study compared with data from the European region. Biomed Pap Med Fac Univ Palacky Olomouc Czech Repub 2016;160(3):448-55.
- 4. Michael Klompas. Does this patient have ventilator-associated pneumonia? JAMA 2007;297:1583-93.
- 5. Endimiani A, Hujer KM, Hujer AM, Kurz S, Jacobs MR, Perlin DS. Are we ready for novel detection methods to treat respiratory pathogens in hospital-acquired pneumonia? Clin Infect Dis 2011;52:373-83.
- 6. Barbier F, Andremont A, Wolff M, Bouadma L. Hospital-acquired pneumonia and ventilator-associated pneumonia: recent advances in epidemiology and management. Curr Opin Pulm Med 2013;19:216-28.
- 7. American Thoracic Society. Hospital-acquired, Ventilator- associated and Healthcare-associated Pneumonia. Am J Respir Crit Care Med 2005;171:388-416.
- 8. Şen N, Özhan MH (eds). Pnömoni. Türkiye Solunum Araştırmaları Derneği 2017. TÜSAD Eğitim Kitapları Serisi.
- 9. Erdem I, Ozgultekin A, Inan AS, Dincer E, Turan G, Ceran N. Incidence, etiology, and antibiotic resistance patterns of gram-negative microorganisms isolated from patients with ventilator-associated pneumonia in a medical-surgical intensive care unit of a teaching hospital in Istanbul, Turkey (2004-2006). Jpn J Infect Dis 2008;61(5):339-42.
- 10. Yılmaz G, Çaylan R, Ulusoy H, Aydın K, Erciyes N, Köksal İ. Yoğun bakım ünitesinde izlenen ventilatörle ilişkili pnömonilerin değerlendirilmesi. Yoğun Bakım Dergisi 2004;4(2):131-7.
- 11. Aydemir O, Aydemir Y, Ozdemir M. The role of multiplex PCR test in identification of bacterial pathogens in lower respiratory tract infections. Pak J Med Sci 2014;30(5):1011-6.
- 12. Serin DÇ, Pullukçu H, Çiçek C, Sipahi OR, Taşbakan S, Atalay S. Pneumonia Study Group (Yamazhan T, Taşbakan MI, Arda B, Aydemir Ş, Ulusoy S). Bacterial and viral etiology in hospitalized community acquired pneumonia with molecular methods and clinical evaluation. J Infect Dev Ctries 2014;8(6):510-8.
- 13. Sevinç C, Şahbaz S, Uysal Ü, Kılınç O, Ellidokuz H, İtil O ve ark. Hastane kökenli pnömoni olgularında etken dağılımı ve prognoza etkili faktörler. Tüberküloz ve Toraks Dergisi 2007;55(2):153-9.
- 14. Bergogne-Berezin E. Importance of Acinetobacter spp. In: Bergogne-Berezin E (ed). Acinetobacter Biology and Pathogenesis. Springer, France 2008;s:1-85.
- 15. Şengül A, Şengül E, Barış SA, Hayırlıoğlu N. Factors associated with mortality in ventilator associated pneumonia of multidrug resistant Acinetobacter baumannii. Eur Respiratory J 2013;42:P2747.
| APA | UYSAL A, Tasbakan M, Aydemir S, Pullukçu H, Çilli F, Bacakoğlu F (2021). Geç Dönemde Hastanede Gelişen Pnömoni Etkenlerinin Hızlı Moleküler Biyolojik Yöntemlerle Saptanması. , 78 - 87. 10.5578/flora.20219907 |
| Chicago | UYSAL AHMET,Tasbakan Mehmet Sezai,Aydemir Sohret,Pullukçu Hüsnü,Çilli Feriha,Bacakoğlu Feza Geç Dönemde Hastanede Gelişen Pnömoni Etkenlerinin Hızlı Moleküler Biyolojik Yöntemlerle Saptanması. (2021): 78 - 87. 10.5578/flora.20219907 |
| MLA | UYSAL AHMET,Tasbakan Mehmet Sezai,Aydemir Sohret,Pullukçu Hüsnü,Çilli Feriha,Bacakoğlu Feza Geç Dönemde Hastanede Gelişen Pnömoni Etkenlerinin Hızlı Moleküler Biyolojik Yöntemlerle Saptanması. , 2021, ss.78 - 87. 10.5578/flora.20219907 |
| AMA | UYSAL A,Tasbakan M,Aydemir S,Pullukçu H,Çilli F,Bacakoğlu F Geç Dönemde Hastanede Gelişen Pnömoni Etkenlerinin Hızlı Moleküler Biyolojik Yöntemlerle Saptanması. . 2021; 78 - 87. 10.5578/flora.20219907 |
| Vancouver | UYSAL A,Tasbakan M,Aydemir S,Pullukçu H,Çilli F,Bacakoğlu F Geç Dönemde Hastanede Gelişen Pnömoni Etkenlerinin Hızlı Moleküler Biyolojik Yöntemlerle Saptanması. . 2021; 78 - 87. 10.5578/flora.20219907 |
| IEEE | UYSAL A,Tasbakan M,Aydemir S,Pullukçu H,Çilli F,Bacakoğlu F "Geç Dönemde Hastanede Gelişen Pnömoni Etkenlerinin Hızlı Moleküler Biyolojik Yöntemlerle Saptanması." , ss.78 - 87, 2021. 10.5578/flora.20219907 |
| ISNAD | UYSAL, AHMET vd. "Geç Dönemde Hastanede Gelişen Pnömoni Etkenlerinin Hızlı Moleküler Biyolojik Yöntemlerle Saptanması". (2021), 78-87. https://doi.org/10.5578/flora.20219907 |
| APA | UYSAL A, Tasbakan M, Aydemir S, Pullukçu H, Çilli F, Bacakoğlu F (2021). Geç Dönemde Hastanede Gelişen Pnömoni Etkenlerinin Hızlı Moleküler Biyolojik Yöntemlerle Saptanması. Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi, 26(1), 78 - 87. 10.5578/flora.20219907 |
| Chicago | UYSAL AHMET,Tasbakan Mehmet Sezai,Aydemir Sohret,Pullukçu Hüsnü,Çilli Feriha,Bacakoğlu Feza Geç Dönemde Hastanede Gelişen Pnömoni Etkenlerinin Hızlı Moleküler Biyolojik Yöntemlerle Saptanması. Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi 26, no.1 (2021): 78 - 87. 10.5578/flora.20219907 |
| MLA | UYSAL AHMET,Tasbakan Mehmet Sezai,Aydemir Sohret,Pullukçu Hüsnü,Çilli Feriha,Bacakoğlu Feza Geç Dönemde Hastanede Gelişen Pnömoni Etkenlerinin Hızlı Moleküler Biyolojik Yöntemlerle Saptanması. Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi, vol.26, no.1, 2021, ss.78 - 87. 10.5578/flora.20219907 |
| AMA | UYSAL A,Tasbakan M,Aydemir S,Pullukçu H,Çilli F,Bacakoğlu F Geç Dönemde Hastanede Gelişen Pnömoni Etkenlerinin Hızlı Moleküler Biyolojik Yöntemlerle Saptanması. Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi. 2021; 26(1): 78 - 87. 10.5578/flora.20219907 |
| Vancouver | UYSAL A,Tasbakan M,Aydemir S,Pullukçu H,Çilli F,Bacakoğlu F Geç Dönemde Hastanede Gelişen Pnömoni Etkenlerinin Hızlı Moleküler Biyolojik Yöntemlerle Saptanması. Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi. 2021; 26(1): 78 - 87. 10.5578/flora.20219907 |
| IEEE | UYSAL A,Tasbakan M,Aydemir S,Pullukçu H,Çilli F,Bacakoğlu F "Geç Dönemde Hastanede Gelişen Pnömoni Etkenlerinin Hızlı Moleküler Biyolojik Yöntemlerle Saptanması." Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi, 26, ss.78 - 87, 2021. 10.5578/flora.20219907 |
| ISNAD | UYSAL, AHMET vd. "Geç Dönemde Hastanede Gelişen Pnömoni Etkenlerinin Hızlı Moleküler Biyolojik Yöntemlerle Saptanması". Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi 26/1 (2021), 78-87. https://doi.org/10.5578/flora.20219907 |
