Pulmoner ve ekstrapulmoner örneklerden üretilen S. maltophilia izolatlarının biyofilm oluşturma özelliklerinin karşılaştırılması

GÜR VURAL, DEMET; Tanriverdi Çaycı, Yeliz; BIRINCI, ASUMAN; Bıyık, İlknur; Bilgin, Kemal; torun, elif gülsüm

Pulmoner ve ekstrapulmoner örneklerden üretilen S. maltophilia izolatlarının biyofilm oluşturma özelliklerinin karşılaştırılması

Kemal BİLGİN, (Ondokuz Mayıs Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji AD, Samsun)

Yeliz TANRIVERDİ ÇAYCI, (Ondokuz Mayıs Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji AD, Samsun)

İlknur BIYIK, (Ondokuz Mayıs Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji AD, Samsun)

Demet GÜR VURAL, (Ondokuz Mayıs Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji AD, Samsun)

Elif Gülsüm TORUN, (Sütçü İmam Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji AD, Kahramanmaraş)

Asuman BİRİNCİ (Ondokuz Mayıs Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji AD, Samsun)

Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi

1 0

Yıl: 2021 Cilt: 78 Sayı: 2 Sayfa Aralığı: 147 - 152 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 15-02-2022

Pulmoner ve ekstrapulmoner örneklerden üretilen S. maltophilia izolatlarının biyofilm oluşturma özelliklerinin karşılaştırılması

Öz:

Amaç: Stenotrophomonas maltophilia, toplum kökenli enfeksiyonlarda bildirilmiş olmakla birlikte, genellikle çoklu ilaç direncine sahip nozokomiyal bir patojendir. S. maltophilia’nın etkeni olduğu enfeksiyonların tedavisinde ilk tercih edilecek olan antibiyotik trimetoprim-sülfametoksazoldür. Hastanede yatan hastalarda solunum yolu, en sık izole edildiği vücut bölgesidir. Bakteri hakkında, plastik yüzeylere tutunabilme yeteneği sayesinde biyofilm oluşumuna neden olduğu bilinmekle birlikte, virülans faktörleri açısından nispeten az şey bilinmektedir. Çalışmamızın amacı, pulmoner ve ekstrapulmoner örneklerden üretilen S. maltophilia izolatlarının biyofilm oluşturma özelliklerinin karşılaştırılmasıdır. Yöntem: Çalışmaya 37 adet pulmoner, 41 adet ekstrapulmoner örnekten izole edilmiş olan toplam 78 adet S. maltophilia izolatı dahil edilmiştir. Suşların identifikasyonu Vitek MS otomatize sistemi (bioMérieux, Fransa) ile yapılmıştır. Ayrıca disk difüzyon yöntemi kullanılarak antibiyotik duyarlılık testi çalışılmıştır. Tüm izolatlar, mikrotitrasyon plak yöntemi ile biyofilm oluşturması yönünden araştırılmıştır. Örneğin pulmoner veya ekstrapulmoner olmasının biyofilm üretimi ile ilişkisi istatistiksel olarak incelenmiştir. Bulgular: Tüm izolatlar trimetoprim-sülfametoksazole duyarlı bulunmuştur. Toplam 78 S. maltophilia izolatının 68 (%87,2)’inde biyofilm oluşumu saptanmıştır. Pulmoner ve ekstrapulmoner örneklerden izole edilen S. maltophilia suşlarının biyofilm oluşturma yetenekleri sırasıyla; 35/37 (%94,6), 33/41 (%80,5) şeklinde bulunmuştur. S. maltophilia’nın üretildiği örneğin pulmoner veya ekstrapulmoner olması, biyofilm oluşturma özelliği ile istatistiksel olarak ilişkili bulunmamıştır. Sonuç: Çalışmaya dahil edilen tüm suşların önemli bir kısmının (%87,2) biyofilm oluşturduğu görülmüştür. Pulmoner örneklerdeki biyofilm aktivitesinin ekstrapulmoner örneklere göre oransal olarak daha fazla olduğu görülmektedir. Ancak pulmoner ve ekstrapulmoner örneklerden izole edilen suşlar arasında biyofilm oluşumu yönünden anlamlı bir fark saptanmamıştır. Ayrıca trimetoprim-sülfametoksazole karşı bir direnç gelişiminin söz konusu olmadığı görülmektedir. Bu konuda daha geniş kapsamlı yeni çalışmaların yapılması S. maltophilia’nın virülans mekanizmalarının daha iyi anlaşılmasına katkı sağlayabilecektir.

Anahtar Kelime:

Comparing the biofilm formation properties of S. maltophilia isolates obtained from the pulmonary and extrapulmonary samples

Öz:

Objective: Stenotrophomonas maltophilia is commonly a nosocomial pathogen with multiple drug resistance, although it has been reported in communityacquired infections. Trimethoprim-sulfamethoxazole is prefered as the first antibiotic in the treatment of S. maltophilia infections. In hospitalized patients, the respiratory tract is the body area that it is most frequently isolated. Although it is known about the bacteria that it causes the formation of biofilms due to its ability to attach to plastic surfaces, relatively little is known in terms of virulence factors. The aim of our study is to compare the property of biofilm formation of pulmonary and extrapulmonary isolates of S. maltophilia. Methods: A total of 78 S. maltophilia isolates isolated from 37 pulmonary and 41 extrapulmonary specimens were included in the study. The identfication of the isolates were performed in Vitek MS (bioMérieux, Fransa) automated system. In addition, antibiotic susceptibility was tested using the disc diffusion method. All isolates were investigated for biofilm formation by microtitration plate method. The relation of the pulmonary or extrapulmonary specimens with the biofilm formation was statistically investigated. Results: All of the isolates were found susceptible to trimetoprim-sulphametaxozole. Biofilm formation was detected in 68 of 78 (87.2%) S. maltophilia isolates. Biofilm formation of S. maltophilia isolates that isolated from pulmonary and extrapulmonary specimens were detected as 35/37 (94.6%), 33/41 (80.5%), respectively. There was no statistical relationship between pulmonary or extrapulmonary samples and biofilm forming capability. Conclusion: It was observed that a significant part (87.2%) of all strains included in the study were formed biofilms. It was seen that the biofilm activity of the pulmonary specimens was proportionally higher than extrapulmonary specimens. However, there was no significant difference in terms of biofilm formation between the strains isolated from pulmonary and extrapulmonary specimens. It was also detected that there was no development of resistance to trimethoprimsulfamethoxazole. New comprehensive studies on this subject may contribute to a better understanding of the virulence mechanisms of S. maltophilia.

Anahtar Kelime:

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık

1. Tünger A, Çavuşoğlu C, Korkmaz M. Asya Mikrobiyoloji. 4th ed. İzmir: Asya Tıp Kitapevi, 2005.
2. Arabacı Ç, Yanılmaz Ö, Uzun B. Çeşitli klinik örneklerden izole edilen Stenotrophomonas maltophilia suşlarının antibiyotik duyarlılıkları. ANKEM Derg, 2019; 33 (2): 58-64.
3. Denton M, Kerr KG. Microbiological and clinical aspects of infection associated with Stenotrophomonas maltophilia. Clinical Microbiology Reviews, 1998; 11 (1): 57–80.
4. Kandemir Ö. Stenotrophomonas maltophilia. Yoğun Bakım Dergisi, 2007; 7 (1): 151-7.
5. Donlan RM, Costerton JW. Biofilms: Survival mechanisms of clinically relevant microorganisms. Clin Microbiol Rev, 2002; 15 (2): 167-93.
6. Diani M, Ariafar MN, Akçelik N. İnsan ve hayvan sağlığı açısından risk oluşturan enterokokal biyofilm yapısının doğası. Turk Hij Den Biyol Derg, 2016; 73 (1): 71-80.
7. The European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing. Breakpoint tables for interpretation of MICs and zone diameters. Version 9.0, 2019. http://eucast.org.
8. Christensen GD, Simpson WA, Younger JJ, Baddour LM, Barrett FF, Melton DM, et al. Adherence of coagulase-negative staphylococci to plastic tissue culture plates: a quantitative model for the adherence of staphylococci to medical devices. J Clin Microbiol, 1985; 22 (6): 996-1006.
9. Milletli Sezgin F, Çoban AY, Günaydın M. Investigation of biofilm formation in Acinetobacter baumannii isolates and their colistin susceptibilities in biofilm. Int J Antimicrob Agents, 2013; 41 (2): 199.
10. Us D. Serolojik Tanı Yöntemleri. Ankara: Hacettepe Üniversitesi Yayınları, 2006.
11. Dülger D, Berktaş M. Stenotrophomonas maltophilia Suşlarının Klinik Önemi. Van Tıp Dergisi, 2007; 14 (3): 90-5.
12. Taşçılar MO, Habip Z, Özekinci T, Koçoğlu ME. Klinik örneklerden izole edilen Stenotrophomonas maltophilia suşlarının antimikrobiyal direnci açısından değerlendirilmesi. Turk Mikrobiyol Cemiy Derg, 2020; 50 (1): 44-8.
13. Hazırolan G, Araz H, Kocagül Çelikbaş A, Aksu N. Dikkat! Klinik örneklerden izole edilen Stenotrophomonas maltophilia suşlarının trimetoprim-sülfametoksazol ve levofloksasin direncinde belirgin artış var (2008-2016). Turk Mikrobiyol Cemiy Derg, 2018; 48 (2): 134-40.
14. Tanrıverdi Çaycı Y, Bıyık İ, Birinci A. Yoğun bakım ünitelerinden izole edilen nonfermentatif gram negatif bakterilerin antimikrobiyal duyarlılıklarının araştırılması. Turk Mikrobiyol Cemiy Derg, 2015; 45 (4): 170-4.
15. Özkaya E, Aydın F, Bayramoğlu G, Buruk CK, Sandallı C. Klinik örneklerden izole edilen trimetoprimsülfametoksazole dirençli Stenotrophomonas maltophilia suşlarında integron, sul1-2 ve dfr genlerinin araştırılması. Mikrobiyol Bul, 2014; 48 (2): 201-12.
16. Di Bonaventura G, Spedicato I, D’Antonio D, Robuffo I, Piccolomini R. Bioﬁlm formation by Stenotrophomonas maltophilia: Modulation by quinolones, trimethoprim-sulfamethoxazole, and ceftazidime. Antimicrob Agents Chemother, 2004; 48 (1): 151–60.
17. Bıočanın M, Madı H, Vasıljevıć Z, Kojıć M, Jovčıć B, Lozo J. Temperature, pH and trimethoprimsulfamethoxazole are potent inhibitors of biofilm formation by Stenotrophomonas maltophilia clinical isolates. Pol J Microbiol, 2017; 66 (4): 433–8.
18. Flores-Trevin S, Gutierrez-Ferman JL, Morfın-Otero R, Rodrıguez-Noriega E, Estrada-Rivadeneyra D, Rivas-Morales C, et al. Stenotrophomonas maltophilia in Mexico: antimicrobial resistance, biofilm formation and clonal diversity. JJ Med Microbiol, 2014; 63; 1524–30.
19. Pompilio A, Savini V, Fiscarelli E, Gherardi G, Di Bonaventura G. Clonal diversity, bioﬁlm formation, and antimicrobial resistance among Stenotrophomonas maltophilia strains from cystic fibrosis and non-cystic fibrosis patients. Antibiotics, 2020; 9 (15): 2-16.
20. Sun E, Liang G, Wang L, Wei W, Lei M, Song S, et al. Antimicrobial susceptibility of hospital acquired Stenotrophomonas maltophilia isolates biofilms. Braz J Infect Dis, 2016; 20 (4): 365-73.

APA	Bilgin K, Tanriverdi Çaycı Y, Bıyık İ, GÜR VURAL D, torun e, BIRINCI A (2021). Pulmoner ve ekstrapulmoner örneklerden üretilen S. maltophilia izolatlarının biyofilm oluşturma özelliklerinin karşılaştırılması. , 147 - 152.
Chicago	Bilgin Kemal,Tanriverdi Çaycı Yeliz,Bıyık İlknur,GÜR VURAL DEMET,torun elif gülsüm,BIRINCI ASUMAN Pulmoner ve ekstrapulmoner örneklerden üretilen S. maltophilia izolatlarının biyofilm oluşturma özelliklerinin karşılaştırılması. (2021): 147 - 152.
MLA	Bilgin Kemal,Tanriverdi Çaycı Yeliz,Bıyık İlknur,GÜR VURAL DEMET,torun elif gülsüm,BIRINCI ASUMAN Pulmoner ve ekstrapulmoner örneklerden üretilen S. maltophilia izolatlarının biyofilm oluşturma özelliklerinin karşılaştırılması. , 2021, ss.147 - 152.
AMA	Bilgin K,Tanriverdi Çaycı Y,Bıyık İ,GÜR VURAL D,torun e,BIRINCI A Pulmoner ve ekstrapulmoner örneklerden üretilen S. maltophilia izolatlarının biyofilm oluşturma özelliklerinin karşılaştırılması. . 2021; 147 - 152.
Vancouver	Bilgin K,Tanriverdi Çaycı Y,Bıyık İ,GÜR VURAL D,torun e,BIRINCI A Pulmoner ve ekstrapulmoner örneklerden üretilen S. maltophilia izolatlarının biyofilm oluşturma özelliklerinin karşılaştırılması. . 2021; 147 - 152.
IEEE	Bilgin K,Tanriverdi Çaycı Y,Bıyık İ,GÜR VURAL D,torun e,BIRINCI A "Pulmoner ve ekstrapulmoner örneklerden üretilen S. maltophilia izolatlarının biyofilm oluşturma özelliklerinin karşılaştırılması." , ss.147 - 152, 2021.
ISNAD	Bilgin, Kemal vd. "Pulmoner ve ekstrapulmoner örneklerden üretilen S. maltophilia izolatlarının biyofilm oluşturma özelliklerinin karşılaştırılması". (2021), 147-152.

APA	Bilgin K, Tanriverdi Çaycı Y, Bıyık İ, GÜR VURAL D, torun e, BIRINCI A (2021). Pulmoner ve ekstrapulmoner örneklerden üretilen S. maltophilia izolatlarının biyofilm oluşturma özelliklerinin karşılaştırılması. Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi, 78(2), 147 - 152.
Chicago	Bilgin Kemal,Tanriverdi Çaycı Yeliz,Bıyık İlknur,GÜR VURAL DEMET,torun elif gülsüm,BIRINCI ASUMAN Pulmoner ve ekstrapulmoner örneklerden üretilen S. maltophilia izolatlarının biyofilm oluşturma özelliklerinin karşılaştırılması. Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi 78, no.2 (2021): 147 - 152.
MLA	Bilgin Kemal,Tanriverdi Çaycı Yeliz,Bıyık İlknur,GÜR VURAL DEMET,torun elif gülsüm,BIRINCI ASUMAN Pulmoner ve ekstrapulmoner örneklerden üretilen S. maltophilia izolatlarının biyofilm oluşturma özelliklerinin karşılaştırılması. Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi, vol.78, no.2, 2021, ss.147 - 152.
AMA	Bilgin K,Tanriverdi Çaycı Y,Bıyık İ,GÜR VURAL D,torun e,BIRINCI A Pulmoner ve ekstrapulmoner örneklerden üretilen S. maltophilia izolatlarının biyofilm oluşturma özelliklerinin karşılaştırılması. Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi. 2021; 78(2): 147 - 152.
Vancouver	Bilgin K,Tanriverdi Çaycı Y,Bıyık İ,GÜR VURAL D,torun e,BIRINCI A Pulmoner ve ekstrapulmoner örneklerden üretilen S. maltophilia izolatlarının biyofilm oluşturma özelliklerinin karşılaştırılması. Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi. 2021; 78(2): 147 - 152.
IEEE	Bilgin K,Tanriverdi Çaycı Y,Bıyık İ,GÜR VURAL D,torun e,BIRINCI A "Pulmoner ve ekstrapulmoner örneklerden üretilen S. maltophilia izolatlarının biyofilm oluşturma özelliklerinin karşılaştırılması." Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi, 78, ss.147 - 152, 2021.
ISNAD	Bilgin, Kemal vd. "Pulmoner ve ekstrapulmoner örneklerden üretilen S. maltophilia izolatlarının biyofilm oluşturma özelliklerinin karşılaştırılması". Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi 78/2 (2021), 147-152.