Yıl: 2021 Cilt: 51 Sayı: 1 Sayfa Aralığı: 11 - 14 Metin Dili: Türkçe DOI: 10.5222/TMCD.2021.71463 İndeks Tarihi: 16-05-2022

Kan Kültürlerinden İzole Edilen Candida parapsilosis Kompleks Türlerinin Eşey Tipi (MTL) Genotiplerinin Belirlenmesi

Öz:
Amaç: Candida parapsilosis, sistemik kandidoz etkenleri arasında Candida albicans’tan sonra en sık rastlanan Candida türlerinden biridir. Candida türlerinde eşey tipinin belirlenmesi ve eşeyli üremenin gerçekleştirilmesi, eşey tipi (MTL) gen bölgesi kontrolünde gerçekleşir. Bu bölge, iki farklı eşey tipinde (a ve α) tamamen farklı dizilimlerde olup idiomorf olarak adlandırılır. MTLa idiomorfu a1 ve a2 transkripsiyon faktörlerini kodlarken, MTLα, α1 ve α2 proteinlerini kodlar. Bu genler haricinde her iki idiomorfta da eşeyli üreme ile ilgili işlevleri bilinmeyen PAB, OBP ve PIK genlerinin a ya da α versiyonları vardır. Candida parapsilosis ve yakın ilişkili Candida orthopsilosis ile Candida metapsilosis türlerinde ise, bugüne kadar eşeyli üreme döngüsüne bugüne kadar rastlanmamıştır. Gerçekleştirilen incelemelerde, C. orthopsilosis’in MTLa ve MTLα homozigot ve MTLa/MTLα heterozigot genotiplerini içeren karışık bir popülasyon yapısına sahip olduğu, C. metapsilosis izolatlarının çoğunluğunun ise MTLa/MTLα heterozigot olduğu belirlenmiştir. Buna karşılık, şimdiye kadar incelenen C. parapsilosis izolatlarının hepsinin tek bir eşey tipinde (MTLa) olduğu görülmüştür. Yöntem: Sunulan çalışmada, Türkiye kaynaklı C. parapsilosis kökenlerinin MTL genotiplerinin belirlenmesi amaçlanmış ve bu amaçla 167 kan izolatı incelendi. ITS bölgesinin PCR’da çoğaltılarak sekanslanması ile C. parapsilosis olarak identifikasye edilen izolatlar, MTLa1, MTLa2, MTLα1 ve MTLα2 genleri yönünden taranmıştır. Bulgular: PCR sonucunda yalnızca MTLa1 ve MTLa2 genlerine rastlanmıştır; dolayısı ile tüm izolatların MTLa genotipine sahip olduğu belirlenmiştir. Sonuç: Bulgular önceki çalışmalarla birlikte değerlendirildiğinde, C. parapsilosis’in MTLα eşey tipinin zaman içerisinde yok olduğu veya henüz araştırılmamış coğrafi bölgelerde varlığını sürdürecek şekilde seyrek olduğu sonucuna varılmıştır.
Anahtar Kelime:

Identification of The Mating Type (MTL) Genotypes of Clinical Candida parapsilosis Complex Species isolated from Blood Cultures

Öz:
Objective: Candida parapsilosis is one of the most common species after Candida albicans among the causative factors of systemic candidosis. In Candida species, determination of the cell identity and the sexual reproduction process take place under the control of the mating type (MTLα) locus. This region has completely different sequences in two different mating types (a and α) and is called an idiomorph. While the MTLa idiomorph encodes the transcription factors a1 and a2, MTLα encodes α1 and α2 proteins. Apart from these genes, both idiomorphs have a or α versions of PAB, OBP, and PIK genes, whose functions in sexual reproduction are unknown. On the other hand, up to now neither Candida parapsilosis nor the closely related species Candida orthopsilosis or Candida metapsilosis has been reported to have sexual cycles. While C. orthopsilosis was found to have a mixed population structure harboring MTLa and MTLα homozygous and MTLa/MTLα heterozygous genotypes in realized studies, the majority of C. metapsilosis isolates were MTLa/ MTLα heterozygotes. Nevertheless, all C. parapsilosis isolates analyzed were found to be of a single mating type (MTLa). Method: This study was aimed to determine the MTL genotypes of C. parapsilosis isolates of Turkey origin, and 167 blood isolates were used for this purpose. The isolates identified as C. parapsilosis by PCR-amplifying and sequencing the ITS region were screened for MTLa1, MTLa2, MTLα1 and MTLα2 genes. Results: Only MTLa1 and MTLa2 genes were detected in PCR; therefore, all isolates were determined to have the MTLa genotype. Conclusion: When the results are assessed with previous findings, it could be inferred that the MTLα mating type of C. parapsilosis has been lost or extremely rare in yet unanalyzed geographical regions.
Anahtar Kelime:

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık
  • 1. Tabah A, Koulenti D, Laupland K, et al. Characteristics and determinants of outcome of hospital-acquired bloodstream infections in intensive care units: the EUROBACT International Cohort Study. Intensive Care Med. 2012;38(12):1930-45. https://doi.org/10.1007/s00134-012-2695-9
  • 2. Tóth R, Nosek J, Mora-Montes HM, et al. Candida parapsilosis: from genes to the bedside. Clin Microbiol Rev. 2019;20;32(2):e00111-18. https://doi.org/10.1128/CMR.00111-18
  • 3. Trofa D, Gácser A, Nosanchuk JD. Candida parapsilosis, an emerging fungal pathogen. Clin Microbiol Rev. 2008;21(4):606-25. https://doi.org/10.1128/CMR.00013-08
  • 4. Döğen A, Sav H, Gonca S, et al. Candida parapsilosis in domestic laundry machines. Med Mycol. 2017;55(8):813-9. https://doi.org/10.1093/mmy/myx008
  • 5. Fell JW, Meyer SA. Systematics of yeast species in the Candida parapsilosis group. Mycopathol Mycol Appl. 1967;32(3):177-93. https://doi.org/10.1007/BF02049795
  • 6. van Asbeck EC, Clemons KV, Stevens DA. Candida parapsilosis: A review of its epidemiology, pathogenesis, clinical aspects, typing and antimicrobial susceptibility. Crit Rev Microbiol. 2009;35(4):283–309. https://doi.org/10.3109/10408410903213393
  • 7. Tavanti A, Davidson AD, Gow NAR, Maiden MCJ, Odds FC. Candida orthopsilosis and Candida metapsilosis spp. nov. to replace Candida parapsilosis groups II and III. J Clin Microbiol. 2005;43(1):284-92. https://doi.org/10.1128/JCM.43.1.284-292.2005
  • 8. Wolfe KH, Butler G. Evolution of mating in the Saccharomycotina. Annu Rev Microbiol. 2017;71(1): 197-214. https://doi.org/10.1146/annurev-micro-090816-093403
  • 9. Bennett RJ, Turgeon BG. Fungal sex: The Ascomycota. Microbiol Spectr. 2016;4(5). https://doi.org/10.1128/microbiolspec.FUNK-0005-2016
  • 10. Butler G. Fungal sex and pathogenesis. Clin Microbiol Rev. 2010 Jan 1;23(1):140. https://doi.org/10.1128/CMR.00053-09
  • 11. Butler G, Rasmussen MD, Lin MF, et al. Evolution of pathogenicity and sexual reproduction in eight Candida genomes. Nature. 2009;459(7247):657-62. https://doi.org/10.1038/nature08064
  • 12. Hull CM, Raisner RM, Johnson AD. Evidence for mating of the “asexual” yeast Candida albicans in a mammalian host. Science. 2000;289(5477):307-10. https://doi.org/10.1126/science.289.5477.307
  • 13. Magee BB, Magee PT. Induction of mating in Candida albicans by construction of MTLa and MTLα strains. Science. 2000;289(5477):310-3. https://doi.org/10.1126/science.289.5477.310
  • 14. Bennett RJ, Johnson AD. Completion of a parasexual cycle in Candida albicans by induced chromosome loss in tetraploid strains. EMBO J. 2003;22(10):2505-15. https://doi.org/10.1093/emboj/cdg235
  • 15. Sai S, Holland LM, McGee CF, Lynch DB, Butler G. Evolution of mating within the Candida parapsilosis species group. Eukaryot Cell. 2011;10(4):578-87. https://doi.org/10.1128/EC.00276-10
  • 16. Döğen A, Metin B, Ilkit M, de Hoog GS, Heitman J. MTL genotypes, phenotypic switching, and susceptibility profiles of Candida parapsilosis species group compared to Lodderomyces elongisporus. PLoS One. 2017;12(8):e0182653. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0182653
  • 17. Logue ME, Wong S, Wolfe KH, Butler G. A genome sequence survey shows that the pathogenic yeast Candida parapsilosis has a defective MTLa1 allele at its mating type locus. Eukaryot Cell. 2005;4(6):1009-17. https://doi.org/10.1128/EC.4.6.1009-1017.2005
  • 18. Lockhart SR, Messer SA, Pfaller MA, Diekema DJ. Lodderomyces elongisporus masquerading as Candida parapsilosis as a cause of bloodstream infections. J Clin Microbiol. 2008;46(1):374-6. https://doi.org/10.1128/JCM.01790-07
  • 19. van der Walt JP. Lodderomyces, a new genus of the Saccharomycetaceae. Antonie van Leeuwenhoek. 1966;32(1):1-5. https://doi.org/10.1007/BF02097439
  • 20. Cebeci Güler N, Tosun İ, Bayramoğlu G, Buruk K, Aydın F. Klinik örneklerden izole edilen Candida parapsilosis kompleks türlerinin (C. parapsilosis sensu stricto, C. metapsilosis ve C. orthopsilosis) genotipik olarak tanımlanması ve dağılımlarının belirlenmesi. Mikrobiyol Bul. 2011;45(4):723-8.
  • 21. Pryszcz LP, Németh T, Saus E, et al. The genomic aftermath of hybridization in the opportunistic pathogen Candida metapsilosis. PLoS Genet. 2015;11(10):e1005626. https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1005626
APA Metin B, Yasar-Duman M, HOŞBUL t, Döğen A, Hilmioğlu Polat S, Ilkit M (2021). Kan Kültürlerinden İzole Edilen Candida parapsilosis Kompleks Türlerinin Eşey Tipi (MTL) Genotiplerinin Belirlenmesi. , 11 - 14. 10.5222/TMCD.2021.71463
Chicago Metin Banu,Yasar-Duman Melike,HOŞBUL tugrul,Döğen Aylin,Hilmioğlu Polat Süleyha,Ilkit Macit Kan Kültürlerinden İzole Edilen Candida parapsilosis Kompleks Türlerinin Eşey Tipi (MTL) Genotiplerinin Belirlenmesi. (2021): 11 - 14. 10.5222/TMCD.2021.71463
MLA Metin Banu,Yasar-Duman Melike,HOŞBUL tugrul,Döğen Aylin,Hilmioğlu Polat Süleyha,Ilkit Macit Kan Kültürlerinden İzole Edilen Candida parapsilosis Kompleks Türlerinin Eşey Tipi (MTL) Genotiplerinin Belirlenmesi. , 2021, ss.11 - 14. 10.5222/TMCD.2021.71463
AMA Metin B,Yasar-Duman M,HOŞBUL t,Döğen A,Hilmioğlu Polat S,Ilkit M Kan Kültürlerinden İzole Edilen Candida parapsilosis Kompleks Türlerinin Eşey Tipi (MTL) Genotiplerinin Belirlenmesi. . 2021; 11 - 14. 10.5222/TMCD.2021.71463
Vancouver Metin B,Yasar-Duman M,HOŞBUL t,Döğen A,Hilmioğlu Polat S,Ilkit M Kan Kültürlerinden İzole Edilen Candida parapsilosis Kompleks Türlerinin Eşey Tipi (MTL) Genotiplerinin Belirlenmesi. . 2021; 11 - 14. 10.5222/TMCD.2021.71463
IEEE Metin B,Yasar-Duman M,HOŞBUL t,Döğen A,Hilmioğlu Polat S,Ilkit M "Kan Kültürlerinden İzole Edilen Candida parapsilosis Kompleks Türlerinin Eşey Tipi (MTL) Genotiplerinin Belirlenmesi." , ss.11 - 14, 2021. 10.5222/TMCD.2021.71463
ISNAD Metin, Banu vd. "Kan Kültürlerinden İzole Edilen Candida parapsilosis Kompleks Türlerinin Eşey Tipi (MTL) Genotiplerinin Belirlenmesi". (2021), 11-14. https://doi.org/10.5222/TMCD.2021.71463
APA Metin B, Yasar-Duman M, HOŞBUL t, Döğen A, Hilmioğlu Polat S, Ilkit M (2021). Kan Kültürlerinden İzole Edilen Candida parapsilosis Kompleks Türlerinin Eşey Tipi (MTL) Genotiplerinin Belirlenmesi. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi, 51(1), 11 - 14. 10.5222/TMCD.2021.71463
Chicago Metin Banu,Yasar-Duman Melike,HOŞBUL tugrul,Döğen Aylin,Hilmioğlu Polat Süleyha,Ilkit Macit Kan Kültürlerinden İzole Edilen Candida parapsilosis Kompleks Türlerinin Eşey Tipi (MTL) Genotiplerinin Belirlenmesi. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi 51, no.1 (2021): 11 - 14. 10.5222/TMCD.2021.71463
MLA Metin Banu,Yasar-Duman Melike,HOŞBUL tugrul,Döğen Aylin,Hilmioğlu Polat Süleyha,Ilkit Macit Kan Kültürlerinden İzole Edilen Candida parapsilosis Kompleks Türlerinin Eşey Tipi (MTL) Genotiplerinin Belirlenmesi. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi, vol.51, no.1, 2021, ss.11 - 14. 10.5222/TMCD.2021.71463
AMA Metin B,Yasar-Duman M,HOŞBUL t,Döğen A,Hilmioğlu Polat S,Ilkit M Kan Kültürlerinden İzole Edilen Candida parapsilosis Kompleks Türlerinin Eşey Tipi (MTL) Genotiplerinin Belirlenmesi. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi. 2021; 51(1): 11 - 14. 10.5222/TMCD.2021.71463
Vancouver Metin B,Yasar-Duman M,HOŞBUL t,Döğen A,Hilmioğlu Polat S,Ilkit M Kan Kültürlerinden İzole Edilen Candida parapsilosis Kompleks Türlerinin Eşey Tipi (MTL) Genotiplerinin Belirlenmesi. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi. 2021; 51(1): 11 - 14. 10.5222/TMCD.2021.71463
IEEE Metin B,Yasar-Duman M,HOŞBUL t,Döğen A,Hilmioğlu Polat S,Ilkit M "Kan Kültürlerinden İzole Edilen Candida parapsilosis Kompleks Türlerinin Eşey Tipi (MTL) Genotiplerinin Belirlenmesi." Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi, 51, ss.11 - 14, 2021. 10.5222/TMCD.2021.71463
ISNAD Metin, Banu vd. "Kan Kültürlerinden İzole Edilen Candida parapsilosis Kompleks Türlerinin Eşey Tipi (MTL) Genotiplerinin Belirlenmesi". Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi 51/1 (2021), 11-14. https://doi.org/10.5222/TMCD.2021.71463