Tracking SARS-CoV-2, İzmir, Turkey
Yıl: 2021 Cilt: 15 Sayı: 4 Sayfa Aralığı: 235 - 238 Metin Dili: İngilizce DOI: 10.5578/ced.20219606 İndeks Tarihi: 06-06-2022
Tracking SARS-CoV-2, İzmir, Turkey
Öz: Objective: With the rapid spread of SARS-CoV-2, a new coronavirus,
around the world, a pandemic was declared by World Health Organization on March 2020. The first cases were reported in March 2020 from
Turkey. In our hospital, the first pediatric case was detected on April 2,
2020. However, there is no data on whether this virus had been present in our region or not before this date. The aim of our study was to
determine the first entry of SARS-CoV-2 virus to our region for pediatric
patients.
Material and Methods: SARS-CoV-2 positivity was investigated retrospectively with the RT-qPCR method in the pediatric respiratory tract
specimens taken between the October 1, 2019 and March 31, 2020. In
the specimens, SARS-CoV-2 RNA was studied using real-time PCR based
“COVID-19 RT-qPCR Detection Kit”.
Results: 886 samples were included in the study. Of the respiratory tract
specimens, 97.1% were nasopharyngeal swabs, 2.8% were bronchoalveolar lavage. Most frequently, rhinovirus (28.6%), influenza A subtype
H1N1 (pandemic H1N1) (18.5%) and influenza B (16%) were detected.
Rhinovirus and enterovirus were the most frequent double agents seen
together. No SARS-CoV-2 positivity was detected in the respiratory tract
specimens studied.
Conclusion: SARS-CoV-2 PCR test was conducted in a limited number
of centers at the beginning of the pandemics may have affected the detection of the first case in Turkey. Multicenter studies of archived samples
would enable more realistic results in tracking SARS-CoV-2 in our country.
Anahtar Kelime: SARS-CoV-2 İzinin Sürülmesi, İzmir, Türkiye
Öz: Giriş: Yeni bir koronavirüs olan SARS-CoV-2’nin dünya çapında hızla
yayılmasıyla birlikte, Mart 2020’de Dünya Sağlık Örgütü tarafından bir
pandemi ilan edildi. İlk vakalar Mart 2020’de Türkiye’den bildirildi. Hastanemizde ilk pediatrik vaka 2 Nisan 2020 tarihinde tespit edildi. Ancak bu
virüsün bölgemizde bulunup bulunmadığına dair bu tarihten önce herhangi bir veri bulunmamaktadır. Çalışmamızın amacı, pediatrik hastalar
için SARS-CoV-2 virüsünün bölgemize ilk girişini belirlemektir.
Gereç ve Yöntemler: SARS-CoV-2 pozitifliği, 1 Ekim 2019 ile 31 Mart
2020 tarihleri arasında alınan pediatrik solunum yolu örneklerinde RTqPCR yöntemi ile retrospektif olarak araştırıldı. Örneklerde, SARS-CoV-2
RNA, gerçek-zamanlı PCR tabanlı “COVID-19 RT-qPCR Tespit Kiti” kullanılarak çalışıldı.
Bulgular: Çalışmaya 886 örnek dahil edildi. Solunum yolu örneklerinin
%97.1’i nazofaringeal sürüntü, %2.8’i bronkoalveolar lavajdı. En sık rinovirüs (%28.6), influenza A alt tipi H1N1 (pandemik H1N1) (%18.5) ve
influenza B (%16) tespit edildi. Rinovirüs ve enterovirüs birlikte görülen
en sık çift etkenlerdi. İncelenen solunum yolu örneklerinde SARS-CoV-2
pozitifliği tespit edilmemiştir.
Sonuç: SARS-CoV-2 PCR testinin, Türkiye’de pandeminin başlangıcında
sınırlı sayıda merkezde yapılmış olması ilk vakanın tespitini etkilemiş olabilir. Arşivlenmiş örnekler ile yapılacak çok merkezli çalışmalar, ülkemizde SARS-CoV-2’nin izlenmesinde daha gerçekçi sonuçlar sağlayacaktır
Anahtar Kelime: Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık
- 1. World Health Organization (2020). Novel coronavirus (2019- nCoV), situation report-1. Available from: https://www.who.int/ docs/default-source/coronaviruse/situation-reports/20200121-sitrep-1-2019-ncov.pdf Accessed date: 21 January 2020. [CrossRef]
- 2. Yan Y, Chang L, Wang L. Laboratory testing of SARS-CoV, MERS-CoV, and SARS-CoV-2 (2019-nCoV): Current status, challenges, and countermeasures. Rev Med Virol 2020;30:e2106. [CrossRef]
- 3. Cui J, Li F, Shi ZL. Origin and evolution of pathogenic coronaviruses. Nat Rev Microbiol 2019;17:181-192. [CrossRef]
- 4. T.C. Sağlık Bakanlığı. Halk Sağlığı Genel Müdürlüğü (2020). COVID-19 (Sars-Cov-2 Enfeksiyonu) Rehberi, Bilim Kurulu Çalışması. Available from: https:// hgmstokyonetimidb.saglik.gov.tr/Eklenti/37044/0/ covid-19rehberipdf.pdf Accessed date: 14.04.2020. [CrossRef]
- 5. Appak Ö, Duman M, Belet N, Sayıner AA. Viral respiratory infections diagnosed by multiplex polymerase chain reaction in pediatric patients. J Med Virol 2019;91:731-7. [CrossRef]
- 6. Lescure FX, Bouadma L, Nguyen D, Parisey M, Wicky P-H, Behillil S, et al. Clinical and virological data of the first cases of COVID-19 in Europe: a case series. Lancet Infect Dis 2020;20:697-706. [CrossRef]
- 7. Deslandes A, Berti V, Tandjaoui-Lambotte Y, Alloui C, Carbonnelle E, Zahar JL, et al. SARS-CoV-2 was already spreading in France in late December 2019. Int J Antimicrob Agents 2020;55:106006. [CrossRef]
- 8. Blanco-Suárez A, Pérez-Jové P, Escribano-Castillejo N, Ballestero-Tellez M. Retrospective search of SARS-CoV-2 in respiratory samples in Vallès Occidental (Barcelona, Spain) before the first case was reported. Enferm Infecc Microbiol Clin 2020;38:511-2. [CrossRef]
- 9. Hogan CA, Garamani N, Sahoo MK, Huang CH, Zenhder J, Pinsky BA. Retrospective Screening for SARS-CoV-2 RNA in California, USA, Late 2019. Emerg Infect Dis 2020;26:2487-88. [CrossRef]
- 10. Tomb RM, MacLean AR, Gunson RN. Retrospective screening for SARSCoV-2 in Greater Glasgow and Clyde ICUs between December 2019 and February 2020. J Infect 2020;81:452-82. [CrossRef]
APA | Appak O, Güzel I, Gülmez A, ARSLAN n, Duman M, Belet N, SAYINER A (2021). Tracking SARS-CoV-2, İzmir, Turkey. , 235 - 238. 10.5578/ced.20219606 |
Chicago | Appak Ozgur,Güzel Irmak,Gülmez Abdurrahman,ARSLAN nazlı,Duman Murat,Belet Nurşen,SAYINER AYCA ARZU Tracking SARS-CoV-2, İzmir, Turkey. (2021): 235 - 238. 10.5578/ced.20219606 |
MLA | Appak Ozgur,Güzel Irmak,Gülmez Abdurrahman,ARSLAN nazlı,Duman Murat,Belet Nurşen,SAYINER AYCA ARZU Tracking SARS-CoV-2, İzmir, Turkey. , 2021, ss.235 - 238. 10.5578/ced.20219606 |
AMA | Appak O,Güzel I,Gülmez A,ARSLAN n,Duman M,Belet N,SAYINER A Tracking SARS-CoV-2, İzmir, Turkey. . 2021; 235 - 238. 10.5578/ced.20219606 |
Vancouver | Appak O,Güzel I,Gülmez A,ARSLAN n,Duman M,Belet N,SAYINER A Tracking SARS-CoV-2, İzmir, Turkey. . 2021; 235 - 238. 10.5578/ced.20219606 |
IEEE | Appak O,Güzel I,Gülmez A,ARSLAN n,Duman M,Belet N,SAYINER A "Tracking SARS-CoV-2, İzmir, Turkey." , ss.235 - 238, 2021. 10.5578/ced.20219606 |
ISNAD | Appak, Ozgur vd. "Tracking SARS-CoV-2, İzmir, Turkey". (2021), 235-238. https://doi.org/10.5578/ced.20219606 |
APA | Appak O, Güzel I, Gülmez A, ARSLAN n, Duman M, Belet N, SAYINER A (2021). Tracking SARS-CoV-2, İzmir, Turkey. Çocuk Enfeksiyon Dergisi, 15(4), 235 - 238. 10.5578/ced.20219606 |
Chicago | Appak Ozgur,Güzel Irmak,Gülmez Abdurrahman,ARSLAN nazlı,Duman Murat,Belet Nurşen,SAYINER AYCA ARZU Tracking SARS-CoV-2, İzmir, Turkey. Çocuk Enfeksiyon Dergisi 15, no.4 (2021): 235 - 238. 10.5578/ced.20219606 |
MLA | Appak Ozgur,Güzel Irmak,Gülmez Abdurrahman,ARSLAN nazlı,Duman Murat,Belet Nurşen,SAYINER AYCA ARZU Tracking SARS-CoV-2, İzmir, Turkey. Çocuk Enfeksiyon Dergisi, vol.15, no.4, 2021, ss.235 - 238. 10.5578/ced.20219606 |
AMA | Appak O,Güzel I,Gülmez A,ARSLAN n,Duman M,Belet N,SAYINER A Tracking SARS-CoV-2, İzmir, Turkey. Çocuk Enfeksiyon Dergisi. 2021; 15(4): 235 - 238. 10.5578/ced.20219606 |
Vancouver | Appak O,Güzel I,Gülmez A,ARSLAN n,Duman M,Belet N,SAYINER A Tracking SARS-CoV-2, İzmir, Turkey. Çocuk Enfeksiyon Dergisi. 2021; 15(4): 235 - 238. 10.5578/ced.20219606 |
IEEE | Appak O,Güzel I,Gülmez A,ARSLAN n,Duman M,Belet N,SAYINER A "Tracking SARS-CoV-2, İzmir, Turkey." Çocuk Enfeksiyon Dergisi, 15, ss.235 - 238, 2021. 10.5578/ced.20219606 |
ISNAD | Appak, Ozgur vd. "Tracking SARS-CoV-2, İzmir, Turkey". Çocuk Enfeksiyon Dergisi 15/4 (2021), 235-238. https://doi.org/10.5578/ced.20219606 |