Derinliği 0.5-5.0 m. arasında değişen, 2500 dekarlık bir alanı kaplayan Güllük lagünü bir kanal ile Güllük körfezine bağlanır. Bu çalışmada, fiziko-kimyasal, fitoplankton ve bentik örneklemeler 1993 yılında 5 istasyonda aylık olarak yürütülmüştür. Yıllık ortalama sıcaklığın 19.53$pm$1.511°C olduğu lagünde, en düşük sıcaklık Ocak ayında (10.42°C) ve en yüksek sıcaklık Temmuz ayında (26.92°C) saptanmıştır. Yıllık ortalama tuzluluğun %o10.65 $pm$ 0.555 olduğu lagünde tuzluluk, en düşük Ocak ayında 96o 7.48 ve en yüksek Mart ayında %o13.92 ölçülmüştür. Yüzey altı su'da (0.25 m) çözünmüş oksijen yıllık ortalaması 7.32$pm$0.331 mg ]^-1 olduğu lagünde, en düşük oksijen Haziran ayında 5.56 mg ]^-1 ve en yüksek ise Şubat ayında 9.06 mg ]^-1 olarak ölçülmüştür. Secchi-disk derinliği Mayıs'ta 1.12 m ve Ekim'de 2.40 m'dir. Nutrient ölçümlerinde amonyum yüksek düzeyde (4.39-29.70 $mu$g-at ]^-1), nitrat (0.81-17.87 $mu$g-at ]^-1), nitrit (0.19- 1.35 $mu$g-at ]^-1), fosfat (0.01 - 0.45 $mu$g-at ]^-1) ve silis (0.26 - 6.00 $mu$g-at ]^-1) düşük düzeylerde saptanmıştır. Birincil üretimi ifade eden klorofil a dağılımı Mayısta en yüksek (21.49 mg ]^-1) ve Eylülde en düşük düzeylere sahiptir (0,77 mg M). Melosira moniliformis tüm yıl boyunca dağılım gösteren baskın fitoplankton türüdür. Lagündeki tüm istasyonlar, yüksek diversite özelliği göstermektedir. Bentik türlerin tanımı bir yıllık periyotta 5 istasyondan alınan 60 örnek'te yapılmıştır. Bentik örneklerde 7 sistematik gruba (Nemertina, Polychaeta, Oligochaeta, Crustacea, Mollusca, İnsecta, Echinodermata) ait 68 tür tanımlanmıştır. Polychaeta grubu içinde yeralan Notomastus latericeus (3737 birey) sayısal olarak en baskın tür olup, bunu Hediste diversicolor (1524 birey) ve Spionidae (sp) (1361 birey) izlemiştir. Lagündeki ekonomik öneme sahip balık türleri, kefal Mugil cephalus (has, topan, paçoz), Mugil capito (ceran, plutarina, ince dudaklı), Chelon labrosus (mavraki, kalın dudaklı), Lizasaliens (kastros, ilarya, mavraki), Sparus aurata (çipura), Dicentrarchus labrax (levrek), Solea solea (dil balığı), Anguilla anguilla (yılan balığı) ve sazan'dır. Lagün yıllık 10-69 ton arasında değişen balık verimine sahiptir.