Kırıkkale bölgesinde koyun kökenli Echinococcus granulosus izolatlarının moleküler karakteri

ÇAKIR, Şükran; GAZYAĞCI, Aycan N.; YILDIZ, Kader; YILDIRAN, F. Azize Budak

Kırıkkale bölgesinde koyun kökenli Echinococcus granulosus izolatlarının moleküler karakteri

F. Azize Budak YILDIRAN, (Kırıkkale Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi, Biyoloji Bölümü, Kırıkkale, Türkiye)

Kader YILDIZ, (Kırıkkale Üniversitesi, Veteriner Fakültesi, Parazitoloji Anabilim Dalı, Kırıkkale, Türkiye)

Şükran ÇAKIR, (Kırıkkale Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi, Biyoloji Bölümü, Kırıkkale, Türkiye)

Aycan N. GAZYAĞCI (Kırıkkale Üniversitesi, Veteriner Fakültesi, Parazitoloji Anabilim Dalı, Kırıkkale, Türkiye)

Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi

3 0

Yıl: 2010 Cilt: 16 Sayı: 2 Sayfa Aralığı: 245 - 250 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 29-07-2022

Kırıkkale bölgesinde koyun kökenli Echinococcus granulosus izolatlarının moleküler karakteri

Öz:

Bu çalışmada, koyunlardan elde edilen Echinococcus granulosus’un moleküler karakterizasyonunu belirlemek amaçlandı. Bunun için enfekte koyunların değişik organlarından elde edilen 24 adet kist hidatit’e ait germinal membran ve protoskoleks örneklerinden DNA izolasyonu yapıldı ve daha sonra DNA örnekleri 16 primer kullanılarak RAPD-PCR metodu ile tarandı. Echinococcus granulosus G1 suşu referans materyali olarak kullanıldı. Kullanılan 16 primerden 4’ü (AP2, AP4, OPB12 ve G05) koyun izolatları ve referans G1suşunun her ikisinde de tipik RAPD band kalıpları verdi. AP2 primeri ile oluşan 250 baz çiftlik tek bant koyun izolatları ve G1 suşunun her ikisinde de ortaktı. Sonuçlar bu çalışmada örneklenen koyun izolatlarının hepsinin aynı Echinococcus granulosus suşu olacağına işaret etmektedir.

Anahtar Kelime: ekinokokozis DNA Echinococcus granulosus koyun Türkiye soy Kırıkkale rastgele çoğaltılmış polimorfik DNA karakterizasyon polimeraz zincir reaksiyonu

Konular: Biyoloji Veterinerlik

The molecular characterization of Echinococcus granulosus isolates from sheep in Kırıkkale region

Öz:

In present study, it was aimed to determine molecular characterization of Echinococcus granulosus obtained from sheep. For this purpose, DNA isolation was done from germinal membrans and protoscolices of 24 hydatic cyst samples obtained from different organs of infected sheep and then DNA samples were scanned by RAPD-PCR using 16 primers. Echinococcus granulosus G1 strain was used as reference material. Only 4 of these 16 primers (AP2, AP4, OPB12 and G05) gave the typical RAPD band patterns in both sheep isolates and the reference G1 strain. The single band of 250 bp occurred by AP2 primer was common in both sheep isolates and G1strain According to result, AP2 primer can be successfully used for separation of G1 strain in different isolates. The results indicated that all sheep isolates sampled in this study can be assumed in the same Echinococcus granulosus strain.

Anahtar Kelime: sheep Turkey strains Kirikkale random amplified polymorphic DNA characterization polymerase chain reaction echinococcosis DNA Echinococcus granulosus

Konular: Biyoloji Veterinerlik

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık

1.Eckert J, Gemmel MA, Meslin FX, Pawlowski ZS: WHO/OIE Manual on Echinococcosis in Humans and Animals: A Public Health Problem of Global Concern. 2001.
2.McManus DP, Zhang W, Li J, Bartley PB: Echinococcosis. Lancet, 362, 1295-1304, 2003.
3.Gıcık Y, Arslan MÖ, Kara M, Köse M: Kars ilinde kesilen snğnr ve koyunlarda kistik ekinokokkozisin yaygınlığı. Türkiye Parazitol Derg, 28, 136-139, 2004.
4.Oge H, Kalınbacak F, Gıcık Y, Yıldız K: Ankara yöresinde kesilen koyun, keçi ve sığırlarda bazı metasestodların (Hidatik kist, Cysticercus tenuicollis, Cysticercus bovis) yaynlnşn. Ankara Univ Vet Fak Derg, 45, 123-130, 1998.
5.Şenlik B: Bursa yöresi koyunlarında hidatidoz’un yaygnnlnğn ve yaş, nrk, cinsiyetle ilişkisi. Türkiye Parazitol Derg, 24, 304308, 2000.
6.Umur S: Prevalence and economic importance of cystic echinococcosis in slaughtered ruminants in Burdur, Turkey. J Med Vet B, 50, 247-252, 2003.
7.Yıldız K, Gurcan S: Prevalence of hydatidosis and fertility of hydatid cysts in sheep in Kırıkkale, Turkey. Acta Vet Hung, 51, 181-187, 2003.
8.Yıldız K, Tunçer Ç: Kırıkkale’de sığırlarda kist hidatik’in yayılışı. Türkiye Parazitol Derg, 29, 247-250. 2005.
9.Arslan MÖ, Umur Ş: Erzurum mezbahalarında kesilen koyun ve snğnrlarda hidatidozun yayılışı ve ekonomik önemi. Kafkas Univ Vet Fak Derg, 3, 167-171, 1997.
10.Yılmaz H, Taş Cengiz Z, Çiçek M: The problem of cystic echinococcosis in Van Province. Kafkas Univ Vet Fak Derg, 15, 607-610, 2009.
11.Ataş AD, Özçelik S, Saygm G: Sivas sokak köpeklerinde görülen helmint türleri, bunların yayılışı ve halk sağlığı yönünden önemi. Türkiye Parazitol Derg, 21, 305-309, 1997.
12.Doğanay A: Ankara köpeklerinde görülen helmint türleri, bunlarnn yayılışı ve halk sağlnğn yönünden önemi. Ankara Univ Vet Fak Derg, 30, 550-561, 1983.
13. Pamukcu AM, Ertürk E: 1933-1960 ynllarn arasnnda Ankara ve yöresi köpeklerde görülen hastalnklara toplu bir baknş. Ankara Univ Vet Fak Derg, 8, 323-346, 1961.
14. Umur Ş, Arslan MÖ: Kars yöresi sokak köpeklerinde görülen helmint türlerinin yayılışı. Türkiye Parazitol Derg, 22, 188-193, 1998.
15. Altintas N: Past to present: Echinococcosis in Turkey. Acta Trop, 85, 105-112, 2003.
16. Kamenetzky L, Gutierrez AM, Canova SG, Haag KL, Guarnera EA, Parra A, Garcia GE, Rosenzvit MC: Several strains of Echinococcus granulosus infect livestock and humans in Argentina. Infec Gen Evol, 2, 129-136, 2002.
17. Altmntaş N, Tmnar R, Çoker A: Echinococcosis. Hidatidoloji Derneği Yaynn No.1, Ege Üniv Matbaasn, Bornova, İzmir. 2004.
18. Hobbs RP, Lymbery AJ, Thompson RCA: Rostellar hook morphology of Echinococcus granulosus (Batsch, 1786) from natural and experimental Australian hosts, and its implications for strain recognition. Parasitology, 101, 273-281, 1990.
19. Kumaratilake LM, Thompson RCA: Morphological characterization of Australian strains of Echinococcus granulosus. Int J Parasitol, 14, 467-477, 1984.
20. Nakao M, McManus DP, Schantz M, Craig PS, Ito A: A molecular pylogeny of the genus Echinococcus inferred from complete mitochondrial genomes. Parasitology, 134, 713722, 2007.
21. Utuk AE, Simsek S, Koroglu E, McManus DP: Molecular genetic characterization of different isolates of Echinococcus granulosus in east and southeast regions of Turkey. Acta Trop, 107, 192-194, 2008.
22. Thompson RCA, McManus DP: Towards a taxonomic revision of the genus Echinococcus. Trends Parasitol, 18, 452457, 2002.
23. Thompson RCA, Lymbery AJ, Constantine CC: Variation in Echinococcus: Towards a taxonomic revision of the genus. Adv Parasitol, 35, 145-176, 1995.
24. Ortona E, Margutti P, Rigano R, Siracusano A: Genetic variability in Italian sheep isolates of Echinococcus granulosus. Appl Parasitol, 3, 205-208, 1996.
25. Siles-Lucas M, Felleisen R, Cuesta-Bandera C, Gottstein B, Eckert J: Comperative genetic analysis of Swiss and Spanish isolates of Echinococcus granulosus by southern hybridization and random amplified polymorphic DNA technique. Appl Parasitol, 35, 107-117, 1994.
26. Romig T, Dinkel A, Mackenstedt U: The present situation of echinococcosis in Europe. Parasitol Int, 55, 187-191, 2006.
27. Turcekova L, Snabel V, D’Amelio S, Busi M, Dubinsky P: Morphological and genetic characterization of Echinococcus granulosus in the Slovac Republic. Acta Trop, 85, 223-229, 2003.
28. Azab ME, Bishara SA, Helmy H, Oteifa NM, El-Hoseiny LM, Ramzy RMR, Ahmed MA: Molecular characterization of Egyptian human and animal Echinococcus granulosus isolates by RAPD-PCR technique. J Egpt Soc Parasitol, 34, 83-96, 2004.
29. Mwambete KD, Ponce-Gordo F, Cuesta-Bandera C: Genetic identification and host range of the Spanish strains of Echinococcus granulosus. Acta Tropica, 91, 87-93, 2004.
30. Reddy YA, Rao JR, Butchiaiah G, Sharma B: Random amplified polymorphic DNA for the specific detection of bubaline Echinococcus granulosus by hibridizition assay. Vet Parasitol, 79, 315-323, 1998.
31. Siles-Lucas M, Cuesta-Bandera C, Cezar-Benito M: Random Amplified polymorphic DNA techniques for speciation studies of Echinococcus granulosus. Parasitol Res, 79, 343345, 1993.
32. Bhattacharya D, Bera AK, Bera BC, Pan D, Das SK: Molecular appraisal of Indian animal isolates of Echinococcus granulosus. Indian J Med Res, 127, 383-387, 2008.
33. Ymldmz K, Gurcan IS: The detect of Echinococcus granulosus strain using larval rostellar hook morphometry. Türkiye Parazitol Derg, 33, 199-202, 2009.
34. Güralp N, Doğru C: Ankara mezbahasnnda kesilen değişik yaşlardaki koyun ve snğnrlarnn organlarnnda görülen ekinokok kistlerinin fertilite durumlarn. Ankara Univ Vet Fak Derg, 18, 195-205, 1971.

APA	YILDIRAN F, YILDIZ K, ÇAKIR Ş, GAZYAĞCI A (2010). Kırıkkale bölgesinde koyun kökenli Echinococcus granulosus izolatlarının moleküler karakteri. , 245 - 250.
Chicago	YILDIRAN F. Azize Budak,YILDIZ Kader,ÇAKIR Şükran,GAZYAĞCI Aycan N. Kırıkkale bölgesinde koyun kökenli Echinococcus granulosus izolatlarının moleküler karakteri. (2010): 245 - 250.
MLA	YILDIRAN F. Azize Budak,YILDIZ Kader,ÇAKIR Şükran,GAZYAĞCI Aycan N. Kırıkkale bölgesinde koyun kökenli Echinococcus granulosus izolatlarının moleküler karakteri. , 2010, ss.245 - 250.
AMA	YILDIRAN F,YILDIZ K,ÇAKIR Ş,GAZYAĞCI A Kırıkkale bölgesinde koyun kökenli Echinococcus granulosus izolatlarının moleküler karakteri. . 2010; 245 - 250.
Vancouver	YILDIRAN F,YILDIZ K,ÇAKIR Ş,GAZYAĞCI A Kırıkkale bölgesinde koyun kökenli Echinococcus granulosus izolatlarının moleküler karakteri. . 2010; 245 - 250.
IEEE	YILDIRAN F,YILDIZ K,ÇAKIR Ş,GAZYAĞCI A "Kırıkkale bölgesinde koyun kökenli Echinococcus granulosus izolatlarının moleküler karakteri." , ss.245 - 250, 2010.
ISNAD	YILDIRAN, F. Azize Budak vd. "Kırıkkale bölgesinde koyun kökenli Echinococcus granulosus izolatlarının moleküler karakteri". (2010), 245-250.

APA	YILDIRAN F, YILDIZ K, ÇAKIR Ş, GAZYAĞCI A (2010). Kırıkkale bölgesinde koyun kökenli Echinococcus granulosus izolatlarının moleküler karakteri. Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi, 16(2), 245 - 250.
Chicago	YILDIRAN F. Azize Budak,YILDIZ Kader,ÇAKIR Şükran,GAZYAĞCI Aycan N. Kırıkkale bölgesinde koyun kökenli Echinococcus granulosus izolatlarının moleküler karakteri. Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi 16, no.2 (2010): 245 - 250.
MLA	YILDIRAN F. Azize Budak,YILDIZ Kader,ÇAKIR Şükran,GAZYAĞCI Aycan N. Kırıkkale bölgesinde koyun kökenli Echinococcus granulosus izolatlarının moleküler karakteri. Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi, vol.16, no.2, 2010, ss.245 - 250.
AMA	YILDIRAN F,YILDIZ K,ÇAKIR Ş,GAZYAĞCI A Kırıkkale bölgesinde koyun kökenli Echinococcus granulosus izolatlarının moleküler karakteri. Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi. 2010; 16(2): 245 - 250.
Vancouver	YILDIRAN F,YILDIZ K,ÇAKIR Ş,GAZYAĞCI A Kırıkkale bölgesinde koyun kökenli Echinococcus granulosus izolatlarının moleküler karakteri. Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi. 2010; 16(2): 245 - 250.
IEEE	YILDIRAN F,YILDIZ K,ÇAKIR Ş,GAZYAĞCI A "Kırıkkale bölgesinde koyun kökenli Echinococcus granulosus izolatlarının moleküler karakteri." Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi, 16, ss.245 - 250, 2010.
ISNAD	YILDIRAN, F. Azize Budak vd. "Kırıkkale bölgesinde koyun kökenli Echinococcus granulosus izolatlarının moleküler karakteri". Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi 16/2 (2010), 245-250.