Çeşitli Klinik Örneklerden İzole Edilen Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae İzolatlarının Antibiyotiklere Direnç Durumu

OZER, SERDAR; BAŞGÖNÜL, Sedef; ÇAĞ, Yasemin; haciseyitoglu, demet

Çeşitli Klinik Örneklerden İzole Edilen Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae İzolatlarının Antibiyotiklere Direnç Durumu

Demet HACISEYİTOĞLU, (SB Dr. Lütfi Kırdar Kartal Eğitim ve Araştırma Hastanesi, Klinik Mikrobiyoloji Laboratuvarı)

Yasemin ÇAĞ, (SB Dr. Lütfi Kırdar Kartal Eğitim ve Araştırma Hastanesi, Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Kliniği)

Sedef BAŞGÖNÜL, (SB Dr. Lütfi Kırdar Kartal Eğitim ve Araştırma Hastanesi, Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Kliniği)

Serdar ÖZER (SB Dr. Lütfi Kırdar Kartal Eğitim ve Araştırma Hastanesi, Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Kliniği)

Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi

8 3

Yıl: 2014 Cilt: 44 Sayı: 3 Sayfa Aralığı: 101 - 106 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 29-07-2022

Çeşitli Klinik Örneklerden İzole Edilen Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae İzolatlarının Antibiyotiklere Direnç Durumu

Öz:

Amaç: Genişlemiş spektrumlu beta laktamazlar (GSBL)Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae başta olmak üzereEnterobacteriaceae'da sık görülmektedir. Beraberinde florokinolonve aminoglikozid direnci de görülebildiğinden gelişenenfeksiyonların tedavisi daha da güçleşmektedir. Bu nedenleuygun empirik tedavide direnç durumunun bilinmesi son dereceönemlidir. Bu çalışmada hastanemizde yatan hastalarınçeşitli klinik örneklerinden izole edilen E. coli ve K. pneumoniaeizolatlarının GSBL üretme oranını ve antibiyotik duyarlılıkdurumunu belirlemeyi amaçladık.Gereç ve Yöntem: Çalışmaya Ocak-Aralık 2012 tarihleri arasındaLütfi Kırdar Kartal Eğitim ve Araştırma Hastanesi'ndeyatan hastaların klinik örneklerinde ilk üreyen 385 E. coli ve154 K. pneumoniae izolatı dâhil edildi. Aynı hastaların farklıkültürlerinden üreyen izolatlar çalışma dışı bırakıldı. Üreyenbakterilerin tanımlanması, antibiyotik duyarlılıkları ve GSBLvarlığı VITEK2 otomatize sistemiyle (bioMérieux, Fransa)belirlendi.Bulgular: Çalışmamızda 385 adet E. coli ve 154 adetK. pneumoniae izole edildi. Üç yüz seksen beş E. coli izolatının212'sinin (%55), 154 K. pneumoniae izolatının 86'sının(%55.8) GSBL ürettiği saptandı. GSBL pozitif E. coli'de siprofloksasine%70.7, kotrimoksazole %74.0 amikasine %16.5,gentamisine %43 oranında direnç saptandı. GSBL pozitifK. pneumoniae'da ise siprofloksasine %66.2, kotrimoksazole%68.6, amikasine %16.2, gentamisine %43.0 oranında dirençbelirlendi. GSBL üreten E. coli'lerin %1.4'ü imipeneme, %2.8'iertapeneme ve %0.9'u meropeneme dirençli idi. GSBL pozitifK. pneumoniae'da %10.5 imipeneme, %7.0 meropeneme, %11.6ertapeneme direnç bulundu. Kolistine dirençli suş tespit edilmedi.Sonuç: GSBL pozitif E. coli ve K. pneumoniae'da direnç oranıen düşük olan antibiyotiklerin kolistin ve karbapenemler oldu-ğu görüld.

Anahtar Kelime:

Konular: Mikrobiyoloji Biyoteknoloji ve Uygulamalı Mikrobiyoloji

Antibiotic Resistance Patterns of Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae Strains Isolated from Clinical Specimens

Öz:

Objective: Extended-spectrum beta-lactamases (ESBL) arefrequently seen in Enterobacteriaceae species, especiallyEscherichia coli and Klebsiella pneumoniae. Treatment ofinfections caused by these bacteria is becoming even morechallenging due to simultaneous co-resistance to aminoglycosidesand fluoroquinolones. Thus, knowledge about thestate of resistance is extremely important for appropriateempirical antibiotic treatment. This study was conducted todetermine the antimicrobial susceptibility patterns and therates of ESBL production in E. coli and K. pneumoniae strainsisolated from the clinical specimens of hospitalized patientsin our hospital.Materials and Methods: A total of firstly grown isolates of385 E. coli and 154 K. pneumoniae on the bacterial cultures ofclinical specimens of consecutive patients hospitalized betweenJanuary and December 2012 were analyzed, Strains isolatedsimultaneously from the other body sites of the same patientswere excluded from the analysis. VITEK 2 automated system(bioMérieux, France) was used for bacterial identification,susceptibility testing, and detection of the presence of ESBL.Results: In our study 212 (55%)out of 385 E. coli, and 86(55.8%) out of 154 K. pneumoniae strains were found toproduce ESBL. The resistance rates of ESBL-producing E. coliwere 70.7% for ciprofloxacin, 74.0% for co-trimoxazole,16.5% for amikacin, and 43.0% for gentamicin. The correspondingrates for ESBL-producing K. pneumoniae were 66.2,68.6, 16.2, and 43%, respectively. Of ESBL-producing E. colistrains, 1.4% were resistant to imipenem, 2.8% to ertapenem,and 0.9% to meropenem. Among ESBL-producing K. pneumoniaestrains, 10.51, 7, and 11.6% of isolates exhibited resistance toimipenem, meropenem, and ertapenem, respectively. Any resistantstrain to colistin was not detected.Conclusion: Among ESBL-producing E. coli and K. pneumoniaestrains the lowest rates of resistance was seen against colistinand carbapene.

Anahtar Kelime:

Konular: Mikrobiyoloji Biyoteknoloji ve Uygulamalı Mikrobiyoloji

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık

1. Jacoby GA, Munoz-Price LS. The new betalactamases. N Engl J Med 2005; 352:380-91. http://dx.doi.org/10.1056/NEJMra041359
2. Bradford PA. Extended-spectrum-beta-lactamases in the 21st century: characterization, epidemiology, and detection of this important resistance threat. Clin Microbiol Rev 2001; 14:933-51. http://dx.doi: 10.1128/CMR.14.4.933-951.2001
3. Mulvey MR, Simor AE. Antimicrobial resistance in hospitals: How concerned should we be? CMAJ 2009; 180:408-15. http://dx.doi: 10.1503/cmaj.080239
4. Clinical and Laboratory Standards Institute; CLSI. Performance Standards for Antimicrobial Susceptibility Testing; Twenty-Third Informational Supplement. CLSI Document M100-S23. Wayne, PA; 2013.
5. Bertrand X, Dowzicky MJ. Antimicrobial susceptibility among gram-negative isolates collected from intensive care units in North America, Europe, the Asia-Pacific Rim, Latin America, the Middle East, and Africa Between 2004 and 2009 as Part of the Tigecycline Evaluation and Surveillance Trial. Clin Ther 2012; 34:124-37. http://dx.doi:10.1016/j.clinthera.2011.11.023
6. Reinert RR, Low DE, Rossi F, Zhang X, Wattal C, Dowzicky MJ. Antimicrobial susceptibility among organisms from the Asia/Pacific Rim, Europe and Latin and North America collected as part of TEST and the in vitro activity of tigecycline. J Antimicrob Chemother 2007; 60:1018-29.
7. Hoban DJ, Nicolle LE, Hawser S, Bouchillon S, Badal R. Antimicrobial susceptibility of global in patient urinary tract isolates of Escherichia coli: results from the Study for Monitoring Antimicrobial Resistance Trends (SMART) Program: 2009-2010. Diagn Microbiol Infect Dis 2011; 70:507-11. http://doi:10.1016/j.diagmicrobio.2011.03.021.
8. Korten V, Ulusoy S, Zarakolu P, Mete B, Turkish MYSTIC Study Group. Antibiotic resistance surveillance over a 4-year period (2000-2003) in Turkey: results of the MYSTIC Program. Diagn Microbiol Infect Dis 2007; 59:453-7. http://doi:10.1016/j.diagmicrobio.2007.06.016.
9. Gür D, Gülay Z, Akan ÖA, ve ark. Türkiye'de hastane izolatı gram-negatif bakterilerde yeni beta-laktam antibiyotiklere direnç ve GSBL tipleri: Çok Merkezli Hitit Sürveyansının Sonuçları. Mikrobiyol Bul 2008; 42:537-44.
10. Aykan ŞB, Çiftçi İ. Türkiye'de idrar kültürlerinden izole edilen Escherichia coli suşlarının antibiyotiklere direnç durumu: Bir Meta-Analiz Mikrobiyol Bul 2013; 47:603-18.
11. Baykal A, Çöplü N, Şimşek H, Esen B, Gür D. Kan izolatı E. coli ve K. pneumoniae suşlarında genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz, KPC-Tip karbapenemaz ve plazmid aracılı AmpC beta-laktamaz varlığının araştı- rılması. Mikrobiyol Bul 2012; 46:159-69.
12. Güler Ö, Aktaş O, Uslu H. Klinik örneklerden izole edilen bakterilerde beta-laktamaz varlığının ve çeşitli antibiyotik gruplarına karşı duyarlılıklarının araştırılması. ANKEM Derg 2008; 22:72-80.
13. Uğur AR, Türk Dağı H, Tuncer İ, Fındık D, Arslan U. İdrar kültürlerinden izole edilen Esherichia coli suşları- nın antibiyotik duyarlılığı ve genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz oranı. ANKEM Derg 2013; 27:13-18. http://doi:10.5222/ankem.2013.013.
14. Karaayak Uzun B, Güngör S, Şerifhan İlgün M, Özdemir R, Baran N, Yüksel Ergin Ö. Kan kültürlerinden izole edilen Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae izolatlarında genişlemiş spektrumlu betalaktamaz sıklığı ve in-vitro antibiyotiklere direnç paternleri. ANKEM Derg 2012; 26:181-6. http://doi:10.5222/ankem.2012.181
15. Işıkgöz Taşbakan M, Pullukçu H, Sipahi OR, ve ark. Hastane kökenli bakteriyemi etkeni olan Klebsiella pneumoniae suşlarının direnç paternleri ve genişlemiş spektrumlu beta laktamaz üretimi: 2001-2005 yıllarının değerlendirilmesi. Mikrobiyol Bul 2008; 42:1-7.
16. Al-Muhtaseb M, Kaygusuz A. Kan kültürlerinden izole edilen Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae suşlarında genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz (GSBL) sıklığı. ANKEM Derg 2008; 22:175-82.
17. Senbayrak Akcay S, Inan A, Cevan S, ve ark. Gramnegative bacilli causing infections in an intensive care unit of a tertiary care hospital in Istanbul, Turkey. J Infect Dev Ctries 2014; 8:597-604. http://doi: 10.3855/jidc.4277.
18. Nazik H, Öngen B, Sarıkaya A, Kuvat N, İlktaç M. Genişlemiş Spektrumlu beta-laktamaz üreten Klebsiella pneumoniae suşlarında CTX-M tipi beta-laktamaz sıklığı ve antibiyotik ko-rezistansı. Turkiye Klinikleri J Med Sci 2011; 31:300-6. http://doi:10.5336/medsci.2010-19642
19. Gündem NS, Çıkman A, Gülhan B. İdrar kültürlerinden izole edilen Escherichia coli ve Klebsiella spp. suşlarının genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz (GSBL) üretimi ve antibiyotik direnci. J Clin Exp Invest 2013; 4:56-62. http://doi: 10.5799/ahinjs.01.2013.01.0234
20. Karlı Ş, Ceran N, Genç İ, ve ark. Toplum ve hastane kaynaklı infeksiyonlardan izole edilen GSBL pozitif Escherichia coli suşlarında tigesiklin duyarlılığının araştırılması. ANKEM Derg 2010; 24:209-14.
21. Falagas ME, Karageorgopoulos DE. Extendedspectrum beta-lactamase-producing organisms. J Hosp Infect 2009; 73:345-54. http://doi:10.1016/j.jhin.2009.02.021
22. Ulusoy S. Tigesiklin. ANKEM Derg 2006; 20(Ek 2):E117-19.
23. Bouchillon SK, Hoban DJ, Johnson BM, Johnson JL, Hsiung A, Dowzicky MJ, Tigecycline Evaluation and Surveillance Trial (TEST) Group. In vitro activity of tigecycline against 3989 Gram-negative and Grampositive clinical isolates from the United States Tigecycline Evaluation and Surveillance Trial (TEST Program; 2004). Diagn Microbiol Infect Dis 2005; 52:173-9. http://dx.doi.org/10.1016/j.diagmicrobio.2005.06.004
24. Özkan Ö, Özbek B, Sınırtaş M, Özakın C. Gram negatif bakterilerde tigesiklin duyarlılığı. Turk Mikrobiyol Cem Derg 2011; 41:42-5. http:// doi:10.5222/TMCD.2011.042
25. Mengeloğlu FZ, Taş T, Koçoğlu E, Bucak Ö. Geniş- lemiş spektrumlu beta-laktamaz üreten Escherichia coli izolatlarında tigesiklin duyarlılığının belirlenmesi. Abant Med J 2013; 2;87-90. http://doi: 10.5505/abantmedj.2013.29392

APA	haciseyitoglu d, ÇAĞ Y, BAŞGÖNÜL S, OZER S (2014). Çeşitli Klinik Örneklerden İzole Edilen Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae İzolatlarının Antibiyotiklere Direnç Durumu. , 101 - 106.
Chicago	haciseyitoglu demet,ÇAĞ Yasemin,BAŞGÖNÜL Sedef,OZER SERDAR Çeşitli Klinik Örneklerden İzole Edilen Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae İzolatlarının Antibiyotiklere Direnç Durumu. (2014): 101 - 106.
MLA	haciseyitoglu demet,ÇAĞ Yasemin,BAŞGÖNÜL Sedef,OZER SERDAR Çeşitli Klinik Örneklerden İzole Edilen Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae İzolatlarının Antibiyotiklere Direnç Durumu. , 2014, ss.101 - 106.
AMA	haciseyitoglu d,ÇAĞ Y,BAŞGÖNÜL S,OZER S Çeşitli Klinik Örneklerden İzole Edilen Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae İzolatlarının Antibiyotiklere Direnç Durumu. . 2014; 101 - 106.
Vancouver	haciseyitoglu d,ÇAĞ Y,BAŞGÖNÜL S,OZER S Çeşitli Klinik Örneklerden İzole Edilen Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae İzolatlarının Antibiyotiklere Direnç Durumu. . 2014; 101 - 106.
IEEE	haciseyitoglu d,ÇAĞ Y,BAŞGÖNÜL S,OZER S "Çeşitli Klinik Örneklerden İzole Edilen Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae İzolatlarının Antibiyotiklere Direnç Durumu." , ss.101 - 106, 2014.
ISNAD	haciseyitoglu, demet vd. "Çeşitli Klinik Örneklerden İzole Edilen Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae İzolatlarının Antibiyotiklere Direnç Durumu". (2014), 101-106.

APA	haciseyitoglu d, ÇAĞ Y, BAŞGÖNÜL S, OZER S (2014). Çeşitli Klinik Örneklerden İzole Edilen Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae İzolatlarının Antibiyotiklere Direnç Durumu. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi, 44(3), 101 - 106.
Chicago	haciseyitoglu demet,ÇAĞ Yasemin,BAŞGÖNÜL Sedef,OZER SERDAR Çeşitli Klinik Örneklerden İzole Edilen Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae İzolatlarının Antibiyotiklere Direnç Durumu. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi 44, no.3 (2014): 101 - 106.
MLA	haciseyitoglu demet,ÇAĞ Yasemin,BAŞGÖNÜL Sedef,OZER SERDAR Çeşitli Klinik Örneklerden İzole Edilen Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae İzolatlarının Antibiyotiklere Direnç Durumu. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi, vol.44, no.3, 2014, ss.101 - 106.
AMA	haciseyitoglu d,ÇAĞ Y,BAŞGÖNÜL S,OZER S Çeşitli Klinik Örneklerden İzole Edilen Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae İzolatlarının Antibiyotiklere Direnç Durumu. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi. 2014; 44(3): 101 - 106.
Vancouver	haciseyitoglu d,ÇAĞ Y,BAŞGÖNÜL S,OZER S Çeşitli Klinik Örneklerden İzole Edilen Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae İzolatlarının Antibiyotiklere Direnç Durumu. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi. 2014; 44(3): 101 - 106.
IEEE	haciseyitoglu d,ÇAĞ Y,BAŞGÖNÜL S,OZER S "Çeşitli Klinik Örneklerden İzole Edilen Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae İzolatlarının Antibiyotiklere Direnç Durumu." Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi, 44, ss.101 - 106, 2014.
ISNAD	haciseyitoglu, demet vd. "Çeşitli Klinik Örneklerden İzole Edilen Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae İzolatlarının Antibiyotiklere Direnç Durumu". Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi 44/3 (2014), 101-106.