Son Üç Yılda Kahramanmaraş Necip Fazıl Şehir Hastanesinde Kan Kültürlerinden İzole Edilen Candida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılıkları

TÜMER, Seray; Özkaya, Esra; Çalışkan, Ahmet; Kirişci, Özlem

Son Üç Yılda Kahramanmaraş Necip Fazıl Şehir Hastanesinde Kan Kültürlerinden İzole Edilen Candida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılıkları

Esra ÖZKAYA, (Karadeniz Teknik Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı)

Ahmet ÇALIŞKAN, (Kahramanmaraş Necip Fazıl Şehir Hastanesi, Mikrobiyoloji Laboratuvarı)

Özlem KİRİŞÇİ, (Kahramanmaraş Necip Fazıl Şehir Hastanesi, Mikrobiyoloji Laboratuvarı)

Seray TÜMER (*Adana Devlet Hastanesi, Mikrobiyoloji Laboratuvarı)

Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi

0 0

Yıl: 2016 Cilt: 46 Sayı: 2 Sayfa Aralığı: 63 - 68 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 29-07-2022

Son Üç Yılda Kahramanmaraş Necip Fazıl Şehir Hastanesinde Kan Kültürlerinden İzole Edilen Candida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılıkları

Öz:

Amaç: Candida türleri, ciddi enfeksiyonlara yol açan fırsatçı patojenlerdir. Son yıllarda hastane kökenli mantar enfeksiyonlarında artış gözlenmekte olup, tüm hastane enfeksiyonlarının %5'inden Candida türlerinin sorumlu olduğu bildirilmektedir. Kandidemilerde en sık etken Candida albicans'dır. Ancak albikans-dışı Candida türlerinin de görülme oranı giderek artmaktadır ve antifungallere duyarlılıkları birbirlerinden farklılık göstermektedir. Çalışmamızda Ocak 2013Aralık 2015 tarihleri arasında laboratuvarımıza çeşitli klinik birimlerden gönderilen kan kültürlerinden izole edilen Candida türlerinin tanımlanması ve antifungal duyarlılık oranlarının belirlenmesi amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Çalışmamız süresince Kahramanmaraş Necip Fazıl Şehir Hastanesi Mikrobiyoloji Laboratuvarına gönderilen tüm kan kültürü örnekleri incelenmiştir. Örnekler BACTEC/9050 (Becton Dickinson, Maryland, ABD) otomatize sisteminde inkübe edilmiştir. Maya izolatlarının tür düzeyinde identifikasyonu ve antifungal duyarlılıkları Vitek 2.0 Compact (BioMérieux, Fransa) otomatize sistemi kullanılarak saptanmıştır. İzolatlarının flukonazol, vorikonazol, flusitozin, amfoterisin B ve kaspofungine duyarlılık kategorileri Klinik ve Laboratuvar Standartları Enstitüsü (CLSI M27-A3) standartlarına göre belirlenmiştir. Bulgular: Çalışma süresince laboratuvarımıza toplam 8271 kan kültürü örneği gönderilmiştir. Gönderilen örneklerin 6419 (%77.6)'unda üreme saptanmamıştır. Elli hastaya ait 93 kan kültürü örneğinde Candida spp. üremesi görülmüştür. Kan kültürlerinde Candida spp. tespit edilen hastaların 2'si (%4.0) dâhiliye servisinde, diğerleri (%96.0) yoğun bakım ünitelerinde tedavi görmekteydi. İzolatların %62.0'ını Candida parapsilosis oluşturmaktadır. İkinci sıklıkta C. albicans (%34.0) saptanmıştır. Candida tropicalis ve Candida krusei türlerinden ise birer izolat (%2.0) bulunmuştur. Antifungal duyarlılık testlerinde flusitozine karşı hiç direnç saptanmamıştır. En düşük duyarlılık oranının (%74.2) C. parapsilosis izolatlarında vorikonazole karşı olduğu görülmüştür. C. albicans izolatlarında amfoterisin B'ye %94.1 oranında duyarlılık görülmüşken, test edilen diğer antifungal maddelere direnç bulunmamıştır. Sonuç: Çalışmamızda, en sık yoğun bakım ünitelerinden gönderilen kan kültürü örneklerinde Candida türleri saptanmıştır. Ayrıca çalışmamızda, en sık C. parapsilosis, ikinci sıklıkta ise C. albicans türü tespit edilmiştir. İzole edilen kandida türlerinin bazı antifungallere karşı dirençli olduğu görülmüştür. Bu durum, özellikle yoğun bakım ünitelerindeki hastalarda, tür düzeyinde tanımlamasının ve antifungal duyarlılıklarının bildirilmesinin tanı ve tedavi takibinde oldukça önemli olduğunu düşündürmüştür

Anahtar Kelime:

Konular: Biyoloji Mantar Bilimi Mikrobiyoloji Biyoteknoloji ve Uygulamalı Mikrobiyoloji Enfeksiyon Hastalıkları Tıbbi Laboratuar Teknolojisi

Distribution and Antifungal Susceptibilities of Candida Species Isolated from Blood Cultures at Kahramanmaraş Necip Fazıl City Hospital in the Last Three Years

Öz:

Aim: Candida species are opportunistic pathogens that cause seriousinfections. Recently, an increase is observed in hospital-acquiredfungal infections; and Candida species are reported to be responsiblefor 5% of all nosocomial infections. Candida albicans is the mostcommon cause of candidemia. However, the incidence of non-albicansCandida species has been increasing, and their antifungalsusceptibilities are different from each other. In this study investigationof identification, and determination of antifungal susceptibility ratesamong Candida species isolated from blood cultures which were sentto our laboratory from various clinical units during January 2013-December 2015 were aimed.Material and Method: In the context of this study, blood culturesamples collected at Kahramanmaraş Necip Fazıl City Hospital wereexamined. Samples were incubated using BACTEC/9050 (BectonDickinson, Maryland, USA) automated system. For the identificationand antifungal susceptibility tests of Candida species, Vitek version 2.0(BioMérieux, France) automated system was used. Fluconazole,voriconazole, flucytosine, amphotericin B and caspofungin susceptibilitycategories of the isolates were determined according to the criteriae ofClinical and Laboratory Standards Institute (CLSI M27-A3).Results: During our study period, 8271 blood cultures were analysedin the laboratory. Six thousand four hundred and nineteen (77.6%)cultures resulted as negative. Candida species were isolated from 93blood cultures of 50 patients. Candida species were isolated from bloodcultures.of two patients (4.0%) in internal medicine services, and otherpatients (96.0%) with Candida growth were treated in the intensivecare units. Candida parapsilosis constituted 62.0% of isolates. C. albicanswas detected in 34.0% of the cultures at the second frequency. Candidatropicalis and Candida krusei species were cultured from only one(2.0%) specimen, each. No resistance was detected in antifungalsusceptibility tests of flucytosine. The least susceptibility rate wasobserved among C. parapsilosis isolates for voriconazole. Ninety fourpercent of C. albicans isolates showed susceptibility to amphotericin B,and no resistance to the other antifungal agents tested.Conclusion: In conclusion, in our study Candida species were mostfrequently isolated from blood culture samples sent from the intensivecare units. While the most frequent species isolated was C. parapsilosis,C. albicans was at the second frequency. Resistance to some of theantifungals tested was observed for some of the Candida speciesisolated. It was considered that identification and antifungalsusceptibility tests are very important in the diagnosis and treatment ofthese infections in patients especially at intensive care units.

Anahtar Kelime:

Konular: Biyoloji Mantar Bilimi Mikrobiyoloji Biyoteknoloji ve Uygulamalı Mikrobiyoloji Enfeksiyon Hastalıkları Tıbbi Laboratuar Teknolojisi

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık

1. Çalışkan E, Dede A, Biten Güven G. Kan kültürlerinde saptanan Candida türlerinin dağılımı ve antifungal duyarlılıkları. ANKEM Derg 2013; 27:25-30.
2. Yenigün Koçak B, Kuloğlu F, Doğan Çelik A, Akata F. Bir üçüncü basamak hastanesinde erişkin kandidemi olgularının epidemiyolojik özellikleri ve risk faktörlerinin değerlendirilmesi. Mikrobiyol Bul 2011; 45:489-503.
3. Akalın H. Kandidemilerde risk faktörleri ve risk değerlendirmesi. ANKEM Derg 2008; 22:270-4.
4. Atalay MA, Sav H, Demir G, Koç AN. Kan kültürlerinden izole edilen Candida türlerinin dağılımı ve amfoterisin B ve flukonazole in v itro duyarlılıkları. Selçuk Tıp Derg 2012; 28:149-51.
5. Temiz H, Temiz S, Kaya Ş. Çeşitli klinik örneklerden izole edilen Candida türlerinin dağılımı ve antifungal duyarlılıkları. Okmeydanı Tıp Derg 2015; 31:13-7. http://dx.doi.org/10.5222/otd.2015.013
6. CLSI. Reference method for broth dilution antifungal susceptibility testing of yeasts. Approved Standard, 3rd ed, M27-A3, Clinical and Laboratory Standards Institute, 2008.
7. Mutlu Sarıgüzel F, Koç AN, Karagöz S. Kan kültürlerinden izole edilen maya türlerinin Vitek 2 sistemi ile tanımlanması ve antifungal duyarlılıkları. Harran Univ Tıp Fak Derg 2015; 12:261-8.
8. Falagas ME, Roussos N, Vardakas KZ. Relative frequency of albicans and the various non-albicans Candida spp. among candidemia isolates from inpatients in various parts of the world: a systematic review. Int J Infect Dis 2010; 14:e954-66. http://dx.doi.org/10.1016/j.ijid.2010.04.006
9. Tak V, Mathur P, Varghese P, Gunjiyal J, Xess I, Misra MC. The epidemiological profile of candidemia at an Indian trauma care center. J Lab Physicians 2014; 6:96-101. http://dx.doi.org/10.4103/0974-2727.141506
10. Gültekin B, Eyigör M, Telli M, Aksoy M, Aydın N. Yedi yıllık dönemde kan kültürlerinden izole edilen Candida türlerinin retrospektif olarak incelenmesi. ANKEM Derg 2010; 24:202-8.
11. Öztürk T, Özseven AG, Sesli Çetin E, Kaya S. Kan kültürlerinden izole edilen Candida suşlarının tiplendirilmesi ve antifungal duyarlılıklarının araştırılması. Kocatepe Tıp Derg 2013; 14:17-22.
12. Sav H, Demir G, Atalay MA, Koç AN. Klinik örneklerden izole edilen Candida türlerinin değerlendirilmesi. Turk Hij Den Biyol Derg 2013; 70:175-80. http://dx.doi.org/10.5505/TurkHijyen.2013.37267
13. Berk E, Kayman T, Sarıgüzel FM, Koç AN, Sav H, Çelik İ. Yoğun bakım ünitesinde yatan hastaların kan kültürlerinden izole edilen Candida türleri ve antifungal duyarlılıkları. 35. Türk Mikrobiyoloji Kongresi Özet Kitabı, (3-7 Kasım 2012, Aydın) P027: 227.
14. Ece G. Distribution of Yeast-Like fungi at a university hospital in Turkey. Jundishapur J Microbiol 2014; 7:e13141. http://dx.doi.org/10.5812/jjm.13141
15. Zhang XB, Yu SJ, Yu JX, Gong YL, Feng W, Sun FJ. Retrospective analysis of epidemiology and prognostic factors for candidemia at a hospital in China, 2000-2009. Jpn J Infect Dis 2012; 65:510-5. http://dx.doi.org/10.7883/yoken.65.510
16. Erdem F, Tuncer Ertem G, ve ark. Candida türlerine bağlı nozokomiyal enfeksiyonların epidemiyolojik ve mikrobiyolojik açıdan değerlendirilmesi. Mikrobiyol Bul 2012; 46:637-48.
17. CLSI. Reference method for broth dilution antifungal susceptibility testing of yeasts; 4th informational supplement. M27-S4. Clinical and Laboratory Standards Institute, 2012.
18. Rodriguez-Tudela JL, Arendrup MC, Barchiesi F, et al. EUCAST Definitive Document EDef7.1: method for the determination of broth dilution MICs of antifungal agents for fermentative yeasts. Clin Microbiol Infect 2008; 14:398-405. http://dx.doi.org/10.1111/j.1469-0691.2007.01935.x
19. Bourgeois N, Dehandschoewercker L, Bertout S, Bousquet PJ, Rispail P, Lachaud L. Antifungal susceptibility of 205 Candida spp. isolated primarily during invasive candidiasis and comparison of the Vitek 2 system with the CLSI broth microdilution and Etest methods. J Clin Microbiol 2010; 48:154-61. http://dx.doi.org/10.1128/JCM.01096-09
20. Pfaller MA, Diekema DJ, Procop GW, Rinaldi MG. Comparison of the Vitek 2 yeast susceptibility system with CLSI microdilution for antifungal susceptibility testing of fluconazole and voriconazole against Candida spp., using new clinical breakpoints and epidemiological cutoff values. Diagn Microbiol Infect Dis 2013; 77:37- 40. http://dx.doi.org/10.1016/j.diagmicrobio.2013.05.019

APA	Özkaya E, Çalışkan A, Kirişci Ö, TÜMER S (2016). Son Üç Yılda Kahramanmaraş Necip Fazıl Şehir Hastanesinde Kan Kültürlerinden İzole Edilen Candida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılıkları. , 63 - 68.
Chicago	Özkaya Esra,Çalışkan Ahmet,Kirişci Özlem,TÜMER Seray Son Üç Yılda Kahramanmaraş Necip Fazıl Şehir Hastanesinde Kan Kültürlerinden İzole Edilen Candida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılıkları. (2016): 63 - 68.
MLA	Özkaya Esra,Çalışkan Ahmet,Kirişci Özlem,TÜMER Seray Son Üç Yılda Kahramanmaraş Necip Fazıl Şehir Hastanesinde Kan Kültürlerinden İzole Edilen Candida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılıkları. , 2016, ss.63 - 68.
AMA	Özkaya E,Çalışkan A,Kirişci Ö,TÜMER S Son Üç Yılda Kahramanmaraş Necip Fazıl Şehir Hastanesinde Kan Kültürlerinden İzole Edilen Candida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılıkları. . 2016; 63 - 68.
Vancouver	Özkaya E,Çalışkan A,Kirişci Ö,TÜMER S Son Üç Yılda Kahramanmaraş Necip Fazıl Şehir Hastanesinde Kan Kültürlerinden İzole Edilen Candida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılıkları. . 2016; 63 - 68.
IEEE	Özkaya E,Çalışkan A,Kirişci Ö,TÜMER S "Son Üç Yılda Kahramanmaraş Necip Fazıl Şehir Hastanesinde Kan Kültürlerinden İzole Edilen Candida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılıkları." , ss.63 - 68, 2016.
ISNAD	Özkaya, Esra vd. "Son Üç Yılda Kahramanmaraş Necip Fazıl Şehir Hastanesinde Kan Kültürlerinden İzole Edilen Candida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılıkları". (2016), 63-68.

APA	Özkaya E, Çalışkan A, Kirişci Ö, TÜMER S (2016). Son Üç Yılda Kahramanmaraş Necip Fazıl Şehir Hastanesinde Kan Kültürlerinden İzole Edilen Candida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılıkları. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi, 46(2), 63 - 68.
Chicago	Özkaya Esra,Çalışkan Ahmet,Kirişci Özlem,TÜMER Seray Son Üç Yılda Kahramanmaraş Necip Fazıl Şehir Hastanesinde Kan Kültürlerinden İzole Edilen Candida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılıkları. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi 46, no.2 (2016): 63 - 68.
MLA	Özkaya Esra,Çalışkan Ahmet,Kirişci Özlem,TÜMER Seray Son Üç Yılda Kahramanmaraş Necip Fazıl Şehir Hastanesinde Kan Kültürlerinden İzole Edilen Candida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılıkları. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi, vol.46, no.2, 2016, ss.63 - 68.
AMA	Özkaya E,Çalışkan A,Kirişci Ö,TÜMER S Son Üç Yılda Kahramanmaraş Necip Fazıl Şehir Hastanesinde Kan Kültürlerinden İzole Edilen Candida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılıkları. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi. 2016; 46(2): 63 - 68.
Vancouver	Özkaya E,Çalışkan A,Kirişci Ö,TÜMER S Son Üç Yılda Kahramanmaraş Necip Fazıl Şehir Hastanesinde Kan Kültürlerinden İzole Edilen Candida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılıkları. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi. 2016; 46(2): 63 - 68.
IEEE	Özkaya E,Çalışkan A,Kirişci Ö,TÜMER S "Son Üç Yılda Kahramanmaraş Necip Fazıl Şehir Hastanesinde Kan Kültürlerinden İzole Edilen Candida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılıkları." Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi, 46, ss.63 - 68, 2016.
ISNAD	Özkaya, Esra vd. "Son Üç Yılda Kahramanmaraş Necip Fazıl Şehir Hastanesinde Kan Kültürlerinden İzole Edilen Candida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılıkları". Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi 46/2 (2016), 63-68.