KAN KÜLTÜRLERİNDEN İZOLE EDİLEN CANDIDA TÜRLERİNİN DAĞILIMININ VE ANTİFUNGAL DUYARLILIKLARININ RETROSPEKTİF OLARAK DEĞERLENDİRİLMESİ

EKENOĞLU, Yağmur; YAMAN, AKGÜN; Etiz, Pınar; KİBAR, Filiz

KAN KÜLTÜRLERİNDEN İZOLE EDİLEN CANDIDA TÜRLERİNİN DAĞILIMININ VE ANTİFUNGAL DUYARLILIKLARININ RETROSPEKTİF OLARAK DEĞERLENDİRİLMESİ

Pınar ETİZ, (Çukurova Üniversitesi Sağlık Hizmetleri Meslek Yüksekokulu, ADANA)

Filiz KİBAR, (Çukurova Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, ADANA, Çukurova Üniversitesi Balcalı Hastanesi, Merkez Laboratuvarı, ADANA)

Yağmur EKENOĞLU, (Çukurova Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, ADANA)

Akgün YAMAN (Çukurova Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, ADANA, Çukurova Üniversitesi Balcalı Hastanesi, Merkez Laboratuvarı, ADANA)

ANKEM Dergisi

6 1

Yıl: 2015 Cilt: 29 Sayı: 3 Sayfa Aralığı: 105 - 113 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 29-07-2022

KAN KÜLTÜRLERİNDEN İZOLE EDİLEN CANDIDA TÜRLERİNİN DAĞILIMININ VE ANTİFUNGAL DUYARLILIKLARININ RETROSPEKTİF OLARAK DEĞERLENDİRİLMESİ

Öz:

Kandidemi yüksek mortalite ile seyreden ciddi bir klinik tablodur. Son yıllarda Candida infeksiyonlarının epidemiyolojisi ve tedavide kullanılan antifungallerle ilgili önemli değişiklikler ortaya çıkmıştır. Bu çalışmada kan kültürlerinden izole edilen Candida türlerinin tanımlanması ve bunların amfoterisin B, kaspofungin, flukonazol, flusitozin ve vorikonazole duyarlılıklarının retrospektif olarak araştırılması amaçlanmıştır.Laboratuvarımıza Ocak 2013-Aralık 2014 döneminde gönderilen kan kültürlerinde tespit edilen maya üremeleri konvansiyonel yöntemler, germ tüp ve VITEK 2 Compact (bioMérieux, Fransa) otomatize identifikasyon sistemi ile tiplendirilmiş ve antifungal duyarlılıkları VITEK 2 Compact sistemi ile belirlenmiştir.İzole edilen 280 Candida suşunun 95'i (% 33.9) Candida parapsilosis, 77'si (% 27.5) Candida albicans, 45'i (% 16) Candida tropicalis, 27'si (% 9.6) Candida glabrata, dokuzar tanesi (% 3.2) Candida kefyr ve Candida lusitaniae, beşi (% 1.7) Candida krusei, dörder tanesi (% 1.4) Candida famata ve Candida sphaerica, ikisi (% 0.7) Candida dubliniensis, birer tanesi de (% 0.3) Candida haemulonii, Candida norvegensis ve Candida pelliculosa olarak tanımlanmıştır. Antifungal duyarlılık yorumlamaları C.albicans, C.parapsilosis, C.tropicalis, C.glabrata, C.krusei olarak izole edilen 249 izolat için yapılmıştır. Antifungallere dirençli Candida türlerinin saptandığı çalışmamızda, üreme saptanan kan kültürlerindeki Candida türlerinin tanımlanmasının ve antifungal duyarlılıklarının bildirilmesinin, tedaviyi yönlendirmek için önemli olduğu sonucuna varılmıştır

Anahtar Kelime:

Konular: Mikrobiyoloji Biyoteknoloji ve Uygulamalı Mikrobiyoloji Tıbbi Laboratuar Teknolojisi

Retrospective Evaluation of Distribution and Antifungal Susceptibilities of Candida Species Isolated from Blood Cultures

Öz:

Candidemia is a serious clinical presentation with a rather high mortality. Over the last years, there have been importantchanges in the epidemiology of Candida infections and antifungal agents used to treat these infections. In this study, theidentification of the Candida species isolated from blood cultures and investigation of their susceptibilities against amphotericinB, caspofungin, fluconazole, flucytosine and voriconazole retrospectively were aimed.Yeasts detected from blood cultures in our laboratory between January 2013 and December 2014 were identified byconventional methods, germ tube and VITEK 2 Compact (bioMérieux, France) automated identification system and susceptibilitiesto antifungal agents were determined by VITEK 2 Compact System.Among 280 Candida spp., strains isolated, 95 (33.9 %) were identified as Candida parapsilosis, the others were identifiedas follows: 77 (27.5 %) Candida albicans, 45 (16 %) Candida tropicalis, 27(9.6 %) Candida glabrata, nine (3.2 %)Candida kefyr, nine (3.2 %) Candida lusitaniae, five (1.7 %) Candida krusei, four (1.4 %) Candida famata, four (1.4 %)Candida sphaerica, two (0.7 %) Candida dubliniensis, one (0.3 %) Candida haemulonii, one (0.3 %) Candida norvegensis andone (0.3 %) Candida pelliculosa. Interpretation of antifungal susceptibility tests of C.albicans, C.parapsilosis, C.tropicalis,C.glabrata, C.krusei isolates were made to 249 as described.As a result of our study, in which Candida strains resistant to antifungal agents were isolated, identification to specieslevel and determining antifungal susceptibilities of Candida species isolated from blood cultures is concluded to be importantto guide treatment.

Anahtar Kelime:

Konular: Mikrobiyoloji Biyoteknoloji ve Uygulamalı Mikrobiyoloji Tıbbi Laboratuar Teknolojisi

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık

1. Bayram Y, Gültepe B, Özlük S, Güdücüoğlu H. Çeşitli klinik örneklerden izole edilen Candida kökenlerinin identifikasyonu ve antifungal duyarlılıklarının araştırılması, Van Tıp Derg 2012;19(4): 177-81.
2. Borghi E, Iatta R, Sciota R et al. Comparative evaluation of the Vitek 2 yeast susceptibilty test and CLSI broth microdilution reference method for testing antifungal susceptibility of invasive fungal isolates in Italy: GISIA3 study, J Clin Microbiol 2010;48(9):33153-57.
3. Bourgeois N, Dehandschoewercker L, Bertout S, Bousquet PJ, Rispail P, Lachaud L. Antifungal susceptibility of 205 Candida spp isolated primarily during invasive candidiasis and comparison of the vitek 2 system with the CLSI broth microdilution and E-test methods, J Clin Microbiol 2010;48(2):154-61. http://dx.doi.org/10.1128/JCM.1096-09 PMid:19889902
4. Cheng MF, Yu KW, Tang RB et al. Distribution and antifungal susceptibility of Candida species causing candidemia from 1996 to 1999, Diagn Microbiol Infect Dis 2004;48(1):33-7. http://dx.doi.org/10.1016/j.diagmicrobio.2003.08.002 PMid:14761719
5. Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). Reference method for brothdilution antifungal susceptibility testing of yeasts. 3rd ed. Wayne: Clinical and Laboratory Standards Institute; 2008 (Approved standard. M27-S3).
6. Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). Reference method for broth dilution antifungal susceptibility testing of yeasts; fourth informational supplement. Wayne: Clinical and Laboratory Standards Institute; 2012 (Document M27-S4).
7. Cuenca-Estrella M, Gomez-Lopez M, AlastrueyIzquierdo A et al. Comparison of the Vitek 2 antifungal susceptibility system with the clinical and laboratory standards institute (CLSI) an European committee on antimicrobial susceptibility testing (EUCAST) broth microdilution reference methods and with the sensititre yeastone and E-test techniques for in vitro detection of antifungal resistance in yeast isolates, J Clin Microbiol 2010;48(5):1782-86. http://dx.doi.org/10.1128/JCM.02316-09 PMid:20220169
8. Çalışkan E, Dede A, Biten Güven G. Kan kültürlerinde saptanan Candida türlerinin dağılımı ve antifungal duyarlılıkları, ANKEM Derg 2013;27(1): 25-30. http://dx.doi.org/10.5222/ankem.2013.025
9. Durán MT, Velasco D, Canle D, Moure R, Villanueva R. Antifungal susceptibility of Candida spp. isolates from blood cultures in a five-year period (1997-2001), Enferm Infect Microbiol Clin 2003;21(9):488-92. PMid:14572381 http://dx.doi.org/10.1157/13052332
10. Gültekin B, Eyigör M, Telli M, Aksoy M, Aydın N. Yedi yıllık dönemde kan kültürlerinden izole edilen Candida türlerinin retrospektif olarak incelenmesi, ANKEM Derg 2010;24(4):202-8.
11. Gültekin B, Eyigör M, Tiryaki Y, Kırdar S, Aydın N. Kan kültürlerinden izole edilen Candida suşlarında antifungal duyarlılığın ve bazı virülans faktörlerinin araştırılması ve RAPD-PCR ile genotiplendirilmesi, Mikrobiyol Bul 2011;45(2):306-17.
12. Gürcüoglu E, Ener B, Akalın H et al. Epidemiology of nosocomial candidaemia in a university hospital: a 12-year study, Epidemiol Infect 2010;138(9): 1328-35.
13. Jung SI, Shin JH, Song JH et al and Korean Study Group for Candidemia. Multicenter surveillance of species distribution and antifungal susceptibilities of Candida bloodstream isolates in South Korea, Med Mycol 2010;48(4):669-74. http://dx.doi.org/10.3109/13693780903410386 PMid:20392145
14. Keçeli Özcan S, Mutlu B, Dündar D, Willke A. Kan kültürlerinden izole edilen Candida spp. suşları- nın antifungal ilaçlara karşı duyarlılıklarının belirlenmesinde buyyon mikrodilisyon ile E-test yöntemlerinin karşılaştırılması, Mikrobiyol Bul 2010;44(2):263-71. PMid:20549961
15. Kuzucu Ç, Yetkin G, Çalışkan A. Bir yıl içerisinde kan kültürlerinden izole edilen Candida türlerinin dağılımı ve antifungal duyarlılıkları, Erciyes Tıp Derg 2007;29(2):115-9.
16. Öztürk T, Özseven AG, Sesli Çetin E, Kaya S. Kan kültürlerinden izole edilen Candida suşlarının tiplendirilmesi ve antifungal duyarlılıklarının araştırılması, Kocatepe Tıp Derg 2013;14(1):17-22.
17. Pappas PG, Rex JH, Lee J et al. A prospective observational study of candidemia: epidemiology, therapy, and influences on mortality in hospitalized adult and pediatric patients, Clin Infect Dis 2003;37(5):634-43. http://dx.doi.org/10.1086/376906 PMid:12942393
18. Pfaller MA, Castanheira M, Messer SA, Moet GJ, Jones RN. Echinocandin and triazole antifungal susceptibility profiles for Candida spp., Cryptococcus neoformans, and Aspergillus fumigatus: application of new CLSI clinical breakpoints and epidemiologic cutoff values to characterize resistance in the SENTRY Antimicrobial Surveillance Program (2009), Diagn Microbiol Infect Dis 2011;69(1):45-50. http://dx.doi.org/10.1016/j.diagmicrobio.2010.08.013 PMid:21146713
19. Santos ERD, Forno CFD, Hernandez MG et al. Susceptibility of Candida spp isolated from blood cultures as evulated using the M27-A3 and new M27-S4 approves breakpoints, Rev Inst Med Trop Sao Paulo 2014;56(6):477-82. http://dx.doi.org/10.1590/S0036-46652014000600004 PMID: 25351540
20. Saracli MA, Gumral R, Gul HC, Gonlum A, Yildiran ST. Species distribution and in vitro susceptibility of Candida bloodstream isolates to six new and current antifungal agents in a Turkish Tertiary Care Military Hospital recovered through 2001 and 2006, Mil Med 2009;174(8):860-5. PMid:19743744 http://dx.doi.org/10.7205/MILMED-D-04-7808
21. Sheng-Yuan Ruana S, Yao-Wen Kuoa, Chun-Ta Huanga, Han-Chung Hsiueb, Po-Ren Hsueh. Infections due to Candida haemulonii: species identification, antifungal susceptibility and outcomes, Int J Antimicrob Agents 2010;35(1):85-8. http://dx.doi.org/10.1016/j.ijantimicag.2009.08.009 PMid:19786341
22. Shin JH, Kim MN, Jang SJ et al. Detection of amphotericin B resistance in Candida haemulonii and closely related species by use of the Etest, Vitek 2 yeast susceptibility system and CLSI and EUCAST broth microdilution methods, J Clin Microbiol 2012;50(6):1852-5. http://dx.doi.org/10.1128/JCM.06440-11 PMid:22442324
23. Şahiner F, Ergünay K, Özyurt M, Ardıç N, Hoşbul T, Haznedaroğlu T. Hastane enfeksiyonu etkeni olarak izole edilen Candida suşlarının genotipik ve fenotipik olarak tanımlanması, Mikrobiyol Bul 2011;45(3):478-88. PMid:21935781
24. Zepelin MB, Kunz L, Rüchel R, Reichard U, Weig M, Groß U. Epidemiology and antifungal susceptibilities of Candida spp. to six antifungal agents: results from a surveillance study on fungaemia in Germany from July 2004 to August 2005, J Antimicrob Chemother 2007;60(4):424-8.
25. Zer Y, Balcı İ. Yoğun bakım ünitesindeki hastalardan izole edilen Candida suşlarının identifikasyonu ve antifungal duyarlılıkları, Türk Mikrobiyol Cem Derg 2002;32(3):230-4.

APA	Etiz P, KİBAR F, EKENOĞLU Y, YAMAN A (2015). KAN KÜLTÜRLERİNDEN İZOLE EDİLEN CANDIDA TÜRLERİNİN DAĞILIMININ VE ANTİFUNGAL DUYARLILIKLARININ RETROSPEKTİF OLARAK DEĞERLENDİRİLMESİ. , 105 - 113.
Chicago	Etiz Pınar,KİBAR Filiz,EKENOĞLU Yağmur,YAMAN AKGÜN KAN KÜLTÜRLERİNDEN İZOLE EDİLEN CANDIDA TÜRLERİNİN DAĞILIMININ VE ANTİFUNGAL DUYARLILIKLARININ RETROSPEKTİF OLARAK DEĞERLENDİRİLMESİ. (2015): 105 - 113.
MLA	Etiz Pınar,KİBAR Filiz,EKENOĞLU Yağmur,YAMAN AKGÜN KAN KÜLTÜRLERİNDEN İZOLE EDİLEN CANDIDA TÜRLERİNİN DAĞILIMININ VE ANTİFUNGAL DUYARLILIKLARININ RETROSPEKTİF OLARAK DEĞERLENDİRİLMESİ. , 2015, ss.105 - 113.
AMA	Etiz P,KİBAR F,EKENOĞLU Y,YAMAN A KAN KÜLTÜRLERİNDEN İZOLE EDİLEN CANDIDA TÜRLERİNİN DAĞILIMININ VE ANTİFUNGAL DUYARLILIKLARININ RETROSPEKTİF OLARAK DEĞERLENDİRİLMESİ. . 2015; 105 - 113.
Vancouver	Etiz P,KİBAR F,EKENOĞLU Y,YAMAN A KAN KÜLTÜRLERİNDEN İZOLE EDİLEN CANDIDA TÜRLERİNİN DAĞILIMININ VE ANTİFUNGAL DUYARLILIKLARININ RETROSPEKTİF OLARAK DEĞERLENDİRİLMESİ. . 2015; 105 - 113.
IEEE	Etiz P,KİBAR F,EKENOĞLU Y,YAMAN A "KAN KÜLTÜRLERİNDEN İZOLE EDİLEN CANDIDA TÜRLERİNİN DAĞILIMININ VE ANTİFUNGAL DUYARLILIKLARININ RETROSPEKTİF OLARAK DEĞERLENDİRİLMESİ." , ss.105 - 113, 2015.
ISNAD	Etiz, Pınar vd. "KAN KÜLTÜRLERİNDEN İZOLE EDİLEN CANDIDA TÜRLERİNİN DAĞILIMININ VE ANTİFUNGAL DUYARLILIKLARININ RETROSPEKTİF OLARAK DEĞERLENDİRİLMESİ". (2015), 105-113.

APA	Etiz P, KİBAR F, EKENOĞLU Y, YAMAN A (2015). KAN KÜLTÜRLERİNDEN İZOLE EDİLEN CANDIDA TÜRLERİNİN DAĞILIMININ VE ANTİFUNGAL DUYARLILIKLARININ RETROSPEKTİF OLARAK DEĞERLENDİRİLMESİ. ANKEM Dergisi, 29(3), 105 - 113.
Chicago	Etiz Pınar,KİBAR Filiz,EKENOĞLU Yağmur,YAMAN AKGÜN KAN KÜLTÜRLERİNDEN İZOLE EDİLEN CANDIDA TÜRLERİNİN DAĞILIMININ VE ANTİFUNGAL DUYARLILIKLARININ RETROSPEKTİF OLARAK DEĞERLENDİRİLMESİ. ANKEM Dergisi 29, no.3 (2015): 105 - 113.
MLA	Etiz Pınar,KİBAR Filiz,EKENOĞLU Yağmur,YAMAN AKGÜN KAN KÜLTÜRLERİNDEN İZOLE EDİLEN CANDIDA TÜRLERİNİN DAĞILIMININ VE ANTİFUNGAL DUYARLILIKLARININ RETROSPEKTİF OLARAK DEĞERLENDİRİLMESİ. ANKEM Dergisi, vol.29, no.3, 2015, ss.105 - 113.
AMA	Etiz P,KİBAR F,EKENOĞLU Y,YAMAN A KAN KÜLTÜRLERİNDEN İZOLE EDİLEN CANDIDA TÜRLERİNİN DAĞILIMININ VE ANTİFUNGAL DUYARLILIKLARININ RETROSPEKTİF OLARAK DEĞERLENDİRİLMESİ. ANKEM Dergisi. 2015; 29(3): 105 - 113.
Vancouver	Etiz P,KİBAR F,EKENOĞLU Y,YAMAN A KAN KÜLTÜRLERİNDEN İZOLE EDİLEN CANDIDA TÜRLERİNİN DAĞILIMININ VE ANTİFUNGAL DUYARLILIKLARININ RETROSPEKTİF OLARAK DEĞERLENDİRİLMESİ. ANKEM Dergisi. 2015; 29(3): 105 - 113.
IEEE	Etiz P,KİBAR F,EKENOĞLU Y,YAMAN A "KAN KÜLTÜRLERİNDEN İZOLE EDİLEN CANDIDA TÜRLERİNİN DAĞILIMININ VE ANTİFUNGAL DUYARLILIKLARININ RETROSPEKTİF OLARAK DEĞERLENDİRİLMESİ." ANKEM Dergisi, 29, ss.105 - 113, 2015.
ISNAD	Etiz, Pınar vd. "KAN KÜLTÜRLERİNDEN İZOLE EDİLEN CANDIDA TÜRLERİNİN DAĞILIMININ VE ANTİFUNGAL DUYARLILIKLARININ RETROSPEKTİF OLARAK DEĞERLENDİRİLMESİ". ANKEM Dergisi 29/3 (2015), 105-113.