8 5

Proje Grubu: EEEAG Sayfa Sayısı: 48 Proje No: 112E315 Proje Bitiş Tarihi: 01.10.2015 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 10-04-2019

Yerel Voksel Ağları Ile Beyin Verisi Üzerinden Bilişsel Süreçlerin Modellenmesi Ve Otomatik Olarak Tanınması

Öz:
Yapay zeka konusunda çalışan araştırmacılar, insan zekasınından esinlenerek, insan zekasına benzeyen yapay sistemleri geliştirmeye çalışmaktadır. Temel amaç insan gibi düşünen, insan gibi öğrenen ve problem çözebilen makinalar yapabilmektir. Bu sistemlerle ilgili yazılım ve donanımları geliştirebilmek üzere birçok matematiksel yöntem ve algoritmalar geliştirilmiştir. Bu yöntemler sayesinde nesneleri algılama, tanıma, sınıflama ve öğrenme gibi önemli bilişsel süreçlerin matematiksel modelleri oluşturulmuştur. Bu projede, yapay zeka algoritmaları için geliştirilen yöntemleri kullanarak, bilişsel süreçleri (örneğin bellek, öğrenme, duygulanım) modelledik. Diğer bir deyişle, bugüne kadar insan zekasını taklit ederek geliştirdiğimiz yapay zeka yöntemlerini tersinir bir mühendislikle geri çevirerek doğal zekayı modellemek üzere kullandık. Modellerimizi bilişsel süreçler sırasında kaydededilen fonksiyonel Manyetik Resonans Görüntüleri (fMRG) kullanarak oluşturduk. Bunun için, bir dizi bilişsel deney tasarladık ve bu deneyleri denekler üzerinde uygularken fMRG sinyallerini kaydettik. Böylece, elde ettiğimiz etiketli öğrenme verilerini geliştirdiğimiz makine öğrenme algoritmalarını eğitmek için kullandık.Projenin en önemli çıktılarından birisi de oluşturulan modellerin ve elde edilen fMRG verilerinin, web tabanlı bir ortamda tüm araştırmacıların hizmetine açılmasıdır. Böylece oluşturulduğumuz metodoloji ve programları nörobilimciler veri analizinde kullanabilecekler ve kendi fMRG verilerini de modelleyebileceklerdir. Proje kapsamında geliştirdiğimiz matematiksel beyin modeline Yerel Voksel Ağları (YVA) adını verdik. İnsan-bilgisayar etkileşimi teknolojileri için bilimsel bir altyapı oluşturma potansiyeline sahip olan bu model, iki farklı veri seti üzerinde gerçekleştirilen deneylerde, literatürde yoğun olarak kullanılan diğer Çoklu Voksel Örüntü Analizi (ÇVÖA) yöntemlerine göre daha başarılı sonuçlar ortaya koyduğu anlaşılmıştır. Yerel Voksel Ağları yöntemi, fMRG sinyalllerinin en küçük birimi olan voksellerden elde edilen zaman serileri arasındaki ilişkiyi doğrusal denklemlerle modellemektedir. İnsan beyninde, birbirine yakın nöronların benzer aktiviteler gösterdiği bilinmektedir. Bu yerel benzerlik, birbirine yakın vokseller arasındaki ilişkinin doğrusal olduğunu göstermektedir. Bazen de birbirinden uzak vokseller de beyindeki direk yollar aracılığı ile benzer aktivasyonlara sahip olabilmektedir. Bu tür vokseller yerel olarak değil de fonksiyonel olarak birbirine komşu kabul edilebilir. Geliştirmiş olduğumuz bu yeni komşuluk sistemine fonksiyonel komşuluk adını verdik. Ve vokseller arasındaki doğrusal ilişkiyi, “Fonksiyonel Komşuluk” adını verdiğimiz bu ölçütü kullanarak modelledik. YVA modelinin, FMRG sinyallerinden gelen ham özniteliklere göre, bilişsel süreçleri etiketleme konusunda daha başarılı olduğunu deneysel olarak gösterdik. Proje kapsamında öncelikle fMRG verisi toplamak üzere bir dizi deney tasarladık ve bu deneyleri Bilkent Üniversitesi UMRAM merkezinde gerçekleştirdik. Bunun için insan beyninin bilgileri nasıl depolandığını ve nesneleri nasıl tanıdığını anlamak üzere 3 değişik deney yaptık. Bu deneylerde değişik nesnelerin tanındığı etiketli fMRG verileri elde ettik. Daha sonra verileri işleyerek gürültülerden arındırmaya çalıştık ve modelimiz için uygun hale getirdik. Kullandığımız görüntü iyileştirme teknikleri ile, YVA yönteminde elde edilen etiketleme performansını arttırdık.YVA yöntemi sonucunda elde edilen beyin ağını kullanılarak birçok öznitelik oluşturulabilir. Biz bu çalışmada YVA’ dan elde ettiğimiz kenar ağırlıklarını öznitelik olarak kullanarak Yapay Sinir Ağları, Destek Vektör Makinaları ve k-En Yakın komşuluk gibi çeşitli sınıflandırıcıları eğittik. Bunların içinde en başarılı olanları seçerek performansları ölçtük. Yöntemin başarılı sonuçlar vermesi neticesinde, doğrusal ilişki özniteliklerinin çıkarılma adımının hızlandırılması için GPU programlama tekniklerinden faydalandık. Son olarak da ortaya çıkarılan özniteliklerin beyin modeli üzerinde bilim insanlarına sunulması için, proje kapsamında bir kullanıcı ara yüzü geliştirdik. Böylece, oluşturduğumuz beyin ağlarını bilim insanlarının kullanımına sunmayı hedefledik.
Anahtar Kelime: GPGPU fMRG İnsan-bilgisayar etkileşimi Beyin Okuma Yapay Zeka Örüntü Tanıma Makine Öğrenmesi

Konular: Bilgisayar Bilimleri, Bilgi Sistemleri Bilgisayar Bilimleri, Donanım ve Mimari Bilgisayar Bilimleri, Yapay Zeka
Erişim Türü: Erişime Açık
  • Norman, Kenneth A., vd. "Beyond mind-reading: multi-voxel pattern analysis of fMRI data." Trends in cognitive sciences 10.9 (2006): 424-430.
  • Functional Mesh Learning for pattern analysis of cognitive processes (Bildiri - Uluslararası Bildiri - Sözlü Sunum),
  • Polyn, Sean M., vd. "Category-specific cortical activity precedes retrieval during memory search." Science 310.5756 (2005): 1963-1966.
  • Enhancing Local Linear Models Using Functional Connectivity for Brain State Decoding (Makale - Diğer Hakemli Makale),
  • Mitchell, Tom M., vd. "Learning to decode cognitive states from brain images." Machine Learning 57.1-2 (2004): 145-175.
  • Modeling the Brain Connectivity for Pattern Analysis (Bildiri - Uluslararası Bildiri - Poster Sunum),
  • Haynes, John-Dylan, and Geraint Rees. "Decoding mental states from brain activity in humans." Nature Reviews Neuroscience 7.7 (2006): 523-534.
  • Estimating Brain Connectivity for Pattern Analysis (Bildiri - Ulusal Bildiri - Sözlü Sunum),
  • Mitchell, Tom M., vd. "Learning to decode cognitive states from brain images." Machine Learning 57.1-2 (2004): 145-175.
  • Localization of semantic category classification in fMRI images (Bildiri - Ulusal Bildiri - Sözlü Sunum),
  • De Martino, Federico, vd. "Combining multivariate voxel selection and support vector machines for mapping and classification of fMRI spatial patterns." Neuroimage 43.1 (2008): 44-58.
  • FUNCTIONAL NETWORKS OF ANATOMIC BRAIN REGIONS (Bildiri - Uluslararası Bildiri - Sözlü Sunum),
  • Jin, Bo, vd. "Feature selection for fMRI-based deception detection." BMC bioinformatics 10.Suppl 9 (2009): S15.
  • Large Scale Functional Connectivity For Brain Decoding (Bildiri - Uluslararası Bildiri - Sözlü Sunum),
  • Sun, Fengrong, vd. "Feature-space-based fMRI analysis using the optimal linear transformation." Information Technology in Biomedicine, IEEE Transactions on 14.5 (2010): 1279-1290.
  • Michel, Vincent, vd. "A supervised clustering approach for fMRI-based inference of brain states." Pattern Recognition 45.6 (2012): 2041-2049.
  • Wang, Defeng, vd. "Ellipsoidal support vector clustering for functional MRI analysis." Pattern Recognition 40.10 (2007): 2685-2695.
  • Chu, Carlton, vd. "Kernel regression for fMRI pattern prediction." NeuroImage56.2 (2011): 662-673.
  • Cabral, Carlos, Margarida Silveira, and Patricia Figueiredo. "Decoding visual brain states from fMRI using an ensemble of classifiers." Pattern Recognition45.6 (2012): 2064-2074.
  • Plumpton, Catrin O., vd. "Naive random subspace ensemble with linear classifiers for real-time classification of fMRI data." Pattern Recognition 45.6 (2012): 2101-2108.
  • Kuncheva, Ludmila I., vd. "Multi-modal biometric emotion recognition using classifier ensembles." Modern approaches in applied intelligence. Springer Berlin Heidelberg, 2011. 317-326.
  • M. Ozay, I. Oztekin, U. Oztekin, F. T. Yarman Vural, "Modeling cognitive states using machine learning techniques", Neuroinformatics 2011, Boston, MA, USA
  • O. Firat, M. Ozay, I. Onal, I. Oztekin, F. T. Yarman Vural, "Functional Mesh Learning for Pattern Analysis of Cognitive Processes",12th IEEE International Conference on Cognitive Informatics and Cognitive Computing (ICCI*CC), 2013.
  • O. Firat, M. Ozay, I. Onal, I. Oztekin, F. T. Yarman Vural, "Enhancing Local Linear Models Using Functional Connectivity for Brain State Decoding", International Journal of Cognitive Informatics and Natural Intelligence (IJCINI), 2014.
  • I. Onal, E. Aksan, B. Velioglu, O. Firat, M. Ozay, I. Oztekin, F. T. Yarman Vural, "Estimating Brain Connectivity for Pattern Analysis", 22nd IEEE Conference on Signal Processing and Communications Applications (SIU), 2014
  • I. Onal, E. Aksan, B. Velioglu, O. Firat, M. Ozay, I. Oztekin, F. T. Yarman Vural, "Modeling the Brain Connectivity for Pattern Analysis", 22nd International Conference on Pattern Recognition (ICPR), 2014.
  • B. Velioglu, E. Aksan, I. Onal, O. Firat, M. Ozay, F. T. Yarman Vural, "Functional Networks of Anatomic Brain Regions", 13th IEEE International Conference on Cognitive Informatics and Cognitive Computing (ICCI*CC), 2014
  • Onal, Itir; Ozay, Mete; Vural, Fatos T.Yarman, "Modeling Voxel Connectivity for Brain Decoding," in Pattern Recognition in NeuroImaging (PRNI), 2015 International Workshop on , vol., no., pp.5-8, 10-12 June 2015
  • Bishop, Christopher M. Pattern recognition and machine learning. Springer, 2006.
  • Rubinov, Mikail, and Olaf Sporns. "Complex network measures of brain connectivity: uses and interpretations." Neuroimage 52.3 (2010): 1059-1069.
  • Smith, Stephen M., vd. "Network modelling methods for FMRI." Neuroimage 54.2 (2011): 875-891.
  • O. Firat, M. Ozay, I. Onal, I. Oztekin, F. T. Yarman Vural, "A Mesh Learning Approach for Brain Data Modeling",IEEE 20th Conference on Signal Processing and Communications Applications (SIU), 2012.
APA VURAL F, ÖZTEKİN İ, AKSAN E, VELİOĞLU B, AFRASİYABİ A, ALKAN S (2015). Yerel Voksel Ağları Ile Beyin Verisi Üzerinden Bilişsel Süreçlerin Modellenmesi Ve Otomatik Olarak Tanınması. , 1 - 48.
Chicago VURAL Fatoş Tunay,ÖZTEKİN İlke,AKSAN Emre,VELİOĞLU Burak,AFRASİYABİ Arman,ALKAN Sarper Yerel Voksel Ağları Ile Beyin Verisi Üzerinden Bilişsel Süreçlerin Modellenmesi Ve Otomatik Olarak Tanınması. (2015): 1 - 48.
MLA VURAL Fatoş Tunay,ÖZTEKİN İlke,AKSAN Emre,VELİOĞLU Burak,AFRASİYABİ Arman,ALKAN Sarper Yerel Voksel Ağları Ile Beyin Verisi Üzerinden Bilişsel Süreçlerin Modellenmesi Ve Otomatik Olarak Tanınması. , 2015, ss.1 - 48.
AMA VURAL F,ÖZTEKİN İ,AKSAN E,VELİOĞLU B,AFRASİYABİ A,ALKAN S Yerel Voksel Ağları Ile Beyin Verisi Üzerinden Bilişsel Süreçlerin Modellenmesi Ve Otomatik Olarak Tanınması. . 2015; 1 - 48.
Vancouver VURAL F,ÖZTEKİN İ,AKSAN E,VELİOĞLU B,AFRASİYABİ A,ALKAN S Yerel Voksel Ağları Ile Beyin Verisi Üzerinden Bilişsel Süreçlerin Modellenmesi Ve Otomatik Olarak Tanınması. . 2015; 1 - 48.
IEEE VURAL F,ÖZTEKİN İ,AKSAN E,VELİOĞLU B,AFRASİYABİ A,ALKAN S "Yerel Voksel Ağları Ile Beyin Verisi Üzerinden Bilişsel Süreçlerin Modellenmesi Ve Otomatik Olarak Tanınması." , ss.1 - 48, 2015.
ISNAD VURAL, Fatoş Tunay vd. "Yerel Voksel Ağları Ile Beyin Verisi Üzerinden Bilişsel Süreçlerin Modellenmesi Ve Otomatik Olarak Tanınması". (2015), 1-48.
APA VURAL F, ÖZTEKİN İ, AKSAN E, VELİOĞLU B, AFRASİYABİ A, ALKAN S (2015). Yerel Voksel Ağları Ile Beyin Verisi Üzerinden Bilişsel Süreçlerin Modellenmesi Ve Otomatik Olarak Tanınması. , 1 - 48.
Chicago VURAL Fatoş Tunay,ÖZTEKİN İlke,AKSAN Emre,VELİOĞLU Burak,AFRASİYABİ Arman,ALKAN Sarper Yerel Voksel Ağları Ile Beyin Verisi Üzerinden Bilişsel Süreçlerin Modellenmesi Ve Otomatik Olarak Tanınması. (2015): 1 - 48.
MLA VURAL Fatoş Tunay,ÖZTEKİN İlke,AKSAN Emre,VELİOĞLU Burak,AFRASİYABİ Arman,ALKAN Sarper Yerel Voksel Ağları Ile Beyin Verisi Üzerinden Bilişsel Süreçlerin Modellenmesi Ve Otomatik Olarak Tanınması. , 2015, ss.1 - 48.
AMA VURAL F,ÖZTEKİN İ,AKSAN E,VELİOĞLU B,AFRASİYABİ A,ALKAN S Yerel Voksel Ağları Ile Beyin Verisi Üzerinden Bilişsel Süreçlerin Modellenmesi Ve Otomatik Olarak Tanınması. . 2015; 1 - 48.
Vancouver VURAL F,ÖZTEKİN İ,AKSAN E,VELİOĞLU B,AFRASİYABİ A,ALKAN S Yerel Voksel Ağları Ile Beyin Verisi Üzerinden Bilişsel Süreçlerin Modellenmesi Ve Otomatik Olarak Tanınması. . 2015; 1 - 48.
IEEE VURAL F,ÖZTEKİN İ,AKSAN E,VELİOĞLU B,AFRASİYABİ A,ALKAN S "Yerel Voksel Ağları Ile Beyin Verisi Üzerinden Bilişsel Süreçlerin Modellenmesi Ve Otomatik Olarak Tanınması." , ss.1 - 48, 2015.
ISNAD VURAL, Fatoş Tunay vd. "Yerel Voksel Ağları Ile Beyin Verisi Üzerinden Bilişsel Süreçlerin Modellenmesi Ve Otomatik Olarak Tanınması". (2015), 1-48.